Manejo y Conservación de Muestras Biológicas Flashcards

1
Q

Obtención de muestras biológicas

A

Sangre
Biopsia
Frotis
Hisopado
Punción lumbar

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Q

Muestras biológicas

A

Material como orina, sangre, tejido, células, DNA / RNA, proteinas

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3
Q

¿Para que sirven las muestras biológicas?

A

Dx
Monitorización
Investigación
Creación de bancos genéticos

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4
Q

¿Qué nos permite determinar los fluidos corporales?

A

Estado biológico y bioquímico del individuo

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5
Q

Los líquidos corporales también permiten evaluar:

A

Inflamación
Presencia de infecciones
Naturaleza de tumor

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6
Q

¿Que se evalua con respecto a los fluidos corporales?

A

Vol
Apariencia
Color
Conteo c.
Etc…

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7
Q

Tipos de muestras utilizadas para extracción DNA

A

Sangre (globulos blancos)
C. epi bucales
Raices de cabello
Biopsa de tejido
Líquido amniótico (Dx prenatal)
Tejido / c. en cultivo

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8
Q

Para cadaveres se puede extraer DNA de…

A

Raices de cabello y huesos largos porque tardan en degradarse

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9
Q

Metodología que permite indentificar mol de DNA/RNA mediante hibridación

A

Microarreglos

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10
Q

En que estructura se hacen los microarreglos

A

Estructura de vidrio o silicona

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11
Q

Fundamento de microarreglos

A

Principio de complementaridad
- Detección por fluoresencia (bn marcadas)
- Se obtiene señal donde hay hibridación
- Permite lesctura de miles de varientes en un solo ensayo

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12
Q

Tipos de microarreglos

A

DNA
RNA
Metilación
Proteinas

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13
Q

Microarreglos DNA

A

SNPs (detección de variantes específicas)
Chips desde 50,000 oligos

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14
Q

Microarreglos RNA

A

Análisis expresión génica
Analiza cDNA porque RNA es muy inestable

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15
Q

Microarreglos metilación

A

Análisis y comparación de sitios de metilación (CpG)

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16
Q

Microarreglos proteinas

A

Analisis de proteinas mediante a.c. específicos

17
Q

Pasos de microarreglos

A

1 Distribución de oligonuc sobre estructura

2 Cada oligonuc contiene miles de copias

3 Se agregan fragmentos de DNA de librerias

4 Variantes se analizan de manera simultánea

5 Resultado reflejado por fluorecencia

18
Q

Oligonucleótidos en microarreglos

A

Son primers
15-25 nucleótidos

19
Q

Librerias

A

Colecciones de clonas DNA

20
Q

¿Que se necesita para generar librerias?

A

1 Extraer DNA
2 Corte con enz de restricción
3 Genera fragmentos de restricción de distintos tamaños que se traslapan
4 Unión al vector y clonar

21
Q

¿Que es la digestión controlada?

A

Corte con enz de restricción

22
Q

¿Como, como investigador, controlo los cortes que quiero que mi enz de restricción genere?

A

Controlo concentración, tiempo y temp

23
Q

Chip de microarreglos DNA / fluorecencia IMAGEN

24
Q

Usos de los microarreglos DNA

A

Forense (perfil genético)
Ciencias de las salud (análisis de polimorf en enf metabólicas)

25
¿Porqué los microarreglos son específicos?
Porque los tejidos no expresan lo mismo y en momentos diferentes
26
¿En que microarreglos encontramos expresión diferencial?
RNA
27
¿En que microarreglos encontramos genotipos?
DNA
28
Microarreglos para identificar cancer por rutas metabólicas implicadas
RNA Permite conocer expresión diferencial entre un px y otro
29
Usos de microarreglos RNA
Ciencias de la salud - Análisis comparativo entre c. sanas y enf - Analisis comparativos Microbiología - Estudios de patogenicidad - Resistencia bacteriana
30
Posibles aplicaciones de microarreglos ARN
Dx temprano Estudios de cancer Guías de tx Estudio de nuevos fármacos
31
¿A que está altamente asociado la metilación DNA?
Cancer
32
¿Donde se realiza la metilación del DNA?
Carbono 5 de citosina
33
¿Quién dona los metilos en la metilación de DNA?
S-adenosil metionina
34
La metilación del DNA...
Silencia / inactiva genes
35
Human Methylation 450 Beadchip (microarreglo)
Illumina Cubre 99% de genes referenciados y 250,000 islas CpG
36
Infinitum II
De Illumina Bisulfito cambia C>T cuando NO esta metilado ROJO: NO met VERDE: SI met