Virologi Flashcards
Vad är skillnaden mellan ett “naket” virus och ett höljeförsett virus?
Ett “naket” virus innehåller inget hölje. Ett virushölje består av cellens plasmamembran. Fäst på höljet finns virala höljeproteiner, glykoproteiner.
Vilka fyra “effekter” har virus på de celler som infekteras?
- Virus kan påverka den invaderade cellen att bli tumörcell genom att immortalisera cellen. Exempelvis herpesviruset Epstein-Barr (EBV) 2. Viruset kan orsaka lys i infekterade cellen - viruset frisläpps då. 3. Viruset kan orsaka persistent infektion, där viruset långsamt släpps ut. 4. Viruset kan orsaka latent infektion, finns i cellen men ger ingen skada. Kan vid senare tillfälle aktiveras. Exempelvis herpesvirusfamiljen.
Hur definieras en virulensfaktor?
En virulensfaktor är en specifik egenskap som mikroorganismen har, som ger upphov till dess virulens i cellen. 1.
Ge några exempel på några virulensfaktorer och deras funktion
Adhesionsfaktorer (höljeprotein), dvs cell-receptorbindande strukturer. 2,3: Invasionsfaktorer, viroporiner: cellmembran-penetrerande mekanismer (fusion, endosomfrisättning) och avklädning 4,5,6: Repliakationsfaktorer/Transkription och translation: nya enzymer, resistensfaktorer (viral mRNa transkription), translation av nya virala proteiner som cytotoxiska enzymer, immunmodulerande faktorer, toxiner. 7. Uppbyggnad av nya viruspartiklar - assembly 8. Frisättningegenskaper: egress - avknoppning eller lytisk (båda finns också)
Vad är ett virion?
Den fysiska viruspartikeln
Vad består viruskärnan av?
Nukleinsyra (DNA eller RNA) omgiven av en tät proteinstruktur
Vad är en kapsid? Hur kan en kapsid vara uppbyggd?
En kapsid består av enskilda proteinmolekyler som arrangerats runt nukleinsyran. Kapsiden kan vara stavformad eller rund. De stavformade virusen är helikala - sprialvridna, de runda är ikosahedrala.
Vad är en kapsomer?
De proteinenheter som bygger upp kapsiden.
Vad är en nukleokapsid?
Virusgenom + kapsid (proteinskalet)
Hur förökar sig ett virus?
- Viruset fäster vid värdcellens yta (attachment) 2. Viruset penetrerar in i värdcellen (penetration) 3. Kapsiden faller sönder och genomet frigörs (uncoating) 4. Replikationen äger rum (replication) 5. Generna expresseras (gene expression) 6. Nya virus fogas ihop (assembly) 7. Maturation = mognad (maturation) 8. Virus frigörs från värdcellen (release)
Vad kännetecknar paramyxovirus?
Paramyxo: stor virusfamilj. Ebola: blödarfebervirus, mässlingvirus, respiratoriska infektionsvirus - är ofta paramyxovirus. Enkelsträngade RNA virus. Kapsid omkring sig, helikal struktur. Utanpå matrixprotinen och yttre höljeprotein. Finns total 8 proteiner hos mässlingsviruset. Sex av dessa är strukturella, oumbärliga för strukturen. 2 som är icke-strukturella. Man blir “prickig”.
Hur sprider sig mässlingsviruset? (paramyxo)
Klär av sig inne i cellen så arvsmassan blir fri. Här måste RNA-polymeraset transporteras in i cellen ihop med viruset. Härefter sker translation till nya virala proteinet, också en replikation - inte bara till +RNA utan också vidare så det kan packas in i nya kapsider. Allt sker i cytoplasman. Behöver inte ta sig in i cellkärnan. Kan knoppas av i visas celler eller orsaka lys i andra. Detta virus har en bred celltropism - valt en receptor som är vanligt förekommande i många celler - kan därför sprida sig systemiskt. (CD150 till fusionsproteinet eller haemagglutinin)
Vilka är de tre stegen i mässlingsinfektionen?
- Primär infektion. Binder till DC-SIGN i luftvägarna. Dendritiska celler är rika på DC-SIGN och infekteras därför ofta. Även CD150+ lymfocyter. Dendriterna vandrar sedan till närliggande lymfvävnad. 2. Systemisk spridning. Viruset sprids till B-celler och minnes T-celler. 3. Utdödning av immunceller i lymfvävnader och andra vävnader resulterar i mässlingskaraktäristiska röda utslag.
Varför är man immunsupprimerad efter en mässlingsvirusinfektion?
Man slår ut T-cellerna, minnescellerna försvinner (30-80%) för även andra infektioner än mässlingvirus. Immunsupprimerad och mottaglig för efterkommande andra infektioner.
Vilka komplikationer kan uppstå efter primär mässlingsinfektion?
ADEM: Neurotrop: söker sig gärna upp till hjärnan där det åstadkommer ännu större skada. Antimyelinriktad immunitet - demyelisering - sensoriska eller nervskador MIBE: Fokala “seizures” (anfall) med ibland synnervsförlust eller hörselpåverkan SSPE: Degenerering av hjärnceller. Lång tid.
Vad ingår i barnvaccinationsprogrammet?
Vaccination: barnvaccinationsprogrammet: mässling, påssjuka och rödahund. Mässlingvaccin: Godartat variant av viruset: ger feber och god immunitet. (Inom barnhälsovård och elevhälsa erbjuds barn och ungdomar vaccinationer som ger skydd mot tio sjukdomar: rotavirusinfektion, polio, difteri, stelkramp, kikhosta, infektioner orsakade av Haemophilus influenzae typ b, mässling, påssjuka och röda hund och allvarlig sjukdom orsakad av pneumokocker. Flickor erbjuds även vaccin mot humant papillomvirus (HPV))
Beskriv virusreplikationens fäste/attachement
Fäste/attachment är en specifik bindning mellan virala kapsidproteiner och specifika värdcellreceptorer. Denna specificitet bestämmer värdurvalet för ett virus, exempelvis så kan HIV bara infektera en liten mängd leukocyter.
Beskriv virusreplikationens penetration
- Penetration: Binding till receptorn kan leda till att virala lipidmembranet fuserar med värdcellsmembranet, eller att det sker en receptormedierad endocytos, alternativt som hos bakteriofager kan viruset injicera sitt genom i värdcellen.
Beskriv virusreplikationens uncoating
Uncoating: kapsiden tas bort. Genom värdcellen enzymer, virusets enzymer eller dissociering. Nukleinsyran blir fri.
Beskriv virusreplikationens “replikaiton”
Replikation: virus replikerar sig genom att multiplicera sitt genom. Här kan också mRNA syntetiseras, virala protein likaså.
Beskriv virusreplikationens assembly
Assembly: Modifiering av proteiner. Mognad
Beskriv virusreplikationens frisläppning
Frisläppning: frisläpps av värdcellen genom lys. En process som innebär att cellmembranet spricker (och cellvägg om det finns). Virus kan också ingå i en lysogenisk cykel där de inkorpereras i värdcellen kromosom där genetisk rekombination sker. Viruset kallas nu ett provirus och när värdcellen delas så delas också det virala genomet. Vid någon tidpunkt kan viruset bli aktivt och göra att värdcellen lyserar.
Hur skiljer sig hastigheten med vilket ett virus kan verka genom dess olika genomstrukturer?
DS DNA måste bara ta sig in i cellkärnan SS DNA måste bli DS först innan de blir protein +RNA är snabbast på att bli transkriberade till proteiner -RNA som influensa, måste först göra om sig till plus, är beroende av Rnase för att bli + Dubbelsträngat RNA: kan direkt läsas av och ge upphov till protein
Hur skiljer sig platsen var ett RNA kontra DNA virus förekommer?
DNA virus är välanpassade till våra cellkärnor. RNA virus stannar istället gärna i våran cytoplasma eftersom det finns ribosomer som tar hand om RNA.
Vad är en zoonos och ge ett exempel på ett zoonosvirus
Zoonoser: influensa A - den som finns i naturen. Sjöfågel bär influensa A naturligt Zoonos: smittar mellan människa och djur Grisar delar vi frekventast influensa med. Exempelvis svininfluensa.
Ge exempel på ett rent humant virus.
Influensa B är rent human.
Vad är ett retrovirus och hur fungerar det?
Retrovirus är ett dimer RNA-virus med hölje. Använder sig av Rnase för att göra om RNA strängen till DNA och på så sätt kunna inkorperera sig i värdcellens DNA. Dessutom görs det virala proteiner som bidrar till förökning av viruset. Det virala transkriptaset som används vid transkriptionen av viralt DNA i cytosolen har ingen “proof-reading”, vilket gör mutationer mer sannolika och därmed slumpmässig resistens.
Nämn 3 karaktäristika för retrovirus.
- Lipidhölje. 2. Dimer-RNA 3. Proteiner: GAG-proteiner, proteaser, Pol-proteiner och ENV-proteiner.
Hur gör HIV viruset för att fästa till en värdcell?
HIV binder till CD4 molekylen. Sedan bildas ett komplex med HIV höljet, CD4 molekylen och en kemokinkoreceptor. Därefter fuserar virushöljet och cellmembranet.
Hur gör herpresviruset för att ta sig in i värdcellen?
Herpesviruset fäster till kolhydratsstrukturen: glykoprotein C, sedan D och tillslut har den tagit sig så nära att den smälter samman med cellens plasmamembran, då kan viruset glida in i cellens cytoplasma. Viruset kan via importiner ta sig genom nukleoporerna och in i cellkärnan.
Hur kan virus sprida sig?
Lokalt från platsen: vårtvirus Via blod eller nerver: hepatit B,XC; poliovirus, Rabies, HIV Hud: Papilloma, herpes simplex typ 1 Urin: Hepatit A Sexuellt: Hepres simplex typ 1, HIV, HPV, Hepatit B och C
Vad innebär head up/ heads down konformationsändringen i paramyxovirusets (mässling) glykoproteiner?
Glykoproteinerna (HN/H/G) på virusets cellyta är antingen i en så kallad “head’s up” komformation eller heads down. När dessa binder till receptorer på värdcellsmembranet så ändrar de formation från up till down och vice versa. Detta gör att fusionsproteinet antingen associerar eller dissocierar och därmed aktiveras vilket leder till fusion.
Hur förhåller sig mässlingRNA i kroppsvätskor?
Blod > Saliv > Ögonvätska > Urin > Hud
Vad beror utslagen på i infektionsförloppet hos mässlingsviruset?
Utslagen uppstår samtidigt som virala utrensningen börjar, vilket tar ungefär en vecka från första utslaget. Det är alltså mässlingsspeicifka T-celler som tar sig till huden och rensar infekterade celler, vilket ger upphov till röda utslag.
Vad är första tecknet på mässlingsviruset?
Första tecknet är “the prodrome” som är ospecifika symtom (klåda, hosta, feber etc). Ett vältränat öga kan dock också se små vita prickar i munnen på kindslemhinnan, dessa kallas Koplik fläckar, och kommer före utslagen med ett par dagar och är väldigt mässlingsspecifika.
Vad är de tre symtomförloppen hos mässling?
- Prodrom med Kopliks fläckar. 2. Röda utslag. Första utslag korresponderar med högsta viremin. 3. Immunsuppresion - kan ge sekundära komplikationer.
Vad har mässlingen för celltropism?
Bred! Epitelceller i kärl, B- och T- minnesceller, makrofager och DC. Glia- och astrocyter i CNS.
Vilken är den näst vanligaste humana virala sjukdomen efter influenza och förkylningsvirus?
Herpes
Vilka virus ingår i Alfaherpesvirus? Hur brukar de uttrycka sig och var?
Alfaherpesvirus. Neurottropa. Herpes simplex typ 1 och typ 2. Munblåsor, genitala blåsor. Bred tropism. Heparansulfat - som finns på många epitelceller. Lytisk cykel - går in, förökar sig och sedan brister den. Kan den passera slemhinnan i en nervände - letar den gärna till nervcellens sensoriska ganglion - latent där.
Vilket är det vanligaste gammaherpesviruset? Vilka är målceller
Gammaherpesvirusgruppen: Epstein-Barr vanligaste - human herpes 4. Våra B-lymfocyter och epitelceller är målceller. EBV sprider sig genom saliv: kissing disease. Herpes typ 8 - tumörorsakande- hittas ffa hos cancerpatienter och HIV-patiener. Nästan exklusivt B-cellsinfekterande. Onkogen - kan transformera till B-cells lymfom.
Ge ett exempel på ett betaherpesvirus och vilka som är särskilt utsatta för dessa virus.
Betaherpesvirus: cytomegalovirus - förvärrar sjukdomar. Livsfarliga hos väldigt unga (nyfödda) eller gamla. Monocyter eller lymfocyter. Långsam: två veckor. Mer restriktiv. Föredrar lymfocyter att infektera. I mikroskop syns syncytium - smälter samman i nästa cell - cytomegala celler - multinukleära. Latens utvecklas i sekretoriska kärl i makrofager eller monocyter. Herpes typ 6 - får man när man blir pussad av föräldrar. Herpes typ 7 - T-cellstransformerande virus.
Vad är strukturen hos ett herpesvirus?
- Dubbeltsträngat linjärt DNA (hade den varit “supercoilad” hade den fungerat sämre, nu kan den istället läsas av effektivt) 2. Ikosahedral kapsid 3. Teugment: kluster av proteiner som hjälper till med DNA-replikation och undvika immunförsvar. 4. Yttre lipidhölje med glykoproteiner (gB-gN).
Hur skiljer sig alfa-, beta- och gammaherpesvirus?
Alfa har snabb replikation jämfört med beta och gamma som har långsam replikation. Alfa har bred tropism, beta mindre bred och gamma starkt begränsad värdcellsbredd. Alfa är typiskt lyserande och latens sker i sensoriska ganglier, medan betaherpesvirinae ger cytomegalia (förstorade) celler och latens. Gamma etablerar och latens (B-celler eller T-celler)
Hur fungerar attachment och entry för HSV?
Hugger tag i heparansulfat (med gC/gB) - sedan nästa receptor - sedan ett coreceptor - tillslut kan den smälta samman med cellmembranet och där nå cellkärnan - eftersom det är ett DNA-virus!
Hur fungerar herpesvirusets replikation?
- Efter entry i värdcellen så tar sig (DNA)viruset till nukleus, där det börjar producera immediate early proteiner, alfaproteiner. 2. Dessa tar sig delvis tillbaka till kärnan och hjälper till vid genomreplikationen och dessutom sker ytterligare proteinproduktion - earlyproteiner/betaproteiner 3. Strukturella proteiner (late/gammaproteiner) produceas och mognad av nya viruspartiklar sker genom ER och Golgi. 4. De färdiga viruspartiklarna kan antingen lysera cellen och frisäppas, genomgå exocytos och frisläppas eller föras över till intilligande cell med cell-cell relase.
Hur kan hepresviruset mediera immunsuppression?
- Genom att interferera med MHC klass I molekylen. Detta görs olika hos olika heprestyper. Epstein-Barr virusproteiner blockerar proteasomen och därmed nedbrytningen och antigenpresentationen av virus på MHC-I. Herpes simplex blockerar TAP-systemet (Kanalen mellan TAP-1 och TAP-2), vilket blockerar transporten av virala peptider till ER. HCMV blockerar energileverans till TAP-systemet. 2. Genom att producera virala cytokinhomologer. Dessa fungerar antingen antiinflammatoriskt eller tillväxtfrämjande för virusets målceller.
Vad kännetecknar Epstein-Barr viruset och vad är dess funktioner?
B-lymfocytvirus - latent i minnes B-celler. Symtom är trötthet, feber, svullna lymfkörtlar, inflammerad hals/slavg, utslag i hud, förstorad mjälte och lever. Spridning sker via saliv: kissing disease. T-celler är viktiga för begränsning av proliferation avB-celler som kontrollerar sjukdom, EBV manipulerar detta genom producera IL-10 homolog för produktiv infektion som inhiberar protektiv Th1 respons. Kan orsaka lymfom eller carcinom. Kraftigt förhöjda CD 8+ T-celler.
Hur verkar Epstein-Barr viruset?
Infekterar epitelet. Är en lytisk infektion. B-cellen går inte i lys först! Utan den krackelerar och faller sönder när den reaktiveras. Epitelcellerna brister - virus kommer in i submukosan som infekterar B-lymfocyter som i sin tur blir angripna av T-celler. De B-celler som utvecklas till minnesceller brukar slinka undan och bli kvar som latenta celler. Bär viruset som en episomal-virusförvaring. Kan ligga där 50-60 år. Sedan händer något som reaktiverar Epstein-Barr, då får vi igång en delning och cellen brister och viruset sprids till omgvivningen.
Hur sker förändringen från latent infektion till lytisk infektion i Epstein-Barr?
Genom zebraproteinet BZLF1 (ett immediate-early protein) som snabbt samlar på sig transkriptionsfaktorer och bygger ihop ett komplex av molekyler som får igång avläsningen av de avslängda generna, man får en switch och produktion av nya viruspartiklar.
Hur fungerar latensen hos HSV-1?
Nervändarna blir infekterade efter primär infektion. DNA i sensoriska ganglier i nervceller, episomalt, ligger lantent i 10-tals år, ibland ett helt liv. Något triggar den, produceras virus - transporteras längs nervtrådarna. Beroende på hur de är förgrenade hamnar de på hudytan, läppen, ögat och vi får ett nytt skov av infektion.
Vad kännetecknar familjen herpesvirus? (Sammanfattat)
8 olika dsDNA virus. Akut infektioner som etablerar “immun evasion”, latens (neruon, B/T-celler, monocyter) Reaktivering förekommer Behandling: antiviral (nukleosid, nukleotid) Vaccin finns endast mot VZV
Vad kännetecknar familjen retrovirus?
+ssRNA genom. Omvänt transkriptas. Genomisk integration - latens. Långsamma. Tropism för centrala immunceller.
Varför uppkommer diarré?
Uppkommer då för mycket vatten och salt aktivt transporteras ut i tarmen. Stor orsak till barnadödlighet i utv-länder.
Hur kan man se att en patient är uttorkad?
Man kan märka att patienten är “frånvarande” med blicken. Man kan också testa genom att nypa huden, ska gå snabbt tillbaka hos en hydrerad patient.
