Bioquimica Flashcards
fNucleotide x nucleoside
sao todos polimeros de DNA, formados por pentose sugar, nitrogenous base e phosphate group mas o nucleoside não tem phosphate group.
o nome do nucleotide leva em consideração qual base ele tem: adenosine (possui adenine), uridine (possui uracil) etc
Tipos de bases nitrogenadas
pirimidinas (1 anel): cytosine, thymine (apenas em DNA), uracil (apenas em RNA)
purines (2 aneis): adenine e guanine
DNA methylation
Quando temos segmentos C-G, eles são metilados (Adiciona-se grupo metil à citosine) e isso inativa a transcription (epigenética age aqui). Cerca de 70% do DNA humano é metilado. Segmentos C-G não metilados, estimulam resposta imune.
Quanto mais metilado, menos transcripção.
na bacteria, a metilação ocorre na cytosine - adenine. E serve como proteção para a bacteria contra viros pq as areas nao metiladas sao mais susceptiveis a destruição.
Cromatina
DNA + proteina encontrado no nucleo da celula. Condensa-se em cromossomos.
Histonas
proteinas que envolvem o DNA para fazer a sua condensação H1 é importante para a condensação no nucleo (nao fica envolvida diretamente no DNA como as outras histonas)
quanto mais histone acetylation (acetyl group to lysine), mais transcrição. existem drogas anti-cancer que irao atuar aqui - histone deacetylase inhibitor
anti-histona antibodies (LES drug induced)
Pra que servem as purinas (adenine e guanine), síntese e metabolismo
função: construir boxes para a sintese de RNA (acido ribonucleico) e DNA (deoxyribonucleic acid);
formar energia ATP;
cAMP (adenosine monophosphate) - blood flow; cGMP (guanine monophosphate) - second messenger.
Sintese: ribose phosphate (HMP shunt) + aminoacido + carbons (tetrahidrofolato, CO2). ribose fosfate > phosphoribosil pyrofosfate > IMP (inosine monofosfate) > AMP + GMP
hipoxantina é uma base intermediária que funciona como a adenosina e a guanina.
Drogas que inibem a IMP desidrogenase, bloqueando a conversão de IMP em GMP: ribavirin (antiviral) e micofenolato (imunossupressor).
Serão metabolizadas em uric acid e excretadas ou reaproveitadas (salvage).
hipoxantina e guanina > xantinas > uric acid
adenina > AMP > inosine > hipoxantina > uric acid
Alopurinol bloqueia xantina oxidase (bloqueia hipoxantina > acid urico). Por isso, evitar usar com 6-MP ou azatioprina > acaba aumentando efetividade dessas drogas porém aumentando toxicidade.
6 mercaptopurine /6-MP (quimioterapico) imita hipoxantina guanina que é resposavel por criar um acido que inibe IMP, AMP, GMP.
Azatioprina se converte em 6-MP no corpo ou seja, atua da mesma forma no fim das contas.
Lesch-nyhan-syndrome: X-linked absence of hipoxantina-guanine fosforibosil transferase) o que atrapalha o reaproveitamento das purinas e maior produção de acido urico em crianças. Juvenile gout. Aumenta PRPP e IMP - neurologico com hipotonia, corea, self mutilation.
Pirimidines (citidine, timidine, uridine) função, sintese, metaboliso
Funcao: criar CMP, UMP, TMP
Ingredientes: ribose phosphate (HMP shunt) + aminoacidos + carbons (THF e CO2)
Glutamine > carbamoyl fosfatase > orotic acid > UMP (citidine e timidine são formados a partir do UMP).
Hidroxiureia bloqueia o ribonucleotide reductase que faz a conversão de UMP em timidine.
5-FU quimioterapico tb inibe a sintese de timidine (TMP) ao imitar UMP e se ligar à timidilate sintese.
Metotrexate bloqueia dihydrofolate reductase que esta envolvido na sintese de TMP tb.
Sulfonamide (sulfa) imita PABA que é utilizada pela bacteria pra produzir THF. Sem THF, sem TMP. Não afeta a pessoa pois ela consegue folato da dieta.
Orotic aciduria: autossomica recessiva defeito UMP sintase e com isso nao produz UMP e outras pirimidinas a partir do orotic acid, elevando-o. Anemia megaloblastica que não melhora com B12 / folato. tto: repor uridine.
Def folato e B12
Nas duas há aumento de homocisteina
Na B12 ha elevacao de metilmalonil acid (MMA)
Na de folato, ha defeito na sintese de metionina o que acaba acumulando homocisteina (seu precursor). Baixa metionina, alta homocisteina e normal acido metilmalonil.
Formas da glicose entrar na celula
independente de sodio na maioria das vezes GLUT 1 a GLUT 14
dependente de sodio no tubulo renal e no epitelio intestinal (SGLT1 do lumen para celula e SGLT2 da celula pro sangue - nao depende de sodio).
As GLUT sao facilitadores de difusao. Nao gasta ATP.
GLUT 1 (cerebro e hemacias) e GLUT 2 (figado, rim, intestino e pancreas) nao dependem de insulina
GLUT 4 (gordura, esqueleto) depende de insulina
Glicolise
gerar energia
ocorre no citoplasma
gera ATP e NADH
glicose»_space;> piruvato
Glicose > glicose 6p > frutose 6p > frutose 1.6bip > gliceraldeido + dihydroxyacetone
Gliceraldeido > 1.3biphosphoglicerate > 3phosphoglicerate > 2 phos > proproenolpyruvate > pyruvate > lactato e vai para o TCA cycle
acidose latica
em um contexto de hipoxia, o TCA cycle vai trabalhar menos. Com isso, haverá acumulo de piruvato que vai ser transformado em lactato.
caimbra muscular gasta muito NAD+ com o exercicio e isso favorece o caminho pro lactato.
corredores de maratona desenvolvem mais mitocondria para aumentar a producao de TCA cycle e reduzir lactato
Fasting
hexokinase ativa (glicose vai para os tecidos), glucokinase inativa (glicose nao vai para o figado)
inibição de PFK1 (fosfofrutokinase) que transforma frutose-6 em frutose 1.6 > inibida por citrate, ATP (produtos do TCA cycle)
glucagon reduz frutose 2.6p (fosforilaçao) que inibe glicolise
After meal
hexokinase inativa (inibido por Glicose 6p) e glucokinase ativa (glicose vai para o figado estocar)
ativação de PFK1 (fosfofrutokinase) que transforma frutose-6 em frutose 1.6 > ativada por AMP, frutose 2.6 (insulina eleva frutose 2.6 p desfosforilacao)
Deficiencia de glucokinase
enzima que leva a glicose pro figado. Sua deficiencia gera hiperglicemia. pode ser exacerbado na gestacao.
Ciclo da alanina
Musculo esqueletico utiiza proteina como energia, produzindo alanina. No figado, alanina se transforma em glicose atraves da enzima alanine transaminase (ALT). Com isso, inibe a piruvate kinase e reduz a glicolise.
Deficiencia de piruvate kinase
doença autossomica recessiva. Afeta principalmente hemacias pois precisam do PK para metabolismo anaerobio essencial (não possuem mitocondria). Sem produção de ATP perdem sua membrana e são fagocitadas no baço. Hemolise extravascular e esplenomegalia no neonato.
Etapas irreversiveis da glicolise
Glucose > G6p (hexo e glucokinase)
Frutose 6P > F1.6p (PFK1)
PEP > Pyruvate (pyruvate kinase)
Etapas da glicose que produz ATP
1.3 bifosfoglicerate > 3 fosfoglicerate
fosfoenolpiruvato > piruvato
Etapas da glicolise que gasta ATP
glucose > glucose 6p (hexokinase ou glucokinase)
frutose 6p > frutose 1.6p (PFK1)
Lesch-nyhan-syndrome:
X-linked absence of hipoxantina-guanine fosforibosil transferase) o que atrapalha o reaproveitamento das purinas e maior produção de acido urico em crianças. Juvenile gout. Aumenta PRPP e IMP - neurologico com hipotonia, corea, self mutilation.
Orotic aciduria X OTC deficiency (ornithine transcarbamilase):
orotic aciduria: autossomica recessiva defeito UMP sintase e com isso nao produz UMP e outras pirimidinas a partir do orotic acid, elevando-o. Anemia megaloblastica que não melhora com B12 / folato. tto: repor uridine.
OTC deficiency (ornithine transcarbamilase): é uma outra doença que tb Eleva orotic acid mas atraves de defeito no ciclo da ureia. Essa enzima combina o carbomoyl fosfatase com ornitina pra formar citrulina. Estando deficient, sobrara muito carbomoyl fosfatase que seguira pela sintese de orotic acid. Tb haverá elevação de ammonia e encefalopatia em bebes.
Fontes para formação de glicose (gluconeogenesis)
Piruvato, lactato (ciclo de cori), aminoacidos, propionate glicerol (gordura)
Ciclo do piruvato
Pyruvate carboxylase dará inicio à gluconeogenesis gastando ATP
Pyruvate desidrogenase transformará piruvato em acetyl-coA que iniciará o TCA cycle para produção de ATP.
Gluconeogenesis pelo piruvato
STEP 1:
Pyruvate > oxaloacetato (atraves da piruvato carboxilase gastando ATP dentro da mitocondria) > fosfoenolpiruvato (PEP) (no citosol). Esse processo só é possivel atraves do Malate shuttle que carrega o oxaloacetato da mitocondria para o citosol.
- biotina é importante na piruvate carboxilase, acetyl coA carboxilase, propionil coa carboxilase. Deficiencia: excesso de ovo - avidin. Dermatite, glossite, apetite ruim, nausea.
- def piruvate carboxilase: acumulo de piruvato que leva a aumento de lactato (acidose lactica) e aumento de ALT (piruvato acaba indo pro ciclo da alanina). Criança com desenvolvimento ruim.
STEP 2:
Fosfoenopiruvato > 2 fosfoglicerate > 3 fosfoglicerate > 1.3 bifosfoglicerate > gliceraldeido > frutose 1.6 bifosfate
frutose 1.6 bifosfate > frutose 6 fosfate atraves da frutose 1.6 bifosfatase
STEP 3:
Glucose 6p > glucose pela glucose 6 fosfatase (no reticulo endoplasmatico)
epinefrina: aumentar glicose na corrente sanguinea. promove gluconeogenesis e quebra de glicogenio
cortisol: estimula gluconeogenesis e eleva glicose
tireoide tb estimula gluconeogenesis
Quem estoca glicogenio
Figado > para todo o corpo
musculo > para uso proprio
Sintese de glicogenio
Glicose 6p > glicose 1p > UDP glicose > unbranched glicogen > branched glicogen
Em quanto tempo se gasta o glicogenio estocado
Ate 8h apos comer, vc utiliza glicose ingerida. Depois disso, vc começa a usar glicogenio estocado que dura até 24h. Depois disso, você começa a criar glicose a partir da gluconeogenesis (proteinas, gordura, etc)
Def biotina
Def biotina é importante na piruvate carboxilase, acetyl coA carboxilase, propionil coa carboxilase. Deficiencia: excesso de ovo - avidin. Dermatite, glossite, apetite ruim, nausea.
def piruvate carboxilase:
def piruvate carboxilase: acumulo de piruvato que leva a aumento de lactato (acidose lactica) e aumento de ALT (piruvato acaba indo pro ciclo da alanina). Criança com desenvolvimento ruim.
Glycogen storage disease
autossomicas recessivas. Defeito na quebra do glicogenio. Figado causa hipoglicemia e no musculo, fraqueza. Mais de 14 descritas.
Von Gierker´s disease (tipo 1):
- glicose 6p.
- Hipoglicemia entre refeições.
- acidose lactica,
- aumenta figado
Pompe´s disease (tipo2):
- acid alfa glucosidase.
- Cresce musculos (cardiomegalia, aumenta lingua).
- aumenta figado.
Coris disease (tipo3):
- debranching enzyme.
- hipoglicemia entre refeicao,
- hepatomegalia,
- hipotonia, cardiomegalia.
Mcardles disease (tipo4):
- glycogenphosphorylase.
- Adolescente, adulto.
- Intolerancia ao exercicio, fadiga, cramps, fraqueza, CK e mioglobinuria. Urina escura apos exercicio.
TCA cycle
nao produz glicose (nao tem carbono)
produz NADH, FADH2
Converte acetyl-coa em CO2.
piruvate > acetil coa (na mitocondria)
acetil coa > citrate > isocitrate > alfa ketoglutarate > succinil coA > succinate > fumarate > malate > oxaloacetate > citrate
citrate
inibe glicolise (inibe PFK1), ativa a coacarboxilase (sintese de fatty acid), inibida por ATP. Parte do TCA cycle.
Produzida pelo oxaloacetate com acetil-coA.
Em periodos de jejum, o oxaloacetato é convertido em glicose, entao reduz sua disponibilidade no ciclo. Com isso, o acetil-coA não é utilizado pelo ciclo também, acumulando-se o que fará o figado produzir ketones bodies.
Fumarate
parte do TCA cycle. mediada pela succinate dehydrogenase - unica enzima na membrana da mitocondria. Funciona como complex II electron transport.
tb pode ser formada pelo ciclo da ureia, da sintese das purinas e do aminoacid breakdown (fenilalanina e tirosina)
Malate
capaz de atravessar a membrana da mitocondria para buscar NADH que esteja no citosol e que precise para o TCA cycle. Logo, é possivel produzir oxaloacetato dentro e fora da mitocondria.
Succinil-coA
produzido no TCA cycle ou no metabolismo de fatty acids pelo metilmalonil coa.
No TCA cycle, produz succinate e faz sintese de heme (Hb).
TCA cycle inhibitors
ATP, NADH, acetil COA, citrate e succinil COA
activate TCA cycle
ADP, calcium
Cadeia de transporte de eletron
Produção de ATP a partir de NADH e FADH2. Aerobic. Produz agua.
Malate shuttle produz mais ATP que o glycerol shuttle.
Complex I da cadeia de eletrons
NADH desidrogenase
oxidiza NADH - transfere eletrons para a coenzima Q que leva para o complexo III.
Complexo II da cadeia de eletrons
Succinate desidrogenase (parte do TCA cycle)
envolvida nos dois ciclos (TCA e cadeia de eletrons) > pega os eletrons do succinaate, produzindo FADH2 que é usado pela coenzima Q
Complexo III da cadeia de eletrons
Cytocromo bcj complex
Transfere eletrons que recebeu da coenzima Q para o citocromo C que ira enviar para o complexo IV.
Complexo IV da cadeia de eletrons
citocromo a +a3 ou citocromo oxidase
contem cobre
eletrons e O2 produz H20 e pump H+
2 formas de se produzir ATP
substrate phosphorylation (via enzima): ex phosphoenol pyruvate ao se transformar em pyruvate fosforila a molecula de ADP em ATP.
oxidative phosphorilation (ocorre apenas na mitocondria) - usa todo o H+ acumulado ao passar pela cadeia de eletrons para produzir ATP. Mediado pelo complexo V (ATP synthase);
Complexo V cadeia de eletrons ou ATP synthase
converte os protons em ATP
3 ou 2.5 pra cada NADH
2 ou 1.5 pra cada FADH2
Medicações que atuam na cadeia de transporte de eletrons
- Bloqueiam o transporte de eletrons: rotenone (inseticida), antimycin (ATB), monoxido de carbono, cianide.
- permitem vazamento do H+ para fora da membrana (ou seja, nao atrapalha o transporte de eletrons mas continua impedindo a fosforilação oxidativa que dá origem ao ATP): 2.4 dinitrofenol (DNP), overdose de aspirina, brown fat em newborns > produzem calor
Sintese de fatty acid
excesso de carbo e proteina vira fatty acids.
em um estado pos alimentar, com bastante glicose disponivel, o ciclo de krebs acabara acumulando o citrato. Esse citrato, atravessa para o citosol pelo citrate shuttle. La, ele ira bloquear glicolise e estimular a sintese de fatt acid.
obs: acetil coa tb acumula, mas nao pode atravessar membrana da mitocondria, por isso precisa do shuttle.
Citrate > acetil COa > malonyl coA > palmitate
malonyl coa
produto do acetil-coa apos a enzima acetil coa carboxilase e transforma-se em palmitato na formaçao de fatty acid.
bloqueia a beta oxidacao que faz a quebra do fatty acid
fatty acid storage
triacilglicerols em tecido adiposo
quando ele é quebrado, libera fatty acid e glycerol (que vai pro figado e pode ser usado para produzir glicose)
Fatty acid breakdown
objetivo: produzir acetil coa que pode ser usado no TCA cycle ou ketone bodies formation
lipase remove fatty acid dos triacilglicerols do tecido adiposo. é ativada por glucagon e epinefrina.
fatty acid nao é usado por hemacias (usam apenas glicose) e pelo cerebro (glicose e ketones). É carreado por albumina até o local que irá atuar. quando chega no tecido, sobre beta oxidação pela fatty acid coa synthetase. (STEP 1)
O fatty acid coa é entao transportado pra dentro da mitocondria pela carnitina shuttle e atraves da carnitina palmitol transferase é formado a acyl carnitina que se move pra dentro da mitocontria e retorna para a forma fatty acid coa. (STEP 2)
STEP 3: ciclos de beta oxidação. A acylcoa dehydrogenase é a primeira do ciclo.
se a cadeia tem numero par de carbonos, eles sofrem beta oxidacao. Mas se têm numero impar, irao sofrer beta oxidação apenas quando tiverem 3 carbonos (propionyl coa) que atraves da propionylcoa carboxylase se transforma em succinil coa e pode ser usado na formaçao de glicose.»_space; odd chain produz glicose / even chain não
carnitina
carnitina shuttle esta envolvida no metabolismo de fatty acid, levando-o pra dentro da mitocondria.
Adquirimos pela dieta ou atraves da sintese de lisina e metionina. Figado e rim conseguem sintetizar, mas musculo e coração são dependentes da carnitina da dieta.
def carnitina
manutrição, doença hepatica, queimadura, gravidez, hemodialise
inabilidade de transportar fatty acid para a mitocondria e isso faz com que eles acumulem na celula
baixa carnitina e baixa acylcarnitina
fraqueza muscular durante exercicio, cardiomiopatia, hipoglicemia hipocetotica em jejum
disturbio primario de deficiencia da carnitina é quando se tem defeito na absorçao da carnitina - nos primeiros dois anos de vida a criança tem encefalopatia, hepatomegalia, eleva amonia e baixa carnitina.
MCAD Deficiency (medium chain acyl-coA dehydrogenase)
doenca autossomica recessiva. Problema na oxidação do fatt acid. Hipoglicemia severa sem corpos cetonicos. Dx: dicarboxilic acid de 6-10 carbons na urina e aumento da acilcarnitina. Tto é evitar jejum.
organic acidemia (methylmalonic acidemia ou propionic acidemia)
acidose metabolica com anion gap elevado, sintomas neurologicos, fatal
defeito na enzima methylmanolyl coa que faz parte do metabolismo de odd chain fatty acid
Ketone bodies
sintetizado quando há excesso de acetil COA
quando aumenta, há acidose metabolica com anion gap elevado
Metabolismo etanol
Etanol > acetaldeido (enzima alcogol dehydrogenase)
- fomepizole bloqueia essa enzima e pode ser usado em intoxicaçao de etilenoglicol ou metanol
- o acetaldeido que causa cirrose
acetaldeido entra na mitocondria > acetate (aldehyde dehydrogenase)
- dissulfiram bloqueia a aldahyde dehydrogenase, logo, acumula acetaldeido
- acetate formado vai ao figado formar acetyl-coa e ketone bodies
Nesses dois processos, temos formaçao de NADH que é o que causa o problema metabolico da cirrose > bloqueia o TCA cycle fazendo com que sobre acetil coa que ira aumentar produção de cetone. diminui tambem gluconeogenesis levando a hipoglicemia.
alcohol flushing é slow metabolism of acetaldeydo. Asiatico. Deficiencia de aldehyde dehydrogenase 2. aumenta risco de cancer de esofago e orofaringe
Kwashiorkor x marasmus
K: desnutrição proteica. hipoalbuminemia, edema.
M: desnutrição calorica / energetica
Classes de doenças que causam hipoglicemia em criança
glycogen storage disease (hipoglicemia, cetose - after fast): Mc Ardler type V e Pompes Type II afeta apenas musculo e nao tem hipoglicemia. Coris disease tipo III nao tem acidose lactica. Von gierkers tipo I é grave com acidose latica.
hereditary fructose intolerance (diminui aldolase B e diminui ATP): hipoglicemia, cetose, hepatomegalia, inicio apos desmame aleitamento
disordem do metabolism dos fatty acids (hipoglicemia hipocetotica): MCAD deficiency, carnitine deficiency
Hereditary fructose intolerance (HFI):
aldolase B. Diminui ATP. Loss of glucogeneogeneis and glucogenolysis. Hipoglicemia, cetose, hepatomegalia. Começa apos desmame de aleitamento. Acucares reduzidos na urina.
Maple syrup urine disorder
Branched chain aminoacid disorder. Neurotoxicidade por acumulo de leucine. def de alfa cetoacid dehydrogenase. isoleucine da cheiro doce na urina. tto suplementar tiamina e evitar valina, leucina e isoleucina.
Urea cycle disorder
primeiros dois dias de vida apos iniciar alimentaçao > poor feeding, vomiting, lethargy, seizure. aumenta nh4 ureia >1000.
- UTC deficiency (ornitine transcarbamylase) acumula carbomoyls phosphate, NH4 e orotic acid.
diferente de
- orotic aciduria é uma desordem da sintese de pirimidine (nucleotide) que tb pode causar orotic aciduria mas nao tem elevaçao de amonia. Tem tb anemia megaloblastica
Mitochondria disorders
acidose lactica, eleva alanina, nao tem hipoglicemia.
deficiencia de pyruvate dehydrogenase complex (piruvato nao transforma em acetyl coa e acumula-se)
Galactosemia
galactose 1 phosphate uridil def
diminui ATP
leite materno tem lactose > vomito, diarreia.
reducing sugar in the urine
aminoacidos essenciais
Essenciais: devem ser suplementados na dieta: histidine, leucine, tryptophan, phenylanine, threonine, isoleucine, methionine, valine, lysine
aminoacidos 100% ketogenicos
que podem dar origem apenas a corpos cetonicos: leucine e lysine
os outros aminoacidos ou sao glucogenicos ou gluco / ketogenicos
Phenylalanine e tyrosine
Sintese de dopamina, norepinefrina, epinefrina, hormonio tireoidiano e melanina. São keto e glucogenicas: na sua degradação produzem fumarate e acetoacetate.
- Fenilalanina é essencial e é convertida em tirosine pela fenilalanina hidroxilase. que precisa de BH4 tetrahydrobiopterin pra funcionar
- Tirosine > Dopa > dopamine > norepinefrine > epinefrine
Da tirosine pra Dopa tb usa BH4; a enzima chama tyrosine hidroxilase e a metyrosine é medicaçao que bloqueia ela (feocromocitoma).
Da DOPA para dopamine a enzima é a dopa decarboxilase (local de bloqueio do carbidopa no tecido periferico) e tem como cofator B6
Da dopamina para norepinefrine tem vitC como cofator
Da nore para epinefrine, a enzima é a fenilethevolamine e o cofator o SAM
- Tirosine tb se transforma em tyroxine (T4) ao juntar iodo.
- Melanina é polimero de varias unidades de tirosine.
- oculocutaneos albinism é deficiencia na tyrosinase.
Fenilcetonuria
def de fenilalanina hidroxilase. Seja por def da propria enzima (classico) ou de seu cofator BH4. Erro inato do metabolismo mais comum. acumula fenilalanina e def de tirosina. Com isso precisa evitar o primeiro e suplementar o segundo.
Maternal PKU: doença ativa é teratogenica - microcefaleia e problema cardiaco
Se for por def BH4 (dihydropteridine reductase), alem dos sintomas classicos neurologicos, ha tambem, diminuicao de sintese de epinefrina, nora, serotonina e dopamina (oq eleva a prolactina).
Alkaptonuria
deficiencia da homogentisic acid oxidase (HGA oxidase) que faz a degradação da tirosina (aminoacido). aumento de homogentic acid. dark urine depois de um tempo de repouso, artrite, black pigment.
Catecolamina breakdown
MAO (seleginina bloqueia aqui) e COMT (entacapone bloqueia aqui) sao as enzimas que fazem a degradaçao das catecolaminas
Epi e nore > VMA
Dopamina > HVA
secretados na urina
Triptofano
- produz serotonina tb usando BH4
apenas 1% do triptofano é convertido em serotonina mas na sindrome carcinoide, 70% é
serotonina é metabolizada em melatonina
serotonina via MAO produz 5-HIAA
2.deficiencia causa pellagra
- produz niacina
- Hartnup disease: perda de triptofano na urina. def de niacina. lembra pelagra: rash hiperpigmentado em areas expostas ao sol, lingua vermelha, diarreia, demencia.
glutamate
transforma GABA (neurotransmitor inibitorio)
homocisteina
produzida a partir de metionina que ao produzir SAM, da origem a homocisteina.
methionina > SAM > homocisteina > cistationina > cisteina
glucogenicos
a homocisteina uma vez formada, pode, atraves da methionine synthase, produzir mais metionina e perpetuar esse ciclo.
Elevação de homocisteina pode ocorrer na deficiencia de vitaminas B12, folato e B6 pois elas sao cofatores do seu processo de produção.
Homocistinuria: def na cysthathionine syntase que quebra homocisteina em cysteina. Ai acumula-se homocisteina. problemas visuais, membros longos, deformidades no peito, osteoporose, mental, trombose, aterosclerose
Processos que ocorrem na mitocondria
Beta oxidação de fatty acids
TCA cycle (citric acid cycle)
Carboxylation of pyruvate (gluconeogeneses)
Ketogenesis
Sintese das proteinas
Transcripção do DNA em pre-mRNA no nucleo
Post-transcriptional modifications: introns, poly A tail
Translation do mRNA para o ribossomo do reticulo endoplasmatico rugoso
Folding a cadeia de aminoacids em estrutura de proteina
Posttranslational modifications para sinalizar a correta destinação (golgi)
lisossomos colocam em vesiculas
no reticulo endoplasmatico liso, nao tem ribossomo e é local da glucose-6phosphatase e local de steroid synthesis e drug detoxification.
Poly A tail
não é transcribed from DNA. É adicionada nas modificações pós transcripção, downstream da sequencia AAUAAA. Protege o mRNA de degradar no citoplasma quando sai do nucleo.
o mRNA maduro possui poly A tail. É o tipo que se conecta mais forte ao latex durante um experimento.
Processos que ocorrem no citosol
glicolise
sintese de fatty acid
HMP shunt ou pentose phosphate pathway
Processos que ocorrem entre mitocondria e cytosol
heme synthesis
urea cycle
gluconeogenese
TCA cycle
Proteinas que contêm DNA-binding domain:
Transcription factors (myc, creb)
Steroid receptors (cortisol, aldosterona, progesterona)
Thyroid horone receptor
Fat-soluble vitamin receptors
DNA transcription / replication proteins.
Marfan
fibrilin 1 gene mutation. Aortic root dilation and upwards lens dislocation.
Homocystinuria
CBS gene mutation
intelectual disability
trombosis, downward lens dislocation, anemia megaloblastica
marfanoide
Def type 1 colagen
osteogenesis imperfecta
short stature
joint laxity
fracture
blue sclerae
Def Type 4 colagen
erlen-dahlos
joint hypermobility
skin laxity
easy bruising
alternative splicing
exons sao reconectados de multiplas formas no mRNA. Isso cria isoformas de proteinas / aumenta biodiversidade de proteinas e permite que um unico gene codifique varias proteinas.
stop codons (3)
UAG, UAA, UGA
releasing factors reconhecem stop codons e terminam a sintese de proteinas > eles facilitam a liberação de cadeia polipeptidea do ribossomo e dissolução do complexo ribosome-mRNA
initiate codon(1)
AUG
Glucose-6-phosphate dehydrogenase
enzima que limita o pentose phosphate pathway, a maior fonte de NADPH. Essa molécula é responsável por reduzir glutathione (que protege as celulas vermelhas do dano oxidativo) e pela biosintese de colesterol, fatty acid e esteroides.
Enzimas que tiamina B1 é cofator (4)
piruvate desidrogenase
alfa ketoglutarato desidrogenase
alfa ketoacid desidrogenase
transkerolase
pelagra
rash hiperpigmentado em areas expostas ao sol, lingua vermelha, diarreia, demencia.
def niacina
def niacina (pellagra) impacta quais enzimas
desidrogenases (exceto succinate desidrogenase pois usa FAD e nao NAD)
qual dos carboidratos (glicose, galactose, manose e frutose) é metabolizado mais rapido e pq?
frutose pois é fosforilada em F1P bypassando PFK1
Fructosuria essencial
Desordem benigna do metabolismo da frutose causada por def da fructokinase. Nesses casos, uma parte da dieta de frutose é convertida pela hexokinase em frutose 6 fosfato que consegue entrar na glicolise. E entao, nao ha sintomas, apenas a presença de frutose na urina.
malonyl-coa acao
inibe acao da carnitinine acyltransferase mitocondrial inibindo beta oxidaçao de novos acidos graxos
metabolismo do sorbitol
glucose > sorbitol > fructose (sorbitol dehydrogenase)
catarata infantil x adulto / idoso
infantil - pensar em acumulo de galactitol devido galactosemia
adulto - pensar em sorbitol por excesso de glicose ou injuria oxidativa relacionada a idade
fluorescence in situ hybridization (FISH)
identificar translocações especificas cromossomicas, duplicações e deleções usando um DNA complementar que é marcado com um radiotracer.
western blotting
avalia proteinas especificas usando um anticorpo marcado
utilidade: confirmar ELISA de HIV e doença de Lyme
Northern blotting
avalia RNA no gel marcado com uma sequencia de mRNA especifica
flow cytometry
laser-based test avalia marcadores de superficie de celulas especificas
utilidade: diagnostico de leucemia (identificar CD5 por ex)
Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA)
quantifica anticorpos e antigenos em um fluido
reação que produz GTP e reação que gasta GTP
produz: succinyl-coa synthetase (succinyl-coa em succinate) no TCA cycle
gasta: phosphoenolpyruvate em oxaloacetato (phosphoenolpyruvate carboxykinase) na gluconeogenese
linkage desequilibrio
tendencia de certos alelos em dois loci conectados ocorrerem juntos em maior ou menor frequencia do que o esperado ao acaso. Varia em diferentes populações.
Mosaicismo
presença de mutação em linhas de celulas diferentes. Pode ser somatico se adquirido depois da fertilização ou gonadal (germinal) se adquirido no ovo ou esperma.
MacCune Albright é um exemplo. lesao cafe com leite de um lado so, displasia fibrotica poliostotica (osso é substituido por colageno e fibroblasto) e uma endocrinopatia (puberdade precoce por ex).
Locus heterogeneidade
mutações em diferentes loci produzindo um mesmo fenotipo
ex.: albinismo, retinite pigmentosa, hipercolesterolemia familiar
Allelic heterogeneidade
diferentes mutações no mesmo loci produzindo o mesmo fenotipo
beta talassemia
Heteroplasmia
expressao variavel na doena mitocondrial
DNa mitocontrial só é passado pela mãe
imprinting disorders
Prader Willi syndrome: gene que vem da mãe é silenciado e doença ocorre quando o alelo do pai é deletado ou tem mutação. Hiperfagia, obesidade, retardo, hipogonadismo e hipotonia. Cromossomo 15 paterno. 25% dos casos ocorre por maternal uniparental disomy.
Angelman syndrome: gene que vem do pai é sileciado e a doença ocorre quando o alelo da mãe é deletado ou tem mutação. convulsao, taxia, retardo, riso inapropriado. Cromossomo 15 UBE3A. 5% dos casos sao por paternal uniparental disomy.
O que determina diferenciação celular?
fator de transcrição milieu
todas as celulas nucleadas humanas possuem o genoma inteiro mas fatores de transcrição especificos permitem apenas a expressao de determinados genes que sao relevantes para um tipo particular de celula. Fatores de transcrição tambem podem induzir diferenciacao celular.
