Virologi Flashcards
1
Q
Vad är skillnaden mellan ett “naket” virus och ett höljeförsett virus?
A
Ett “naket” virus innehåller inget hölje. Ett virushölje består av cellens plasmamembran. Fäst på höljet finns virala höljeproteiner, glykoproteiner.
2
Q
Vilka fyra “effekter” har virus på de celler som infekteras?
A
- Virus kan påverka den invaderade cellen att bli tumörcell genom att immortalisera cellen. Exempelvis herpesviruset Epstein-Barr (EBV) 2. Viruset kan orsaka lys i infekterade cellen - viruset frisläpps då. 3. Viruset kan orsaka persistent infektion, där viruset långsamt släpps ut. 4. Viruset kan orsaka latent infektion, finns i cellen men ger ingen skada. Kan vid senare tillfälle aktiveras. Exempelvis herpesvirusfamiljen.
3
Q
Hur definieras en virulensfaktor?
A
En virulensfaktor är en specifik egenskap som mikroorganismen har, som ger upphov till dess virulens i cellen. 1.
4
Q
Ge några exempel på några virulensfaktorer och deras funktion
A
Adhesionsfaktorer (höljeprotein), dvs cell-receptorbindande strukturer. 2,3: Invasionsfaktorer, viroporiner: cellmembran-penetrerande mekanismer (fusion, endosomfrisättning) och avklädning 4,5,6: Repliakationsfaktorer/Transkription och translation: nya enzymer, resistensfaktorer (viral mRNa transkription), translation av nya virala proteiner som cytotoxiska enzymer, immunmodulerande faktorer, toxiner. 7. Uppbyggnad av nya viruspartiklar - assembly 8. Frisättningegenskaper: egress - avknoppning eller lytisk (båda finns också)
5
Q
Vad är ett virion?
A
Den fysiska viruspartikeln
6
Q
Vad består viruskärnan av?
A
Nukleinsyra (DNA eller RNA) omgiven av en tät proteinstruktur
7
Q
Vad är en kapsid? Hur kan en kapsid vara uppbyggd?
A
En kapsid består av enskilda proteinmolekyler som arrangerats runt nukleinsyran. Kapsiden kan vara stavformad eller rund. De stavformade virusen är helikala - sprialvridna, de runda är ikosahedrala.
8
Q
Vad är en kapsomer?
A
De proteinenheter som bygger upp kapsiden.
9
Q
Vad är en nukleokapsid?
A
Virusgenom + kapsid (proteinskalet)
10
Q
Hur förökar sig ett virus?
A
- Viruset fäster vid värdcellens yta (attachment) 2. Viruset penetrerar in i värdcellen (penetration) 3. Kapsiden faller sönder och genomet frigörs (uncoating) 4. Replikationen äger rum (replication) 5. Generna expresseras (gene expression) 6. Nya virus fogas ihop (assembly) 7. Maturation = mognad (maturation) 8. Virus frigörs från värdcellen (release)
11
Q
Vad kännetecknar paramyxovirus?
A
Paramyxo: stor virusfamilj. Ebola: blödarfebervirus, mässlingvirus, respiratoriska infektionsvirus - är ofta paramyxovirus. Enkelsträngade RNA virus. Kapsid omkring sig, helikal struktur. Utanpå matrixprotinen och yttre höljeprotein. Finns total 8 proteiner hos mässlingsviruset. Sex av dessa är strukturella, oumbärliga för strukturen. 2 som är icke-strukturella. Man blir “prickig”.
12
Q
Hur sprider sig mässlingsviruset? (paramyxo)
A
Klär av sig inne i cellen så arvsmassan blir fri. Här måste RNA-polymeraset transporteras in i cellen ihop med viruset. Härefter sker translation till nya virala proteinet, också en replikation - inte bara till +RNA utan också vidare så det kan packas in i nya kapsider. Allt sker i cytoplasman. Behöver inte ta sig in i cellkärnan. Kan knoppas av i visas celler eller orsaka lys i andra. Detta virus har en bred celltropism - valt en receptor som är vanligt förekommande i många celler - kan därför sprida sig systemiskt. (CD150 till fusionsproteinet eller haemagglutinin)
13
Q
Vilka är de tre stegen i mässlingsinfektionen?
A
- Primär infektion. Binder till DC-SIGN i luftvägarna. Dendritiska celler är rika på DC-SIGN och infekteras därför ofta. Även CD150+ lymfocyter. Dendriterna vandrar sedan till närliggande lymfvävnad. 2. Systemisk spridning. Viruset sprids till B-celler och minnes T-celler. 3. Utdödning av immunceller i lymfvävnader och andra vävnader resulterar i mässlingskaraktäristiska röda utslag.
14
Q
Varför är man immunsupprimerad efter en mässlingsvirusinfektion?
A
Man slår ut T-cellerna, minnescellerna försvinner (30-80%) för även andra infektioner än mässlingvirus. Immunsupprimerad och mottaglig för efterkommande andra infektioner.
15
Q
Vilka komplikationer kan uppstå efter primär mässlingsinfektion?
A
ADEM: Neurotrop: söker sig gärna upp till hjärnan där det åstadkommer ännu större skada. Antimyelinriktad immunitet - demyelisering - sensoriska eller nervskador MIBE: Fokala “seizures” (anfall) med ibland synnervsförlust eller hörselpåverkan SSPE: Degenerering av hjärnceller. Lång tid.
16
Q
Vad ingår i barnvaccinationsprogrammet?
A
Vaccination: barnvaccinationsprogrammet: mässling, påssjuka och rödahund. Mässlingvaccin: Godartat variant av viruset: ger feber och god immunitet. (Inom barnhälsovård och elevhälsa erbjuds barn och ungdomar vaccinationer som ger skydd mot tio sjukdomar: rotavirusinfektion, polio, difteri, stelkramp, kikhosta, infektioner orsakade av Haemophilus influenzae typ b, mässling, påssjuka och röda hund och allvarlig sjukdom orsakad av pneumokocker. Flickor erbjuds även vaccin mot humant papillomvirus (HPV))
17
Q
Beskriv virusreplikationens fäste/attachement
A
Fäste/attachment är en specifik bindning mellan virala kapsidproteiner och specifika värdcellreceptorer. Denna specificitet bestämmer värdurvalet för ett virus, exempelvis så kan HIV bara infektera en liten mängd leukocyter.
18
Q
Beskriv virusreplikationens penetration
A
- Penetration: Binding till receptorn kan leda till att virala lipidmembranet fuserar med värdcellsmembranet, eller att det sker en receptormedierad endocytos, alternativt som hos bakteriofager kan viruset injicera sitt genom i värdcellen.
19
Q
Beskriv virusreplikationens uncoating
A
Uncoating: kapsiden tas bort. Genom värdcellen enzymer, virusets enzymer eller dissociering. Nukleinsyran blir fri.
20
Q
Beskriv virusreplikationens “replikaiton”
A
Replikation: virus replikerar sig genom att multiplicera sitt genom. Här kan också mRNA syntetiseras, virala protein likaså.
21
Q
Beskriv virusreplikationens assembly
A
Assembly: Modifiering av proteiner. Mognad
22
Q
Beskriv virusreplikationens frisläppning
A
Frisläppning: frisläpps av värdcellen genom lys. En process som innebär att cellmembranet spricker (och cellvägg om det finns). Virus kan också ingå i en lysogenisk cykel där de inkorpereras i värdcellen kromosom där genetisk rekombination sker. Viruset kallas nu ett provirus och när värdcellen delas så delas också det virala genomet. Vid någon tidpunkt kan viruset bli aktivt och göra att värdcellen lyserar.
23
Q
Hur skiljer sig hastigheten med vilket ett virus kan verka genom dess olika genomstrukturer?
A
DS DNA måste bara ta sig in i cellkärnan SS DNA måste bli DS först innan de blir protein +RNA är snabbast på att bli transkriberade till proteiner -RNA som influensa, måste först göra om sig till plus, är beroende av Rnase för att bli + Dubbelsträngat RNA: kan direkt läsas av och ge upphov till protein
24
Q
Hur skiljer sig platsen var ett RNA kontra DNA virus förekommer?
A
DNA virus är välanpassade till våra cellkärnor. RNA virus stannar istället gärna i våran cytoplasma eftersom det finns ribosomer som tar hand om RNA.
25
Vad är en zoonos och ge ett exempel på ett zoonosvirus
Zoonoser: influensa A - den som finns i naturen. Sjöfågel bär influensa A naturligt Zoonos: smittar mellan människa och djur Grisar delar vi frekventast influensa med. Exempelvis svininfluensa.
26
Ge exempel på ett rent humant virus.
Influensa B är rent human.
27
Vad är ett retrovirus och hur fungerar det?
Retrovirus är ett dimer RNA-virus med hölje. Använder sig av Rnase för att göra om RNA strängen till DNA och på så sätt kunna inkorperera sig i värdcellens DNA. Dessutom görs det virala proteiner som bidrar till förökning av viruset. Det virala transkriptaset som används vid transkriptionen av viralt DNA i cytosolen har ingen "proof-reading", vilket gör mutationer mer sannolika och därmed slumpmässig resistens.
28
Nämn 3 karaktäristika för retrovirus.
1. Lipidhölje. 2. Dimer-RNA 3. Proteiner: GAG-proteiner, proteaser, Pol-proteiner och ENV-proteiner.
29
Hur gör HIV viruset för att fästa till en värdcell?
HIV binder till CD4 molekylen. Sedan bildas ett komplex med HIV höljet, CD4 molekylen och en kemokinkoreceptor. Därefter fuserar virushöljet och cellmembranet.
30
Hur gör herpresviruset för att ta sig in i värdcellen?
Herpesviruset fäster till kolhydratsstrukturen: glykoprotein C, sedan D och tillslut har den tagit sig så nära att den smälter samman med cellens plasmamembran, då kan viruset glida in i cellens cytoplasma. Viruset kan via importiner ta sig genom nukleoporerna och in i cellkärnan.
31
Hur kan virus sprida sig?
Lokalt från platsen: vårtvirus Via blod eller nerver: hepatit B,XC; poliovirus, Rabies, HIV Hud: Papilloma, herpes simplex typ 1 Urin: Hepatit A Sexuellt: Hepres simplex typ 1, HIV, HPV, Hepatit B och C
32
Vad innebär head up/ heads down konformationsändringen i paramyxovirusets (mässling) glykoproteiner?
Glykoproteinerna (HN/H/G) på virusets cellyta är antingen i en så kallad "head's up" komformation eller heads down. När dessa binder till receptorer på värdcellsmembranet så ändrar de formation från up till down och vice versa. Detta gör att fusionsproteinet antingen associerar eller dissocierar och därmed aktiveras vilket leder till fusion.
33
Hur förhåller sig mässlingRNA i kroppsvätskor?
Blod \> Saliv \> Ögonvätska \> Urin \> Hud
34
Vad beror utslagen på i infektionsförloppet hos mässlingsviruset?
Utslagen uppstår samtidigt som virala utrensningen börjar, vilket tar ungefär en vecka från första utslaget. Det är alltså mässlingsspeicifka T-celler som tar sig till huden och rensar infekterade celler, vilket ger upphov till röda utslag.
35
Vad är första tecknet på mässlingsviruset?
Första tecknet är "the prodrome" som är ospecifika symtom (klåda, hosta, feber etc). Ett vältränat öga kan dock också se små vita prickar i munnen på kindslemhinnan, dessa kallas Koplik fläckar, och kommer före utslagen med ett par dagar och är väldigt mässlingsspecifika.
36
Vad är de tre symtomförloppen hos mässling?
1. Prodrom med Kopliks fläckar. 2. Röda utslag. Första utslag korresponderar med högsta viremin. 3. Immunsuppresion - kan ge sekundära komplikationer.
37
Vad har mässlingen för celltropism?
Bred! Epitelceller i kärl, B- och T- minnesceller, makrofager och DC. Glia- och astrocyter i CNS.
38
Vilken är den näst vanligaste humana virala sjukdomen efter influenza och förkylningsvirus?
Herpes
39
Vilka virus ingår i Alfaherpesvirus? Hur brukar de uttrycka sig och var?
Alfaherpesvirus. Neurottropa. Herpes simplex typ 1 och typ 2. Munblåsor, genitala blåsor. Bred tropism. Heparansulfat - som finns på många epitelceller. Lytisk cykel - går in, förökar sig och sedan brister den. Kan den passera slemhinnan i en nervände - letar den gärna till nervcellens sensoriska ganglion - latent där.
40
Vilket är det vanligaste gammaherpesviruset? Vilka är målceller
Gammaherpesvirusgruppen: Epstein-Barr vanligaste - human herpes 4. Våra B-lymfocyter och epitelceller är målceller. EBV sprider sig genom saliv: kissing disease. Herpes typ 8 - tumörorsakande- hittas ffa hos cancerpatienter och HIV-patiener. Nästan exklusivt B-cellsinfekterande. Onkogen - kan transformera till B-cells lymfom.
41
Ge ett exempel på ett betaherpesvirus och vilka som är särskilt utsatta för dessa virus.
Betaherpesvirus: cytomegalovirus - förvärrar sjukdomar. Livsfarliga hos väldigt unga (nyfödda) eller gamla. Monocyter eller lymfocyter. Långsam: två veckor. Mer restriktiv. Föredrar lymfocyter att infektera. I mikroskop syns syncytium - smälter samman i nästa cell - cytomegala celler - multinukleära. Latens utvecklas i sekretoriska kärl i makrofager eller monocyter. Herpes typ 6 - får man när man blir pussad av föräldrar. Herpes typ 7 - T-cellstransformerande virus.
42
Vad är strukturen hos ett herpesvirus?
1. Dubbeltsträngat linjärt DNA (hade den varit "supercoilad" hade den fungerat sämre, nu kan den istället läsas av effektivt) 2. Ikosahedral kapsid 3. Teugment: kluster av proteiner som hjälper till med DNA-replikation och undvika immunförsvar. 4. Yttre lipidhölje med glykoproteiner (gB-gN).
43
Hur skiljer sig alfa-, beta- och gammaherpesvirus?
Alfa har snabb replikation jämfört med beta och gamma som har långsam replikation. Alfa har bred tropism, beta mindre bred och gamma starkt begränsad värdcellsbredd. Alfa är typiskt lyserande och latens sker i sensoriska ganglier, medan betaherpesvirinae ger cytomegalia (förstorade) celler och latens. Gamma etablerar och latens (B-celler eller T-celler)
44
Hur fungerar attachment och entry för HSV?
Hugger tag i heparansulfat (med gC/gB) - sedan nästa receptor - sedan ett coreceptor - tillslut kan den smälta samman med cellmembranet och där nå cellkärnan - eftersom det är ett DNA-virus!
45
Hur fungerar herpesvirusets replikation?
1. Efter entry i värdcellen så tar sig (DNA)viruset till nukleus, där det börjar producera immediate early proteiner, alfaproteiner. 2. Dessa tar sig delvis tillbaka till kärnan och hjälper till vid genomreplikationen och dessutom sker ytterligare proteinproduktion - earlyproteiner/betaproteiner 3. Strukturella proteiner (late/gammaproteiner) produceas och mognad av nya viruspartiklar sker genom ER och Golgi. 4. De färdiga viruspartiklarna kan antingen lysera cellen och frisäppas, genomgå exocytos och frisläppas eller föras över till intilligande cell med cell-cell relase.
46
Hur kan hepresviruset mediera immunsuppression?
1. Genom att interferera med MHC klass I molekylen. Detta görs olika hos olika heprestyper. Epstein-Barr virusproteiner blockerar proteasomen och därmed nedbrytningen och antigenpresentationen av virus på MHC-I. Herpes simplex blockerar TAP-systemet (Kanalen mellan TAP-1 och TAP-2), vilket blockerar transporten av virala peptider till ER. HCMV blockerar energileverans till TAP-systemet. 2. Genom att producera virala cytokinhomologer. Dessa fungerar antingen antiinflammatoriskt eller tillväxtfrämjande för virusets målceller.
47
Vad kännetecknar Epstein-Barr viruset och vad är dess funktioner?
B-lymfocytvirus - latent i minnes B-celler. Symtom är trötthet, feber, svullna lymfkörtlar, inflammerad hals/slavg, utslag i hud, förstorad mjälte och lever. Spridning sker via saliv: kissing disease. T-celler är viktiga för begränsning av proliferation avB-celler som kontrollerar sjukdom, EBV manipulerar detta genom producera IL-10 homolog för produktiv infektion som inhiberar protektiv Th1 respons. Kan orsaka lymfom eller carcinom. Kraftigt förhöjda CD 8+ T-celler.
48
Hur verkar Epstein-Barr viruset?
Infekterar epitelet. Är en lytisk infektion. B-cellen går inte i lys först! Utan den krackelerar och faller sönder när den reaktiveras. Epitelcellerna brister - virus kommer in i submukosan som infekterar B-lymfocyter som i sin tur blir angripna av T-celler. De B-celler som utvecklas till minnesceller brukar slinka undan och bli kvar som latenta celler. Bär viruset som en episomal-virusförvaring. Kan ligga där 50-60 år. Sedan händer något som reaktiverar Epstein-Barr, då får vi igång en delning och cellen brister och viruset sprids till omgvivningen.
49
Hur sker förändringen från latent infektion till lytisk infektion i Epstein-Barr?
Genom zebraproteinet BZLF1 (ett immediate-early protein) som snabbt samlar på sig transkriptionsfaktorer och bygger ihop ett komplex av molekyler som får igång avläsningen av de avslängda generna, man får en switch och produktion av nya viruspartiklar.
50
Hur fungerar latensen hos HSV-1?
Nervändarna blir infekterade efter primär infektion. DNA i sensoriska ganglier i nervceller, episomalt, ligger lantent i 10-tals år, ibland ett helt liv. Något triggar den, produceras virus - transporteras längs nervtrådarna. Beroende på hur de är förgrenade hamnar de på hudytan, läppen, ögat och vi får ett nytt skov av infektion.
51
Vad kännetecknar familjen herpesvirus? (Sammanfattat)
8 olika dsDNA virus. Akut infektioner som etablerar "immun evasion", latens (neruon, B/T-celler, monocyter) Reaktivering förekommer Behandling: antiviral (nukleosid, nukleotid) Vaccin finns endast mot VZV
52
Vad kännetecknar familjen retrovirus?
+ssRNA genom. Omvänt transkriptas. Genomisk integration - latens. Långsamma. Tropism för centrala immunceller.
53
Varför uppkommer diarré?
Uppkommer då för mycket vatten och salt aktivt transporteras ut i tarmen. Stor orsak till barnadödlighet i utv-länder.
54
Hur kan man se att en patient är uttorkad?
Man kan märka att patienten är "frånvarande" med blicken. Man kan också testa genom att nypa huden, ska gå snabbt tillbaka hos en hydrerad patient.
55
Hur sker reglering av vatten-saltbalansen i tunntarmen på molekylär nivå?
Sker på villi och i kryptan. Na/glukos co transrpoten (högst upp på villi) - Socker behövs för att ta upp salt - Därav för att ta upp mer vätska vid uttorkning måste glukos/na tas upp - Vatten diffunderar bara passivt, så måste ta in salt för att få mer vatten Cystisk fibros transmembrane regulator - Kloridkanal (med natrium) ut i lumen nere i kryptan Skickar ut elektrolyter lumen, om denna är defekt kommer inte heller vatten ut i lumen vilket kan ge förstoppning
56
Vad är det enteriska nervsystemet?
Fungerar fristående från CNS och innehåller lika många nerver som ryggmärgen. Kontrollerar motilitet, exokrin/endokrin sekretion, mikrocirkulation och immun- och inflammationsprocesser. Exempelvis: Mätta - hormoner i tarmen som skickar signaler till hjärnan Hjärnan förbereder tarmen för mat genom frisättning av enzymer etc
57
Hur verkar immodium?
Immodium kortsluter nerverna - ingen rörelse/tarmmotorik - ingen fysisk diarré.
58
Vad reglerar submukosaplexat?
Submukosaplexat reglerar upptag och sekretion av näringsämnen.
59
Det finns två typer av diarré, vilka?
1. Osmotisk diarré, orsakas av bakterier. 2. Sekretorisk diarré, orsakas av virus.
60
Vad innebär osmotisk diarré?
Bakterier koloniserar i tarmen - förstör enterocyterna som har som uppgift att ta upp näringsämnena. De enzymerna som finns på enterocyternas yta är förstörda - matprodukterna blir kvarliggandes i tarmen - utgör nu en osmotisk kraft, kroppen tar därför vatten från kroppen för att späda ut denna gradient - kroppen blir av med vätska.
61
Vad innebär en sekretorisk diarré?
Använder sig av ENS och kryptcellerna. En virusinfektion aktiverar ENS - denna aktivering leder till aktivering av kryptcellerna, det kommer blir stor utsöndring från kryptcellerna. Hormoner som är involverande: VIP. Öppning av kloridkanalen CFTR - cystic fibrosis transmembrane regulator fulltsändigt.
62
Ge exempel på två virus associerade med akuta gastroenteriter.
Rotavirus: vanligast bland barn. Norovirus: ger upphov till vinterkräksjukan. Adenovirus: DNA-virus, går att påvisa i elektronmikroskop.
63
Vilka celler påverkar Rotaviruset? Vad medför detta?
Rotaviruset påverkar bara mogna enterocyter, alltså aldrig celler nere i krypterna (omogna). Detta tros bero på antingen att det är en vattensekretion från krypterna med full fart uppåt, virus har svårt att simma motströms. Eller så beror det på att de omogna cellerna inte har receptorn på cellytan som viruset binder till och kräver för förökning, de kan därmed inte bli infekterade. Rotaviruset medför en väldigt lytisk infektion, cellerna dör snabbt. Omsättningen (nygenerationen) är dock så snabb att det inte blir någon effekt på näringsupptaget.
64
Vilket virus är orsaken till allvarlig diarré hos små barn över hela världen?
Rotaviruset är främsta orsaken till allvarlig diarré hos små barn över hela världen.
65
Finns det vaccin mot rotaviruset? Vad gör det?
Rotavaccination infördes i Sverige nyligen - för att begränsa sjukdomsbördan. Ingår i barnvaccinationsprogrammet. Levande vacciner. En symtomatisk infektion - ger skydd resten av livet till man är 65-70. I utvecklingsländer behöver man 2 st tidiga infektioner. Skyddar mot kliniska symtom, inte infektion!
66
Vad är problemet med oral administering av näringsämnen vid dehydrering?
Svårt att veta hur mycket vätska barnet faktist får i sig ifall barnet samtidigt/senare kräks upp det.
67
Vilka celler är involverade vid en kräkning? Vad är deras funktion och vilka ämnen medierar de med?
I tunntarmen finns en subpopulation av celler, enterokromaffina celler. Dessa frisätter 5-HT som är samma sak som serotonin. Dessa celler är senosorceller i tarmen. De känner igen salter, surt, toxiner, tryck när matprodukter passerar förbi. När de blir retade frisätter de serotinin. De här cellerna har mer serotinin än hjärnan har tillsammans. Serotoninet stimulerar ENS och sen vagus som vidare stimulerar bland annat kräkcentrat. Kräkcentrat skickar i sin tur ut signaler till buken att den ska dras ihop.
68
Vilken endogen nerutransmittor är viktig för mag-tarmfunktion?
Serotonin. Är inblandad i: GI-motilitet. Slemproduktion. Matintag. Sekretion. Kräkningar. Kemoterapiinducerat illamående.
69
Hur fungerar seratoninantagonister?
Blir ingen signalering när man ger 5-HT antagonister, blockerar naturligt serotonin att binda in, ingen stimulering av ENS som i vanliga fall frisläpper VIP som aktiverar kryptcellerna som utsöndra klorid vilket ökar osmosen och därmed vatten i tarmen och diarré.
70
Hur orsakar rotavirus sekretorisk diarré?
RV binder till receptorer på mogna enterocyter. Replikerar och frisätter virustoxinet NSP4 som stimulerar frisättning av 5-HT från enterochromaffina celler (EC). 5-HT binder till afferenta nerver och vidare till efferenta som frisläpper VIP vilket ökar cAMP och frisättning av Cl via CFTR (cystic fibrosis transmembrane regulator), ger osmotisk ökning av vatten i lumen -\> sekretorisk diarré.
71
Vilka tre områden kan 5-HT verka?
På det submukösa plexat - vattensekretion. På det myenteriska plexat: tarmmotilitet På CNS: illamående och kräkningar
72
Vilket virus ger vinterkräksjuka? Hur är det uppbyggt?
Norovirus. Är ett ssRNA virus.
73
Hur kommer det sig att vissa individer är resistenta mot norovirus?
FUT2-genen. Kodar för för ett enzym, fukosyltransferas, som sätter på en kolhydrat - fukos - på en receptor (H-antigen prekusor) vilket aktiverar den till H-antigen som virus kan binda till. Är man homozygot är den genen död. Blir inget enzym -\> kommer inte finnas något frukos (som binder till receptorn) och därmed kan inte viruset ta sig in i cellen.
74
Vad har luftvägarna för skyddsmekanismer?
Bortforslande av partiklar och mikrober från luftvägarna. Cilier flyttar svalda partiklar uppåt. Alveolära makrofager slukar och bryter ned partiklar, virus och bakterier. Hostningar.
75
Hur delas luftvägsinfektioner upp anatomiskt? Hur skiljer man dessa?
Övre och nedre luftvägsinfektioner. Till övre räknas mun och svalg ned till larynx. Under larynx är nedre luftvägarna, innefattar bronkit, bronkiolit, pneumoni.
76
Vad är en viktig faktor för hur allvarlig en luftvägsinfektion är?
Ålder spelar stor roll. Ett litet barn har tunnare luftvägskanaler och när en sådan blir inflammerad så finns det inte mycket plats för luft att passera ned.
77
Nämn 6 virus som orsakar primär luftvägsinfektion i människa?
1. Rhinovirus. Övre luftvägar. 2. Influensa: ortomyxovirus. (A,B,C) 3. Respiratoriskt syncytievirus (aggressivt för småbarns luftvägar). Är ett paramyxovirus. 4. Parainfluensa - paramyxo. 5. Coronavirus: SARS/MERS 6. Adenovirus. DNA-virus.
78
Vilket influensavirus var aktivt förra året/säsongen?
H1N1.
79
Vilka virus orsakar flest luftvägsinfektioner?
1. Influensa A och B 2. RSV - respiratoriskt syncytievirus 3 +4 = Rhino + Corona
80
Vad orsakade Spanska sjukan?
Influensa A, H1N1. Spanska sjukan 1918 hade en nordamerikansk gris som ursprung. 50 miljoner döda.
81
Hur sprider sig influensa A?
Via aerosol. Är en luftburen smitta. Bildas en myriad av vätskedroppar. 1-2 meter. Virusavgivning 1 dag innan symtom och framtill 5 dagar efter symtom.
82
Var sker antigenic shift?
Grisens influensavirus (grisen är naturlig bärare) anpassar sig genom att dela det med människa. Grisen får det humana viruset och grisinfluensan, i de celler som har båda virus - kan blandas om bland de åtta kromosomuppsättningarna och vips så har man helt nya varianter av influensa som är nykonstruerade - mot denna influensa har man ingen immunitet.
83
Vad påverkar spridning av influensa?
Luftfuktighet och temperatur spelar roll vid en ordentlig aerosolinfektion. Låg luftfuktighet och kallt gör att de kan sväva längre- 40 minuter. Vid över 80% sjunker de snabbt till marken - total blockad.
84
Vilka samhällsgrupper är mest utsatta vid influensainfektion?
Spädbarn/småbarn och åldringar/äldre. Även hjärt och lungsjukdomspatienter är en riskgrupp. Utbrott sker hos barn och ungdomar.
85
Vilket influensa ger upphov till lindrig övre luftvägsinfektion?
Influensa C. Influensa A och B orsakar epidemier och florerar samtidigt.
86
Vad är influensaviruset beroende av för att kunna verka?
RNA beroende RNA-polymeras. Måste ta med det in i värdcellen. Även ytproteinerna gemagglutinin (H) och neruaminidas (N)
87
Hur är influensaviruset uppbyggd?
Tillhör ortomyxoviridae. Genomet är ett -ssRNA, segmenterat i 8 segment. Är höljeförsett. Helikal kapsidstruktur.
88
Vilka cytokiner produceras vid influensa patogenes?
Interferon alfa (IFN-a) och interferon gamma (IFN-y).
89
Vilka symtom finns hos influensa?
1. Feber 2. Extrem trötthet Huvudvärk, ont i halsen, rinnande och täppt näsa, torrhosta, ömmande muskler, magproblem
90
Vilket protein finns endast hos typ A influensa?
M2-protein. Är en jonkanal som importerar vätejoner när viruset är inne i cellen.
91
Hur sker influensainfektionen?
1. Influensaviruset fäster till sialinsyrareceptorn via sina hemagglutinin-spikes. Viruset endocyteras/ smälter samman med endosomväggen via M2-proteinet. Uncoating. Influensan skickar sina 8 genomsegment till kärnan. -RNA-strängarna omvandlas till +, som sedan skapar virala proteiner som skapar kapsider och "spikes", som transporteras till cellmembranet där de fäster. +RNA användas också för att syntetisera nya -RNA, dessa sammansätts till nukleokapsider och transporteras ur kärnan mot cellmembranet. Moget virus avknoppas när alla komponenter samlats vid cellmembranet och vid avknoppningen tar viruset cellmembranet med redan fästa "spikes" som hölje.
92
Hur påverkas luftvägsvävnaden av virusinfektinen?
Epitelceller blir virusinfekterade och virusproducenter. 1. Stimulerar Toll-receptorer som leder aktivitet i blodkärl som vidgas -\> plasma läckage -\> inflammation -\> neutrofiler/NK-celler/T-celler/Eosinofiler. 2. Nervaktivering ger stressade lungor -\> snabbare andning. Via vagusnerven kan man också få diarréstimulering. 3. Luftvägshyperreaktivitet 4. Slemhypersekretion
93
Vilken cell är målcellen för influena i luftvägarna?
Kolumnära epitelceller i luftvägarna.
94
Vad menas om man säger att det sällan är influensan själv som dödar?
Influensan gör att cilierna blir bortrensade och barriärfunktionen försvinner. Detta underlättar för efterföljande infektion med streptokocker, stafylokocker etc. Dessutom är immunförsvaret nedsatt vilket ytterligare bidrar till en allvarlig bakteriell sekundärinfektion.
95
Vilka är influensavirusets virulensfaktorer?
Hemagglutinin - H är huvudvirulensfaktorn. N: har en plasminogenbindande förmåga, plasmin klyver H NS1: sänker cellens förmåga att producera interferoner.
96
Vad gjorde att influensan under spanska sjukan var så "effektiv"?
Spanska sjukans NS1 var väldigt effektivt mot cellens innata immunförsvar. Olika influensor har snabbare enzym, andra har klenare RNA-beroende RNA polymeras Vidare: Det riktig aggressiva med 1918 influensan var NS1 proteinet som kunde stänga av medfödda försvaret, genom att vara potent och resistent mot IFN och TNF. (Stänger inte av adaptiva immunförsvaret - därför fick unga värre vävnadsskador)
97
Vad innebär H0 och H1?
Höljeproteinet H är i sin ursprungsform uselt - hjälper inte viruset - behöver klyvas från H0 till H1 och H2. Detta kan virus normalt inte göra självt, vår kropp och våra miljöer i våra vävnader gör detta via plasmin och bakterier i vår normalflora som utsöndrar proteaser som hjälper till.
98
Hur är hemagglutinin uppbyggt?
Hemagglutinin är en trimer bestående av tre identiska monomerer. Varje monomer består av en HA0 polypeptidkedja med HA1 och HA2 regioner som länkas med disulfidbryggor. HA trimeren syntetiseras som inaktivt HA0 för att undvika oönskad fusionsaktivitet. Utöver detta finns det en "fusionspeptid", vilket är en region på HA2-regionen.
99
Hur fungerar den molekylära verkningsmekanismen hos hemagglutinin?
HA har en stor roll vid "entry". First så fäster HA1 domänet till sialinsyrareceptorer på värdcellen, vilket medför "attachment". (Även MHC-II kan vissa HA binda till). Värdcellen uppslukar viruset genom endocytos och skapar en intracellulär endosom. Värdcellen försöker sedan bryta ned delarna i endosomen genom att omvandla det till en lysosom, pHt sjunker. När pH minskat tillräckligt så sker konformationsförändringar: Fusionspeptiden släpps och binder till endosommembranet och HA1 dissocierar från HA2. HA2 får membranet att komma närmare varandra och fusera, när detta skett så släpps virusets RNA ut i cytoplasman och transporteras sedan till kärnan.
100
Hur klyvs hemagglutininet?
Hemagglutininet klyvs normalt extracellulärt, före infektion av ny cell. Proteas-tryptas Clara-liknande enzymer i luftvägsepitelet, enzymer från inflammatoriska celler eller från bakterier medierar troligen klyvning hos människa.
101
Vad är funktionen av N?
Hemagglutinin på nybildas virus fastnar på sialinsyrereceptorn i samband med att avknoppning ska ske från värdcellen. N förstör receptorn och viruset kan frisläppas. Lång stjälk på N gör ofta att detta kan ske effektivt, men beroende av H-konfigurationen kan den optimala N-konfigurationen variera. Viktigast är att H och N är anpassade efter varandra. Att inte alla H och N kombinationer finns i naturen kan bero på bristande möjlighet till konfigurationsanpassnig.
102
Vilket är första fösvaret mot virus?
IFN-a och IFN-beta är första försvaret mot virus. Blockerar proteinsyntes och virusförökning i infekterade celler och aktiverar antivirus-protiener i icke-infekterade celler så de blir mer resistenta.
103
Vilken funktion har influensaproteinet NS1?
NS1 blockerar IFN-produktion och signalering. Binder dubbelsträngat RNA (dsRNA) och döljer detta, gör att det inte blir någon stark IFN-produktion via dsRNA beroende signalvägar. NS1 blockerar PKR (det som stopppar proteinsyntesen) Blockerar även IRF (IFN-reglerande faktorer) vilket stoppar IFN-produktion
104
Hur påverkar NS1 dendritiska celler?
Ett effektivt NS1 kommer aktivera toll-receptorer vilket gör att DC kommer vara suboptimala vilket gör kommunikationen med lymfoida organ klenare -\> ger högre virusload i kroppen som skadar oss mer.
105
Vad är DC's roll i influensaimmunitet?
Står för det adaptiva immunsvaret efter presentation för T-celler och bildning av B-celler och T-celler. Antikroppar IgA och IgG från B-celler är effektiva. IgA i slemhinnor mest potenta.
106
Vilka T-celler är involverade mot influensa?
Th1 och Th27 producerar cytokiner som dämpar infektionen medan TC1 och TC17 dödar influensainfekterade celler.
107
Vilka antikroppar är viktiga mot influensa?
Antikroppar som känner igen HA och NA är viktiga. HA-specifka viktigast, kan neutralisera viruset.
108
Hur uppstår ett influensa A virus-DRIFT?
Genom genetiska förändringar (mutationer) som ger aminosyrabyten i influensaproteiner - hemagglutinin och neuraminidas. Drift ger epidemier. Under en influensasäsong passerar ett influensavirus många immunsystem vilket gör att det förändras allt eftersom det överlever och sprids. I början kanske viruset kan kännas igen av antikroppar men inte i slutet av säsongen.
109
Hur uppstår ett influensa A virus SHIFT?
Shift innebär att en ny HA-subtyp uppstår vilket orsakar pandemier eftersom populationen inte har någon immunitet mot den nya virusstammen.
110
Var uppstår vanligen antigenshift?
Grisar bär naturligt på sjöfågel-infulensa. När en gris blir smittad av humant influensavirus kan en och samma cell bli infekterad av de två lika influensavirussubtyperna. Dessa kan genom rekombinering ge upphov till en helt ny subtyp av influensavirus.
111
Hur skiljer sig inbindningen av humant kontra fågelinfluensa?
Cellreceptorerna i luftvägsepitelet är anpassade för humana influensor - sockerstrukturerna är vinklade på ett sätt så att viruset bara kan binda ifall de är a2,6 sialinsyrakompatibla. Gäller bara övre luftvägarna. Fåglar har a2,3
112
Hur skiljer sig parainfluensaviruset mot influensaviruset? (uppbyggnad)
Parainfulensa en enda lång RNA-kedja (tillskillnad från influensa som har segemnterat)
113
Hur fungerar inbindingen av respiratoriska syncytieviruset (RSV)?
G-proteinet på RSV binder till CX3CR1 på epitelcellytan och F-proteinet åstadkommer fusionen med cellmembranet. Viruset replikerar sedan i cytoplasman.
114
Vilket typ av infektion ger RSV?
Nedre luftvägsinfektion efter 5-7 dagar. 4-5 dagar inkubationstid
115
Hur sker spridning av RSV-infekterade celler?
Bildas stora klumpar av skadade celler (infekterade cellaggregat) - faller ner i djupare luftvägar -\> spridning där. Cell-cell överföring av virus via fusion mellan flera celler -\> jätteceller - syncytia
116
Hos vilken patientgrupp är RSV allvarligt?
Barn under 3 år. Luftvägarna drabbade: nässpel, andningssvårigheter. Under 1 års ålder har man 50-90% risk, 5-40% bronkopneumoni Krupp i 10% av alla fall. 9 ggr högre moralitet hos spädbarn jämfört med influensa.
117
Finns det något läkemedel mot RSV?
Monoklonala antikroppar mot fusionsprotinet, F-proteinet, är svindyrt och skyddar 70%.
118
Hur påverkar RSV kroppens immunförsvar?
På liknande sätt som influensa använder RSV NS1 och NS2 proteiner för att blockera IFN. F-proteinet kan blockera T-cellsaktivering.
119
Vad för typ av virus är parainfluensavirus?
Ett Paramyxovirus. -ssRNA. Enkelsträngat med hölje.
120
Hur skiljer sig genomet i influensa A vs Parainfluensa?
Parainfluensa är mycket mer genetiska stabilt än influensa. - Mycket färre mutationer. - Litem antigendrift - Inget antigenshift Man brukar bli immun efter en genomgången infektion.
121
Hur skiljer sig ett coronavirus från andra helikala RNA-virus?
Det är ett +ssRNA, detta är samma sak som mRNA och det kan därför direkt translateras till virala proteiner. +RNA är snabbare än minussträngat RNA.
122
Hur är ett coronavirus uppbyggt? Ge exempel på ett virus och symtom från coronavirus.
+ssRNA med hölje. Helikal kapsid. SARS-CoV är ett exempel på virus. SARS är ett exempel på symtom - severe acute respiratory syndrome (feber,torrhosta,dyspné,huvudvärk). Symtomen förbättras först för att sedan bli sämre vecka 2.
123
Vilket virus orsakar 30% av våra förkylningar?
Humant coronavirus.
124
Hur sprider sig coronavirus?
Genom droppar: hosta, nysningar. Andra spridningsvägar finns.
125
Hur är rhinoviruset uppbyggt?
+RNA, enkelsträngat. Ikosaedral struktur. Inget hölje.
126
Ge 2 exempel på rhinovirus.
Hepatit A och Polio.
127
Hur binder Rhinoviruset till epitelceller?
Binder till ICAM-1.
128
Vad är symtomen från rhinovirus?
75% av pat får symtom. Symtomen är "vanlig förkylning". Inkubationsperiod 1-3 dagar.
129
Hur är ett adenovirus uppbyggt?
Det är ett dubbelsträngat DNA virus. Ikosahedral struktur utan hölje.
130
Vad är symtomen från adenovirus?
Många olika symtom: - Luftvägssjukdomar Gastroenterit (maginfluensa, diarré) ALlvarlig luftvägsinfektion (lunginflammation, bronkit) Adenoviral konjuktivit - syns i ögonvitan.
131
Vad har adenoviruset för replikation?
I epitelcellernas kärna sker virusreplikation och tillverkning av nya virus. Använder värdcellens transkriptionsapparat men modifierar den.
132
Hur sprids adenovirus?
Hosta - dvs droppar från luftvägarna. Adenoviruset är mycket stabilt vilket tillåter lång överlevnad utanför kroppen.
133
Vad är patogenesen hos RSV?
RSV infekterar epitelceller i nedre luftvägarna. Detta leder till epitelial nekros och förlust av cilierade celler. Inflammation i bronkiolerna med glattmuskelkonstriktion (air trapping) och infiltration. Gobletcellproliferation med ökad slemproduktion vilket ger upphov till "mucuspluggar", ihop med celldebris från nekrotiserande celler. Luftvägarna hos barnet blir trängre som resultat av detta, vilket leder till andningssvårigheter och näsljud.
134
Vad är de stora humanpatogena virusfamiljerna? Ge två exempel på virus i varje.
Paramyxovirus: mässlingen, RSV (akut infektion)
Herpesvirus: HSV, EBV (kronisk)
Retrovirus: HERV, HIV (kronisk)
Ortomyxovirus: Influensa A, Influensa B (akut infektion)
135
Vilka enzymer använder sig de stora virusfamiljerna av?
Mässlingen: RNA-beroende RNA-polymeras
Retrovirus: omvänt transkriptas
Herpesvirus: DNA-polymeras
Ortomyxovirus: RNA-beroende RNA polymeras
136
Vad är influensa H5N1? Hur skiljer sig en "highly pathogenic" mot en "low pathogenic"?
H5N1 är fågelinfluensan. LPAI (low pathogenic avain influenza) är inte virulenta och orsakar ingen död hos någon art. Förekommer natruligt hos fåglar. HPAI (highly pathogenic avain influenza) har däremot hög mortalitet i alla arter den hittats och har dessutom infekterat djur som tidigare aldrig bilivit infekterade med influensa, katter.
