Week 3 ZO's/VO's

Question 1

Hoe lang duurt de G1-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?

Answer 1

11-14 uur, 50%

Question 2

Hoe lang duurt de S-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?

Answer 2

8-9 uur, 30%

Question 3

Hoe lang duurt de G2-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?

Answer 3

3-5 uur, 20%

Question 4

Hoe lang duurt de M-fase en hoe veel cellen bevinden zich er in?

Answer 4

1 uur, 10%

Question 5

Welke 3 nucleïnezuren kunnen worden gebruikt om aan te tonen in welke fase een cel zit?

Answer 5

• 3H-T
• 3H-U
• 3H-A

Question 6

Waar wordt 3H-T ingebouwd?

Answer 6

In het DNA

Question 7

Waar wordt 3H-U ingebouwd?

Answer 7

In het RNA

Question 8

Waar wordt 3H-A ingebouwd?

Answer 8

In het DNA en het RNA

Question 9

In welke fase zijn de cellen bij piek 1 bij flow-cytometrie?

Answer 9

Cellen in de G1-fase

Question 10

In welke fase zijn de cellen bij piek 2 bij flow-cytometrie?

Answer 10

Cellen in de G2/M fase

Question 11

Hoe werken nucleotide homologen?

Answer 11

Ze kunnen nier in het DNA worden ingebouwd, waardoor er bij hoge concentraties door ophoping DNA-polymerase wordt tegengewerkt

Question 12

Hoe werkt nucleotidedepletie?

Answer 12

Het voorkomt de vorming van deoxynucleotiden in de cel

Question 13

Hoe werken enzymremmers?

Answer 13

Ze leggen DNA polymerase stil door te binden aan de actieve site. Het is reversibel, een voorbeeld is aphidicoline

Question 14

Waar zie je bij FCAS een hoge piek bij gebruik van enzymremmers?

Answer 14

Bij 1 (G1 fase). Alle cellen in de S-fase blijven steken en na de S-fase verdwijnt de piek

Question 15

Hoe werken DNA beschadigende stoffen om celproliferatie te voorkomen?

Answer 15

DNA-polymerase blijft bij beschadigingen hangen

Question 16

Hoe werken vincristine + paclitaxel?

Answer 16

Ze zijn veelgebruikt voor chemotherapie. Tubulinedraden worden niet gevorm en cellen blijven in de S-fase steken. Enorme piek bij 2 in FCAS

Question 17

Wat zijn 4 manieren die pathologen kunnen gebruiken om een schatting van de proliferatie te maken van cellen van vaste tumoren zonder FCAS?

Answer 17

1. Zoeken naar cellen in mitose
2. Zoeken naar cellen in S-fase
3. Antilichamen die alleen prolifererende cellen aantonen
4. Antilichamen die alleen cellen in mitose aankleuren

Question 18

Hoe werkt een immuno/western blot?

Answer 18

Eiwitten worde ngedenatureerd en op grootte gescheiden door SDS gel-elektroforese. Door middel van antilichamen wordt het te onderzoeken eiwit zichtbaar gemaakt.

Question 19

Waar vertelt de positie van het eiwit je iets over bij een Western blot?

Answer 19

De grootte

Question 20

Waar vertelt de intensiteit van de eieitband je iets over bij een Western blot?

Answer 20

De hoeveelheid eiwit

Question 21

Wat is cDNA?

Answer 21

Een dubbelstrengs DNA molecuul, dat in basenvolgorde overeenkomt met een rijp mRNA

Question 22

Wat is moleculair hybridisatie en wanneer wordt het gebruikt?

Answer 22

Het is de vorming van een dubbele helix uit twee enkelstrengs nucleïnezuren met een homologe nucleotidenvolgorde

Question 23

Wat wordt bij een RNA-blot gebruikt ipv een antilichaam zoals bij en immunoblot?

Answer 23

Een specifiek stukje DNA (probe)

Question 24

Wat gebeurt er met het RAS gen bij tumoren?

Answer 24

Val wordt ingebouwd ipv Gly, hierdoor werkt het uitzetten van het eiwit niet meer goed waardoor groei gestimuleerd blijft

Question 25

Wat is chromosome painting?

Answer 25

Bij FISH een mengsel van veel probes gebruiken om totale of regio’s van een chromosoom op te doen lichten

Question 26

Wat kun je zichtbaar maken met dual-colour chromosome painting?

Answer 26

Translocaties van relatief korte stukken die niet te zien zijn op het karyogram

Question 27

Wat zijn dicentrische chromosomen en hoe ontstaan ze?

Answer 27

Ze hebben twee centale punten, ze zijn het gevolg van foutief gerepareerde DNA breuken

Question 28

Wat is centrosoom amplificatie?

Answer 28

Cellen (met name anafase en telofase) waarin een afwijken aantal centriolenparen te zien is, meestal 3 of zelfs 4

Question 29

Wat is er aan de hand bij het syndroom van Turner?

Answer 29

Een vrouw mist een X-chromosoom

Question 30

Wat is er aan de hand bij het syndroom van Klinefelter?

Answer 30

Mannen hebben een extra X-crhomosoom

Question 31

Wat houdt loss of heterozygosity in?

Answer 31

Het verlies van de paternale of maternale kopie van een chromosoom

Question 32

Wat is spectral karyotyping?

Answer 32

Alle individuele chromosomen krijgen een unieke kleur, zo kun je translocaties makkelijk opsporen

Question 33

Wat betekent het als een marker niet-informatief is tijdens een microsattalite assay?

Answer 33

Er is slechts één piek zichtbaar wanneer de twee allelen even lang zijn. Het wil zeggen dat verlies van één van de allelen niet gemeten kan worden

Question 34

Wat betekenen de X- en Y-as bij microsattelite assay?

Answer 34

X-as: lengte van het geamplificeerde fragment in nucleotiden
Y-as: de hoeveelheid

Question 35

Wat zijn 3 mogelijke verklaringen van het niet ompleet verloren gaan van een signaal in een tumorweefsel bij microsattelite assay?

Answer 35

1. De tumor bevat bloedvaten en stromaal weefsel met normale cellen
2. De tumor is heterogeen, in niet alle tumorcellen is het bestudeerde chromosoom verloren
3. Er is geen LOH in de tumorcellen: het lange allel is afkomstig van een chromosoom dat meerdere keren aanzwezig is in de tumor, daarom is de verhouding van intensiteit scheef

Question 36

Wat is CIN?

Answer 36

Chromosomale instabiliteit, het betekent dat tumorigenese via chromosoomafwijkingen ontstaat

Question 37

Wat is MIN?

Answer 37

Microsattelietinstabiliteit, het betekent dat fouten die tijdens de DNA-synthese makkelijk optreden in de microsattelieten niet meer gecorrigeerd worden omdat het DNA mismatch systeem defectief is. Lynch-tumoren hebben een MIN fenotype