Aminoacides Flashcards
Reste à faire: Learn un max + Correct Annales + Révision/Ajuster FC
Qu’est ce qu’une protéine ?
une protéine est un constituant extrêmement important des cellules vivantes, tant au niveau qualitatif que quantitatif. Elles représentent en général plus de la moitié du poids sec de la cellule. Les protéines sont le produit de l’expression de l’information génétique qui permettent l’exécution.
Quelle est la différence entre les acide aminé et les peptides ?
On va distinguer :
- Les acides aminés = aminoacides (AA)
- Les Peptides = enchaînement d’aminoacides liés par liaison peptidique (chaîne courtes) -
Protéines = polypeptides (long peptides)
Quelles sont les protéines qui ont un rôle biologique capital ?
- Enzymes qui sont des catalyseurs biologiques indispensables au déroulement des réactions dans la cellule
- Des transporteurs, comme l’albumine qui est un transporteur que l’on retrouve dans le sérum et le plasma
- Des récepteurs cellulaires
- Des hormones
- Des anticorps qui ont un rôle très important dans le système immunitaire - Protéines de
réserve = ovalbumine…
Combien il y a d’acide aminé ?
Il existe un 21ème acide–aminé rare (découvert récemment) : sélénocystéine, il est incorporé dans les protéines au cours de la traduction comme les 20 que l’on va voir (à partir de la sérine)
Qu’est ce qui constitue un acide aminé ?
Un acide aminé est un composé qui possède :
- Une fonction acide carboxylique COOH ou COO- (sous forme ionisée)
- Une fonction basique amine NH2 ou NH3
+ (sous forme ionisée)
Quels sont les 2 cas particuliers ?
- La glycine : C’est le seul AA non chiral, car il n’a pas de C*, c’est le plus petit des AA, il a juste un groupement H au niveau du groupement latéral R
- La proline : C’est un acide α-iminé car on a un groupe aminé secondaire et sa chaine latéral est liée à la fois au groupe α-carboxyle et α-aminé.
Comment on distingue les AA dans la classification ?
- Les AA (α-aminés) constitutifs des protéines : standards ou primaires
- Les AA non constitutifs des protéines , α ou non α
Qu’est ce qu’un alpha aminé ?
Ils ont un C𝛼. Ils sont codés par le code génétique et sont incorporés pendant la traduction (au niveau des ribosomes) dans les protéines. Ils peuvent subir des modifications post-traductionnelles (≠ modifications post-transcriptionnelles), ce peut être des ajouts de différents groupements sur les AA ce
qui modifie la fonction des protéines. On en compte 20 dans le génome humain
Qu’est ce qu’un AA non constitutif ?
Ils ne sont pas incorporés pendant la traduction. Ils sont isolés au sein de la cellule et peuvent intervenir dans différents cycle (ex : cycle de l’urée). La citrulline et l’ornithine entrent dans le métabolisme
cellulaire.
- On retrouve également de petits peptides isolés qui entrent dans la constitution de microorganismes ou végétaux. On ne les retrouve qu’à l’état libre.
Quels sont les 2 acide α - aminés rares, non-standards mais constitutifs ?:
- Sélénocystéine (notée Sec ou U)
- Pyrrolysine (notée Pyl ou O)
Quelle est la nomenclature officielle ?
« acide α-amino » + nom de l’acide organique
On nomme les carbones par rapport à celui qui porte la fonction COOH, en grec : α, β, γ, δ, ε suivant le type d’AA auquel on a affaire.
Quel sont les dénominations a connaître pour chaque acide aminé ?
- Noms courants, d’usage : Glycine, Alanine, Tryptophane…
- Systèmes en 3 lettres : Gly pour glycine, Ala pour alanine, Val pour valine, Met pour
méthionine, His pour histidine… - Système à 1 lettre : G pour glycine, A pour alanine, W pour Tryptophane…
De quelle façon classifie t-on les aminoacides ?
- NOMBRE TOTAL D’ATOMES DE CARBONE : (carbones du groupement latéral + carbones des fonctions)
- NATURE CHIMIQUE DU GROUPEMENT LATERAL R (souvent cette classification)
- CLASSEMENT SELON LA POLARITE DU GROUPEMENT LATERAL R
A quoi correspond C2 ?
Gly
A quoi correspond C3 ?
Ala, Ser, Cys
A quoi correspond C4 ?
Thr, Asn, Asp
A quoi correspond C5 ?
Val, Met, Pro, Gln , Glu
A quoi correspond C6 ?
Ile, Leu, Lys, Arg, His
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond R hydrocarbonée ?
Linéaire : glycine & Alanine
Ramifié: Valine, Leucine et Isoleucine
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond fonction alcool ?
Sérine & tréonine
Memo: T’es Saoul ?
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond soufré ?
Cystéine & méthionine
Mémo: je soufré en CM
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond Amide ?
Aspartate & glutamine
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond Acide ?
Aspartate & glutamate
Mémo: aciDE
Concernant le groupement latéral R aliphatique (non cyclique) , a quoi correspond basique ?
Lysine & arginine
Memo: KRacher c’est la base
Concernant le groupement latéral R cyclique, a quoi correspond fonction basique ?
Histidine
Concernant le groupement latéral R cyclique, a quoi correspond aromatique ?
Phénylalanie
Tyrosine
Tryptophane
Concernant le groupement latéral R cyclique, a quoi correspond hétérocyclique ?
Tryptophane
Proline
Histidine
Qu’est ce que la classification selon la polarité du groupement latéral R ?
C’est une classification par rapport à la charge des chaines latérales à pH neutre. Il existe deux types :
* AA à groupement latéral polaire = Au plus l’AA est ramifié au plus il sera polaire.
Ils sont en majorité hydrophiles
* AA à groupement latéral non polaire (apolaire) = Ils sont tous non ionisables c’est-à-dire non chargés à pH neutre.Ces AA qui possèdent une chaine apolaire, sont fortement hydrophobes.
Concernant les AA à groupement latéral polaire , quels sont les 3 types d’ionisation à pH neutre ?
- Non chargé à pH neutre : Serine, Thréonine, Cystéine, Asparagine, Glutamine, Tyrosine
- Chargés négativement à pH neutre (l’AA est qualifié d’acide) : Aspartate, Glutamate
- Chargés positivement à pH neutre (l’AA est qualifié de basique) : Lysine, Arginine, Histidine
Qu’est ce qu’un AA essentiel ou indispensable ?
Ce sont des AA non synthétisé par l’organisme, par conséquent ils doivent être apporté par l’alimentation. Ils sont 8 !
Qu’est ce qu’un AA semi-essentiel ?
Ce sont des AA synthétisable par l’homme mais peuvent être insuffisant dans certaines conditions:
-doivent être apporté par l’alimentation pour éviter des carences
exemple: insuffisance hépatique , prématurité et lors de la croissance
Ils sont 2 !
Qu’est ce qu’un AA non essentiel ?
Ce sont des AA synthétisable en quantité suffisante par l’organisme . Ils sont 10
