Génome 4: Anomalies génétiques Flashcards
Reste à faire: FC détaillé + Reannales Vitamine + Révision FC
Quels sont les 4 niveaux d’organisation du génome ?
- Le niveau linéaire : la fibre d’ADN s’enroule sous forme de chromatine et de chromosome
(visible sur le caryotype) - Les boucles chromatiniennes : permet la mise en contact de différents domaines chromatiniens afin de moduler l’expression génique (2dimensions)
- Les domaines chromatiniens comportant plusieurs boucles de régulation chromatinienne (3D)
- Territoire chromosomique : au sein du noyau comportant plusieurs domaines chromatiniens (4D)
A quelles pathologies une cellule vivante est exposée ?
- Des agressions extérieures (radiations et agents génotoxiques de l’environnement)
- Des agressions endogènes (radicaux libres) = métabolisme naturel de l’organisme,
- Des erreurs de réplication
- Des accidents de recombinaison.
Par <3 !
Qu’est ce qu’une mutation ?
Une mutation désigne n’importe quel changement intervenu dans la séquence de l’ADN, sans préjuger de sa pathogénicité à l’échelle du gène ou du chromosome.
Quelles sont les 2 types de mutations possibles ?
- Mutation somatique
- Mutation germinale
Qu’est ce qu’une mutation somatique ?
Une mutation somatique a lieu dans une cellule somatique d’un tissu et elle sera présente dans les cellules filles au niveau de ce tissu.
Exemple : Implication dans les cancers.
Qu’est ce qu’une mutation germinale ?
Une mutation germinale a lieu au niveau d’un gamète parental,lors de la méiose, elle sera présente de façon « constitutionnelle » chez l’individu. Issu de ce gamète, puis transmissible de génération en génération et à l’origine des mutations «anciennes ».
Qu’est ce qu’un polymorphisme ?
Un polymorphisme est une mutation et peut se situer en région codante ou non codante.
Sur quoi repose la notion de polymorphisme ?
- Le caractère non pathogène de la variation
- La fréquence dans la population (> à 1% par définition).
Donner les principales catégories de polymorphisme :
- Les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms)
- Les CNVs (Copy Number Variation)
- Les Polymorphisme de répétition (Autres polymorphismes : RFLP, …)
Qu’est ce qu’une macrolésions ?
Les macrolésions sont des anomalies à l’échelle du chromosome de nombre ou de structure (translocations, délétions, duplications).
Qu’est ce qu’une microlésion ?
Les microlésions sont des anomalies à l’échelle du gène. Comme:
* les substitutions d’1 nucléotide
* les insertions/délétions de quelques nucléotides
* les insertions/délétions de quelques 10aines de nucléotides
* Les insertions/délétions de quelque 100aines de nucléotides (A part : Mutations dynamiques).
Concernant les macrolésions du génome quel types d’anomalie peuvent exister ?
- Anomalies du nombre de chromosomes : perte ou gain d’un ou de plusieurs chromosomes entiers,
- Anomalies de la structure des chromosomes : remaniement structural des chromosomes (translocations, délétions, duplications, etc.)
Qu’est ce qu’une aneuploïdie ?
Les aneuploïdies concernent une paire de chromosomes ou plusieurs paires de chromosomes.
Exemple : Trisomie 21.
Ce sont les anomalies chromosomiques les plus fréquentes et la cause la plus fréquente de déficience intellectuelle.
Qu’est ce qu’une polyploïdie ?
Les polyploïdies concernent un lot complet de 23 chromosomes. Exemple : Triploïdie = 69 chromosomes. Ils sont responsables des fausses couches spontanées.
Qu’est ce que la mutation faux-sens ?
La mutation faux-sens n’est pas toujours responsable d’un effet pathogène. En effet, la modification d’acide α aminé au niveau de la protéine peut être tolérée par la cellule sans conséquence délétère.
Qu’est ce que la mutation non-sens ?
La mutation non-sens entraine des mutations généralement pathogènes et/ou la perte ou le gain de fonction.C’est un signal prématuré d’arrêt de la traduction.
Qu’est ce que la mutation isosémentique ?
La mutation isosémentique peut avoir un effet délètère éventuel sur l’ARNm (donc pas totalement silencieuse). Le codon initial et muté codent pour le même acide aminé.
Qu’est ce qu’une microlésion en séquence non-codante ?
Les microlésions en séquence non-codante peuvent être de type substitution ou délétions/insertions, sont en dehors de la séquence codante et provoquent des altérations de séquences régulatrices. Elles ne sont pas toujours pathogènes. Aucune correspondance impliquant le code génétique
Quelle est l’origine d’une aneuploïdies ?
concerne une paire de chromosomes (ou plusieurs paires)
Anomalies chromosomiques les plus fréquentes
Quelle est l’origine d’une polyploïdie ?
Concerne un lot complet de 23 chromosomes
Donner un exemple d’aneuploïdie:
La trisomie 21, cause la plus fréquente de déficience intellectuelle
Donner un exemple de polyploïdie:
La triploïdie = 69 chromosomes, responsable de fausses couches spontanées.
Quels sont les différents mécanismes survenant lors qu’une anomalie de structure impliquant un seul chromosome ?
- Délétion: perte de fragments chromosomiques
- Duplication de fragments chromosomiques
- Inversion de fragments chromosomiques
Quels sont les différents mécanismes survenant lors qu’une anomalie de structure impliquant 2 chromosome ?
- Insertion de fragments chromosomiques
- Translocation échange de fragments chromosomiques
Quelles sont les conséquences des anomalies de structure ?
- Formation de gamètes avec l’anomalie de structure
- L’anomalie pourra donc être présente au niveau de l’œuf fécondé (zygote)
- En général (!! Pas toujours !!) perte ou gain de fragments
chromosomiques, donc perte ou gain de matériel génétique = DESEQUILIBRE
Quelle est la cause des anomalies de structure des chromosomes ?
Dues à des remaniements structuraux des chromosomes (au cours de la méiose ++ ou de la mitose .
Quelle est la cause des anomalies du nombre des chromosomes ?
Dues à des anomalies de disjonction des chromosomes (au cours de la méiose ++ ou de la mitose pour les cellules somatiques) .
Donner les 2 méthodes d’analyses des anomalies génétiques à l’échelle des chromosomes (cytogénétique) :
Examen “de base” en cytogénétique
Examen avec une résolution plus importante
