2.1 Transcripción y ARNm Flashcards
Porcentaje de los genes codificantes de proteínas del humano entre mayor a menor
- Desconocido un poco menos de 50%
- Transcripción
- Metabolismo
- Proteínas multifuncionales
- Transporte
Facts de transcripción
- ADN → ARN
- Hebra antisentido sirve de molde para transcribir ARN
- Transcrito es copia exacta de hebra líder (excepto por el uracilo)
Definición de gen
Secuencias de ácidos nucleicos necesarios para síntesis de un próducto génico funcional (proteína o ARN)
- Secuencias codificantes (exones)
- Secuencias no codificantes (intrones)
Describe las diferentes uniones/enlaces en el ADN y así
- Fosfodiester: ribosa + fosfato (C5’-3’)
- N-glucosídico: C1´
- Puentes de hidrógeno: A-T (2), C-G (3)
Facts ARNm
- Adición de bases de 5’-3’
- Downstream o río abajo: dirección de templado en la cual es transcriot el ADN (o ARN en traducción)
- Upstream o río arriba: dirección contraria
Regulación genética en cél eucariotas, secuencias reguladoras: Caja TATA
→ Secuencia de T, A repetidas 25-35 pb río arriba
- Estudios de mutagénesis demuestran que el cambio de una base baja la tasa de transcripción de POL II
Regulación genética en cél eucariotas, secuencias reguladoras: Caja GC
→ Elemento regulador con secuencua GGGCGG
- En genes sin caja TATA(85-90) (genes constitutivos → realizan mismas funciones en todas las células)
- Pueden estar en 5’-3’ o visceversa
- Se unen lo FT SP1, SP3 y SP4
Regulación genética en cél eucariotas, secuencias reguladoras: Caja CAAT
- Localización: -80
- Puede orientarse en cualquier dirección (5’-3’; 3’-5’)
Regulación genética en cél eucariotas, secuencias reguladoras: Islas CpG
Secuencias ricas en C y G (20-50 nucleótidos) 100 pb río arriba
- Indican inicio de transcripción
Es una característica del sitio de control
Se pueden encontrar muy lejos del sitio de transcripción
Regulación genética en cél eucariotas, potenciadores distantes: Enhancers
→ Potenciador localizados en:
- Reguladores de tipo CIS
- 50kb río arriba del promotor
- Río abajo en algún intrón
- Río abajo en último exón
- Pueden ser específicos según el tipo célular
Primer Enhancer descubierto
En virus de simio
Los sitios de regulación trabajan de forma independiente
V/F
Falso
Describe como la ARN polimerasa incia y termina de trabajar
→ Inicio: encuentra secuencia promotora
→ Termina: encuentra señal de terminación
Nombra las modificaciones postranscripcionales en el ARNm
Caperuza, splicing y cola de poli A
Facts de caperuza: adición de 5’ cap (7-metilguanosa)
→ Función
- Protege ARN de degradación enzimática
- Ayuda en transporte de ARN a citoplasma
- Sitio de unión de factor proteico requerido para la traducción en citoplasma
Facts de cola de poli A (3’)
→ Modificación en donde se agregan adeninas (100-250)
→ Funciones
- Protege de degradación
- Facilita eficiencia de traducción en ribosomas
Facts de Splicing
→ Eliminación de intrones (regiones no codificantes)
→ Unión de exones (regiones codificantes)
Proceso de Transcripción ADN → ARNm
INICIO
2. 1. Polimerasa se une a promotora en ADN (doble hélice) formando el complejo cerrado
2. Polimerasa desnaturaliza ADN cerca de sitio de inicio, formando borbuja o complejo abierto
3. Polimerasa calatiza enlace fosfodiéster entre los primeros rNTPs
ELONGACIÓN
4. Polimerasa avanza 3’-5’ en cadena molde, desnaturalizando ADN doble hélice y añadiendo rNTPs a ARN en crecimiento
TERMINACIÓN
5. En sitio de terminación, polimerasa libera ARN completado y se separa de ADN
Nombres que recibe el primer ARN sintetizado
→ Transcrito primario
→ RNA heterogéneo (hnRNA)
→ RNA percursor
El primer ARN sintetizado esta confromado por las siguientes etsructuras
→ UTR: untranslated regions
→ m7Gppp cap o 5’cap
→ Intrones
→ Exones
→ Cola de poli A
Procedimiento de pre-mARN
- Transcripción, 5’capping
- Corte en sitio de poli A, por endonucleasa
- Poliadenilación, por poli A polimerasa + ATP
- Splicing de ARN
Proceso de splicing
- Unidad de transcripción formada por intrones y exones
- Secuencias nucleotídicas específicas en uniones de exones e intrones son identificadas (splice junctions; 5’:GU, 3’:AG)
- Pérdida de regiones intrónicas
- Fusión de exones
Fact splice junctions (secuencias consenso unión intrones exones)
→ Donador: en 5’, inicio de intrón, GU, primer punto de corte (10s-10,000 nucleotidos)
→ Ramificado: lapso entre donador y acpetor, T/C, N, C/T, T/C, A/G, A, C/T
→ Aceptor: en 3’, final de intrón, AG, segundo punto de corte (<20 nucleótidos)
Facts de proceso splicing
- Ataque nucleofílico de la G (GU 5’)
- Proceso comienza con ataque nucleofílico de A presente en sitio ramificado contra la G del extremo 5’
- Provoca rompimiento de unión intrón-exón
Facts de splicing alternativo
→ Mecanismo de producción de diferentes isoformas de proteínas transcritas por un solo gen
- Exones con splicing alternativo son muy comunes en SN → proteínas requeridas para desarrollo y función
Transporte del RNAm al citoplasma
→ ARNm asociado a protes heterogéneas nucleares (hnRNP)
- Forma complejo proteico mensajero nuclear (mRNP)
- Núcleo separado de citoplasma por dos membranas
- Transporte: poros nucleares de memb
- Cada poro formado por el complejo de poro nuclear (NCP) (nucleoporinas → protes)
