Introduction aux techniques de diagnostic microbiologique Flashcards
comment se fait détection directe de l’agent pathogène ?
- examen µcopique avec ou sans coloration
- examen macroscopique reste utile aussi
pq examen macroscopique ?
voir aspect consistances selles, urines
intérêt examen direct?
- donne résultat rapide présomptif au clinicien
- visualisation pathogène =) choix de culture à ensemencer
rai ou faux examen µcopique peut se faire avec ou sans coloration ?
Vrai
en qui consiste l’examen à frais ?
- observer prélèvement µcope
- sans colorant
- champ noir / contraste de phase
à quoi sert l’examen à frais?
visualiser organismes mobiles : endospores, spirochètes..
que permet l’encre de chine, d’iodine ou Lugol, et KOH ?
visualiser pathogènes recherchés
citez des parasites sanguins extracellulaires ?
- toxoplasmes
- trypanosomes
- µfilaires
comment peut-on diagnostiquer les parasites sanguins extracellulaires ?
examen µcopique entre lame et lamelle
qu’est ce qui permet de visualiser plus facilement plasmodies, µfilaires et trypanosomes au niveau d’une couche leucocytaire?
centrifugation de sang en tubes capillaires héparinés
que permet centrifugation du sang après lyse des érythrocytaires ?
obtenir µfilaires ds le culot
comment peut-on visualiser certains parasites intestinaux?
- à frais
- examen µcopique des selles
- sans coloration, ni fixation
quels autres méthodes peut-on utiliser pr visualiser les parasites intestinaux?
méthode de concentrations
quels sont les méthodes de concentration pour examen des selles ?
- méthodes de sédimentation-concentration : kystes de protozoaires, oocytes de coccidies, œufs d’helminthes
- méthodes Baerman et Harada_mori pr concetrer les larves d’anguillule
les colorations les plus fréquemment utilisées?
- coloration de Gram =) bactério
- coloration de Giemsa =) hématho et anapath
- coloration de Zhiel Nielsen
- fluorescence
en quoi consiste la coloration de Gram ?
différencier bactéries sur base de la nature de leur paroi
les étapes de la coloration de Gram ?
- coloration au cristal violet qui se lie au peptidoglycane de la paroi bactérienne
- fixation avec le Lugol
- décoloration à l’acétone alcool
- contre coloration au rouge de safranine
ds la coloration de Gram avec quoi fait-on la fixation ?
lugol
ds la coloration de Gram avec quoi fait-on la décoloration ?
acétone d’alcool
ds la coloration de Gram avec quoi fait-on la contre-coloration ?
rouge de safranine
ds la coloration de Gram avec quoi fait-on la coloration de départ ?
cristal violet
ds la coloration de Gram où se lie le cristal violet ?
peptidoglycane de la paroi bactérienne
couleur des bactéries ayant résisté à la décoloration ?
violet = bactéries Gram +
en qupi seront contre-colorées le bactéries ayant été décolorées ?
rose-rouge = bactéries Gram -
role de l’alcool ?
détruire mem externe des Gram - =) bactéries se décolorent
à quoi coloration de Giemsa est-il utilisé pour ?
-détecter et identifier certaines formes: d'Histoplasma capsulatum Pneumocysttis jirovecii et des parastes Toxoplasma gondii Leishmania sp Plasmodium trypanosome et µfilaires
principe de Zhiel Nielsen
- principe d’acido-alcoolo résistance des mycobactéries
étapes du Zhiel-Nielsen ?
- coloration en carbofushine
- décoloration à l’aide de HCl et alcool
- contre coloration en bleu de méthylène
quelle couleur prennent les mycobactéries acido-alcoolo résistantes au Ziel-Nielsen ?
rose
quelle couleur prennent les mycobactéries acido-alcoolo non résistantes au Ziel-Nielsen ?
contre-colorées en bleu
quelle couleur prennent les bactéries qui se sont décolorées ?
celle de contre-coloration
calcofluor utilisé pq ?
blanchissement papier + textile
intérêt du calcofluor en microbio?
- se lie à la chitine et cellulose
- produit florescence sous UV
que permet le calcofluor de mettre en évidence ?
champignons
levures
à l’aide de µcope à fluorescence
que utilise d’autres les techniques de fluorescence pour mettre en évidence les µcobactéries
l’auramine
avantage de la fluorescence ?
- visualiser des pathogènes à plus faible grossissement
- seuil de détection plus bas =) utlile qd y’a pas de germes
Vrai/ F les parasites sanguins ne peut être détectés à frai par µcopie à fluorescence ? si Vrai comment ?
faux
peut se faire à l’aide de sondes fluorescentes
comment peut-on rechercher des œufs d’helminthes , d’oocytes ou de kystes de protozoaires ?
- examen direct de selles fixées au formol
- avec ou sans colorant
Vrai/F la détection de trophozoïtes d’Entamoeba de Giardia et d’oocytes de Cryptospridium peut se faire par µcopie à fluorescence en utilisant des anticorps monoclonaux marqué à la fluorescéine ?
vrai
à quel moment peut-on conclure à 1 absence de parasites ds les selles ?
3 examens successifs négatifs (sur des prélèvements différents )
V/F des examens après fixation et coloration ne peuvent être réalisés sur moelle osseuse ?
F
que recherche t-on au niveau des prélèvements de la moelle osseuse ?
Leishmanies
ds quel domaine le µcope électronique est le plus utilisé?
vriologie
nbre de particules nécessaires pr être visualisées ?
10^6
ds quels spécimens peut-on détecter des virus ?
selles
frottis de peau
vésicules
quels types de virus retrouvent-on ds les selles ?
rotavirus adénovirus norwal like viruses astrovirus calicivirus
quels types de virus trouvent-on ds les liquides vésiculaires ?
HSV
VZV
quels types de virus trouve-ton ds les frottis de peau?
orf
Molluscum contagiosum
V/F µcopie électronique peut aussi être utile pour le diagnostic des microsporidioses ?
V
principaux problèmes ave µcopie électronique ?
équipement couteux
entretien couteux
faut expérience
sensibilité souvent basse
V/F détection d’Ag par EIA peut se faire que les Ag soit associées avec des cellules ou en phase liquide ?
V
quel avantage détection d’Ag par EIA?
- applicable à différents types d’échantillons
- automatisable
quel est le principe d’hémagglutination ?
-mettre en évidence des microorganismes recherché
comment on met en évidence les microorganismes qu’on recherche par hémagglutination ?
par la détection de sa propriété d’agglutiner des érythrocytes
à quoi dépend le choix de la mise en culture bactériologique (isolement bactérie) ?
- type de prélèvements
- pathogène recherché
que trouve t-on ds les milieux neutres lors de l’isolement de bactéries
- peptone
- infusion de foie et de cervelle
lors de l’isolement de bactéries que contiennent les milieux enrichis et que permet-ils ?
- vitamines, facteurs de croissance, du sang , a.a
- permet croissance
que contiennent les milieux sélectifs ?
AB, antiseptiques, sels biliaires =) comme milieux neutres
que permet les milieux sélectifs ?
sélectionner 1 pathogène ds 1 flore commensale et inhiber sa croissance
que contiennent les milieux chromogènes ?
des indicateurs colorés de pH
utilité des milieux enrichis ?
produire 1 métabolite coloré permettant identification de la bactérie