DNA-virus Flashcards

1
Q

Vad finns det för tre klasser av DNA-virus?

A
Grupp 1 (ds)
Grupp 2 (ss->ds)
Grupp 7 (ds -> reversed transkriptas)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hur ser DNA-virus livscykel ut?

A
Tidig fas: 
- Modifikation av cellulära maskiner
- Kontroll av cellcykeln 
- Undkomma antiviralt försvar
DNA-replikation:
- tillgång på byggstenar
- replikationsfaktorer
Sen fas: 
- Strukturproteiner
- Paketering av genom 
- Frisättningsfunktion
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad finns det för tre problem vid DNA-virus som de måste lösa vid replikation?

A
  1. Måste ha tillgång på DNA-replikationsfaktorer som endast finns i S-fas
  2. Få multibla kopior från varje mall
  3. Replikera DNA-ändar.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hur löser viruset problemet med tillgång på replikationsfaktorer?

A

Små virus är bereoende av cellulära funktion och kommer antingen få invänta S-fas (parvovrius) eller tvinga in cellen i S-fas (HPV, adenovirus .
Stora virus har med sig egna replikationsfaktorer och är relativt oberoende av cellulära unktioner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hur kan virus skapa multipla replikationscykler?

A

Alla DNA-virus bildar egna helikas som känner igen virus ”orgin of replication”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hur löser virus replikationen av av DNA-ändarna?

A

Kan använda en proteinprimer (adenovirus) eller DNA-primer (parvovirus, poxvirus).
RNA-primer kan också används vid ex. herpes-, polyoma- och papillomavirus.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad är parvovirus?

A
  • Ikosahedral utan hölje
  • Transkription från olika promoter, får flera mRNA genom splitsning, olika AUG och olika polyA
  • B19: femte sjukan, infekterar erytroplaster.
  • Adeno-associerat virus, AAV: behöver hjälparvirus
  • Bocavirus: luft- och tarminfektioner.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad är polyomavirus?

A
  • Ikosahedrala utan hölje
  • Cirkulärt 5,3 kb dsDNA
  • Har large T: binder till viralt DNA på enhancer och ORI. Aktiverar transkription och rekrytear cellulärt DNA polymeras och har helikasaktivitet.
  • Hämmar tumörsuppressorerna p53 och pRB
  • G1 -> S
  • Hämmar apoptos
  • JS-virus: kan vid immunosuppression ta sig förbi BBB och infektera oligodendrocyter -> död.
  • BK-virus: ger problem vid transplantation
  • Merkelcell polyomavirus .
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad är adenovirus?

A
  • Ikosahedral kapsid, inget hölje
  • linjärt ds DNA, ca 35 000 bp.
  • har små utskott
  • har kompakt genom med tidiga och sena gener. Både strängarna transkriberas -> mycket alternativ splitsning, har eget DNA-polymeras.
  • smittar via aerosoler, kontakt, fekalt/orat.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad är poxvirus?

A
  • Det största viruset!
  • Två fromer: EEV från cell->cell. IMV mellan individer
  • linkärt dsDNA, 150-250 kb
  • replikerar i cytoplasman och kan därför inte splitsas
  • smittkoppor
  • molluscum contagiosum
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är hepatit B-virus?

A
  • Cirkulärt, partiellt dsDNA

- Ikosehedral kapsid med tre ytantigen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är humant papillomvirus?

A
  • Ikosahedral utan hölje
  • Lågrisk ger vårtor, högrisk ger cancer.
  • Cirkulärt dsDNA med ca 8 kb. Två promoter, två poly A. Altenativ splitsning!
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är herpesvirus?

A
  • Ikosahedral kapsid omgiven av tegument och hölje
  • 150-230 kb dsDNA
  • Åtta olik herpesvirus infekterar människa och ger en livslång latent infektioner efter primär lytisk infektion.
  • Är linjärt i kapsiden -> kommer in i kärnan och blir cirkulärt
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad finns det för problem för DNA-virus vid transkriptionen?

A
  1. Tävla om cellens transkriptionsmaskineri
  2. Utnyttja genomet maximalt genom alternativ splitsning
  3. Reglera epigenetisk kontroll av viral och cellulärt transkription
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur kan viruset övervinna cellens transkriptionsmaskineri?

A
  • Starka virala promoter
  • Tropism, pga promotorsekvenser. (värdcellens TF binder till promotorn)
  • Syntets av virala transkriptionsfaktorer.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hur kan virus utnyttja genomet maximalt vid transkription?

A

Ex HPV kan bilda många olika proteiner från ett relativt litet genom. Reglering av tidig och sen fas påverkas av cellens differentieringsstadium.

17
Q

Hur förhindrar virus epigenetisk reglering av viral och cellulär transkription?

A

Ex EBV så kan den latenta infektionen aktiveras genom att lytiska gener kan packa upp kromatinet.

18
Q

Hur gör virus för att överlista cellens försök att hindra viral translation? Hur försöker cellen motverka detta?

A
  1. Viruset tävlar om cellens translationsmaskineri. Ex. adenovirus stänger av värdcellens translation genom att hämmta Mnk1-fosfoyering av eIF4E. Det sker även cap-oberoende translation av sena virala mRNA från så sker även selektiv export av virala mRNA från kärnan.
  2. Antiviralt försvar stänger ner ned translationen genom PRR -> aktiverar PKR. De flesta virus kan undkomma translationinhibition genom att plockera aktivering av PKR, binda PKR, vara pseudosubstrat för PKR, degradera PKR och defosforylera eIF2a.