Bakterier Flashcards
Vad är definitionen av en parasit?
Organism som lever på eller i annan organism, vilken kallas värd. Parasiten kan vara till skada, vara patogen
Vad är definitionen av patogenicitet?
Förmågan hos en parasit att orsaka sjukdom
Vad är definitionen av virulens?
Grad av patogenicitet, kvantitativt begrepp
Vad är definitionen av infektion?
Etablering och tillväxt i värden av mikroorganismer som är potentiellt patogena.
Vad är högvirulent kontra lågvirulent virus? Ge exempel.
Beror på att bakterier är utrustade med olika virulensfaktorer.
Högvirulent: Streoticiccys oneumoniae
Lågvirulent: Salmonella typhimurium

Vad är normalflora och vad behövs det för?
Behövs för att det ger ett bra skydd mot patogena mikroorganismer. Normalfloran är också bra för att den hjälper oss (i tunntarmen) på vitaminer och andra ämnen från maten som vi äter, hjälper till att bryta ned och tillgängliggöra näringsämnen i mat.
Även att skapa bra miljöer på slemhinnor.
Också för att tarmfunktionen ska fungera - därav rik flora i tunntarm och tjocktarm.
Vilka två typer av mikroorganismer finns på huden?
Tillfälliga gäster: transienter, kan inte kolonisera.
Residenterna: Addererar, mikrokolonier som växer till större kolonier och blir stationära på huden.
Vilken typer av bakterier har vi på huden?
Eftersom huden är så ogästvänlig så har vi ofta mycket grampositiva: stafylokocker
S. epidermidis
S. aurens (men mest epidermidis)
Hur förändras normalfloran under en livstid? Vad kan detta medföra?
Vid förlossningen vill man att man ska exponeras mot moderns normalflora - därför vill man att modern ska ha nära kontakt med den nyfödde.
Kring puberteten har vi så rik flora vi någonsin får, därefter utarmas den ju äldre vi blir. Blir snällare och snällare. Äldre personer har större benägenhet att drabbas av allvarliga infektioner. En bakterie som ingår i normalfloran hos en tonåring kan hos en åldring på 80-90 vara en patogen som ger en svår infektion. Har också att göra med att våra barriärer blir sämre, men även att normalfloran utarmats.
Vad är peptidantibiotika? Hur fungerar det? Ge exempel.
Peptidantibiotika: S.epidermidis producerar epidermin - påverkar s. aurus (släktbakterie). Är kortare aminosyrasekvenser som tillsammans flera peptider bildar porer i membranet hos en nära släkting - på det viset kan det drabbade bakterien inte styra sin membrantransport - då kommer man duka under.
Vilka bakterier finns på tänderna? Hur skadas emaljen?
S. sanguis, sobrinus och mutans. Allt eftersom de växer till: mikrokolonier - förstadie till plack - som skadar emaljen. Bakterier förbrukar syre: då kan andra anaeroba bakterier komma in och växa på tänderna. Anaeroba bakterierna bildar i sin slutprodukt svaga organiska syror - denna syraproduktion kommer ge skador på emaljen. Alltså är det en kemisk nedbrytning av emaljen.
Hur klarade vi oss med tandhälsa för 10000 år sedan? Vissa hade bra tandmaterial.
Vi åt andra saker: inte så raffinerat. Mer direkt från växter och djur - mindre behandling. Mer slitage på tänder.
Helt annan normalflora i munnen då - därför kunde tänderna klara sig på ett annat sätt.
Varför är det så känsligt att vi får bakterier i alveolerna?
Gasutbytet sker: känsliga membran. Vi kan drabbas av sepsis eftersom det inte krävs så mycket att från denna miljö ta sig ut i kärlen.
Förklara följade begrepp: fimbrier, pili
Fimbrier och pili är utskott från bakeriens yta. Fimbrier kan vara virulensfaktor. Fimbrier kan hjälpa till att fästa vid ytor som slemhinnor.
Pili är ofta långa och kan också hjälpa till för fäste mot ytor, men behövs även för konjugation (överföring av genetiskt material via plasmider). Kan också fungera som virusreceptorer.
Förklara följande begrepp: glykokalyx och inklusionskroppar
Både glykokalyx och inklusionskroppar ger lagring av energi för bakterien.
Glykokalyx: två typer: kapsel och slemlager, extracellulärt polysackaridmaterial. Gör bakterien klistrig, gör också att bakterien kan undgå att kännas igen av immunförsvar - en virulensfaktor.
Inklusionskroppar - lagring av energi eller byggstenar, ofta som kolhydrater. Ser ut som vakuoler. Poly-B-hydroxybutyrat är vanligast. En bakterie kan vara nästan fylld av detta - för att hushålla till tider då man har brist på näring. Då används dessa som energi och byggstenar.
Vad är en flagell? Hur är den uppbyggd och vilken funktion har den.
Flageller är uppbyggda av proteinet flagellin. Kan vara polära: sitter likadant på båda sidor eller pertricka: sitter åt alla håll.
Flageller möjliggör rörelse hos bakterien. Man vill röra sig mot något som är fördelaktigt, exempelvis kolhydrat - energikälla. Man rör sig bort från något skadligt, exempelvis bakterier som tål UV-ljus dåligt.
Flagellen sitter förankrad i peptidoglykanlagret och får sin energi genom en protongradient. Detta får flagellen och således bakterien att röra på sig. Rörelsen kan vara samordnad: flagellerna är synkroniserade, eller osynkroniserad - bakterien skakar.
Colibakterier och bakterier som lever i någon form av vattenfilm har flageller.
Genom vilka sätt kan vi mäta bakterietillväxten?
- Totalcellräkning i mikroskop. Man räknar antal rutor efter en spädningsserie och sedan tar man medeltalet.
- Viable count (levanderäkning). Bakterierna får växa på agarplatta sedan räknar man cfu.
- Turbiditetsmätningar (optisk täthet). Vi späder till vi inte har några bakterier kvar.

Hur skiljer sig bakteriell tillväxt i naturlig miljö från bakteriell tillväxt i renkultur?
Bakterierenkulturer i oss är allvarligt
I naturlig miljö är det en begränsning på näring - gör att mikroberna aldrig kan nå upp till sin optimala, maximala generationstid. Förutom näringsbrist är det också en konkurrens med andra mikrober - om utrymmet. Begränsning i tillväxt - ofta hittar man en balans - steady state - mellan olika mikrober.
Snabba och ofta oregelbundna förändringar i miljön skapar behov av stor flexibilitet (genotyptisk och fenotypiskt). Bakterierna måste kunna anpassa sig snabbt - både genotypisk och fenotpyiskt. På gennivå kan man plocka upp eller göra sig av med gener eller ändra uttryck. Väldigt fina exempel i bakteriella världen där man förändrar sig väldigt snabbt - enda sättet för bakterier att kunna överleva exempelvis sporbildning. Lagra energi i form av glykokalyx eller inklusionskroppar är ett annat fenotypiskt sätt att anpassa sig i miljön.
Hur skiljer sig ett bakteriegenom mot ett eukaryotgenom?
Hos bakterier är genomet ringslutet, cirkulär molekyl, kovalent slutet. Inga histoner. Bör därför inte kallas bakteriekromosom.
Nukleoiden ser likadan ut i vila som i celldelning.
Ungefär 1/1000 i storlek av en eukaryot cell.
10ggr fler gener i eukaryot än prokaryot.
Mer kodande hos prokaryoter, upp till 100%, detta gör att genomet är mer ömtåligt. De är dessutom haploida - en kopia av varje gen - ger ytterligare skörhet.
Extragenomiskt DNA, bla plasmider.
Hur konkurrerar bakterierna med varandra? Varför kan en bakterie dra nytta av en annan i samma bakteriepopulation?
Många kopior (uppsättningar) av genomet: lång tid att replikera, mindre risk för mutationer
Att konkurrera med tillväxthastighet är viktigt för bakterierna, bara några sekunders skillnad kan göra att en bakterieklon tar över en annan. Det gäller att spara på energi och undvika att ha för stora genom. Detta gör bakterierna genom plasmider: är extragenomiskt DNA, DNA som finns i cirkulära molekyler - innehåller gener som är bra att ha i specifika betingelser: man kan plocka upp dessa om man behöver.
I en bakteriepopulation så kommer vissa bakterier släppa sina plasmider medan andra har kvar: de gemensamma genomet är större än det individuella.
En plasmid som är viktig kommer över tid finnas i större utsträckning i en bakteriepopulation.
Vad innebär transformation, transduktion och konjugation?
Transformation: överföring av fritt, naket, DNA till en cell (f=fritt)
Transduktion: Virusmedierad (bakteriofagmedierad) DNA-överföring
Konjugation: Överföring medierad av konjugativa plasmider (fertilitetsplasmider) kräver cell-cell kontakt

Vad är ett mobilt genetiskt element? Vad är skillnaden mellan transposon och IS-element?
Ett mobilt genetiskt element är en gensekvens som har förmågan att flytta sig inom genomet. Ett IS-element innhåller gener som kodar för transposering, inklusive transposas. En transposon innehåller förutom transposeringsgener även andra gener, exempelvis gener som kodar för antibiotikaresistens.
Vad är funktionen hos en transposon?
En transposon kan helt eller delvis tysta en gen genom att förflytta sig till den. En transposon kan innehålla genen som kodar för antibiotikaresistens, denna kan sedan föras över till andra bakterier via transposering till plasmider (konjugation).
Vilka tre öden finns efter basparsutbyte?
3 saker kan hända:
Till höger: normalt funktionellt. Vildtyp.
Normalt protein: UAU istället för UAC - samma - ingen fenotypförändring - tyst mutation
Nonsense: UAG -> UAG som är ett stoppkodon - blir stopp och proteinsyntesen slutar där. Beroende på var i sekvensen detta sitter kan proteinet få bra funktion i alla fall.
Missense: AAC: annan aminosyra. Fullstort protein med annan aminosyra - eventuellt annan funktion men funktionellt i alla fall.


