4.4: Epigenetica en MDS Flashcards
Myelodysplatisch syndroom (MDS)
Klonale ziekte van de hematopoietische stamcel -> methylering van DNA is gestoord waardoor te veel DNA gemethyleerd wordt en een of meerder genen uitgezet zijn
Azacytidine
Zorgt voor betere overleving bij MDS + vertraging progressie naar AML + meer transfusie-onafhankelijkheid
2 vormen van epigenetische regulatie
- DNA methylering
- Histonmodificatie
DNA methylering
toevoegen van methylgroep aan cytosine op plaats 5 van de ringstructuur. Gebeurt oiv DNA methyltransferase (DNMT), waarbij 5-methylcytosine ontstaat
- Methylering maakt DNA minder toegankelijk
- Methylering vindt alleen plaats op cytosines met een G ernaast, een CpG-eiland (komen relatief veel voor in promotorregio van een tumorsuppresorgen
- Hypermethylatie treedt op in veel vormen van kanker, methylering zorgt voor minder transcriptie van een tumorsuppressorgen (hypothese = dat transcriptiefactoren niet meer kunnen binden)
Hypermethylatie
- Methylering is een modificatie die alleen kan plaatsvinden op een cytosine -> methyl-CpG binding proteins en histon deacetylase gaan binden -> wordt compact
- Methylering DNA oiv enzym DNMT
- Hypermethylatie treedt op in vele vormen van kanker (heel veel genen worden spontaan gemethyleerd en raken gesloten)
- In promotors is een van de enige plekken waar de volgorde C-G (opeenvolgend) vaak voorkomt -> gevoelig voor methylering
Histon modificatie
DNA is ingepakt in de kern rondom histon eiwitten
- Acetylering histon -> open chromatine -> transcriptie kan plaatsvinden
- Deacetylering histon -> gesloten chromatine -> transcriptie kan niet plaatsvinden
2 vormen van methylering
- Novo methylering: iets wordt gemethyleerd wat nog niet gemethyleerd is
- Maintenance methylatie: als een kant gemethyleerd is, dan krijg je een replicatie waarbij de recepliceerde versie ook een methylering is -> is nodig voor de in stand houding van methylering
