Bakteriegenetik Flashcards
Varför är det evolutionärt fördelaktigt för asexuellt reproducerande celler att kunna byta gener med varandra?
För att det ger genetisk variation och kommer ge vissa bakterier en evolutionär fördel
Vad är ett pan-genom? Vad innebär det potentiellt ur ett kliniskt perspektiv?
Den totala mängden DNA som kan utbytas mellan ett visst antal bakterier. Det innebär att olika stammar av en bakterie kan bära på olika egenskaper och gener för antibiotikaresistens och virulens kan spridas mellan celler.
Vilka tre mekanismer för horisontell genöverföring finns det hos bakterier? Hur går det till? Vad har de gemensamt?
- Transformation: direkt upptag av fritt DNA från omgivning. Envägsöverföring av extracellulärt DNA i en cell, vilket resulterar i en fenotypisk variation i mottagaren. Kan rekombineras hos mottagaren. Upptaget är ofta strikt reglerat av mottagarcellen.
- Transduktion: bakteriella gener kan föras mellan olika bakterier via virus (fager). Givarcellen infekteras av en bakteriefag. Fagen replikerar sitt genom och bryter ner värd-DNAt men inte helt. Nya fagpartiklar byggs ihop och bakteriellt DNA förs in i faghuvudet av misstag. Givarcellen lyserar och fager frisätts. Den nya mottagarcellen infekteras av mottagaren med bakteriellt DNA. Sker en homolog rekombination.
- Konjugation: (bakteriesex) en bakterie bygger en rörformad struktur (pilus), kopplar ihop sig via den med en annan bakterie och överför en DNA-plasmid. Gener som behövs för uppbyggnad av pilus och överföringen finns på konjugativa plasmider och gör att de kan spridas mellan bakterier.
Hur skiljer sig lytiska fager från lysogena fager?
Lytiska fager förökar sig i bakterier och frigör nya fager -> dödar alltid bakterien. Den binder en bakterie och skickar in sitt DNA -> blir RNA -> kodar för nukleaser -> degraderar värdcellens DNA medan nya fager syntetiseras. Tillslut brister cellen.
Lysogena fager försökar sig via lytisk växt eller för istället in sitt DNA i bakteriens genom och ligger tyst i bakteriecellen.
Vilken positiv påverkan kan bakteriofager ha på bakterier?
Vissa lysogena fager bär på gener som ökar virulensen hos värdbakterier. Ex, om generna kodar för toxiner.
Hur kan plasmider överföras mellan bakterier? Vilken är den vanligaste mekanismen? Vad är en episom?
Kan överföras via konjugation, transformation och transduktion. Konjugation är den vanligaste. Episom är en plasmid som kan integreras i bakteriens kromosom.
Hur är en sammansatt transposon uppbyggd?
Transposomer är DNA-segment som kan flytta sig från en plats i genomet till en annan. DNA-segmentet innehåller en gen som behövs för förflyttning och är flankerad av inverted repeats (IR).
Varför samlas fördelaktiga gener tillsammans på mobila element?
Transposoner kan lägga sig på var sin sida av gener och därmed ta med sig dem när de flyttar runt. Transposoner flyttar runt gener mellan genom/plasmider och selektion gör att resistens- och virulensgener hamnar tillsammans på samma mobila element eftersom de gör stor fördel för bakterien.
