Instabilité du génome I Flashcards
Qu’est-ce qu’un allèle?
Un ou plusieurs variants d’un même gène qui est présent dans la séquence nucléotidique.
Qu’est-ce qu’un variant?
Séquence nucléotidique trouvée dans l’ADN génomique qui diffère de la séquence de référence.
Qu’est-ce qu’un locus génétique?
La localisation d’un gène sur un chromosome.
Combien d’allèle il y a à chaque locus?
2 allèles, une sur chaque chrosome.
Comment peuvent être les allèles d’une paires de chromosomes homologues?
- Homozygotes (identiques)
- Hétérozygotes (différentes)
Qu’est-ce que le génotype?
L’information génétique (séquence de l’ADN) complète d’un individu pour un gène donné (allèle).
Ex: BB, Bb, bB, bb
Qu’est-ce que le phénotype? De quoi dépend le phénotype?
Des traits ou les caractéristiques observables chez un organisme déterminés par:
- génotype
- facteurs environnementaux (épigénétique)
- mutations
En général quel est le dogme de la biologie moléculaire?
- ADN
-transcription - ARN
-Traduction - Protéine
Que veut dire le code génétique est dégénéré?
Plusieurs codons encodent pour le même acide aminé.
Qu’est-ce que les mutations?
Ce sont des modifications de la séquence nucléotidique présentes dans le génome d’un organisme.
Qu’es-ce qui peut causer des mutations?
- Des erreurs lors de la réplication ou la réparation de l’ADN.
- Des dommages à l’ADN lors de la mitose ou la méïose.
- Des dommages à l’ADN causés par des agents mutagènes.
- Les mutations peuvent aussi être causées par des insertions ou délétions d’éléments d’ADN mobiles dans le génome.
Quels sont les processus biologiques dans lesquels les mutations sont impliquées?
- Évolution
- Diversité génétique
- Cancer
- Développement du système immunitaire
Quels sont les 2 grands types de mutation de l’ADN?
- Mutation à petite échelle: ADN
- Mutation à grande échelle: Chromosome
Quels sont les types de mutation à petite échelle: ADN?
- Ponctuelle
- Insertion/Délétion
Quels sont les sous-types de mutations à petite échelle (ADN) de type ponctuelle?
- Silencieuse
- Faux-sens
- Non-sens
- Décalage du cadre de lecture
Quels sont les sous-types de mutations à grande échelle (chromosome)?
- Duplication
- Translocation
- Insertion/délétion
- Inversion
Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?
Mutation qui implique la modification d’un seul nucléotide.
Quel est l’effet d’une mutation sur la protéine?
- Affecte la fonction de la protéine
- Affecte la localisation de la protéine
- Affecte la stabilité (durée de vie) de la protéine
- Affecte son interactome (interaction avec d’autres protéines)
- Affecte la transcription de l’ADN en ARNm
- Affecte la stabilité de l’ARNm
- Affecte l’épissage de l’ARNm
Qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
Mutation qui ne change pas la nature de l’acide aminé encodé puisque le code génétique est dégénéré et que plusieurs codons codent pour le même acide aminé.
Qu’est-ce qui est affecté par une mutation silencieuse?
- La transcription de l’ADN:
-affecte la forme tridimensionnelle de l’ARNm. - L’épissage de l’ARNm
-Si la mutation est localisée à proximité d’un site d’épissage, il pourra être affecté, ce qui peu contribuer à la perte d’un exon, ou phénomène d’échappement de l’exon (exon skipping). - La traduction de l’ARNm:
-S’il s’agit d’un codon rare, l’ARNt sera peu disponible et une mutation silencieuse contribuera à ralentir la synthèse protéique et ainsi réduire les niveaux finaux de la protéine dans la cellule. - La liaison d’autre ARN ou protéines à l’ARNm mutant.
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens?
Mutation qui change le codon et donc code pour un acide aminé différent.
Qu’est-ce qui est affecté par une mutation faux-sens?
- Affecte la fonction et/ou la localisation de la protéine.
- Affecte la durée de vie de la protéine.
- Certaines mutations causent des phénotypes plus graves que d’autres: l’anémie falciforme
Comment une mutation faux-sens cause l’anémie falciforme?
- Mutation E6V de la sous-unité bêta crée des interactions hydrophobiques qui font interagir les tétramères entre eux en long filaments ce qui déforme le globule rouge
- La mutation HbS positionnée vers la fin de la sous-unité bêta
Est-ce que les mutations faux sens ont que des effets négatifs (anémie calciforme)?
Non, ils ont aussi des effets bénéfiques:
- Certaines mutations de l’hémoglobine qui cause l’anémie falciforme protège les individus contre la malaria:
-HbA/HbA: hémoglobine viable et ne protège pas contre la malaria (hémoglobine normale)
-HbA/HbS: malade et protège contre la malaria (hémoglobine mutante)
-HbS/HbS: malade sévère et cause le décès
Quels sont les sous-types de mutation faux sens et quels sont leurs caractéristiques?
- Substitution conservatrice (glycine)
-peu d’impact sur le repliement de la protéine et la fonction est conservée - Remplacement radical (glutamine (-))
-ajoute une charge négative qui empêche le bon repliement de la protéine et cause une perte de fonction
Qu’est-ce que les mutations sensibles à la température?
Ce sont des mutations faux-sens, dites conditionnelles, qui affectent le repliement des protéines à certaines températures.
Qu’est-ce que les mutations non-sens?
Mutation qui induit la formation d’un codon STOP prématuré.
Quels sont les conséquences des mutations non-sens?
- Donne une protéine tronquée
-Avec ou sans préservation partielle de sa fonction
-Avec un changement de fonction (peut agir comme dominant négatif ou avoir un gain-de-fonction par exemple) - L’impact sur la fonction dépend de l’endroit où se trouve la mutation (au début, millieu, fin de la protéine)
