Kapitel 6 - Kontaminsnten und Assays Flashcards

1
Q

Analyse Methoden für die Heterogenität von mAbs?

A
  • Eine wichtige Eigenschaft von Antikörpern ist deren Heterogenität, insbesondere
    Ladungsheterogenität - Analysemethoden:
    o Ladung:
    Nano Kapillarelektrophorese (nanoCE), Isoelektrische Kapillar Fokussierung (cIEF), Chromatofokussierung, 2dimensionale Elektrophorese, Ionenaustauschchromatographie
    o Hydrophobizität:
    Hydrophobe Interaktionschromatographie (HIC), Umkehrphasenchromatographie ( RP)
    o Größe:
    Size Exclusion Chromatographie (SEC), Natriumdodecylsulfat- Polyacrylamidgelelektrophorese (SDS-Page), Natrumdodecylsulfat- Kapillarelektrophorese (SDS-CE), Massenspektrometrie
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2
Q

Welche Gründe gibt es um den Herstellungspreises zu verändern?

A

bessere Ausbeuten, besseres scale-up, neue
Technologien, zunehmende Reinheit, neue Formulierungen oder Produkt delivery Systeme →kann jedoch die Sicherheit des Systems oder Effizienz des Produkts herabsetzen

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3
Q

Was und warum muss ein Produkt nach einer änderung beurteilt und verglichen werden?

A

o Ist eine Veränderung am Produkt aufgetreten? o Falls ja, hat dies Auswirkungen auf die Sicherheit oder Effizienz?

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4
Q

Die meisten biologischen veränderungen am Produkt können mit Hilfe von hoch entwickelten Technologien erfasst werden. (Nach prozessänderung) Welche Fragen bleiben trotzdem?

A

o Wie viel Veränderung an einem Produkt ist zulässig bis die Sicherheit oder
Wirksamkeit beeinfluss wird? o Wenn eine Veränderung besteht, aber es scheint keine nachteilige Wirkung zu haben
, ab welchem Punkt handelt es sich um ein neues Produkt? o Was sind die kritischen Qualitätsattribue (CQA), die miteinander verglichen werden
müssen und sind diese wichtig für die breite Produktklasse oder wird ihre Relevanz
nur von Fall zu Fall untersucht?

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5
Q

Was sind qualitätsattribute (CQA)? Beispiele

A

o Nur noch Fragmente da →Disulfidbrücken wurden zerstört o Fehlfaltung o Variable Region verändert o Zucker verändert (Untersuchung der Glykolisierung)→keine Immunantwort wird
getriggert

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6
Q

Analytische methode zur Beurteilung der Heterogenität: SDS-PAGE.
Funktionsweise?

A

o Trennt Proteine aufgrund ihrer elektrophoretischen Mobilität (Funktion der Länge
des Polypeptids und der Ladung)
o SDS ist ein anionisches Tensid (negativ geladen), das Proteine entfaltet
Wird ein Protein auf 100°C in Anwesenheit von SDS erhitzt, umschlingt SDS das
Polypeptid Rückgrat (1,4g SDS/gPolypeptid) und überdeckt die Eigenladung
→erlaubt die Auftrennung nach der Kettenlänge, proportional zu Molekülmasse (
längere Moleküle werden im Gel stärker zurückgehalten als Kurze)
Ohne SDS würden Moleküle gleicher Größe unterschiedlich wandern, da sie
unterschiedliche Ladungen aufweisen → SDS löst dieses Problem
o Reducing SDS-PAGE: Reduktionsmittel (DTT oder 2-mercaptoethanol) werden beim
Erhitzen hinzugegeben → weitere Denaturierung durch Entfernung von
Dusilfidbrücken

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7
Q

Analytische methode zur Beurteilung der Heterogenität: Kapillarelektrophorese (CE)
Funktionsweise?

A

o Viel schneller als eine Gelelektrophorese
o Wanderung geladener Teilchen in einem (meist flüssigen) Medium unter Einfluss
eines elektrischen Feldes
o Eine Kapillare taucht mit beiden Enden in ein mit Elektrolyt befülltes Gefäß und eine
Spannung wird angelegt. Sobald die Trennung abgeschlossen ist muss der Inhalt der
Kapillare an einem Detektor vorbei geführt werden (Single point detection).
o NanoCE: ähnliche Merkmale der SDS-PAGE werden integriert: Trennung, Färbung,
Entfärbung und Detektionsschritte →Analysemethode in einem Chip

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8
Q

Analytische methode zur Beurteilung der Heterogenität: Isoelektrische Fokussierung (IEF)
Funktionsweise?

A

o Elektrophoretische Auftrennung aufgrund des relativen Gehalts an sauren und
basischen Aminosäureresten in einer Kapillare oder einem Gel → je nach pH Wert
tragen AS unterschiedliche Ladungen → am pI ist Nettoladung gleich Null → Protein
wandert nicht mehr
o Detektion mit Hilfe einer UV-Messung über die ganze Säule oder einer single point
detection

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9
Q

Analytische methode zur Beurteilung der Heterogenität: 2D-Dige-Gelelektrophorese Funktionsweise?

A

o Kombination der isoelektrischen Fokussierung (IEF) (Auftrennung aufgrund des pI)
mit einer SDS-PAGE (Auftrennung nach Massengewicht).
o Different gel electrophoresis (DIGE) ist eine Form der Gelelektrophorese, bei der drei
unterschiedliche Proben mit drei verschiedenen Fluoreszenzfarbstoffen (z.B. Cy3,
Cy5, Cy2) markiert und aufgetrennt werden →Farbstoffe können separat detektiert
werden. Danach werden alle Proben vermischt und eine 2D-Elektrophorese
durchgeführt
o Bei 2D-DIGE-Gelelektrophorese kann man Proben aus verschiedenen
Prozessschritten direkt miteinander vergleichen und erkennt sehr schnell, ob sich
Prozesslösung verändert hat

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10
Q

Analytische methode zur Beurteilung der Heterogenität: High Performance Liquid Chromatography (HPLC).
Funktionsweise?

A
o Ionenaustauschchromatographie (CEX), Analyse der Ladung von mAb o Protein A Chromatographie,  In der Analytik: Quantifizierung der mAb Konzentration o Size Exclusion Chromatography (SEC), am häufigsten bei mAb: Bestimmung der
Reinheit und Überwachung der Aggregation o Reversed Phase (RP) /Hydrophobe Interaktionschromatographie (HIC)
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11
Q

Welche Strukturmerkmale (deren Änderung) bei mAbs können die Heterogenität erhöhen?

A
.antigenbinding Region
.fab 
.hinge
Carbohydryte Site
.effector Funktion
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12
Q

Welche Formen der Heterogenität gibt es?

A
.disulfide shuffling
.pyrpglutamate
.deamidation/Oxidation
.fragmentation
.glycosylation
.Truncation
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13
Q

Welchen Einfluss haben disulfidbrücken auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

→wichtig für den Aufbau und Zusammenhalt für die strukturelle Funktion
o Jede leichte Kette ist über eine Disulfidbrücken mit je einer schweren Kette
verbunden und jede schwere Kette ist zu der anderen schweren Kette mit zwei bis
vier Disulfidbrücken verbunden. o Jedes IgG hat 12 Domänen und jede Domäne enthält in der Kette eine Disulfidbrücke
(Intra)
Reaktion:
o Bei manchen IgG Spezien gibt es freie Sulfhydryl (-SH) Gruppen und Reaktive Cystein
Reste
(Freie Sulfhydryl aufgrund von unvollständiger Bildung einer Intra-Disulfidbrücke)
Nachweis:
o +2Da: Größenheterogenität: Massenspektrometire (Eine einzelne unvollständige
Disulfidbrücke führt zu zwei freien Sulfhydryl Gruppen und einer Erhöhung des Molekulargewichts um 2Da)
o pI: Größen-und Ladungsheterogenität: bei neutralem pH ist freies Sulfhydryl nicht
geladen, es löst aber dennoch strukturelle Veränderungen aus was die Größen- und Ladungsheterogenität beeinflusst
Auswirkung:
o Unvollständige Disulfidbrücken können „dusilfide bound scrambling“ auslösen,
besonders unter denaturierenden Bedingungen → kann zur Bildung Disulfidbrücken zwischen Fragmenten führen (sichtbar bei SDS-PAGE und SDS-CE) →v.a. bei IgG4 ein Problem, wegen der Instabilität Disulfidbrücken (zwischenkettig= inter) der Hinge-Region

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14
Q

Welchen Einfluss haben oligosaccharide. auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

o Oligosachharid Heterogenitäten treten meist während der Oligosaccharid Synthese
und der Verarbeitung auf
Reaktion:
Alle IgGs haben N-gebundedene Oligosaccharide an der Fc-Region (CH2-Domäne)
und ca 15-20% enthalten N-gebundene O. in der variablen Region.
→bei einigen mAbs ist die Überwachung der Kohlenhydrat Heterogenitäten während
des Prozesses schwierig, da „differential sialylation“, Galaktosylierung und
Fucosylierung die Funktionsfähigkeit beeinflussen können. Auftreten können:
▪ CDC: Complement-dependent cytotoxity ▪ ADCC: Antibody-dependent cellular cytotoxity ▪ Veränderung von Pharmakokinetiken ▪ Veränderung der Antigenbindungsfähigkeit
Nachweis:
o + xx Da: Größenheterogenität: Detektion mit Hilfe von Massenspektrometrie
o pI: mehr sauer
o Ladung: Oligosaccharid Heterogenität: negativer und weniger hydrophob
▪ HIC (AK mit zusätzlichen O. an der Fab Region sind weniger hydrophob und
eluieren früher) ▪ Kationentauscher (AK mit zurätzlichen O. sind negativer geladen und
eluieren früher)

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15
Q

Welchen Einfluss haben N-Terminal Pyroglutamat Bildung auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

o Der N-Terminal Rest besteht bei den schweren Ketten des humanen IgGs entweder
aus Glutamin oder aus Glutamat.
Reaktion:
o Dabei bilden die meisten Glutamine einen cyclische Struktur: Pyroglutamat Nachweis:
o -17/-18 Da: Massenspektrometrie
o pI: mehr sauer
o Ladung: negativer und mehr hydrophob (Verlust eines primären Amins am N-Ende →
mehr saure Spezies und negativere Ladung)
▪ RP/HIC (AK eluieren später)
▪ Kationentauscher (AK eluieren früher)

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16
Q

Welchen Einfluss haben C-Terminal Lysine Processing
auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

Reaktion:
o Der Lysinrest am C-Terminal der schweren Kette wird nicht in der Gensequenz codiert. →Carboxypeptidasen können dann den kompletten Rest entfernen
Nachweis:
o -128 Da: IEF oder cIEF
o pI: mehr sauer
o Ladung: -1 unit: HIC oder RP oder Ionentascher

17
Q

Welchen Einfluss haben Desaminierung auf die Heterogenität?

Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

o Kann in jedem Prozessschritt auftreten: nach der Sekretion, während der
Aufreinigung, während der Lagerung und unter verschiedenen Stressbedingungen
Reaktion:
o Nicht-enzymatische Desamidierung von Asparagin oder Glycin, gefolgt von einer
Hydrolyse (Ergibt Isoaspartat und Aspartat im Molaren Verhältnis von 3:1) Nachweis: o +1 Da: Massenspektrometrie (Strukturelle Veränderungen durch Hinzufügen einer
Methylgruppe) o pI: mehr sauer o Ladung:
▪ Kationentauscher (AK ist negativer geladen und eluiert früher) ▪ IEF (AK bewegt sich schneller)

18
Q

Welchen Einfluss haben oligosaccharide auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

Reaktion:
o Aspartat-Rest ist anfällig für eine Isomerisierung (zu Isoaspartat) o Isomerisierung von asparagin zu isoaspartat o Asparagin Desaminierung: Succinimide
Nachweis:
ISOASPARTAT:
o Ladung:
▪ Kationentauscher (AK ist negativer geladen und eluiert früher) →Problem:
Manche AK mit Isoaspartat eluierten später als AK mit Aspartat →nicht allein
die Ladung, sondern auch die Struktur haben Einfluss, DARUM: ) ▪ HIC (AK eluiert später, AK hydrophober) o Strukturelle Änderungen: ▪ Massenspektrometrie
SUCCINIMIDE
o pI: mehr basisch und weniger polar
o Ladung:

19
Q

Welchen Einfluss haben Oxidation auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung Welchen Einfluss haben oligosaccharide. auf die Heterogenität?
Regionen, Nachweis, Auswirkung

A
Reaktion:
o Methionin (Met) ist eines der am Meisten anfälligen Reste für eine Oxidation o Tritt auf nach langer Lagerung, Inkubation bei erhöhten Temperaturen oder bei
Anwesenheit von Oxidationsmitteln
Nachweis: METHIONIN
o +16 Da: Massenspektrometrie
o pI: mehr basischer und mehr polar
o Ladung: positiver, weniger hydrophob
▪ HIC (AK eluiert früher)
▪ Schwacher Kationentauscher (AK eluiert später)
TRYPTOPHAN
o SEC (AK eluiert früher)
o RP (AK eluiert früher)
20
Q

Welchen Einfluss haben Glykation auf die Heterogenität?

Regionen, Nachweis, Auswirkung

A

o Ungleich Glykolisierung, da es sich um eine nicht-enzymatische Reaktion handelt o Tritt auf wenn Sprühgetrockneter monoklonaler AK mit einem molaren Verhältnis
von 300:1 (Laktose:AK) bei 30°C für 9 Monate gelagert wird →100% Glykolation
Nachweis:
o pI: mehr Sauer

21
Q

Merkmale zur fragmentieren? Was ist zu beachten? Wann kann es dazu kommen?

A
  • Muss beobachtet werden, um die Reinheit und Integrität des Proteins festzulegen
  • Fragmentierung: Fingerabdruck von Herstellung und Stabilität →Zum Vergleich von Produkten
    , die an verschiedenen Stellen hergestellt wurden - Zur Fragmentierung kann es kommen während:
    o Der Proteinproduktion in der Zellkultur, o Wird durch das Reinigungsverfahren moduliert o Und wird sich während der Lagerung anreichern o Oder im Blut Zirkulieren
  • Fragmentierung entsteht durch: Bruch einer kovalenten Bindung als Folge einer spontanen
    oder enzymatischen Reaktion →im Folgenden wird nur nicht-enzymatische Fragmentierung
    betrachtet (Vor allem an ASP/GLY/SER/THR/CYS/ASN)
22
Q

Wovon hängen fragmentierungs Mechanismen ab?

A

.lösemittelbedingungen (pH-Wert, Temperatur)
.Anwesenheit von spezifischen Resten (AS- Sequenz)
.Anwesenheit von Metallen und Radikalen
.Flexibilität der lokalen Struktur

23
Q

Effekte der fragmentierung auf die Funktion von mAbs

A
  • Fragmentierung in der CDRS
    Auswirkung auf die Bindung von mAb mit Antigen - Fragmentierung in der Hinge Region
    Das Fab-Fragment besitzt keine Fc-Effektorfunktion mehr und hat eine geringere
    Halbwertszeit.
    Das Fc-Fac-Fragment ist nicht wirksam, wenn der Zielrezeptor die Interaktion mit beiden Fab-
    Armen benötigt - Fragmentierung in der konstanten Region
    Auswirkung entweder auf den Fc-Effektor oder auf die Halbwertszeit. - Insgesamt: Auswirkung auf die Qualität des Produkts (auch durch Erhöhung der
    Aggregationsraten)
24
Q

Methoden zur Kontrolle und Quantifizierung der Fragmente (fragmentierung)?

A
  • SEC, SDS-PAGE, CE-SDS (Methode: Auftrennung aufgrund von Größe des Proteins)
  • Chromatographie (Methode: Auftrennung aufgrund der Chemie von AS Ketten)
25
Q

Methoden zur Identifizierung der genauen spaltungsrate (Fraktionierung)

A

Massenspektrometrie (MS)

26
Q

Merkmale für SEC zur kontrolle und Quantifizierung von Fragmenten (fragmentierung)?

A

Die Spaltung der Peptidbindung kann nur Detektiert werden, wenn die beiden Fragmente räumlich getrennt werden. Besonders die Spaltung an der oberen Hinge Region kann gut gemessen werden (unter nativen Bedingungen), da sie Fab und Fc Fragmente miteinander verbindet und diese nach der Spaltung frei dissoziieren können. Schlecht nachweisbar sind Spaltungen in gefaltetetn IgG Domänen (nur mit Denaturierung und/oder Reduktion von Disulfidbrücken)

27
Q

Merkmale für SDS-PAGE oder CE-SDS

zur kontrolle und Quantifizierung von Fragmenten (fragmentierung)?

A

Die Spaltung kann gut detektiert werden, ABER Identifizierung der Spaltstelle schwierig

28
Q

Wie funktioniert „Sandwich Elisa „?

A

o Eine Mikrotiterplatte ist mit dem aufgereinigten AK beschichtet o Probe wird hinzugegeben → Antigen bindet an spezifischen AK o Ein zweiter AK, der zur Detektion gebraucht wird, wird hinzugegeben → detecting Ak
bindet spezifisch an Antigen o Ein dritter AK, an dem ein Enzym geknüpft ist, bindet an detecting AK o Ein Substrat wird hinzugegeben → an AK gekoppeltes Enzym katalysiert die
Umsetzung des Substrats → z.B. Farbumschlag

29
Q

Wie funktioniert AlphaLisa?

A

AlphaLisa = Quantitativer Nachweis von humanem Insulin (sandwich assay)
.Im Detektionskit enthalten sind zwei mAbs gegen Insulin, die jeweils an ein Bead (
Donor und Akzeptor) gekoppelt sind
→Basiert auf einer Signalamplifikation →Die Bindung der beiden AK an der Analyt
bringt Donor und Akzeptor in unmittelbare Nähe o Bei Bestrahlung mit 680nm wird Sauerstoff der umgebende Sauerstoff der
Donorbeads in den angeregten Singulett-Zustand überführt, der eine chemische
Kaskade auslöst. o Angeregter Sauerstoff mit den Akzeptorbeads und erzeugt ein Signal mit der
Wellenlänge 370nm→ Energie wird auf Fluorophore im Akzeptor übertragen.
→die Emissionswellenlänge verschiebt sich dadurch auf 615nm.