Genes codificantes Flashcards

1
Q

Hebra sentido (sentido)

A

5’ - 3’

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2
Q

Hebra antisentido (sentido)

A

3’ - 5’

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3
Q

RNA es una copia exacta ( U en vez de T ) de la hebra…

A

Sentido

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4
Q

Hebra RNA (sentido)

A

5’ - 3’

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5
Q

El primer nucleotico del RNA se encuentra…

A

Trifosfatado (PPP)

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6
Q

Secuencias clave para el inicio de la transcripción

A

Factores de transcripción

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7
Q

pre-mRNA

A

Todavía tiene intrones + exones

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8
Q

mRNA maduro

A

Solo exones (ya psaron los loops)

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9
Q

Partes de un gen

A

Cap (centro)
Upstream (-)
Downstream (+)

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10
Q

Que incluye la porción UPSTREAM de un gen

A
  • Región promotora
  • Caja TATA (-35)
  • Caja CAAT (-80)
  • Caja GC (-90)
  • Islas CpG (-100)
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11
Q

¿Que es la caja TATA?

A

Secuencias repetidas de T y A
25 - 35 nc
Sitio de unión de pol-II

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12
Q

¿Que es la caja GC?

A

Elemento regulador
Secuencia: GGGCGG (5’-3’) / GGCGGG (3’-5’)
Genes constitutivos (SIN CAJA TATA)
Se le unen FT SP1, SP2, SP3

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13
Q

¿Que son las islas CpG?

A

Secuencias ricas en G y C ( 20- 50 nc)
GCGCGCGC…
Indican inicio de transcripción
Hipermetiladas = closed
Hipometiladas = open

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14
Q

¿Que es la caja CAAT?

A

Pueden estar 5’-3’ o 3’-5’

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15
Q

Potenciadores distantes

A

Enhancers
Reguladores tipo cis
50 kb upstream del promotor ó downstream en intron / último exón
Pueden ser específicos de tipo c.

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16
Q

Primer potenciador distal descubierto

A

1980
G de virus de simio
SV40

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17
Q

Modificaciones post-transcripcionales

A

Adición de Cap (5’)
Adición de cola de poli-A (3’)
Splicing

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18
Q

¿Que es la adición de la Cap?

A

En región 5’
Lo pone 7-metilguanosina
Protege RNA de degradación enz
Permite transporte a citoplasma
Sitio de unión de fac. prot. para traducción

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19
Q

¿Que es la adición de la cola de poli-A?

A

Adición de 100 - 250 adeninas por PAP
Protege de degradación
Facilita traducción

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20
Q

¿Que es el splicing?

A

Eliminación de intrones y unión de exones

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21
Q

RNA transcrito primario

A

Se acaba de sintetizar
Inmaduro / precursor

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22
Q

Como identificar RNAm inmaduro

A

Reg. UTR (untranslated)
Intrones

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23
Q

Partes del intron

A

Sitio donador (GU)
Sitio aceptor (AG)
Sitio ramificado (A) (20 nc de AG)
exon-GU———A—AG-exon

24
Q

Pasos del splicing

A
  1. Ataque nucleofílico de GU a A
  2. Loop de GU - union con A
  3. 2do ataque nucleofílico a AG
  4. Bye loop
  5. Empalme
25
Splicing alternativo
Mismo gen = diferentes isoformas de prot.
26
Complejo prot. mensajero nuc.
Prot. heterogeneas nucleares + RNA = transporte a traves de poros hacia citoplasma
27
RNA ribosomal
Más abundante (80%) - Subunidad menor - Subunidad mayor
28
Subunidad menor 40S
33 proteinas 18S
29
Subunidad mayor 60S
49 proteinas 28S 5.8S 5S
30
Pasos de maduración de RNAr en núcleolo por pol-I
1. ---------------hebra 45S---------------- 2. Corte de espaciador 5' → 41S 3. Corte → 20S y 32S 4. Corte →18S, 5.8S y 28S 5. Asociación de 28S y 5.8S
31
Ss (RNAr) que se transcriben en núcleo por pol-III
5S
32
Que region se requiere para la unión de pol-1 en la transcripción del RNAr
Ele. compuesto por histonas río arriba (entre -155 y -60) Sitio de inicio que abarca -40 a +5
33
Iniciación de la pol-1
1. unión fac. de activación multimérico UAF a ele. río arriba 2. unión fac. de terminación y TBP a elemento central que tmb interactua con UAF 3. Asociación de complejo con Rrn3p 4. Se da inicio a la transcripción
34
pre-RNA ribosomal
Hebra 45S
35
Que S se le encima a que S en el RNA ribosomal
5.8S a 28S
36
Quie hace que se encime S a S
snoRNA
37
tRNA procede de...
El mismo gen que 5S
38
Unión pol-III para tRNA
Caja A = TFIIIB Caja B = TFIIIC
39
Unión pol-III para 5S
Caja A = TFIIIB Caja B = TFIIIC Caja C = TFIIIA
40
tRNA longitud
75 - 80 nc
41
Maduración de tRNA
1. eliminación de intron (14 nc) 2. Sec. 5' (16 nc) eliminada por ribonucleasa P (RNaseP) 3. Residuo UUU (3') remplazado cor ACC (para a. a.) 4. Mod de distintas bases
42
polimerasa de RNAm
Pol-II
43
RNAm maduro
Cap-----Exones-----Poli-A
44
Estructura de ARNt
Loop D 5' ish Anticodón Loop T Sitio a. a. 3'
45
Los enhancer pueden ayudar...
a 2 genes a la vez
46
FT en RNAm permite que...
se una pol-II
47
Pasos de síntesis RNAm (transcripción)
1. Identificación sec. reguladoras 2. FT permiten union de pol-II 3. Hebra sentido de RNAm (U en vez de T) 4. Terminación 5. Mod post.trancripcionales
48
La unión de un nc RNAm...
Entran trifosfatados, liberan pirofosfato y se quedan monofosfatados
49
Mod post-tranc RNAr
- Unión a prot - Formación de subunidades
50
Gen RNAt y RNAr 5S
---------A----------B--------C-----------
51
Como paso de RNAt inmaduro a RNAt maduro (mod post-tranc)
1. Coste intron 14 nc 2. Corte de secuencia 5' 16 nc 3. cambio UUU a ACC (para unión a. a.) 4. Cambio bases
52
Receta para genes codificantes
Receta: RNAm Bowl: RNAr Utensilios: RNAt
53
Doble hebra DNA estructura B
1 giro a la der. cada 10 bases
54
Doble hebra DNA estructura A
1 giro a la der. cada 11 bases
55
Doble hebra DNA estructura Z
1 giro a la izq. cada 12 bases
56
1 Región promotora 2 RNA transcrito 3 Polimerasas