Microbiologie Flashcards

1
Q

Principaux pathogènes des voies respiratoires supérieures

A
  • Streptococcus pneumoniae
  • Streptocoque B-hémolytique
  • Moxarella catarrhalis
  • Haemophilus influenzae
  • Neisseria spp.
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Q

Principaux pathogènes de la bouche

A
  • Streptocoques groupe viridans
  • Anaérobes
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3
Q

Principaux pathogènes de la peau

A
  • Streptocoques B-hémolytiques
  • Staph aureus
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4
Q

Principaux pathogènes grêle + côlon

A
  • Entérobactéries
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5
Q

Pathogènes génito-urinaire (possibles, pas d’emblée)

A

Femmes : lactobacillus, anaérobes, streptocoques, levures

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6
Q

Quand prescrire le SMU-DCA

A

Habituellement chez tous les patients qui se présentent avec sx urinaires compatibles

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7
Q

Quand peut-on éviter de prescrire le SMU-DCA

A

On peut l’éviter chez les jeunes femmes
- non enceintes
- avec sx typiques
- sans fièvre
- sans facteur de risque d’infection résistante

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8
Q

Votre patient asx vous demande de lui prescrire une analyse d’urine, quoi faire ?

A

On ne prescrit pas une culture d’urine chez un patient asx, sauf exceptions

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9
Q

Quelles flores peuvent contaminer le SMU-DCA

A

Flores digestive, génito-urinaire, cutanée

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10
Q

Quels pathogènes peuvent contaminer le SMU-DCA

A
  • Streptocoques groupe viridans
  • Staph à coagulase négative (sauf S. saprophyticus)
  • Corynébactéries
  • Gardnerella vaginalis
  • Levures
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11
Q

Principales bactéries causant l’infection urinaire la plupart du temps

A
  • Entérobactéries, dont Escherichia coli, Klebsiella sp., Proteus mirabilis
  • Cocci gram + : Staphlococcus saprophyticus (classique dans l’infection urinaire chez la jeune femme)
  • Streptocoque B-hémolytique du groupe B
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Enterococcus faecalis
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12
Q

V/F
La bactérie retrouvée en infection urinaire dans un mi-jet sera identifiée par le laboratoire seulement si elle est un pathogène reconnu en quantité suffisante

A

Vrai
La quantité retrouvée en infection urinaire dans un mi-jet est supérieure à 10^7-8 UFC/L

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13
Q

Demander la culture d’expectorations dans le cas d’une pneumonie acquise en communauté ?

A

Non
En externe, habituellement pas recommandée

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14
Q

Demander la culture d’expectorations dans le cas d’une pneumonie nosocomiale ?

A

Oui, recommandée

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15
Q

Culture d’expectorations recommandée si ?

A
  • pneumonie nécessitant hospitalisation/sévère
  • Histoire de colonisation par des germes plus résistants
  • Détérioration sous abx
  • Hospitalisation récente et utilisation d’abx dans les 3 derniers mois
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16
Q

Principaux pathogènes flore buccale et ORL

Colonisants potentiellement pathogènes

A

VRS
- Streptococcus pneumoniae
- Streptocoques B-hémolytiques
- Moraxella catarrhalis
- Haemophilus influenzae
Bouche
- Strep groupe viridans
- Anaérobes

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17
Q

Patient se présente pour toux, expectorations, fièvre et DEG

À la culture d’expectorations
- > 25/champ polynucléaires
- < 10/champ cellules épithéliales
- Bacilles gram nég en quantité ++
- Culture démontre Haemophilus influenzae

Conclusion ?

A

Probablement pneumonie sur Haemophilus influenzae
Peu de cellules épithéliales et beaucoup de bacilles gram -/polynucléaires : peu de salive dans l’échantillon d’expectoration et bon échantillon

18
Q

De quoi dépend l’interprétation de la culture d’urine

A

Dépend du SMU, de la bactérie identifiée et de la quantité (décompte) retrouvée

19
Q

De quoi dépend l’interprétation de la culture d’expectorations

A

Dépend de la qualité du spécimen et de l’examen microscopique

20
Q

Utilités de la culture des expectos

A
  • Surtout utile pour les pneumonies bactériennes à germe « typique »
  • Si culture positive, peut identifier le germe responsable
  • L’antibiogramme fait sur la culture permet de donner un tx ciblé
  • Permet de connaître l’épidémiologie
21
Q

Limites de la culture des expectos

A
  • Il faut pouvoir expectorer
  • Il faut interpréter en fonction du fait que la flore peut être retrouvée sans être en cause
  • Idéalement, il faut obtenir le spécimen avant les abx
  • Le résultat de la culture peut prendre quelques jours à sortir
22
Q

Quand demander les hémocultures si probabilité élevée de bactériémie

A

Demander de routine

23
Q

Dans quelles pathologies la probabilité de bactériémie est élevée ?

A
  • Sepsis
  • Ostéomyélite/discite vertébrale/abcès épidural
  • Méningite
  • Arthrite septique (non traumatique)
  • Suspicion d’endocardite et autre infection intravasculaire
  • Infection de cathéter
24
Q

Quand demander les hémocultures si probabilité modérée de bactériémie (dans quelles pathologies)

A

Le plus souvent, dans les pathologies suivantes :
- PNA
- Cholangite
- Abcès du foie
- Pneumonie acquise en communauté sévère
- Pneumonie acquise sous ventilateur
- Cellulite chez l’immunosupprimé

25
Q

Pathogènes les plus fréquents qui doivent toujours être considérés comme significatifs dans une hémoculture

A
  • Staph aureus
  • Strep. B hémolytique
  • Strep pneumoniae
  • Entérobactéries (E. coli)
  • Haemophilus influenzae
  • Bacteroides (bacille Gram - anaérobie)
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Candida (levure)

Ne doivent jamais être considérés comme des contaminants

26
Q

Bactéries le plus souvent significatives, mais peuvent parfois être des contaminants dans l’hémoculture

A
  • Entérocoque
  • Strep groupe viridans
27
Q

Bactéries souvent (mais pas exclusivement) contaminants dans l’hémoculture

A
  • Staphylocoques à coagulase neg
  • Corynébactéries
  • Cutibacterium acnes
  • Bacillus sp
  • Micrococcus sp

Ce sont des bactéries de la peau

28
Q

V/F
Concernant l’hémoculture, plus l’inoculum est grand, plus le temps de positivité est petit

A

Vrai

29
Q

Sur quels éléments repose l’interprétation des hémocultures ?

A
  • Le nombre de bouteilles positives p/r au nombre total de bouteilles prélevées
  • Le temps de positivité
  • Le site de prélèvement (cathéter vs périphérie)
  • La probabilité de bactériémie selon le tableau clinique
30
Q

Comment prescire les hémocultures ?

A

Hémocultures (x2)

Prélèvement sur 2 sites de ponctions veineuses, souvent en périphérie
2 bouteilles par ponction (aérobie et anaérobie) = 4 bouteilles au total

31
Q

Comment prescrire la PL ?

A

Analyse à faire sur le LCR

32
Q

Quelles sont les analyses qu’on peut prescrire sur le LCR ?

A
  • Biochimie sur le LCR (glucose et protéines)
  • Gram STAT et culture bactérienne
  • Décompte cellulaire
  • Autres analyses, telles que le PCR méningite multiplex et le PCR spécifique herpès types I et II
33
Q

Sur quoi repose l’interprétation de la PL

A

Dépend de la biochimie, du décompte cellulaire, de la bactérie identifiée et du tableau clinique

34
Q

Quoi faire si on ne peut pas procéder en urgence à la PL ?

A

Hémocultures x2 STAT (en urgence)
PL dès que possible

35
Q

Principaux microorganismes de la flore cutanée pouvant contaminer le LCR ?

A
  • Streptocoques B hémolytiques
  • Staph aureus

Autres : Corynebacterium sp, Staphylocoques à coagulase négative

36
Q

Principales bactéries à ne jamais considérer comme contaminants dans le LCR ?

Selon l’âge et le statut immunitaire

A
  • Streptococcus pneumoniae (méningite à pneumocoque)
  • Neisseria méningitidis (méningocoque)
  • Haemophilus influenzae
  • Streptocoque B-hémolytique de groupe B (chez les plus jeunes enfants)
  • Escherichia coli (chez les plus jeunes enfants)
  • Listeria monocytogenes
37
Q

À quoi ressemble l’infection lors de l’analyse du LCR ?

A
  • GR : 0
  • GB augmentés
  • Glucose diminué
  • Protéines augmentées
  • PCR : positif à E. coli par ex. ou autre pathogène
38
Q

Principaux virus à ne jamais considérer comme contaminants dans le LCR

A
  • Herpès type I et II (encéphalite herpétique)
  • Varicella zoster
  • Entérovirus
39
Q

Quelles investigations microbiologiques doit-on demander avant les abx ?

A
  • SMU-DCA
  • Culture des expectos (si possible)
  • Hémoculture (à tout prix)
  • PL (si ça ne retarde pas le tx)
40
Q

Qu’est-ce qu’un pathogène potentiel ?

A

Microorganismes de la flore qui peuvent, lorsque certaines conditions chez
l’hôte le permettent (bris cutané, infection, etc.), devenir pathogène
Exemples:
- Streptococcus pneumoniae causant une pneumonie après un rhume
- Staphylococcus aureus dans le sang d’un patient avec cathéter veineux
central

41
Q

Investigations microbiologiques en ambulatoire

A
  • Requête pour SMU-DCA
  • Culture des expectorations (si recommandée et facteurs de risque en externe, mais pas la norme)

Autres investigations (pas microbiologiques) : RxP, prise de sang

42
Q

Investigations microbiologiques à l’urgence/hôpital

A
  • PL
  • Hémocultures
  • Culture expectorations