Virus Flashcards
Qu’est-ce qu’un virus? (caractéristiques)
- Parasite intracellulaire obligatoire, peut être filtré (microorganismes de petite taille)
- Agent ne pouvant produire ni énergie ni protéines indépendamment de la cellule hôte
- Génome viral ADN ou ARN
- Enveloppé ou non
- Composantes individuelles assemblée; ne se reproduit pas par division cellulaire
V/F: Les virus sont vivants.
Faux:
- doivent infecter cellule pour assurer réplication et propagation
- Apte a utiliser machinerie cellulaire de l’hôte pour produire propre composantes
Pourquoi les virus ne peuvent-ils pas infecter toutes les cellules ou tous les hôtes?
trois conditions a remplir pour dire que virus a “infecté”, et ainsi assurer sa survie;
- Virus doit pourvoir entrer dans la cellule hote
- Une fois virus entré, cellule doit posséder machinerie cellulaire approprié pour lui permettre de se répliquer
- Une fois répliqué, virus doit pouvoir être libéré de la cellule
Unité de mesure de la taille des virus? relativement petit ou gros en comparaison d’autres microorganismes?
En nanomètre; très petits
V/F: Plus un virion est gros, plus il est complexe.
En général, vrai
- plus gros génome encodant pour plus de protéines
Décrit la structure et composition de la particule virale. (génome, couches)
Génome compris dans une couche de protéines, la capside.
Génome d’Acide nucléique + capside = nucléocapside
avec ou sans enveloppe (membrane et glycoprotéines)
V/F: Tous les virions ont une nucléocapside.
Vrai
V/F: Tous les virions ont une enveloppe.
Faux
Trois formes que peut avoir la nucléocapside d’un virion?
- Icosahédrique
- Hélicoidale
- Complexe
2 types de génome d’Acide nucléique qui peuvent composer le virion? diff?
ADN:
- Simple ou double brin
- linéaire ou circulaire
OU
ARN:
- Simple brin (polarité + ou -)
- Double brin (polarité +/- ou double sens)
- Segmenté ou non
Quelle est la couche la plus externe d’un virus? fonction?
Capside (si virus pas d’enveloppe) ou l’enveloppe (si virus la possède)
Fonction de couche la plus externe:
- Constitue la structure, protection et véhicule de transmission du virus
Quelle structure permet l’interaction du virus aux cellules de l’hôte?
Structure présentes a la surface de la capside ou de l’enveloppe, via une protéine d’attachement virale (PAV) ou autre
On peut inactiver le virus en s’attaquant a quelle structure? Pourquoi?
Sa couche la plus externe (capside ou enveloppe)
- Contient les protéines d’attachement virale permettant interaction avec l’hote
- En brisant/attaquant cette couche, empenne interaction du virus avec cellules
C’est quoi la capside? composition? formes?
- Structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
- Composée de protéines
- Symétrique (icosaédrique ou hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)
Quelle capacité est conféré aux virus nu?
Enveloppé d’une capside (rigide, résistante)
- Résistance à la sècheresse, acidité et détergents (incluant acide et bile du tractus digestif)
- Mode de transmission
Décrit la formation de la capside icosahédrique.
- Sous-unités protéiques s’unissent en protomètres (triangles).
- Cinq potomètres s’unissent pour former capsomères/pentamères (5 cotés)
- Capside icosahédrique simple formée de 12 capsomères/pentamères
- Pour virions avec plus grosse capside, insère capsomères (hexons) entre les pentons
Décrit la formation de la capside hélicoïdale.
Sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former structure qui ressemble a un bâtonnet
Composition de l’enveloppe?
- Membrane composée de lipides, protéines et glycoprotéines (similaire membrane cellulaire)
- Glycoprotéines virales ancrées sur l’enveloppe, se projetant hors de surface du virion; les spikes
Que sont les spikes? fonctions possibles?
Glycoprotéines virales ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virions
Fonctions;
- Protéines d’attachement virale, capable de se lier a cellules cibles
- Antigènes majeurs, pouvant éliciter une immunité protectrice
- Autre
V/F: Les virus enveloppés sont difficilement inactivante en comparaison des virus non enveloppés.
Faux:
enveloppé facilement inactivé par sècheresse, acidité, détergents, solvants (survivent pas dans tractus digestif)
Transmission des virus enveloppés? pourquoi?
- Transmission par les fluides (sang, gouttelettes respiratoires, tissus)
- Car survivent seulement en solution aqueuse (doivent rester mouillées)
V/F: Les virus enveloppés comprennent une enveloppe et une capside.
Vrai
Selon quels facteurs peut-on classer les virus? catégories pour chaque système de classification?
- Acide nucléique: ARN ou ADN
- Simple brin ou double brin (si ARN, polarité +/-)
- Segmenté ou non segmenté
- Linéaire ou circulaire - Structure du virion
- Symétrie de la nucléocapside
- Enveloppé ou non enveloppé
- Nombre de capsomères
- autre
Détermine à quel rang de la hiérarchie taxinomique les terminaisons suivantes correspondent.
Hiérarchie taxinomique:
Ordre
Famille
Sous-famille
Genre
espèce
A) -virinae
B) -virus
C) -virales
D) aucun
E) -viridae
A) sous-famille
B) genre
C) ordre
D) espèce
E) famille
Nomme les questions qu’on se pose lorsqu’on classifie un virus à ADN.
- Simple ou double brin?
- Enveloppé ou non?
- Circulaire ou linéaire
Nomme les questions qu’on se pose lorsqu’on classifie un virus à ARN.
- Simple brin ou double brin? (si simple, + ou -)
- Enveloppé ou non enveloppé?
- Quelle symétrie (icosahedral, ou helical) ?
Qu’est-ce que la cellule hote apporte au virus lors de la réplication?
Agit comme une usine fournissant substrats, énergie et machinerie nécessaire a la synthèse des protéine virale et réplication. du génome.
Ce qui n’est pas fourni par hote est encodé dans le génome du virus.
Énumère les étapes de la réplication virale.
- Reconnaissance de la cellule cible
- Attachement
- Entrée de la cellule a travers membrane plasmique
- Décapsidation (libère génome dans hote)
- Synthèse des constituants viraux (4 sous-étapes)
- Assemblage du virus
- Bourgeonnement des virus enveloppé
- Relache du virus hors de la cellule
Décrit la phase de reconnaissance et attachement a la cellule cible lors de la réplication virale.
PAV ou autres structures de surface des virus se lient à des récepteurs cellule hote
- Spécificité au type de cellule
- Spécificité à l’hôte
Les cellules susceptibles ciblées par les virus définissent quel aspect du virus? des exemples?
Le tropisme (spécificité) tissulaire
- Virus penumotropes
- virus fermotropes
- virus viscérotropes
- virus neurotropes
Nomme deux exemple de PAV et de récepteurs sur la cellule hote.
- VIH
- PAV: glycoprotéine 120 (gp120)
- récepteurs: CD4 et coréceptuers chemines sur lymphocytes T - Influenza A
- PAV: hémaggutinine gp (HA gp)
- Récepteurs: acides salique des cellules épithéliales
Décrit comment se produit l’entrée du virus dans la cellule par les virus enveloppés vs non enveloppés.
- Non enveloppé:
- principalement endocytose médiée par un récepteur - Enveloppé:
- Fusion des membrane du virus et de l cellule cible (précédée ou non d’endocytose)
- nucléocapside ou génome viral ensuite relâché dans cytoplasme.
Décrit l’étape de décapsidation, diff entre génome d’ADN et ARN? exceptions?
Après internalisation, nuclocapside doit arriver au site de réplication et se rompre.
- Génome ADN: transporté au noyau (exception, poxvirus)
- Génome ARN: reste dans cytoplasme (exceptions: orthomyxovirus et rétrovirus)
Nomme les 4 sous-étapes de la réplication virale de la synthèse des constituants viraux.
- Synthèse ARNm précoce et protéines non- structurales
- Réplication génome
- Synthèse ARNm tardif et protéines structurales
- Modifications post-traduction de la protéine
Diff entre synthèse des constituants viraux pour virus a ADN vs ARN?
- Plupart des virus a ADN utilisent les polymérases de la cellule hote pour synthétiser ARNm, dans noyau
- Plupart des virus a ARN se répliquent dans cytoplasme; encodent eux-memes les enzymes nécessaires a leur transcription et réplication (car hote a pas le nécessaire pour répliquer ARN)
- BEAUCOUP ERREURS ARN
Décrit l’étape d’assemblage du virus.
- Site et mécanisme d’assemblage dépend d’ou réplication a eu lieu et si structure finale enveloppé ou non
- Virus a ADN: assemblés dans noyau
- Virus a ARN: assemblé dans cytoplasme - Capside virales soit
- assemblées, puis remplies du génome ou
- assemblées autour du génome
Quels virus passent-par l’étape du bourgeonnement? décrit cette étape.
Viru enveloppés:
- ARN, bourgeonnent membrane plasmatique (emprunte partie membrane) sans tuer cellule
- d’autres virus acquièrent leur enveloppe du réticulum endoblastique et appareil de Golgi
Quel avantage est conféré aux virus qui bourgeonnent?
Lorsqu’ils acquièrent membrane et sorte de cellule, confère une certaine immunité, car système immunitaire pourrait les reconnaitre comme particule de soi
Comment les virus sont relâchés hors de la cellule? méthode plus emprunté par virus enveloppé vs non enveloppé?
- Lyse cellulaire
- exocytose
- bourgeonnement
si bourgeonnement cytoplasme, ranch par lyse ou exocytose
- enveloppés: bourgeonnement membrane plasmatique
- nus: lyse cellulaire
Nomme des mode de transmissions des virus. (8)
- Aérosols
- Ingestion nourriture et eau contaminées (fécale-orale)
- fomites (objet inanimé)
- contact fient avec sécrétions (gouttelettes)
- contact sexuel
- sang contaminé ou transplant d’organe
- zoonose
- de la mère a l’enfant (transmission verticale)
Le mode de transmission des virus dépend de quels aspects de ce dernier?
- Source du virus
- Capacité du virus à endurer conditions de l’environnement du corps jusqu’a cellule cible
(présence d’une enveloppe ou non)
Mode de transmission virus enveloppés vs nus?
nus: résistance
- voie fécale orale, petites gouttelettes, poussières, main a main
- source fréquente: object contaminés
enveloppés: fragile, mouillés
- gouttelettes respiratoires, mucus, salive, sperme, sang, organe transplanté
Diff entre virus enveloppés et nu sur aspects suivants:
- composition couche externe
- résistance condition environnement
- faciliter de transmission
- sortie de la cellule
A)
Enveloppé: lipides, protéines, glycoprotéines
Nu: protéines
B)
Enveloppés: Labile (fragile)
Nus: stable
C)
Enveloppés: doivent rester mouillés
Nus: facilement transmissibles
D)
Enveloppés: bourgeonnement, +/- lyse (pas besoin tuer hote pour transmettre)
Nus: lyse cellule hote
Que signifie le fait que les animaux peuvent être des vecteurs?
Ils transmettent l’infection a d’autres animaux ou a des humains
Que signifie le fait que les animaux peuvent agir comme réservoir?
Maintiennent et amplifient le virus dans l’environnement
Diff entre zoonose et arbovirose?
Zoonose: maladie pouvant atteindre les animaux (ou insecte) et les humains
Arbovirose: infection lorsque les arthropodes (moustiques, tiques, mouches) s’agissent du vecteur de l’infection virale
Nomme des sources fréquentes associés a la transmission.
- ITSS asymptomatiques
- Conditions de vie
- Travail//loisirs
- Styles de vie
- Fréquentation des garderies
- Voyages
Nomme 4 moyens avec lesquels on peut détecter/diagnostiquer infections virales.
- Cultures virales de cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaires (pu vrm utilisé)
- Détection du matériel génétique viral (TAAN), méthode de choix!!
- Détection d’Anticorps spécifiques chez hote infecté
- sérologie (sang) - Observation en microscopie électronique (labo de recherche seulement)
Nomme 3 moyens de controle des infections virales.
- Hygiène (lavage des mains, protection, distanciation)
- Vaccination (prévention)
- inactivés, vivants atténués, autre - Traitement antiviral
Nomme les 6 cibles potentiels du traitement antiviraux
essentiellement étapes du cycle de réplication virale.
- Inhibition de l’attachement du virus a la cellule
- Inhibition de l’entrée dans la cellule
- Inhibition de la décapsidation
- Inhibiteurs de la réplication du génome
- Inhibe enzymes responsables de l’assemblage du virus
- Inhibe enzymes responsables de relâchement hors de la cellule
Exemples de traitement antiviraux qui inhibe l’attachement du virus a la cellule?
- anticorps neutralisants
- antagonistes de récepteurs spécifiques
Pourquoi l’inhibition de la synthèse de l’ARNm n’est pas une bone cible de traitement antiviral?
Difficile d’inhiber ARNm du virus sans inhiber ARNm de la cellule hote
Nomme des exemple d’inhibiteurs de la réplication du génome dans le traitement antiviral.
- Analogues nucléosides
- se lient facilement a polymérase virale, inhibe réplication virale par arrêt de l’élongation d’ADN ou ARN
- bon car enzymes différentes de l’enzyme de l’hôte - Analogues non nucléosides de la polymérase
- se lient de façon non compétitive a des sites autre que celui du substrat
Décrit le mécanisme d’action de l’analogue nuclosidique de la polymérase du VIH.
- Analogue de la cytosine: compétition avec substrat naturel
- Tri-phosphorylation par des kinases des cellules de l’hote
- Incorporation de l’analogue nucléosidique triphosphorylé dans chaine d’ADN virale.
- résulte en la terminaison de l’élongation de la chaine
Nomme un exemple d’inhibition de l’assemblage du virus.
Inhibiteurs de la protéase du VIH (enzyme essentielle a l’assemblage du virus)
Nomme un exemple d’inhibition du relâchement du virus hors de la cellule.
Inhibiteurs de la neuraminidase de l’influenza A et B (enzyme permettant au virus d’être libéré hors de la cellule)