04. Genetica Virale Flashcards
Qual è una caratteristica dei virus che coevolvono con l’ospite?
Aumento dell’infettività e calo della patogenicità
Come viene modificato il gneoma virale?
- mutazione
- ricombinazione
- riassortimento genico in virus a genoma segmentato
come vengono classificati i mutanti rispetto al WT?
- letali
- di delezione
- di placca
- di spettro d’ospite
- attanuati
- condizionali
- farmacoresistenti
Mutanti letali
non sono più in grado di riprodursi
mutanti di delezione
perdono parte del genoma
Mutanti di placca
Alterano le dimensioni e la morfologia di una placca.
Placca
Uno degli effetti citopatici, si creano dei buchi nello strato di cellule in crescita. Patognomonici
Mutanti di spettro d’ospite
Possono variare l’ospite o il tropismo tissutale (vedi spillover)
Spillover
Salto di specie da un animale all’altro
Zoonosi
Spillover da altro animale a uomo. Sono i virus più patogenici, perché non si sono coevoluti con l’uomo.
HIV: scimmia
SARS-Cov2: pipistrello
Talvolta lo spillover può non comportare una trasmissione interumana
Mutanti attenuati
Ridotta patogenicità.
Vengono sfruttati in laboratorio per creare vaccini.
Spesso è un processo naturale perché meno patogenicità significa che l’ospite sopravvive di più e dunque maggiore infettività
mutanti condizionali
Sono in grado di replicare solo in certe condizioni
Mutanti farmacoresistenti
sviluppano resistenza ai farmaci antivirali
fattori che influenzano la selezione
- velocità di replicazione
- proteine che sopperiscono alla mancanza degli host factors
- capacità di contrastarre i restriction factors
- capacità di riprodursi ad alta temperatura
- evasione dal SI
- tolleranza ai farmaci
Perché i virus hanno un alto tasso di mutazione?
le polimerasi virali sono error-prone e mancano di capacità di proofreading adeguate
Perché l’elevato tasso di mutazione comunque non comporta la perdita di omogeneità di popolazione?
- poche mutazioni sono compatibili con la replicazione
- elevata pressione selettiva
- la mutaizone vantaggiosa diventa preponderante
Come è definito il tasso di mutazione virale?
Nucleotidi/anno
Tasso di mutaizone dei virus a ssDNA
Molto basso, perché usano la DNApol eucariotica
Che cosa muta nell’antigenic drift?
Emoagglutinina HA e neuraminidasi NA
Emoagglutinina
Proteina responsabile dell’ingresso nei virus influenzali, attacca l’acido sialico.
Coadiuva la gemmazione, attaccando nuovamente l’as ed incastrando la particella virale
Neuraminidasi
Proteina che coadiuva la gemmazione dei virus influenzali.
Taglia il legame tra HA e acido sialico permettedo la diffusione
Epidemie annuali di influenza
Neuraminidasi edemoagglutinina sono gli antigeni riconosciuti ed ogni anno mutano
Ricombinazione
Scambio di materiale genico tra due genomi. Ci deve essere una coinfezione di due virus geneticamente correlati
Ricombinazione in virus a DNA
Ricombinaizone classica, con gli enzimi cellulari deputati alla ricombinaizone omologa.
Avviene anche nei Poxivirus, a replicazione citoplasmatica che portano geni per enzimi ricombinanti propri
Ricombinazione in virus a RNA
Ricombinazione Copy Choice.
La RNA replicazi si dissocia dallo stampo e ne copia un altro.
Tipico dei Picornavirus
Ricombinazione nei retrovirus
Il genoma diploide gli permette di evolversi velocemente, perché la ricombinaizone può avvenire tra copie identiche
quando avviene il riassortimento genico?
Coinfezione da parte di due ceppi di uno stesso virus a genoma segmentato
riassortimento genico
virus a genoma segmentato si scambiano segmenti corrispettivi
Di che famiglia è tipico il riassortimento genico?
Virus influenzali di tipo A
