Proteinas Flashcards
¿Qué es la proteómica?
Expresión, función y regulación del conjunto de prot cod por un organismo
Técnicas de la proteómica pars estudiar a las prot
Electroforesis mono y bidimensional
Espectometría de masas
Técnicas in silico (análisis de bases de datos)
¿Qué requiere la proteómica pasa el análisis?
Fraccionar mezclas de prot o péptidos
¿Qué busca la separación el la proteómica?
Reducir complejidad y tiempo de análisis
Interacciones prot-prot
Purificacion por afinidad-MS
Prot en estudio se aisla por afinidad que tiene con a.c. y las prot que estan pegadas a ellas
MS
Espectometría de masas
Pasos para analizar prot
1 Homogenización / extracción
2 Desalinización / diálisis y concentrac
3 Intercambio iónico y cromatograf de filtración en gel
4 SDS-PAGE
5 Degradación proteolítica
6 Purificación y secuenciación de a.a.
¿Como extraigo prot?
Con a.c. específicos
Electroforesis bidimensional ¿Cuando?
1995 O’Farrel et al.
¿Que es la electroforesis bidimensional?
Utiliza geles de poliacrilamida dos dimensiones:
- Carga: Isoelectroenfoque (IEE)→punto isoeléctrico(PI)
- Masa mol
En electroforesis bidimensional el gel se tiñe normalmente con…
Plata
Identificación de prot
Manchas individuales se identifican mediante tinción, despues se dirigen con proteasas
¿Después de la identificación de prot como se secuencian?
Mediante espectrometría de masas → se identifica prot
¿Cuando se hace la identificación de proteinas en espectometria bidim
Se hace una vez corrido el gel bidim
Espectrometria de masas
Corta y muestra cada aminoácido de la prot
