Microbio- Microorganismes Flashcards
Def taxonomie?
Identification, classification et nomenclature (des microbes)
Nomme les rangs taxinomique du plus large au plus précis.
Vie
Domaine
Règne (kingdom)
Embranchement (phylum)
Classe
Ordre
Famille
Genre
Espèce
Que regroupe le terme microorganisme/microbe? Nomme leur caractéristiques communes.
Bactéries, virus, mycètes, protozoaires
- Organismes très petits de taille
- Omniprésence et abondance dans la nature
- Unicellulaires
- Niveau d’organisation relativement simple
- Inclut des procaryotes et eucaryotes
- Disposent d’un potentiel métabolique (sauf virus)
- capable de se reproduire de façon autonome (sauf virus)
Qu’est-ce qui différencie les cellule sprocaryotes des cellules eucaryotes?
Procaryotes: sans noyau, généralement 1 chromosome
Eucaryotes: avec noyau, plusieurs chromosomes
Caractéristiques du domaine bactéria? (cellules, membrane, paroi, où)
- Cellules procaryotes
- Membrane cytoplasmique: phospholipides
- Paroi cellulaire: peptidoglycane
- Unicellulaire
- eau, sol, sys digestif
Caractéristiques du domaine archaea? (cellules, membrane, paroi, où)
- Cellules procaryotes
- Membrane: étherlipides
- Paroi: pseudopedidoglycane
- Unicellulaire
- Vivent en conditions extrêmes (méthanogènes, halophiles (sel), thermophile (chaud))
Caractéristiques du domaine eucarya? (cellules, règne)
- Cellules eucaryotes
- unicellulaire ou pluricellulaire
- règne: protistes, mycètes/Fungi, plantes, animaux
Décrit la nomenclature d’un organisme.
2 mots: genre suivi de l’espèce, toujours mis en italique. le genre commence toujours par une majuscule
V/F: les bactéries et archée n’ont pas de règne.
vrai
Où se situent les virus et les prions parmi les microbes?
Virus:
- Aucun des trois domaines, ni des règnes.
- Cellulaires, non vivants (nécessite une cellule hôte qu’assure leur réplication)
Prions:
- Protéines, non vivants
- Nécessite hote pour reproduction
Décrit les bactéries selon les caractéristiques suivantes:
- Noyau/matériel génétique
- Organelle
- Reproduction
- Vie?
- Pas de noyau, matériel génétique dans cytoplasme
- pas d’organelles
- Possèdent ADN et ARN, réplication autonome
- Vivent dans ou a l’extérieur des cellules de l’hôte infecté; parfois besoin de métabolites de ce dernier pour survivre
Décrit les virus selon les caractéristiques suivantes:
- cellule?
- Matériel génétique
- Réplication
- vie ou?
- acellulaire (non vivants)
- Matériel génétique contenu dans capside, soit ADN OU ARN
- Réplication par infection d’une cellule; libère leur matériel génétique; assure synthèse de leurs protéines par cellule hôte
- Vie dans cellules de l’hôte
Décrit les mycètes selon le scaractéristiques suivantes:
- type cellulaire?
- croissance comment?
- deux catégories? (a) reproduction b) formes, utilité, point négatif)
- Organismes eucaryotes
- tirent leur substances de matières organiques en décomposition
Levures:
- reproduction par bourgeonnement
- grande place dans industrie alimentaire et revalorisation des déchets
- infection
Moisissure:
- Forme filamenteuse ou dimorphe
- Industrie alimentaire et pharmaceutique
- dégradation des aliments, parfois toxique
Décrit les protozoaires selon les caractéristiques suivantes:
- type cellulaire
- règne
- vivent ou
- exemple d’infection/maladies qu’ils peuvent causer?
- Eucaryotes unicellulaire
- Protistes
- eau, sols humides, intérieur d’un organisme
- toxoplasmose, malaria, dysenterie amibienne
Quels sont les constutients interne des bactéries?
Cytoplasme
- contient les ribosomes
Ribosomes
- synthèse protéines
Matériel génétique
- ADN
- Plasmides (fragments ADN, transférable d’un microbe a l’autre)
Quelles sont les composantes structurales des bactéries? (9)
Membrane cytoplasmique
- enveloppe et retient le cytoplasme
Paroi
- enveloppe semi-rigide donnant sa forme a la bactérie
Capsule
- enveloppe visqueuse, appelée Antigène K, sérotype: désigne les diverses couches selon caractéristiques capsulaires
Glycolyx
- fibre polysaccharidiques a surface de certaines bactéries
- Adhésion aux surfaces et entre bactéries
Couche-S:
- couche de surface formé de protéines
- protection ou facteur de virulence parfois
Biofilm:
- protection, barrière physique (ex contre antibiotique)
- cellules bactériennes reliées entre elle via matrice extracellulaire (capsules, glycocalyx, couche-S)
Flagelle (facultatif)
- motilité
- protéines (flagellines), nomées Antigène H
Pili (facultatif)
- protéines (pillinnes)
- s’attacher a surfaces, sexualité (transfert de matériel génétique)
Spore
- Préservation matériel génétique (survie) en se débarrassant du reste
Qu’est-ce que le test de Gram permet de déterminer? Comment se déroule ce test?
Permet de déterminer si une bactérie est Gram + ou Gram - (composition de sa paroi), et ainsi, quel médicament est a administrer.
- Injecte un colorant bleu qui colore toute les bactéries (le peptidoglycan, qui est commun a toutes les bactéries (épais Chez +, mince Chez -)
- Attends, puis injecte un colorant rouge, qui lui pénètre et ira colorer la membrane externe des Gram -, car eux ont une couche de lipopolysaccharides en plus (Antigène O)
Décrit les termes suivants;
Monotriche
Lophotriche
Amphitriche
Péritriche
Quant au nombre et a la disposition des flagelles ur les bactéries.
- Monotriche: un seul flagelle a une extrémité de la cellule
- Lophotriche: plusieurs flagelles a une extrémité de la cellule
- Amphitriche: un ou plusieurs flagelles aux deux extrémités de la cellule
- Péritriche: des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule
Décrit le processus de sporulation et germination des bactéries.
Lorsque conditions environnementales devient défavorables: matériel génétique dans spore formée par bactérie
Lorsque favorables: bactérie reprends sa forme active via germination
Que représentent les antigènes suivants: H, K, O?
H: Flagelles
K: Capsule
O: Endotoxine (couche de lipopolysaccharides des Gram -)
Classe les composantes des bactéries suivantes selon si elles sont obligatoires ou facultatives.
Paroi
Spore
Capsule
Membrane plasmique
Ribosomes
Chromosomes
Pili
Granule
Flagelle
Cytoplasme
Plasmide
Endotoxine
Obligatoires: Paroi, membrane, cytoplasme, chromosomes, ribosomes
Facultatif: Capsule, endotoxines, plasmide, flagelle, pili, spore, granule
Diff entre phénotype et génotype? Leur but commun?
L’étude des caractères phénotype et génotypes permet l’identification des bactéries
phénotypes:
- ensemble des caractéristiques découlant du génotypes (morphologie, observable)
génotype:
- contenu en matériel génétique d’un microbe
Nomme des outils/domaines scientifiques de classification et d’identification des microbes.
Morphologiques
biochimiques
phsyico-chimiques
sérologique
protéomique
génétique
Quels sont les formes possibles des bactéries?
Batonnets (bacille):
Sphère (cocci):
Entre deux (coccobacilles):
Virgules (vibrio):
Spirale (spirochètes):
Variable (pléimorphes):
Quels sont les arrangements spatiaux possible d’observer des formes de bactéries?
Isolé
Paires
Chainettes
Paquets organisée en cubes
amas désorganisés
Comment nomme-t-on l’aspect de bactéries qui croissent sur des milieux de cultures gélosées? Comment ceci peut servir a distinguer les espèces (quels caractéristiques)?
colonie
Selon la forme (circulaire, irrégulière, filamenteuse, rhizoide)
l’Élévation (ékevée, convexe, plate, pointe
la bordure (entière, ondulée, frisée, lobée)
La surface (lisse, luisante, crémeuse, mate, rugueuse)
l’opacité (transparente, opaque, translucide)
la pigmentation (diverse couleur, blanc)
3 types de coloration? diff?
Simple
- faire ressortir cellules en entier
Différentielle (ex, Gram)
- coloration primaire CRISTAL-VIOLET, que tous absorbe (peut ajouter iode pour mordant, meilleure coloration), lave (décolore certaines seulement), puis autre coloration pour mettre en évidence les délavée SAFRANINE
- différencier espèces
de structures spécifiques
- capsule (encre de chine)
- endospore
- flagelles (nécessite mordant_
Trois types d’observation microscopique?
Optique, confocale, électronique
Nomme 4 manières dont on peut utiliser la microscopie optique.
Champ clair: courant, cellules foncées sur fond lumineux brillant
Champ fond noir: spécimen non coloré apparait clair sur fond noir sans lumière
Contraste de phase: augmenter le contraste entre structures d’épaisseur variées, détails structure internes de smicroorganismes
A fluorescence: immunofluorescence, le marqueur est couplé a un anticorps qui reconnait structure recherchée
Décrit la technique du microscope confocale
Usage de fluorochrome et laser qui traverse le plan, clarté 40% que microscope optique
Décrit la technique/l’image de la microscopie électronique.
Échantillon traversé par faisceau d’électrons se déplaçant sous forme d’ondes
Image de très grande résolution
Test biochimiques: Utilité? API? Ajd?
Pour identifier les bactéries une fois leur croissance obtenue en culture pure
Auparavant: API:Languettes munies de cupules dans lesquelles ont déshydrates des substrats. ajoute goutte d’échantillon bactérien dans cupule, puis incubation 4-24h. permet enzyme de réagir, donne couleur caractéristique d’une bactérie.
Ajd: robotisé, test dans microplaques avec divers réactifs. Pour chaque rangé, score - ou + si réagit. Résultat donné par ordinateur sour forme de code chiffré, correspondant au phénotypes spécifiques permettant d’identifier espèce bactérienne.
Décrit la technique d’identification des bactéries par MALDI-TOF.
Permet d’analyser en qq minutes des colonies. Prend colonie, mélange avec matrice chimique pour favoriser ionisation des protéines et faire frottis qui entreara dans chambre d’ionisation. Laser ionise le frottis, temps de vol des ions est mesuré, produisant spectres masse/charge. ceux ci sont comparés a base de donnée, permettant l’identification des bactéries.
2 types de tests pour dtecter infection? diff?
Tes sérologique: détection d’Anticorps spécifiques permet de savoir si infection depuis au moins un certain temps
Test antigénique: détection d’Antigène microbien permet de savoir si infection actuellement
Nomme 3 test immunologique
Test d’agglutination sur lame
Méthode ElISA
Test immunochromatographiques rapide
Qu’est-ce que le test d’agglutination sur lame? permet?
Tets antigénique permet de distinguer différentes souches d’une meme espece.
incorporation d’échantillons d’une colonie dans les gouttes de solutions salines de différentes lames. Ajoute ensuite un antisérum sur chaque lame. Bactéries s’agglutinent et forme des grumeaux si correspondent aux anticorps d’un antisérum.
Qu’est-ce que la méthode Élisa? permet?
Permet soit de rechercher antigène dans échantillon donné ou de rechercher des anticorps formé contre cet antigène.
Immobilisation d’un anticorps (ou antigène) dans le fond d’une plaque qui réagira avec antigène (ou anticorps) recherché dans le spécimen qu’on répand ensuite dans la plaque. Si antigène compatible, il se fixera a l’anticorps. Puis ajoute agent révélateur pour mieux visualiser lien (inversement avec l’anticorps)
Nomme 2 méthodes d’identification par test génotypiques.
Séquençage de l’ADN
diagnostic moléculaire par TAAN. (test d’Amplification des acides nucléiques)
Comment peut-on identifier une bactérie a partir de TAAN?
Lorsque,une séquence génétique a été identifiée, on utilise des sondes génétiques (courts segments d’ADN complémentaires a la séquence donnée). ces oligonucléotides sont incorporés dans trousses commerciales, permettant la détection de la bactérie recherchée.
