Génome 1: Acide nucléique (ADN) Flashcards
Reste a faire: finir les FC + Révision FC + Correct Vitamine + ANNALES +++
Combien y a t-il d’étapes dans la biosynthèse de NOVO ?
Il y a au totale 9 étapes
Qu’est ce qu’une base pyrimidique
Les bases pyrimidiques sont dérivée du noyau pyrimidine qui est un noyau hétérocyclique azoté, ce qui signifie que le noyau ne contient pas que des atomes de C, puisqu’il y a deux atomes d’azote .
Qu’est ce qu’un tautomère ?
Les tautomères sont deux isomères qui différent uniquement par la position d’un hydrogène mobile.
Quel est le rôle de la tautomérie céto-énolique
Elle est responsable de liaison illicites à l’intérieur de la chaine d’ADN (réappariement entre 2 tautomères mutagène)
Que signifie liaison illicites ?
Quelle sont les 2 grandes familles de base azotées ?
Il existe 2 grandes familles de bases azotées :
- Bases pyrimidiques : uracile, thymine et cytosine
- Bases puriques : adénine et guanine
Au pH physiologique quelle forme prédomine ?
C’est la forme céto
ça concerne quelle base ?
Qu’est ce qu’une base purique ?
Les bases puriques dérivent du noyau purine qui est également un hétérocycle azoté provenant de l’accolement de deux cycles azotés :
- Un cycle Pyrimidine à 6 sommets et 2 atomes d’azote avec une numérotation antihoraire,
- Un cycle Imidazole, à 5 sommets qui lui est constitué de 2 atomes d’azote avec une numérotation horaire.
Combien d’atomes d’azote constituent le noyau purine ( pyrimidine + Imidazole) ?
4 atomes d’azotes
Qu’est ce qu’un nucléotide ?
Les nucléotides sont des esters de phosphate des nucléosides, leur fonction ne se limite pas à celle de brique élémentaire des acides nucléiques. Ils sont essentiels, nécessaires dans de nombreux processus cellulaires et supportent de multiples fonctions
Donner les multiple fonctions des nucléotides :
- Unités élémentaires des acides nucléiques (ils sont nécessaires pour la transcription ou la réplication de l’ADN mais aussi nécessaire dans l’ARN)
- Transporteurs :
- D’énergie sous forme d’ATP (Adénosine Tri-Phosphate)
- D’oses (ex : UDP-glucose pour les oses)
- D’acides aminés (ex : S-Adénosyl-Méthionine)
- De lipides
- Donneur de groupement phosphoryle, transféré par les protéines kinases (ATP apporte le groupement phosphoryle)
- 2nd messagers, constituants essentiels des voies de transduction intra cellulaire (ex : l’AMPc, pour les récepteurs à 7 domaines transmembranaires en particulier)
- Structure de coenzyme (ex : NAD).
Comment est catalysée la biosynthèse des nucléotides ?
Cette réaction est catalysée en présence d’une PRPP synthétase (=synthase) en présence d’ATP et du ribose 5’phosphate. (C’est l’ATP qui apporte le pyrophosphate).
Quelle est l’étape commune à la biosynthèse des nucléotides puriques et pyrimidiques ?
C’est la synthèse du 5’-phosphoribosyl-1’-pyrophosphate (PRPP).
Qu’est ce que la synthèse “de Novo” des nucléotides pyrimidiques ?
La biosynthèse de novo est une synthèse très consommatrice d’énergie (ceci est vrai peu importe la synthèse de novo). L’autre moyen de synthétiser les nucléotides consiste à passer par les voies de récupérations.
Le cycle pyrimidique est d’abord synthétisé, puis attaché au ribose phosphorylé (au PRPP) pour former un nucléotide pyrimidique.
C’est quoi les voies de récupérations ?
Quelle est la 1ère étape de la biosynthése de novo ?
1er étape : Synthèse du carbamylphosphate
La synthèse de Carbamyl-phosphate par une enzyme, la carbamyl-phosphate-synthétase II (enzyme importante car très finement régulée), à partir :
- De l’ATP
- Du bicarbonate (HCO3-))
- De l’ammoniac (NH3), apporté par la glutamine.
Quelle est la 2ème étape de la biosynthèse de novo ?
La carbamyl-phosphate réagit avec l’aspartate pour former le Carbamyl-aspartate, qui est une réaction catalysée par l’aspartate transcarbamylase.
Quelle est la 3ème et 4ème étape de la biosynthèse de novo ?
C’est tout une série d’étape à ne pas connaître (marquée par une flèche avec des petits points), qui permet la formation de l’orotate.
Il y a formation de l’orotate.
Quelle est la 5ème étape de la biosynthèse de novo ?
L’orotate acquiert un cycle ribose grâce au PRPP, sous l’action d’une enzyme, l’orotate phosphoribosyl transférase aussi appelée pyrimidine-phosphoribosyl transférase.
➔ Il y a formation d’Orotidylate (OMP : Orotidine 5’ Mono Phosphate ou acide Orotidylique).
Quelle est la 6ème étape de la biosynthèse de novo ?
L’orotidylate (OMP) est ensuite décarboxylé par une orotidylate décarboxylase.
➔ Il y a formation d’Uridylate (UMP).
Quelle est la 7ème et 8ème étape de la biosynthèse de novo ?
L’UMP doit être phosphorylée car l’incorporation dans la chaîne d’ADN ne se fait que sous forme triphosphate.
L’UMP est ensuite phosphorylé par des différentes kinases en UDP puis en UTP.
Quelle est la 9ème étape de la biosynthèse de novo ?
L’UTP est transformé en CTP par amination en C4 par la cytidylate synthétase (un résidu amine remplace un résidu céto).
Concernant la régulation de la synthèse des nucléotides pyrimidiques : Quel est le rôle de la ribonucléotide réductase ?
La ribonucléotide réducaste permet de passer de la forme ribose à la forme désoxyribose. Elle agit sur le CTP pour le transformer en dCTP.
Comment est formé la dTMP ?
La formation de la dTMP passe d’abord par réduction de l’UMP en dUMP par la ribonucléotide réducaste. Ensuite le dUMP va pouvoir être transformée en dTMP par la thymidylate synthétase.
Quels sont les différents types d’ARN qui existe ?
Les ARN CODANTS dont font partie les ARN messagers
Les ARN NON-CODANTS
A quoi correspond les ARN CODANR ?
➔ 3-5% des ARN totaux, (celle qui nous intéresse en pathologie et biologie, mais aussi le moins abondant)
