5.9 Proteomas y subpreotomas celulares y expresión diferencial

Question 1

Principal objetivo de proteómica

Answer 1

Id de protes y caracterizar su función

Question 2

Definición de proteómica subcelular

Answer 2

Estudio de protes a nivel de organelos

Question 3

¿Qué nos permite la expresión diferencial?

Answer 3

Comparar la expresión de una prote con un tratamiento vs otro tratamiento

Question 4

¿Cómo se estudia la subproteomica?

Answer 4

• Fluorecencia: Id cada parte de los organelos para saber el comportamiento de las protes a nivel cél (o sea de lo organelos pue)
• Proximidad: analizamos interacción de protes
• Fraccionamiento bioquimico: x detergentes, separa organelos (x densidad x peso molecular pa medirlo por espectometría de masas)

Question 5

Para id proteínas hacemos

Answer 5

• Western blot
• Espectrometria de masas

Question 6

Principal función del estudio de subproteomica

Answer 6

Biomarcadores
“Marcadores que se pueden utilizar en medicina para detección precoz, el dx, estadificación o pronóstico de enfermedades”
- Permite determinar el tratamiento más adecuado
- Marcadores pueden ser: metabolitos, péptidos, protes, medidas de propiedades físicas

Question 7

Facts de biomarcadores

Answer 7

• Descubrimiento se aceleró con desarrollo de tecnologías ómicas
• Pueden proceder del propio proceso patológico o reflejar la reacción del cuerpo frente a la enfermedad
• Pueden encontrarse en líquidos biológicos y tejidos (orina, plasma, saliva, liq intersticial, entre otros)

Question 8

Matrix Assisted Laser Desorption Time Of Flight

Facts de MALDI-TOF

Desorción/ionización láser asistido por matriz acoplada a tiempo de vuel

Answer 8

• Tecnología asistida x matriz
• Debe ser co-cristalizada en matriz
• Placa con matriz y analito > se irradia con un láser (337nm), causa que analito se expulse con partes de la matriz de forma gaseosa (desorción)
• Moléculas de matriz transfieren protones, ionizado a la muestra (ionización)
• Los residuos de la matriz se eliminan (desolvatación)

Question 9

Facts de tiempo de vuelo

MALDI-TOF

Answer 9

• Moléculas serán aceleradas con un campo eléctrico, la velocidad de movimiento de las moléculas
• Tiempo que pasan las moléculas dentro del analizador
• Alta capacidad de procesamiento (96 analitos de diferentes muestras a la vez)

Entre - peso, + velocidad

Q tanto tiempo tarda en llegar desde la matriz al detector

Question 10

Usos del tiempo de vuelo

MALDI-TOF

Answer 10

• Id de cepas bacterianas y fúngicas mediante las variantes de masas de carga
• Diagnóstico