DNA-virus Flashcards
Vad finns det för tre klasser av DNA-virus?
Grupp 1 (ds) Grupp 2 (ss->ds) Grupp 7 (ds -> reversed transkriptas)
Hur ser DNA-virus livscykel ut?
Tidig fas: - Modifikation av cellulära maskiner - Kontroll av cellcykeln - Undkomma antiviralt försvar DNA-replikation: - tillgång på byggstenar - replikationsfaktorer Sen fas: - Strukturproteiner - Paketering av genom - Frisättningsfunktion
Vad finns det för tre problem vid DNA-virus som de måste lösa vid replikation?
- Måste ha tillgång på DNA-replikationsfaktorer som endast finns i S-fas
- Få multibla kopior från varje mall
- Replikera DNA-ändar.
Hur löser viruset problemet med tillgång på replikationsfaktorer?
Små virus är bereoende av cellulära funktion och kommer antingen få invänta S-fas (parvovrius) eller tvinga in cellen i S-fas (HPV, adenovirus .
Stora virus har med sig egna replikationsfaktorer och är relativt oberoende av cellulära unktioner.
Hur kan virus skapa multipla replikationscykler?
Alla DNA-virus bildar egna helikas som känner igen virus ”orgin of replication”
Hur löser virus replikationen av av DNA-ändarna?
Kan använda en proteinprimer (adenovirus) eller DNA-primer (parvovirus, poxvirus).
RNA-primer kan också används vid ex. herpes-, polyoma- och papillomavirus.
Vad är parvovirus?
- Ikosahedral utan hölje
- Transkription från olika promoter, får flera mRNA genom splitsning, olika AUG och olika polyA
- B19: femte sjukan, infekterar erytroplaster.
- Adeno-associerat virus, AAV: behöver hjälparvirus
- Bocavirus: luft- och tarminfektioner.
Vad är polyomavirus?
- Ikosahedrala utan hölje
- Cirkulärt 5,3 kb dsDNA
- Har large T: binder till viralt DNA på enhancer och ORI. Aktiverar transkription och rekrytear cellulärt DNA polymeras och har helikasaktivitet.
- Hämmar tumörsuppressorerna p53 och pRB
- G1 -> S
- Hämmar apoptos
- JS-virus: kan vid immunosuppression ta sig förbi BBB och infektera oligodendrocyter -> död.
- BK-virus: ger problem vid transplantation
- Merkelcell polyomavirus .
Vad är adenovirus?
- Ikosahedral kapsid, inget hölje
- linjärt ds DNA, ca 35 000 bp.
- har små utskott
- har kompakt genom med tidiga och sena gener. Både strängarna transkriberas -> mycket alternativ splitsning, har eget DNA-polymeras.
- smittar via aerosoler, kontakt, fekalt/orat.
Vad är poxvirus?
- Det största viruset!
- Två fromer: EEV från cell->cell. IMV mellan individer
- linkärt dsDNA, 150-250 kb
- replikerar i cytoplasman och kan därför inte splitsas
- smittkoppor
- molluscum contagiosum
Vad är hepatit B-virus?
- Cirkulärt, partiellt dsDNA
- Ikosehedral kapsid med tre ytantigen
Vad är humant papillomvirus?
- Ikosahedral utan hölje
- Lågrisk ger vårtor, högrisk ger cancer.
- Cirkulärt dsDNA med ca 8 kb. Två promoter, två poly A. Altenativ splitsning!
Vad är herpesvirus?
- Ikosahedral kapsid omgiven av tegument och hölje
- 150-230 kb dsDNA
- Åtta olik herpesvirus infekterar människa och ger en livslång latent infektioner efter primär lytisk infektion.
- Är linjärt i kapsiden -> kommer in i kärnan och blir cirkulärt
Vad finns det för problem för DNA-virus vid transkriptionen?
- Tävla om cellens transkriptionsmaskineri
- Utnyttja genomet maximalt genom alternativ splitsning
- Reglera epigenetisk kontroll av viral och cellulärt transkription
Hur kan viruset övervinna cellens transkriptionsmaskineri?
- Starka virala promoter
- Tropism, pga promotorsekvenser. (värdcellens TF binder till promotorn)
- Syntets av virala transkriptionsfaktorer.