Proteómica de Cancer Flashcards
Para poder identificar un proceso de enf es necesario evaluar…
Perfil de expresión
Mod postraduc
Interacciones prot-prot
Estructura prot
Función prot
En cancer la id de biomarcadores y patrones de expresión ha permitido estudiar…
Prognosis de tumor
Predicción
Clasificación de tumor
Id de potenciales respuestas
Pasos para análisis proteómico de cancer
1 Toma de muestra
2 Extracción de prot
3 Proteoma subcelular (en donde organelos)
4 Id de a.a. presentes y cuantificación de prot
5 Gráficas informativas
Básicamente, en el análisis proteomico de cancer…
Queremos extraer proteinas, saber cuales se expresan, cuanto se expresan y donde
Análisis cuantitativo protéico en PdC
Ver si las proteinas incrementa o disminuyen confrome la enfermedad progresa
Análisis cualitativo protéico en PdC
Ver cuales proteinas tengo
PdC En cuanto al crecimiento c. descontrolado
Entender microambiente de tejido (rutas metab)
Tejido enf vs sano
PdC En cuanto a metastasis
Encontrar cascada de iniciación
Id mol aso para frenar progresión
PdC
Proteómica de cancer
PdC en cuento a resistencia de fármacos
Id patrón prot específico en resistencia a farm
Nos dejan crear tx contra estas prot que generan resistencia a farm
INMUNOTERAPIA (nvos farm / a.c. para cancer específico)
CPTAC
Consorcio de PdC 2011
Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium
1 Tumores de distintos sitios
2 Evaluación de transcriptómica (microarreglo cDNA) y proteómica
3 Bases de datos
4 Investigaciones y resultados de regreso a base de datos
5 Todos tienen acceso a todo
¿Como hago cDNA?
RNA + transcriptasa reversa
APOLLO
Applied Proteogenomics OrganizationaL Learning and Outcomes
Busca unir conocimiento de investigación oncológica con el sistema de salúd
ICPC
International Cancer Proteogenome Consortium
Cooperación de + de 10 paises para estudar dx de cancer en las poblaciones e intercambio de datos de tx efectivo