Papillomaviridae Flashcards
Qual è la classe di Baltimore a cui appartiene la famiglia Papillomaviridae?
Prima classe di Baltimore.
Chi ha scoperto che l’HPV è la principale causa del cancro della cervice uterina?
Harald zur Hausen.
Quanti generi comprende la famiglia Papillomaviridae?
Fino a 59 generi.
Quanti genotipi comprendono i 5 generi di interesse umano all’interno della famiglia Papillomaviridae?
Più di 150 genotipi.
Come vengono classificati filogeneticamente i genotipi della famiglia Papillomaviridae?
In base all’omologia di sequenza della proteina capsidica maggiore L1.
Come si caratterizza un nuovo genotipo all’interno della famiglia Papillomaviridae?
Per più del 90% di differenza della sequenza di omologia per L1.
A quale livello delle cellule infettano specificamente i papillomavirus?
Lo strato basale degli epiteli, ossia le cellule staminali indifferenziate dello strato basale.
Come si possono classificare i papillomavirus?
In base al sito d’infezione: alcuni di questi possono replicarsi solamente a livello cutaneo, mentre altri solo a livello delle mucose.
Cosa causano le lesioni epiteliali benigne associate ai papillomavirus?
Elevata proliferazione delle cellule basali e ispessimento locale dell’epitelio.
Dove si presentano le lesioni displastiche associate all’integrazione del genoma virale?
A livello ano-genitale o nella cavità orale.
Qual è la struttura del capside dei Papillomavirus?
Icosaedrica di tipo 7d.
Quali sono le proteine del capside dei Papillomavirus?
Proteina L1 e proteina L2.
Quale tipo di genoma hanno i Papillomavirus?
dsDNA circolare di circa 8kb strettamente associato ad istoni.
Cosa codifica la regione precoce del genoma dei Papillomavirus?
Geni precoci (early) che spingono le cellule alla proliferazione e consentono la replicazione.
Cosa codifica la regione tardiva del genoma dei Papillomavirus?
Geni tardivi (late) che ospitano geni per le proteine strutturali del capside.
Cosa contiene la regione regolatoria centrale non trascritta (LCR) del genoma dei Papillomavirus?
Origine di replicazione unidirezionale e promotori per i geni precoci e tardivi.
Quali sono le sequenze coinvolte nella replicazione e trascrizione del genoma dei Papillomavirus?
Sequenze E1 ed E2.
Quali regioni distinguono i genotipi ad alto rischio da quelli a basso rischio nei Papillomavirus?
Le regioni E6 ed E7.
Qual è il ruolo delle regioni E6 ed E7 dei Papillomavirus?
Creare l’ambiente più adatto alla replicazione del virus e spingere la cellula alla proliferazione, bloccando l’apoptosi.
Quali sono le funzioni della proteina precoce E1?
Ha una funzione regolatoria nelle fasi iniziali dell’infezione, collabora con altre proteine per la replicazione del genoma e presenta il sito di legame per l’origine di replicazione.
Che attività svolge la proteina precoce E1?
Ha attività elicasica che promuove la replicazione del DNA virale.
Quali sono le funzioni principali della proteina precoce E2?
Regola la trascrizione virale a livello dei promotori precoci, attiva E1 e controlla la concentrazione delle proteine precoci.
Qual è il ruolo della proteina precoce E2 nei tumori con DNA virale integrato?
E2 è repressore di E6 e E7, principali proteine oncovirali. Nei tumori con DNA virale integrato, la perdita di E2 impedisce il down-regulation della sintesi di E6 ed E7, portando al raggiungimento del primo stadio della trasformazione neoplastica.
Cosa fa la proteina precoce E4?
Promuove il rilascio dei virioni associandosi allo scheletro di cheratina delle cellule e provocando il collasso della rete dei filamenti di cheratina. Questo provoca il fenomeno della coilocitosi, caratterizzato dalla deformazione delle cellule infettate.
Qual è la funzione della proteina precoce E5?
Promuovere la crescita cellulare, attivare il recettore per EGF, inibire l’apoptosi e bloccare l’espressione del complesso maggiore di istocompatibilità, contribuendo all’evasione del sistema immunitario.
Cosa fa la proteina precoce E6?
Legare p53 e promuoverne la degradazione, bloccando l’apoptosi.
Qual è la funzione della proteina precoce E7?
Legare Rb, inibendolo e stimolando la replicazione del DNA e della cellula nonostante l’assenza di segnali di crescita cellulare.
Dove si verifica l’infezione da HPV nei tessuti?
Nello strato basale dei tessuti, a livello dei cheratinociti indifferenziati.
Quali sono le proteine strutturali tardive coinvolte nella replicazione di HPV?
L1 e L2.
Qual è il ruolo della proteina L1 di HPV?
Proteina di attacco virale con un ruolo nell’adsorbimento e consente la classificazione filogenetica dei diversi genotipi.
Qual è il ruolo della proteina L2 di HPV?
Coinvolta nell’endosomal escape e nel trasporto del genoma al nucleo.
Che tipo di virus sono gli HPV in termini di classificazione di Baltimore?
Sono virus della classe I di Baltimore.
Perché è complesso coltivare gli HPV in vitro?
A causa della necessità di una coltura cellulare di cellule basali stratificate che ricalchi l’epitelio presente nel vivente.
Dove avviene la replicazione ad alti livelli di HPV?
Negli strati più differenziati, ossia negli strati squamosi e granulosi.
Cosa determina una differenza antigenica di risposta anticorpale nei diversi genotipi di HPV?
I loop specifici concentrati presenti nella proteina L1.
Come esce il virus HPV dalla cellula?
Attraverso la normale desquamazione.
Cosa permette al virus di assemblarsi e uscire dalla cellula?
L’espressione genica delle proteine virali in base al differenziamento dei cheratinociti.
Cosa attende il virus HPV affinché possa entrare nel nucleo della cellula ospite?
La disgregazione della membrana nucleare quando la cellula entra in mitosi.
Dove si stabilisce il genoma virale nel nucleo della cellula ospite?
Si stabilisce attaccato alla cromatina della cellula ospite.
Cosa accade alle copie del genoma virale mentre le cellule si differenziano?
Vengono mantenute dalla normale divisione della cellula ospite.
Cosa avviene negli strati più differenziati delle cellule?
Vengono espresse le proteine tardive L1 e L2, permettendo il confezionamento e il rilascio del virus attraverso la normale desquamazione.
Cosa determina la manifestazione clinica del virus HPV?
La sede di replicazione virale.
Cosa causa il virus HPV se è cutaneo?
Le verruche.
Cosa può causare il virus HPV se è mucosale?
Papillomi, condilomi, fino a tumori.
Descrivi il processo di adsorbimento del virus HPV.
Il virus infetta le cellule epiteliali dello strato basale tramite L1, che lega i proteoglicani della membrana basale.
Cosa si ipotizza essere l’altro recettore che permette l’interazione del virus HPV?
Si ipotizza che possa essere l’EGFR (recettore per l’epidermal growth factor) oppure l’integrina α6.
Come avviene l’ingresso del virus HPV nella cellula?
L’entrata del virus nella cellula avviene mediante endocitosi, che può essere endocitosi normale, clatrina dipendente o caveosoma dipendente.
Come avviene il trasporto del virus HPV nel nucleo della cellula?
Il virus dentro la cellula viene trasportato attraverso i microtubuli nel nucleo. Può fuggire all’endosoma grazie a L2, proteina della scapsidazione, ed avviene il rilascio del genoma nel nucleo, facilitato anche dalla nuclear envelope breakdown (NEBD).
Cosa deve fare il virus HPV per poter entrare nel nucleo?
Il virus deve aspettare la divisione cellulare per poter entrare nel nucleo.
Cosa avviene nel nucleo della cellula durante il ciclo vitale del virus HPV?
Nel nucleo avviene l’espressione genica e la replicazione del genoma, che dipendono dallo stato di differenziamento delle cellule infettate.
Come viene regolata l’espressione genica del virus HPV?
Viene regolata a livello trascrizionale e post trascrizionale grazie all’utilizzo di diversi promotori e siti di poliadenilazione specifici, e all’utilizzo di splicing alternativo.
Cosa si forma durante l’espressione genica del virus HPV?
Si formano mRNA policistronici che possono codificare per proteine trascritte in momenti ben precisi in base allo stato di differenziamento del cheratinocita infettato.
Come è la replicazione e la trascrizione del genoma del virus HPV?
Sia la replicazione che la trascrizione sono unidirezionali.
Quanti promotori regolano la trascrizione nel genoma dell’HPV?
Ci sono 2 promotori che regolano la trascrizione nel genoma dell’HPV.
Quanti siti di poliadenilazione sono presenti nel genoma dell’HPV?
Ci sono 2 siti di poliadenilazione nel genoma dell’HPV.
Quali sono i tipi di trascritti che si possono ottenere nel genoma dell’HPV?
Si possono ottenere trascritti precoci, trascritti precoci-tardivi e trascritti tardivi.
Quali sono i promotori nel genoma dell’HPV e quali geni guidano l’espressione?
I promotori sono p97, che guida l’espressione dei geni precoci, e p670, che guida l’espressione dei geni precoci-tardivi e tardivi.
Quali sono i segnali di poliadenilazione nel genoma dell’HPV e quali geni utilizzano questi segnali?
I segnali sono pAE, utilizzato per i geni precoci e precoci-tardivi, e pAL, utilizzato per i geni tardivi.
Cosa caratterizza la fase precoce nelle cellule indifferenziate basali nel genoma dell’HPV?
La fase precoce è caratterizzata dal mantenimento e replicazione del genoma e dalla proliferazione cellulare.
Cosa si attiva quando il virus dell’HPV entra nelle cellule indifferenziate basali?
Si attiva la trascrizione a partire dal promotore p97.
Quali proteine vengono espresse nella fase precoce nelle cellule indifferenziate basali dopo l’attivazione del promotore p97?
Le proteine E1, E2, E5, E6 ed E7 vengono espresse nella fase precoce.