Introducción a las ciencias ómicas Flashcards
genes codificantes en el GH
23,000
Estudio de moléculas involucradas en el funcionamiento de un organismo
C. Ómicas (1980)
Metodologías basada en MÉTODOS BIOQUÍMICOS para la determinación del ORDEN de las bn el la cadena de DNA
Secuenciación
Método basado en la adición de ddNTPs marcados radioactivamente (detienen) con replicación con DNA pol
SANGER 1977
Cuantos nc se pueden leer con SANGER
50 - 300 nc
Después, en lugar de usar radioactividad en SANGER se usarón
fluorocromos con laser (96 muestras en celdas) 30-60k pb
NGS (Next Generation Secuencing)
SOLID / Pirosecuenciación
Illumina : SOLEXA
PCR en emulsión Ion Torren
Cuantos pares de bases puede leer la pirosecuenciación
200 - 400 nc
Método de secuenciación basada en fluoresencia con fluoroforos donde al momento de unión de nc se produce luz de color dependiente de la base
454 Pirosecuenciación / SOLID
reacción enzimatica secuencial de pirosecuenciación
ATP → Ppi → luciferina a oxyluciferina → Luz
Pirosecuenciación moderna
- cadena sencilla en macromolécula
- replicación de la misma hebra
- agregado de nc con cromatofo y Ppi
Método de secueciación basado en la amplificación “en puente” o cluster PCR donde hebras de DNA se unen a su hoyo con primers específicos para replicación
Illumina: SOLEXA
Método de secuenciación que consiste en un solo fragmento de DNA unido a una macromolécula e identificación por liberación de protón en unió de nc (cambio de voltaje)
PCR por emulsión Ion Torrent
Promedio de lecturas que se alinean a una secuencia referencia
Cobertura
número de veces que ha sido secuenciado una base o fragmento de una secuencia
Profundidad