Repetidos comunes

Question 1

Regiones DNA que cotienen secuencias repetidas

Answer 1

Repetidos comunes

Question 2

Los repetidos comúnes estan en…

Answer 2

• Transposones (45%)
• Regiones intergénicas
• Pseudogenes
• Repetidos cortos
• Repetidos largos
• Duplicaciónes en tandem

Question 3

Definición de transposon

Answer 3

Elementos móviles del G que se pueden replicar e insertar en distintas zonas

Question 4

Clase I de tranposones

Answer 4

Retrotransposones : era RNAm que por transcriptasa reversa se vuelve cDNA

Question 5

Tipos de retrotransposones

Answer 5

LTRs : repeticiones terminales largas
no LTRs: repeticiones terminales no largas

Question 6

Que son los LTRs

Answer 6

Retrotransposones de secuencias largas (100 - 5000 pb) localizados en extremos cromosómicos

Question 7

Que son los no LTRs

Answer 7

LINEs: ele intercalados largos (20% G)
SINEs: ele intercalados cortos (13% G)

Question 8

Clase II de transposones

Answer 8

DNA transposones
- Saltan directamente

Question 9

Que son los LINEs

Answer 9

Estan en bandas G
Son autónomos (su transcriptasa reversa y endonucleasa)
3 familias:
- LINE I (6kb: 17%)
- LINE II
- LINE III

Question 10

Que son los SINEs

Answer 10

100 - 400 pb
En bandas R
No autónomos
Comparte secuencias con LINEs
Su retrotransposisión con maquinaria de LINEs
ALU (forma + común)

Question 11

ALU

Answer 11

SINEs más comunes
Longitud de 280pb
- 2 repertidos tandem de 120pb entre ellas secuencia de A / T
Monomero left: regiones A y B
Monomero right: 32 pb (conservada)

Question 12

Que son los pseudogenes

Answer 12

Secuencias de DNA derivadas de dup o retrotransposición del gen funcional que han estado sometidos a selección natura y por ende retienen gran parte de la secuencia y estructura original además de haber adquirido nuevas funciones

Question 13

Cuando se utilizó por primera vez el término “pseudogen”

Answer 13

1977 para describir pseudogen de RNA 5S (Jacq et al.)

Question 14

Origen de los pseudogenes

Answer 14

Duplicaciónes en tandem

Question 15

Porque los pseudogenes perdieron la capacidad de producir proteinas

Answer 15

• Codones de STOP prematuros
• Mutaciones que alteran el marco de lectura
• Adiciones y deleciones

Question 16

Los pseudogenes pueden tener hasta ____% de concordancia con su gen funcional homologo

Answer 16

90%

Question 17

Los genes padre / homologo de los pseudogenes esta…

Answer 17

En el genoma del mismo o bien de ora especia atras

Question 18

Ej de pseudogen: Gen ferroquetalasa

Answer 18

Exones 1-11 concordancia 82-93%
Region 5’ concordancia 63%

Question 19

Ej de pseudogen: Gen lactato deshidrogenasa

Answer 19

Region 5’ doble de diferencias que en 3’ y regiones codificantes

Question 20

Tipos de pseudogenes

Answer 20

• Non processed
• Processed
• Unitary

Question 21

Pseudogenes NON PROCESSED

Answer 21

Remanentes de genes dup en tandem
Mantienen estructura de intrones y exones

Question 22

Pseudogenes PROCESSED

Answer 22

Formados cuando se insertan sec derivadas de retrotranscripción RNAm
- Carecen de intrones y ele reguladores (promotor y upstream)
- Pueden tener poli-A

Question 23

Pseudogenes UNITARY

Answer 23

No tienen gen parental funcional en G ya que pueden estar en otras especies

Question 24

Posibles funciones de pseudogenes

Answer 24

• Actuar como reuladores post-trans al codificar miRNAs
• Si se transcriben pueden causar enfermedad
• Respuesta inmune (diversidad de a. c.)
• Variación genética

Question 25

GENCODE

Answer 25

Pseudogenes
Consorio de ENCODE
Identificación de 12,000

Question 26

LINE I tiene…

Answer 26

2 open reading frames (ORF) (2 genes)
1: P40 (chaperona)
2: Transcriptasa rev y endonucleasa