Genes codificantes Flashcards

1
Q

Hebra sentido (sentido)

A

5’ - 3’

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2
Q

Hebra antisentido (sentido)

A

3’ - 5’

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3
Q

RNA es una copia exacta ( U en vez de T ) de la hebra…

A

Sentido

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4
Q

Hebra RNA (sentido)

A

5’ - 3’

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5
Q

El primer nucleotico del RNA se encuentra…

A

Trifosfatado (PPP)

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6
Q

Secuencias clave para el inicio de la transcripción

A

Factores de transcripción

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7
Q

pre-mRNA

A

Todavía tiene intrones + exones

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8
Q

mRNA maduro

A

Solo exones (ya psaron los loops)

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9
Q

Partes de un gen

A

Cap (centro)
Upstream (-)
Downstream (+)

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10
Q

Que incluye la porción UPSTREAM de un gen

A
  • Región promotora
  • Caja TATA (-35)
  • Caja CAAT (-80)
  • Caja GC (-90)
  • Islas CpG (-100)
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11
Q

¿Que es la caja TATA?

A

Secuencias repetidas de T y A
25 - 35 nc
Sitio de unión de pol-II

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12
Q

¿Que es la caja GC?

A

Elemento regulador
Secuencia: GGGCGG (5’-3’) / GGCGGG (3’-5’)
Genes constitutivos (SIN CAJA TATA)
Se le unen FT SP1, SP2, SP3

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13
Q

¿Que son las islas CpG?

A

Secuencias ricas en G y C ( 20- 50 nc)
GCGCGCGC…
Indican inicio de transcripción
Hipermetiladas = closed
Hipometiladas = open

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14
Q

¿Que es la caja CAAT?

A

Pueden estar 5’-3’ o 3’-5’

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15
Q

Potenciadores distantes

A

Enhancers
Reguladores tipo cis
50 kb upstream del promotor ó downstream en intron / último exón
Pueden ser específicos de tipo c.

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16
Q

Primer potenciador distal descubierto

A

1980
G de virus de simio
SV40

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17
Q

Modificaciones post-transcripcionales

A

Adición de Cap (5’)
Adición de cola de poli-A (3’)
Splicing

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18
Q

¿Que es la adición de la Cap?

A

En región 5’
Lo pone 7-metilguanosina
Protege RNA de degradación enz
Permite transporte a citoplasma
Sitio de unión de fac. prot. para traducción

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19
Q

¿Que es la adición de la cola de poli-A?

A

Adición de 100 - 250 adeninas por PAP
Protege de degradación
Facilita traducción

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20
Q

¿Que es el splicing?

A

Eliminación de intrones y unión de exones

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21
Q

RNA transcrito primario

A

Se acaba de sintetizar
Inmaduro / precursor

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22
Q

Como identificar RNAm inmaduro

A

Reg. UTR (untranslated)
Intrones

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23
Q

Partes del intron

A

Sitio donador (GU)
Sitio aceptor (AG)
Sitio ramificado (A) (20 nc de AG)
exon-GU———A—AG-exon

24
Q

Pasos del splicing

A
  1. Ataque nucleofílico de GU a A
  2. Loop de GU - union con A
  3. 2do ataque nucleofílico a AG
  4. Bye loop
  5. Empalme
25
Q

Splicing alternativo

A

Mismo gen = diferentes isoformas de prot.

26
Q

Complejo prot. mensajero nuc.

A

Prot. heterogeneas nucleares + RNA = transporte a traves de poros hacia citoplasma

27
Q

RNA ribosomal

A

Más abundante (80%)
- Subunidad menor
- Subunidad mayor

28
Q

Subunidad menor 40S

A

33 proteinas
18S

29
Q

Subunidad mayor 60S

A

49 proteinas
28S
5.8S
5S

30
Q

Pasos de maduración de RNAr en núcleolo por pol-I

A
  1. —————hebra 45S—————-
  2. Corte de espaciador 5’ → 41S
  3. Corte → 20S y 32S
  4. Corte →18S, 5.8S y 28S
  5. Asociación de 28S y 5.8S
31
Q

Ss (RNAr) que se transcriben en núcleo por pol-III

A

5S

32
Q

Que region se requiere para la unión de pol-1 en la transcripción del RNAr

A

Ele. compuesto por histonas río arriba (entre -155 y -60)
Sitio de inicio que abarca -40 a +5

33
Q

Iniciación de la pol-1

A
  1. unión fac. de activación multimérico UAF a ele. río arriba
  2. unión fac. de terminación y TBP a elemento central que tmb interactua con UAF
  3. Asociación de complejo con Rrn3p
  4. Se da inicio a la transcripción
34
Q

pre-RNA ribosomal

A

Hebra 45S

35
Q

Que S se le encima a que S en el RNA ribosomal

A

5.8S a 28S

36
Q

Quie hace que se encime S a S

A

snoRNA

37
Q

tRNA procede de…

A

El mismo gen que 5S

38
Q

Unión pol-III para tRNA

A

Caja A = TFIIIB
Caja B = TFIIIC

39
Q

Unión pol-III para 5S

A

Caja A = TFIIIB
Caja B = TFIIIC
Caja C = TFIIIA

40
Q

tRNA longitud

A

75 - 80 nc

41
Q

Maduración de tRNA

A
  1. eliminación de intron (14 nc)
  2. Sec. 5’ (16 nc) eliminada por ribonucleasa P (RNaseP)
  3. Residuo UUU (3’) remplazado cor ACC (para a. a.)
  4. Mod de distintas bases
42
Q

polimerasa de RNAm

A

Pol-II

43
Q

RNAm maduro

A

Cap—–Exones—–Poli-A

44
Q

Estructura de ARNt

A

Loop D 5’ ish
Anticodón
Loop T
Sitio a. a. 3’

45
Q

Los enhancer pueden ayudar…

A

a 2 genes a la vez

46
Q

FT en RNAm permite que…

A

se una pol-II

47
Q

Pasos de síntesis RNAm (transcripción)

A
  1. Identificación sec. reguladoras
  2. FT permiten union de pol-II
  3. Hebra sentido de RNAm (U en vez de T)
  4. Terminación
  5. Mod post.trancripcionales
48
Q

La unión de un nc RNAm…

A

Entran trifosfatados, liberan pirofosfato y se quedan monofosfatados

49
Q

Mod post-tranc RNAr

A
  • Unión a prot
  • Formación de subunidades
50
Q

Gen RNAt y RNAr 5S

A

———A———-B——–C———–

51
Q

Como paso de RNAt inmaduro a RNAt maduro (mod post-tranc)

A
  1. Coste intron 14 nc
  2. Corte de secuencia 5’ 16 nc
  3. cambio UUU a ACC (para unión a. a.)
  4. Cambio bases
52
Q

Receta para genes codificantes

A

Receta: RNAm
Bowl: RNAr
Utensilios: RNAt

53
Q

Doble hebra DNA estructura B

A

1 giro a la der. cada 10 bases

54
Q

Doble hebra DNA estructura A

A

1 giro a la der. cada 11 bases

55
Q

Doble hebra DNA estructura Z

A

1 giro a la izq. cada 12 bases

56
Q
A

1 Región promotora
2 RNA transcrito
3 Polimerasas