Week 3 ZO's/VO's Flashcards
Hoe lang duurt de G1-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?
11-14 uur, 50%
Hoe lang duurt de S-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?
8-9 uur, 30%
Hoe lang duurt de G2-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?
3-5 uur, 20%
Hoe lang duurt de M-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?
1 uur, 10%
Welke 3 nucleïnezuren kunnen worden gebruikt om aan te tonen in welke fase een cel zit?
- 3H-T
- 3H-U
- 3H-A
Waar wordt 3H-T ingebouwd?
In het DNA
Waar wordt 3H-U ingebouwd?
In het RNA
Waar wordt 3H-A ingebouwd?
In het DNA en het RNA
In welke fase zijn de cellen bij piek 1 bij flow-cytometrie?
Cellen in de G1-fase
In welke fase zijn de cellen bij piek 2 bij flow-cytometrie?
Cellen in de G2/M fase
Hoe werken nucleotide homologen?
Ze kunnen nier in het DNA worden ingebouwd, waardoor er bij hoge concentraties door ophoping DNA-polymerase wordt tegengewerkt
Hoe werkt nucleotidedepletie?
Het voorkomt de vorming van deoxynucleotiden in de cel
Hoe werken enzymremmers?
Ze leggen DNA polymerase stil door te binden aan de actieve site. Het is reversibel, een voorbeeld is aphidicoline
Waar zie je bij FCAS een hoge piek bij gebruik van enzymremmers?
Bij 1 (G1 fase). Alle cellen in de S-fase blijven steken en na de S-fase verdwijnt de piek
Hoe werken DNA beschadigende stoffen om celproliferatie te voorkomen?
DNA-polymerase blijft bij beschadigingen hangen
Hoe werken vincristine + paclitaxel?
Ze zijn veelgebruikt voor chemotherapie. Tubulinedraden worden niet gevorm en cellen blijven in de S-fase steken. Enorme piek bij 2 in FCAS
Wat zijn 4 manieren die pathologen kunnen gebruiken om een schatting van de proliferatie te maken van cellen van vaste tumoren zonder FCAS?
- Zoeken naar cellen in mitose
- Zoeken naar cellen in S-fase
- Antilichamen die alleen prolifererende cellen aantonen
- Antilichamen die alleen cellen in mitose aankleuren
Hoe werkt een immuno/western blot?
Eiwitten worde ngedenatureerd en op grootte gescheiden door SDS gel-elektroforese. Door middel van antilichamen wordt het te onderzoeken eiwit zichtbaar gemaakt.
Waar vertelt de positie van het eiwit je iets over bij een Western blot?
De grootte
Waar vertelt de intensiteit van de eieitband je iets over bij een Western blot?
De hoeveelheid eiwit
Wat is cDNA?
Een dubbelstrengs DNA molecuul, dat in basenvolgorde overeenkomt met een rijp mRNA
Wat is moleculair hybridisatie en wanneer wordt het gebruikt?
Het is de vorming van een dubbele helix uit twee enkelstrengs nucleïnezuren met een homologe nucleotidenvolgorde
Wat wordt bij een RNA-blot gebruikt ipv een antilichaam zoals bij en immunoblot?
Een specifiek stukje DNA (probe)
Wat gebeurt er met het RAS gen bij tumoren?
Val wordt ingebouwd ipv Gly, hierdoor werkt het uitzetten van het eiwit niet meer goed waardoor groei gestimuleerd blijft
Wat is chromosome painting?
Bij FISH een mengsel van veel probes gebruiken om totale of regio’s van een chromosoom op te doen lichten
Wat kun je zichtbaar maken met dual-colour chromosome painting?
Translocaties van relatief korte stukken die niet te zien zijn op het karyogram
Wat zijn dicentrische chromosomen en hoe ontstaan ze?
Ze hebben twee centale punten, ze zijn het gevolg van foutief gerepareerde DNA breuken
Wat is centrosoom amplificatie?
Cellen (met name anafase en telofase) waarin een afwijken aantal centriolenparen te zien is, meestal 3 of zelfs 4
Wat is er aan de hand bij het syndroom van Turner?
Een vrouw mist een X-chromosoom
Wat is er aan de hand bij het syndroom van Klinefelter?
Mannen hebben een extra X-crhomosoom
Wat houdt loss of heterozygosity in?
Het verlies van de paternale of maternale kopie van een chromosoom
Wat is spectral karyotyping?
Alle individuele chromosomen krijgen een unieke kleur, zo kun je translocaties makkelijk opsporen
Wat betekent het als een marker niet-informatief is tijdens een microsattalite assay?
Er is slechts één piek zichtbaar wanneer de twee allelen even lang zijn. Het wil zeggen dat verlies van één van de allelen niet gemeten kan worden
Wat betekenen de X- en Y-as bij microsattelite assay?
X-as: lengte van het geamplificeerde fragment in nucleotiden
Y-as: de hoeveelheid
Wat zijn 3 mogelijke verklaringen van het niet ompleet verloren gaan van een signaal in een tumorweefsel bij microsattelite assay?
- De tumor bevat bloedvaten en stromaal weefsel met normale cellen
- De tumor is heterogeen, in niet alle tumorcellen is het bestudeerde chromosoom verloren
- Er is geen LOH in de tumorcellen: het lange allel is afkomstig van een chromosoom dat meerdere keren aanzwezig is in de tumor, daarom is de verhouding van intensiteit scheef
Wat is CIN?
Chromosomale instabiliteit, het betekent dat tumorigenese via chromosoomafwijkingen ontstaat
Wat is MIN?
Microsattelietinstabiliteit, het betekent dat fouten die tijdens de DNA-synthese makkelijk optreden in de microsattelieten niet meer gecorrigeerd worden omdat het DNA mismatch systeem defectief is. Lynch-tumoren hebben een MIN fenotype
