Genes codificantes Flashcards
Hebra sentido (sentido)
5’ - 3’
Hebra antisentido (sentido)
3’ - 5’
RNA es una copia exacta ( U en vez de T ) de la hebra…
Sentido
Hebra RNA (sentido)
5’ - 3’
El primer nucleotico del RNA se encuentra…
Trifosfatado (PPP)
Secuencias clave para el inicio de la transcripción
Factores de transcripción
pre-mRNA
Todavía tiene intrones + exones
mRNA maduro
Solo exones (ya psaron los loops)
Partes de un gen
Cap (centro)
Upstream (-)
Downstream (+)
Que incluye la porción UPSTREAM de un gen
- Región promotora
- Caja TATA (-35)
- Caja CAAT (-80)
- Caja GC (-90)
- Islas CpG (-100)
¿Que es la caja TATA?
Secuencias repetidas de T y A
25 - 35 nc
Sitio de unión de pol-II
¿Que es la caja GC?
Elemento regulador
Secuencia: GGGCGG (5’-3’) / GGCGGG (3’-5’)
Genes constitutivos (SIN CAJA TATA)
Se le unen FT SP1, SP2, SP3
¿Que son las islas CpG?
Secuencias ricas en G y C ( 20- 50 nc)
GCGCGCGC…
Indican inicio de transcripción
Hipermetiladas = closed
Hipometiladas = open
¿Que es la caja CAAT?
Pueden estar 5’-3’ o 3’-5’
Potenciadores distantes
Enhancers
Reguladores tipo cis
50 kb upstream del promotor ó downstream en intron / último exón
Pueden ser específicos de tipo c.
Primer potenciador distal descubierto
1980
G de virus de simio
SV40
Modificaciones post-transcripcionales
Adición de Cap (5’)
Adición de cola de poli-A (3’)
Splicing
¿Que es la adición de la Cap?
En región 5’
Lo pone 7-metilguanosina
Protege RNA de degradación enz
Permite transporte a citoplasma
Sitio de unión de fac. prot. para traducción
¿Que es la adición de la cola de poli-A?
Adición de 100 - 250 adeninas por PAP
Protege de degradación
Facilita traducción
¿Que es el splicing?
Eliminación de intrones y unión de exones
RNA transcrito primario
Se acaba de sintetizar
Inmaduro / precursor
Como identificar RNAm inmaduro
Reg. UTR (untranslated)
Intrones
Partes del intron
Sitio donador (GU)
Sitio aceptor (AG)
Sitio ramificado (A) (20 nc de AG)
exon-GU———A—AG-exon
Pasos del splicing
- Ataque nucleofílico de GU a A
- Loop de GU - union con A
- 2do ataque nucleofílico a AG
- Bye loop
- Empalme
Splicing alternativo
Mismo gen = diferentes isoformas de prot.
Complejo prot. mensajero nuc.
Prot. heterogeneas nucleares + RNA = transporte a traves de poros hacia citoplasma
RNA ribosomal
Más abundante (80%)
- Subunidad menor
- Subunidad mayor
Subunidad menor 40S
33 proteinas
18S
Subunidad mayor 60S
49 proteinas
28S
5.8S
5S
Pasos de maduración de RNAr en núcleolo por pol-I
- —————hebra 45S—————-
- Corte de espaciador 5’ → 41S
- Corte → 20S y 32S
- Corte →18S, 5.8S y 28S
- Asociación de 28S y 5.8S
Ss (RNAr) que se transcriben en núcleo por pol-III
5S
Que region se requiere para la unión de pol-1 en la transcripción del RNAr
Ele. compuesto por histonas río arriba (entre -155 y -60)
Sitio de inicio que abarca -40 a +5
Iniciación de la pol-1
- unión fac. de activación multimérico UAF a ele. río arriba
- unión fac. de terminación y TBP a elemento central que tmb interactua con UAF
- Asociación de complejo con Rrn3p
- Se da inicio a la transcripción
pre-RNA ribosomal
Hebra 45S
Que S se le encima a que S en el RNA ribosomal
5.8S a 28S
Quie hace que se encime S a S
snoRNA
tRNA procede de…
El mismo gen que 5S
Unión pol-III para tRNA
Caja A = TFIIIB
Caja B = TFIIIC
Unión pol-III para 5S
Caja A = TFIIIB
Caja B = TFIIIC
Caja C = TFIIIA
tRNA longitud
75 - 80 nc
Maduración de tRNA
- eliminación de intron (14 nc)
- Sec. 5’ (16 nc) eliminada por ribonucleasa P (RNaseP)
- Residuo UUU (3’) remplazado cor ACC (para a. a.)
- Mod de distintas bases
polimerasa de RNAm
Pol-II
RNAm maduro
Cap—–Exones—–Poli-A
Estructura de ARNt
Loop D 5’ ish
Anticodón
Loop T
Sitio a. a. 3’
Los enhancer pueden ayudar…
a 2 genes a la vez
FT en RNAm permite que…
se una pol-II
Pasos de síntesis RNAm (transcripción)
- Identificación sec. reguladoras
- FT permiten union de pol-II
- Hebra sentido de RNAm (U en vez de T)
- Terminación
- Mod post.trancripcionales
La unión de un nc RNAm…
Entran trifosfatados, liberan pirofosfato y se quedan monofosfatados
Mod post-tranc RNAr
- Unión a prot
- Formación de subunidades
Gen RNAt y RNAr 5S
———A———-B——–C———–
Como paso de RNAt inmaduro a RNAt maduro (mod post-tranc)
- Coste intron 14 nc
- Corte de secuencia 5’ 16 nc
- cambio UUU a ACC (para unión a. a.)
- Cambio bases
Receta para genes codificantes
Receta: RNAm
Bowl: RNAr
Utensilios: RNAt
Doble hebra DNA estructura B
1 giro a la der. cada 10 bases
Doble hebra DNA estructura A
1 giro a la der. cada 11 bases
Doble hebra DNA estructura Z
1 giro a la izq. cada 12 bases
1 Región promotora
2 RNA transcrito
3 Polimerasas