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SEM-III Genómica & Proteómica > Manejo y Conservación de Muestras Biológicas > Flashcards

Manejo y Conservación de Muestras Biológicas Flashcards

1
Q

Obtención de muestras biológicas

A

Sangre
Biopsia
Frotis
Hisopado
Punción lumbar

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Q

Muestras biológicas

A

Material como orina, sangre, tejido, células, DNA / RNA, proteinas

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3
Q

¿Para que sirven las muestras biológicas?

A

Dx
Monitorización
Investigación
Creación de bancos genéticos

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4
Q

¿Qué nos permite determinar los fluidos corporales?

A

Estado biológico y bioquímico del individuo

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5
Q

Los líquidos corporales también permiten evaluar:

A

Inflamación
Presencia de infecciones
Naturaleza de tumor

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6
Q

¿Que se evalua con respecto a los fluidos corporales?

A

Vol
Apariencia
Color
Conteo c.
Etc…

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7
Q

Tipos de muestras utilizadas para extracción DNA

A

Sangre (globulos blancos)
C. epi bucales
Raices de cabello
Biopsa de tejido
Líquido amniótico (Dx prenatal)
Tejido / c. en cultivo

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8
Q

Para cadaveres se puede extraer DNA de…

A

Raices de cabello y huesos largos porque tardan en degradarse

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9
Q

Metodología que permite indentificar mol de DNA/RNA mediante hibridación

A

Microarreglos

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10
Q

En que estructura se hacen los microarreglos

A

Estructura de vidrio o silicona

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11
Q

Fundamento de microarreglos

A

Principio de complementaridad
- Detección por fluoresencia (bn marcadas)
- Se obtiene señal donde hay hibridación
- Permite lesctura de miles de varientes en un solo ensayo

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12
Q

Tipos de microarreglos

A

DNA
RNA
Metilación
Proteinas

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13
Q

Microarreglos DNA

A

SNPs (detección de variantes específicas)
Chips desde 50,000 oligos

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14
Q

Microarreglos RNA

A

Análisis expresión génica
Analiza cDNA porque RNA es muy inestable

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15
Q

Microarreglos metilación

A

Análisis y comparación de sitios de metilación (CpG)

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16
Q

Microarreglos proteinas

A

Analisis de proteinas mediante a.c. específicos

17
Q

Pasos de microarreglos

A

1 Distribución de oligonuc sobre estructura

2 Cada oligonuc contiene miles de copias

3 Se agregan fragmentos de DNA de librerias

4 Variantes se analizan de manera simultánea

5 Resultado reflejado por fluorecencia

18
Q

Oligonucleótidos en microarreglos

A

Son primers
15-25 nucleótidos

19
Q

Librerias

A

Colecciones de clonas DNA

20
Q

¿Que se necesita para generar librerias?

A

1 Extraer DNA
2 Corte con enz de restricción
3 Genera fragmentos de restricción de distintos tamaños que se traslapan
4 Unión al vector y clonar

21
Q

¿Que es la digestión controlada?

A

Corte con enz de restricción

22
Q

¿Como, como investigador, controlo los cortes que quiero que mi enz de restricción genere?

A

Controlo concentración, tiempo y temp

23
Q

Chip de microarreglos DNA / fluorecencia IMAGEN

A
24
Q

Usos de los microarreglos DNA

A

Forense (perfil genético)
Ciencias de las salud (análisis de polimorf en enf metabólicas)

25
Q

¿Porqué los microarreglos son específicos?

A

Porque los tejidos no expresan lo mismo y en momentos diferentes

26
Q

¿En que microarreglos encontramos expresión diferencial?

A

RNA

27
Q

¿En que microarreglos encontramos genotipos?

A

DNA

28
Q

Microarreglos para identificar cancer por rutas metabólicas implicadas

A

RNA
Permite conocer expresión diferencial entre un px y otro

29
Q

Usos de microarreglos RNA

A

Ciencias de la salud
- Análisis comparativo entre c. sanas y enf
- Analisis comparativos
Microbiología
- Estudios de patogenicidad
- Resistencia bacteriana

30
Q

Posibles aplicaciones de microarreglos ARN

A

Dx temprano
Estudios de cancer
Guías de tx
Estudio de nuevos fármacos

31
Q

¿A que está altamente asociado la metilación DNA?

A

Cancer

32
Q

¿Donde se realiza la metilación del DNA?

A

Carbono 5 de citosina

33
Q

¿Quién dona los metilos en la metilación de DNA?

A

S-adenosil metionina

34
Q

La metilación del DNA…

A

Silencia / inactiva genes

35
Q

Human Methylation 450 Beadchip (microarreglo)

A

Illumina
Cubre 99% de genes referenciados y 250,000 islas CpG

36
Q

Infinitum II

A

De Illumina
Bisulfito cambia C>T cuando NO esta metilado
ROJO: NO met
VERDE: SI met

SEM-III Genómica & Proteómica (28 decks)

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