03. classificazione di Baltimore Flashcards

1
Q

su cosa si basa la classificazione di Baltimore?

A

“cosa devono fare i virus per produrre mRNA”
ssRNA+

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Q

ganoma classe I

A

dsDNA

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3
Q

genoma classe II

A

ssDNA

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4
Q

ganoma classe III

A

dsRNA

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5
Q

ganoma classe IV

A

ssRNA+

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6
Q

ganoma classe V

A

ssRNA-

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7
Q

ganoma classe VI

A

ssRNA+

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8
Q

ganoma classe VII

A

dsDNA parzialmente monocatenario

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9
Q

enzimi duplicazione classe I-II

A

DNA polimerasi DNA dipendenti

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10
Q

enzimi duplicazione classe III-IV-V

A

RNA polimerasi RNA dipendente

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11
Q

enzimi duplicazione classe VI

A

il genoma viene convertito da ssRNA+ a dsDNA. RNA polimerasi DNA dipendente

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12
Q

enzimi duplicazione classe VII

A

intermedio genomico a RNA. DNA polimerasi RNA diependente (HBV)

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13
Q

enzimi trascrizione classe I-II

A

RNA polimerasi DNA dipendente

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14
Q

enzimi trascrizione classe III-IV-V

A

RNA polimerasi RNA dipendente

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15
Q

enzimi trascrizione classe VI-VII

A

RNA polimerasi DNA dipendente

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16
Q

In che gruppi si diviiide la classe I

A

replicazione nucleare
replicazione citoplasmatica

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17
Q

virus a replicazione nucleare della classe I

A

usano la RNApol DNAdip dell’ospite. Usano TF sia virali che cellulari, sia ss che ds. Possono avere introni.
- papillomaviridae
- adednoviridae
- herpesviridae

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18
Q

virus a replicazione citoplasmatica di classe I

A

Poxiviridae, codifica per la propria RNA polimerasi DNA dipendente

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19
Q

virus di classe I che codificano per il macchinario replicativo

A

Herpesviridae, Adenoviridae, Poxiviridae. Svincola la fase S del ciclo

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20
Q

Virus che non codificano il macchinario replicativo, classe I

A

Poliomaviridae, Papillomaviridae

21
Q

Geni precocissimi

A

codificano per proteine necessarie nelle primissime fasi dell’infezione, in quanto preparano l’ambiente cellulare per la replicazione e fungono da innesco a cascata per la trascrizione delle proteine precoci

22
Q

geni precoci

A

replicazione del genoma

23
Q

geni tardivi

A

proteine strutturali

24
Q

Qual’è l’unica famiglia di virus di Classe II di interesse clinico?

A

Parvoviridae
agente della V malattia
virus nudi, provocano lisi cellulare negli eritroblasti

25
Q

Caratteristiche comuni ai virus a RNA

A
  • usano lo stesso enzima per replicazione e trascrizione (RpRd)
  • codificano per la RpRd
  • lavorano velocemente
  • error prone
  • enzimi per cap, splicing e teil
  • fase intermedia di dsRNA
26
Q

Unica famiglia di Classe III di interesse clinico

A

Reoviridae
Respiratory Enteric Orphan.
Rotavirus, provoca diarrea e disidratazione.
Genoma segmentato, ad ogni segmento è associata una Rp, la trascrizione avviene nel capside.
Presentano 2/3 capsidi, dentro la cellula perdono il primo e trascrivono all’interno

27
Q

Caliciviridae

A

virus nudo
trascritti senza Cap, ma con PolyA.
Le proteine precoci sono tutto il trascritto, quelle tardive sono RNA subgenici
comprende Norovirus e HEV

28
Q

Picornaviridae

A

non hanno Cap ma sequenzaa IRES che permette la trascrizione senza Cap.
Blocca la trascrizione dei trascritti con cap
comprende:
- Poliovirus
. Enterovirus
- HAV

29
Q

Flaviviridae

A

IV classe. Contiene IRES, e tutti gli Arbovirus. Con envelope, traducono l’inttero genoma in un unica poliproteina poi tagliata
- Dengue
- Zika
- West Nile
- Yellow fiver
- Japanese Encaphalitis
- Meningoencefalite da zecche
- HCV

30
Q

Mantonaviridae

A

IV classe.
Comprende solo la rosolia, che causa malattie esantematiche infantili ed è un teratogeno.
Envelope
genoma a RNA con cap e poliA

31
Q

Coronaviridae

A

IV classe
raffreddori stagionali e virus emergenti (SARS e MERS)
Zoonosi
Genoma molto grande, replicazione readthrough: l’RNA+ viene tradotto il poliproteina e poi, con frameshift in proteina lab, formando le proteine strutturali tra cui RpRd, che trascriverà il filamento stampo come ssRNA- (antigenoma), che viene utilizzato come stampo per la replicazione

32
Q

V classe replicativa

A

ssRNA-, non infettivo
Nel citoplasma deve essere trascritto a ssRNA+ da una RpRd, proteina strutturale.
Tra i trascritti c’è il genoma full-lenght, stampo per il ssRNA+
Contiene virus a genoma segmentato e non

33
Q

Virus di V classe a genoma segmentato

A

Orthomixoviridae, Bunyaviridae

34
Q

Virus di V classe a genoma non segmentato

A

Pneumoviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae.
Replicazione tramite trascrizione a gradiente

35
Q

Paramyxoviridae

A

Contiene il Morbillo (R0: 12-18)

36
Q

Pneumoviridae

A

Virus non segmentati simili ai Paramixoviridae, come il Virus Respiratorio Sinciziale, che da Bronchite Neonatale

37
Q

Rhabdovirus

A

Non segmentato, comprende il virus della rabbia, il più letale conosciuto.
Colpisce il SNC. è una zoonosi.
Polarità negativa.
Trascrizione a gradiente

38
Q

Trascrizione a gradiente

A

I geni hanno regioni intrageniche e una sequenza leader al 3’, partenza della polimerasi. Questa trascrive fino alla prima sequenza genica, dove la maggior parte delle volte si dissocia, ma una piccola percentuale continua. Ripetendo per più frammenti, si ha una grande concentrazione dei primi prodotti genici, che cala più si va avanti nel genoma.
Contraddistingue tutti i virus di V classe con genoma non segmentato

39
Q

Filoviridae

A

V classe, genoma non segmentato.
Contiene virus Marburg ed Ebola.
Zoonosi da scimmie–> pipistrelli

40
Q

Orthomyxoviridae

A

V classe, segmentato
Virus influenzali a potenziale epidemico
due gruppi:
- A: danno pandemie, causato da zoonosi
- B: epidemie annuali

41
Q

Quale famiglia a RNA fa replicazione nucleare?

A

Orthomyxoviridae

42
Q

Antigenic shift

A

scambio di materiale tra virus simili, facilitato dal genoma segmentato

43
Q

Antigenic drift

A

Mutazione delle proteine dell’envelope, che causa influenze stagionali (orthomyxoviridae)

44
Q

Bunyaviridae

A

V classe, genoma segmentato.
Hantavirus, causa febbre emorragica trasmessa da roditori

45
Q

VI classe

A

ssRNA+, che si replicano passando per un intermedio a DNA.
Il genoma viene retrotrascritto e si integra nella cellula ospite.
Usa le proteine strutturali retrotrascrittari e integrasi, e la RNApolII ospite.
Espressione regolata tramite RNA subgenomici spliced o unspliced

46
Q

Retroviridae

A

Unici della VI classe,
Producono virioni immaturi, che subiscono maturazione a carico di proteasi virali.
Comprende HIV (1 e 2) e HTLV1 (orthoretrovirinae) che causa leucemia T-cellulare

47
Q

VII classe

A

dsDNA parzialmente monocatenario.
Dopo l’ingersso, viene completata la parte a ssDNA, e generati ssRNA+.
Questi comprendono degli RNA subgenomici e un RNA full-lenght.

Quest’ultimo viene inserito nel capside e retrotrascritto prima ad ibrido poi a dsDNA parzialmente monocatenario.

Necessitano di RpDd e di Dp(R/D)d

48
Q

Hepadnaviridae

A

Componente principale della VII classe. Comprende HBV.
Genoma molto piccolo da 5 proteine, che viene espanso tramite varie strategie.

Le proteine S dell’envelope sono importanti per l’adsorbimento e il vaccino