Génome 4: Anomalies génétiques Flashcards

Reste à faire: FC détaillé + QCM +++ (OP & Vitamine)

1
Q

Quels sont les 4 niveaux d’organisation du génome ?

A
  • Le niveau linéaire : la fibre d’ADN s’enroule sous forme de chromatine et de chromosome
    (visible sur le caryotype)
  • Les boucles chromatiniennes : permet la mise en contact de différents domaines chromatiniens afin de moduler l’expression génique (2dimensions)
  • Les domaines chromatiniens comportant plusieurs boucles de régulation chromatinienne (3D)
  • Territoire chromosomique : au sein du noyau comportant plusieurs domaines chromatiniens (4D)
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2
Q

A quelles pathologies une cellule vivante est exposée ?

A
  • Des agressions extérieures (radiations et agents génotoxiques de l’environnement)
  • Des agressions endogènes (radicaux libres) = métabolisme naturel de l’organisme,
  • Des erreurs de réplication
  • Des accidents de recombinaison.
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3
Q

Par <3 !

Qu’est ce qu’une mutation ?

A

Une mutation désigne n’importe quel changement intervenu dans la séquence de l’ADN, sans préjuger de sa pathogénicité à l’échelle du gène ou du chromosome.

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4
Q

Quelles sont les 2 types de mutations possibles ?

A
  • Mutation somatique
  • Mutation germinale
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5
Q

Qu’est ce qu’une mutation somatique ?

A

Une mutation somatique a lieu dans une cellule somatique d’un tissu et elle sera présente dans les cellules filles au niveau de ce tissu.
Exemple : Implication dans les cancers.

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6
Q

Qu’est ce qu’une mutation germinale ?

A

Une mutation germinale a lieu au niveau d’un gamète parental,lors de la méiose, elle sera présente de façon « constitutionnelle » chez l’individu. Issu de ce gamète, puis transmissible de génération en génération et à l’origine des mutations «anciennes ».

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7
Q

Qu’est ce qu’un polymorphisme ?

A

Un polymorphisme est une mutation et peut se situer en région codante ou non codante.

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8
Q

Sur quoi repose la notion de polymorphisme ?

A
  • Le caractère non pathogène de la variation
  • La fréquence dans la population (> à 1% par définition).
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9
Q

Donner les principales catégories de polymorphisme :

A
  1. Les SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms)
  2. Les CNVs (Copy Number Variation)
  3. Les Polymorphisme de répétition (Autres polymorphismes : RFLP, …)
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10
Q

Qu’est ce qu’une macrolésions ?

A

Les macrolésions sont des anomalies à l’échelle du chromosome de nombre ou de structure (translocations, délétions, duplications).

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11
Q

Qu’est ce qu’une microlésion ?

A

Les microlésions sont des anomalies à l’échelle du gène. Comme:
* les substitutions d’1 nucléotide
* les insertions/délétions de quelques nucléotides
* les insertions/délétions de quelques 10aines de nucléotides
* Les insertions/délétions de quelque 100aines de nucléotides (A part : Mutations dynamiques).

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12
Q

Concernant les macrolésions du génome quel types d’anomalie peuvent exister ?

A
  • Anomalies du nombre de chromosomes : perte ou gain d’un ou de plusieurs chromosomes entiers,
  • Anomalies de la structure des chromosomes : remaniement structural des chromosomes (translocations, délétions, duplications, etc.)
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13
Q

Qu’est ce qu’une aneuploïdie ?

A

Les aneuploïdies concernent une paire de chromosomes ou plusieurs paires de chromosomes.
Exemple : Trisomie 21.
Ce sont les anomalies chromosomiques les plus fréquentes et la cause la plus fréquente de déficience intellectuelle.

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14
Q

Qu’est ce qu’une polyploïdie ?

A

Les polyploïdies concernent un lot complet de 23 chromosomes. Exemple : Triploïdie = 69 chromosomes. Ils sont responsables des fausses couches spontanées.

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15
Q

Qu’est ce que la mutation faux-sens ?

A

La mutation faux-sens n’est pas toujours responsable d’un effet pathogène. En effet, la modification d’acide α aminé au niveau de la protéine peut être tolérée par la cellule sans conséquence délétère.

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16
Q

Qu’est ce que la mutation non-sens ?

A

La mutation non-sens entraine des mutations généralement pathogènes et/ou la perte ou le gain de fonction.C’est un signal prématuré d’arrêt de la traduction.

17
Q

Qu’est ce que la mutation isosémentique ?

A

La mutation isosémentique peut avoir un effet délètère éventuel sur l’ARNm (donc pas totalement silencieuse). Le codon initial et muté codent pour le même acide aminé.

18
Q

Qu’est ce qu’une microlésion en séquence non-codante ?

A

Les microlésions en séquence non-codante peuvent être de type substitution ou délétions/insertions, sont en dehors de la séquence codante et provoquent des altérations de séquences régulatrices. Elles ne sont pas toujours pathogènes. Aucune correspondance impliquant le code génétique

19
Q

Quelle est l’origine d’une aneuploïdies ?

A

concerne une paire de chromosomes (ou plusieurs paires)
Anomalies chromosomiques les plus fréquentes

20
Q

Quelle est l’origine d’une polyploïdie ?

A

Concerne un lot complet de 23 chromosomes

21
Q

Donner un exemple d’aneuploïdie:

A

La trisomie 21, cause la plus fréquente de déficience intellectuelle

22
Q

Donner un exemple de polyploïdie:

A

La triploïdie = 69 chromosomes, responsable de fausses couches spontanées.

23
Q

Quels sont les différents mécanismes survenant lors qu’une anomalie de structure impliquant un seul chromosome ?

A
  1. Délétion: perte de fragments chromosomiques
  2. Duplication de fragments chromosomiques
  3. Inversion de fragments chromosomiques
24
Q

Quels sont les différents mécanismes survenant lors qu’une anomalie de structure impliquant 2 chromosome ?

A
  1. Insertion de fragments chromosomiques
  2. Translocation échange de fragments chromosomiques
25
Q

Quelles sont les conséquences des anomalies de structure ?

A
  • Formation de gamètes avec l’anomalie de structure
  • L’anomalie pourra donc être présente au niveau de l’œuf fécondé (zygote)
  • En général (!! Pas toujours !!) perte ou gain de fragments
    chromosomiques, donc perte ou gain de matériel génétique = DESEQUILIBRE
26
Q

Quelle est la cause des anomalies de structure des chromosomes ?

A

Dues à des remaniements structuraux des chromosomes (au cours de la méiose ++ ou de la mitose .

27
Q

Quelle est la cause des anomalies du nombre des chromosomes ?

A

Dues à des anomalies de disjonction des chromosomes (au cours de la méiose ++ ou de la mitose pour les cellules somatiques) .

28
Q

Donner les 2 méthodes d’analyses des anomalies génétiques à l’échelle des chromosomes (cytogénétique) :

A

Examen “de base” en cytogénétique
Examen avec une résolution plus importante