La synthèse protéique Flashcards
De quoi se compose le code génétique? Expliquer ce que c’est.
Le code génétique se compose de codons : mots de 3 lettres. Ce terme se rapporte d’habitude à des triades nucléotidiques d’ARNm, mais il peut représenter des triades d’ADN d’un gène (ex : UAC (ARNm)/TAC (ADN) = tyrosine).
Vrai ou faux : Les codons sont toujours traduits à la suite l’un de l’autre dans le sens 3’ —> 5’.
Faux : Les codons sont toujours traduits à la suite l’un de l’autre dans le sens 5’ —> 3’.
Vrai ou faux : Tout codon ne prescrit qu’une seule espèce d’acide aminé.
Vrai : Le code génétique est dépourvu d’ambiguïté.
Que sont les codons synonymes?
Ce sont divers codons spécifiant un acide aminé.
Que permet le fait que pour la plupart des acides aminés, il existe plusieurs codons (le code génétique est dégénéré)?
La dégénérescence du code génétique atténue l’effet des mutations parce que le changement d’une seule base forme souvent un codon qui spécifie encore le même acide aminé.
Quels sont les deux seuls acides aminés spécifié par une seul codon?
La méthionine (AUG) et le tryptophane (UGG)
Quels sont les 3 codons parmi l’ensemble des 64 codons qui ne spécifient pas des acides aminés? Que font-ils?
Les 3 autres codons (UAA, UGA et UAG) sont des codons de terminaison ou codons-stop.
Qu’est-ce que le cadre de lecture du code génétique? Qu’est-ce qui repose sur le cadre de lecture?
C’est le point de départ potentiel d’une suite de codons.
La traduction fidèle du code génétique repose donc sur la fixation du cadre de lecture approprié à la traduction d’une région donnée de la séquence nucléotidique.
Quels sont les 3 cadres de lecture possible?
ARNm : AUGCAUGCAUGC
1er : AUG/CAU/GCA/UGC
2e : A/UGC/AUG/CAU/GC
3e : AU/GCA/UGC/AUG/C
*Par quel nucléotide on commence la lecture
Qu’est-ce que le cadre de lecture ouvert?
C’est la partie d’un cadre de lecture avec le potentiel d’encoder une protéine. C’est une série de codons sans codon de terminaison.
Quel est le codon d’initiation?
AUG
Quelles sont les quatre types de mutations? Expliquer les.
-Mutation silencieuse : on change un nucléotide du codon sans changer l’identité de l’acide aminé
-Mutation faux-sens : on change l’acide aminé et souvent cela a un effet, surtout quand l’acide aminé est très différent
-Muation non sens : un codon de terminaison substitue un codon qui encodait un acide aminé et cela a un effet
-Muation de continuation : on perd un codon de terminaison et donne une protéine avec une extension C-terminale mais fonctionnelle
Quel est le rôle des ARN de transfert (ARNt)?
Les molécules d’ARN de transfert servent d’interprètes à la lecture du code génétique, elles sont les médiatrices-clés entre la séquence nucléotidique de l’ARNm et la séquence d’acides aminés polypeptidique.
*Ce rôle exige que la cellule dispose d’au moins 20 espèces différentes d’ARNt (un pour chaque acide aminé) et que chacun de ces ARNt puisse reconnaître au moins un codon de l’ARNm.
Décrire la structure 2D des ARNt (3 caractéristiques principales).
-Les bases de l’extrémité 5’ s’appartient à celles de la région bordant l’extrémité 3’ pour former une tige appelée tige acceptrice ou tige de l’acide aminé.
-La boule située à l’opposé de la tige acceptrice porte l’anticodon, séquence de 3 bases qui se fixe de façon complémentaire à un codon de l’ARNm. Le lobe qui porte l’anticodon est désigné lobe anticodon.
-Deux des lobes de l’ARNt se distinguent par le fait qu’ils comportent des nucléotides modifiés par covalence. Parmi ces lobes, celui qui porte une thymidine (t) suivie d’une pseudo-uridine (w) et d’une cytidine (c) est désigné lobe twc tandis que le lobe contenant des résidus dihydro-uridine est appelé lobe D.
Quelle est la fonction du lobe anticodon?
Reconnaître le codon
Comment les molécules d’ARNt reconnaissent les molécules d’ARNm?
Grâce à l’appariement des anticodons avec les codons de façon antiparallèle.
Les appariements suivent les mêmes règles (A avec U, G avec C).
Cependant, il a été observé des variants tolérants d’autres types d’appariement en position 5’ de l’anticodon (G-U).
Qu’est-ce que le wobble?
Cet appariement à choix multiple suggère que la position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation est ce qui est nommé wobble.
*C’est pourquoi la position 5’ de l’anticodon est souvent appelée position de flottement.
Vrai ou faux : Certains ARNt peuvent reconnaître plus d’un codon.
Vrai
Que sont les ARNt isoaccepteurs?
Les diverses molécules d’ARNt qui portent toutes le même acide aminé sont appelées ARNt isoaccepteurs.
*Le flottement confère à certaines molécules d’ARNt la liberté de reconnaitre plus d’un codon, mais il faut souvent plusieurs molécules d’ARNt pour reconnaître tous les codons synonymes.
*Ce terme s’applique aussi bien aux molécules d’ARNt de même anticodon, mais de séquence nucléotidique primaire différente.
Comment un acide aminé se lie-t-il? À qui? Quel est le produit de cette réaction?
Un acide aminé déterminé se lie par covalence à l’extrémité 3’ de la molécule d’ARNt qui lui correspond. Le produit de cette réaction d’aminoacylation est un aminoacyl-ARNt.
Comment peut-on qualifier la liaison formée dans l’aminoacyl-ARNt? Comment appel-t-on alors ces molécules?
Comme la liaison ainsi formée dans l,aminoacyl-ARNt est riche en énergie, on dit que l’acide aminé est activé en vue de son futur transfert à la chaîne polypeptidique en croissance.
Les molécules d’aminoacyl-ARNt sont appelées molécules d’ARNt activées ou chargées.