Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

2A1 > Week 2 colleges > Flashcards

Week 2 colleges Flashcards

1
Q

Wat is een transitie in het DNA?

A

Purine → purine of pyrimidine → pyrimidine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Wat is een transversie in het DNA?

A

Purine → pyrimidine of pyrimidine → purine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Wat houdt spontane hydrolyse in?

A

Binding tussen base en suiker verbreekt, je houdt een suiker zonder base over → depurinatie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Waar leidt spontane hydrolyse tot?

A

1 basepaar deletie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Wat houdt deaminatie van basen in?

A

Aminogroep verdwijnt, leidt tot omzetting van cytosine naar uracil (die hoort niet in DNA)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Waar leidt deaminatie van basen tot?

A

Verandering van complementariteit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hoe zorgen zuurstofradicalen voor DNA schade?

A

Radicalen zetten guanine om tot 8-oxoguanine, dit paart met adenosine. Tijdens replicatie vindt de omzetting van G → T plaats.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hoe zorgt benzo[a]pyreen voor DNA schade?

A
  • Metabool geactiveerd: wordt omgezet in benzo[a]pyreen dial epoxide (BPDE)
    • Veroorzaakt chemische adducten die DNA dubbelhelix verstoren
    • BPDE reageert voornamelijk met guanine residu
    • Tegenover G-BPDE wordt een A residu ingebouwd - verandering complementariteit
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Welke chemische adducten verstoren de DNA dubbelhelix niet?

A
  • Spontane hydrolyse
  • Deaminatie
  • Oxidatieve DNA schade
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Wat wordt door base excisie reparatie (BER) gerepareerd?

A

Kleine adducten

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Wat herkent DNA schade?

A

Specifieke DNA glycosylases

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Wat zijn de stappen van BER?

A
  1. DNA glycosylase herkent schade
  2. Endonuclease herkent AP site en maakt knip in DNA; AP site wordt verwijderd
  3. Herstel: DNA polymerase en ligase
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Waartoe dient nucleotide excisie reparatie (NER)

A

Herstel van grote adducten

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Waar dient globaal genoom NER voor?

A

Schadeherstel om kanker te voorkomen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Wat doet de scanning bij globaal genoom NER?

A

XPC/RAD23B complex

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Wat doet de scanning bij transcriptie gekoppeld NER?

A

RNA pol II complex

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Wat zijn de stappen van NER?

A
  1. Herkenning van schade
  2. Openen van omringend DNA
  3. Verwijderen van schade (en aangrenzende gebieden van dezelfde streng
  4. Herstel
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Welke DNA glycosylase herkent deaminatie?

A

Uracil DNA glycosylase (UNG)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hoe werkt uracil DNA glycosylase (UNG)?

A
  • UNG verwijdert ongewenst uracil
  • Creëert een abasische plaats (AP)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Wat is een abasische plaats?

A

Plaats zonder purine of pyrimidinebase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Welke glycosylase herkent oxidatieve DNA schade?

A

8-oxoguanine DNA glycosylase (OGG1)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Wat is er defect bij xyoderma pigmentosum?

A

Het globaal genoom NER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Wat is er mis bij cockayne?

A

Transcriptie-gekoppeld NER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Wat gebeurt er bij XP?

A

Extreme zongevoeligheid, huidkankerontwikkeling

25
Q

Wat gebeurt er bij cockayne?

A

Versnelde veroudering

26
Q

Wat zijn 3 mogelijke ‘templates’ tijdens DNA herstel?

A
  1. Complementaire streng
  2. Zusterchromatide
  3. Homologe chromosoom
27
Q

Welke 2 manieren bestaan er om dubbelstrengse DNA breuken te herstellen?

A
  1. Niet-homologe DNA eindverbinding
  2. Homologe recombinatie
28
Q

Waarom is NHEJ onnauwkeurig?

A

Het gebruikt geen ‘template’

29
Q

Waarom is homologe recombinatie nauwkeurig?

A

Het gebruikt een ‘template’, het zusterchromatide

30
Q

Wat doet NHEJ?

A

Direct aan elkaar ligeren van de twee uiteinden van een DNA breuk

31
Q

Wat doet homologe recombinatie?

A

Het uitwisselen van DNA strengen tussen DNA moleculen

32
Q

Waar gaat celdeling ten koste van bij NHEJ?

A

Nauwkeurigheid in DNA code. Er vindt een kleine deletie plaats

33
Q

Waarom is de onnauwkeurigheid bij niet-homologe DNA eindverbinding positief voor antilichamen?

A

Het vergroot de diversiteit

34
Q

Wat zijn homologe chromosomen?

A

Twee vergelijkbare maar niet identieke kopieën van elk chromosoom

35
Q

Wat is het nut van RAD51 eiwitten?

A

Ze identificeren en bevorderen baseparing tussen het gebruiken en intacte zusterchromatide

36
Q

Wat gebeurt en bij recombinatie als de zusterchromatide gemuteerd is?

A

Dan wordt de beschadigde streng ook gemuteerd

37
Q

Welke 3 mechanismen dragen bij aan de nauwkeurigheid van de DNA replicatie?

A
  1. Baseselectie
  2. Proofreading
  3. Mismatchreparatie
38
Q

Hoe werkt mismatchreparatie?

A

Eiwitten herkennen de mismatch, roepen EX01 op die een deel van de foute strand wegneemt en dan komt een polymerase om het op te lossen

39
Q

Wat ligt ten gronde van Lynch syndroom?

A

Een defecte mismatch reparatie

40
Q

Wat zijn 2 manieren van het aantonen van een mismatch reparatie defect?

A
  1. Immunohistochemische kleuring
  2. Microsattelite instability assay
41
Q

Wat zijn microsattelieten?

A

Microsatellieten bestaan uit korte repeterende sequenties, meestal di-, tri- of tetranucleotide repeats

42
Q

Waarom heeft bij mismatch reparatiedefecten een miscosattelite assay nut?

A

Defect mismatch reparatie leidt tot microsatelliet instabiliteit

43
Q

Wat maakt het moeilijk om Lynch syndroom te vinden?

A

Tumoren van Lynch zitten meestal rechts in de colon

44
Q

Wat wordt geadviseerd bij Lynch-geassocieerd colorectaal carcinoom?

A

een totale colectomie met een ileorectale anastomose (IRA)

45
Q

Welk herstelmechanisme wordt bij ioniserende straling, zuurstofradicalen, alkylerende stoffen en spontane reacties gebruikt?

A

BER

46
Q

Welk herstelmechanisme wordt bij UV licht en polycyclische aromaten gebruikt?

A

NER

47
Q

Welke herstelmechanisme wordt bij antikanker medicatie gebruikt?

A

Recombinationele reparatie

48
Q

Welk herstelmechanisme wordt bij replicatiefouten gebruikt?

A

Mismatch repair

49
Q

Wat is de functie van topoisomerase?

A

Enzym dat zorgt dat 2 DNA strengen die door elkaar lopen door elkaar heen getrokken kunnen worden en los van elkaar kunnen komen

50
Q

Wat is het nut van het remmen van topoisomerase?

A

Remmer laat breuk wel toe, maar het doortrekken niet; allemaal breuken ontstaan en leiden tot chromosomale afwijkingen en cellen plegen apoptose.

51
Q

Wat houdt synthetische letaliteit in?

A
  • Bepaalde reparatie uitzetten die in tumorcellen voorkomt
    • Zowel tumorcellen en normale cellen kunnen reparatie 1 niet meer gebruiken, maar normale cellen kunnen reparatie 2 nog gaan gebruiken
52
Q

Waarom werkt NHEJ niet als er een enkelstrengs breuk is?

A

Omdat er geen tweede DNA uiteinde is

53
Q

Hoe wordt een replicatie-geassocieerd enkelstrengs breuk opgelost?

A

dmv homologe recombinatie

54
Q

In hoe veel van de gevallen is borstkanker erfelijk?

A

5-10%

55
Q

Waar hebben mensen met een gemuteerd BRCA gen meer kans op?

A

Borst- en ovariumkanker

56
Q

Hoe zorgt een PARP inhibitor ervoor dat BRCA tumorcellen dood gaan?

A

Het zorgt voor replicatie en ophoping van dubbelstrengs breuken, normale BRCA cellen of HR proficiënte cellen kunnen dit wel oplossen, tumorcellen niet

57
Q

Waarom werken PARP1 remmers niet voor borstkanker?

A

Naast BRCA wordt POLQ ook gebruikt om het DNA te repareren

58
Q
A

2A1 (17 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions