Virus : biologie et classification Flashcards
Caractéristiques des virus
▪ Ils ne sont pas considérés vivants.
▪ Ils sont des parasites intracellulaires obligatoires.
▪ Ils sont incapables de synthétiser des protéines ou produire de l’énergie par eux-mêmes (en dehors d’une cellule).
▪ Les virus ont une taille beaucoup plus petite que les bactéries: 18 à 300 nanomètres (non visibles au microscope optique).
▪ Ils peuvent infecter les insectes, les poissons, les plantes, les reptiles, les mammifères et les bactéries (bactériophages)
La reproduction des virus se fait par assemblage
Les virus doivent être infectieux pour survivre dans la nature
Les virus sont capables d’utiliser les mécanismes de la cellule de l’hôte pour produire leurs composantes
Qu’est-ce qu’un virus?
▪ La particule virale est nommée un virion.
▪ Un virion est composé d’un génome viral entouré d’une capside +/- une enveloppe. (que certains virus ont des enveloppes)
▪ Le génome viral est composé soit d’ADN ou d’ARN mais pas les deux.
▪ Certains virus sont entourés d’une enveloppe * Composante interne (protéines virales)
* Composante externe (composante lipidique) * +/- des spikes (glycoprotéines)
Structure virus nu vs. développé - différences + Explication de chaque composante :
**Virion **= le virus –> composé d’un génome encadrer dans une capside +/- enveloppe,
Peut contenir des enzymes et autres protéines pour faciliter la réplication dans la cellule
Génome = soit ADN (simple ou double brin) ou ARN (positif –> sens de l’ARNm, ou négatif –> sens complémentaire), le génome ARN peut être segmenté, plus le génome est grand – plus il transporte un grand nombre d’informations dans le virion
Capside = structure rigide capable d’endurer des conditions environnementales diff. => Fournit la résistance aux virus nus
**Enveloppe **= membrane composée de lipides, protéines et glycoprotéines. Peut être maintenant dans les milieux aqueux. Sensible à la sécheresse, l’Acidité, aux détergents et solvants => inactivation du virus
Rôle de la capside/enveloppe => offre une protection au virion durant la transmision du virus d’un hôte à l’autre,
La surface de la capside/enveloppe médit l’interaction cellule/virus grâce à la protéine virale d’attachement (clé serrure) => retrait de la PVA = impossible d’infecter
3 types de classification du génome des virus
RÉPLICATION VIRALE - étapes
A. Étapes :
a. Attachement : protéine d’attachement virale au récepteur de la cellule hôte
1. À noter : il y a une spécificité en ce qui a trait à la protéine d’attachement, ce qui explique pourquoi certains virus iront se lier aux cellules épithéliales, alors que d’autres viseront les hépatocytes (ex : virus des hépatites).
b. Pénétration du virus dans la cellule
c. Décapsidation
1. À noter : cela permet au génome d’être libéré dans le cytoplasme
d. Transcription et réplication
1. But : formation de protéines virales et réplication du génome viral
2. À noter : les virus ARN se répliquent dans le cytoplasme, alors que les virus ADN se répliquent dans le noyau (en général).
3. Particularité des rétrovirus (VIH, HTLV-I, HTLV-II) :
3.1. Type de virus : ARN
3.2. Composition : transcriptase inverse capable de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral, ADN viral pouvant intégré le génome humain et être à l’abris du système immunitaire, augmentant la férocité de ces virus
e. Assemblage
1. But : reformation des structures du virus afin d’être prêt à sortir de la cellule
f. Libération
1. À noter : la cellule de l’hôte sera souvent très endommagée lors de la sortie du virus dans l’espace extracellulaire
où se répliquent les différents types de virus
▪ Les virus ARN se répliquent dans le cytoplasme
▪ Les virus ADN se répliquent dans le noyau
Description des rétrovirus
▪ Ce sont des virus ARN
▪ Ils possèdent une transcriptase inverse qui permet de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral.
▪ Cet ADN viral peut être intégré à l’ADN de la cellule ce qui met le virus à l’abri du système immunitaire.
EXEMPLE : VIH
Classification des virus selon ADN/ARN + nu/enveloppé
Caractéristiques des virus nus
- Résistants
- température- à des détergents - à la sécheresse - à l’acide (survis dans GI) - Sont libérés de la cellule lors de la lyse cellulaire
- Transmission par contact direct et indirect, gouttelettes (fécale-orale)
- Bonne survie dans l’environnement et dans le tractus digestif
- se transmettent facilement (fomites, main à main, par la poussière, gouttelettes)
- peuvent s’assécher et rester infectieux
- Ac peuvent les tuer
CARACTÉRISTIQUES DES VIRUS ENVELOPPÉS
Composantes de l’enveloppe : membrane, lipides, protéines, glycoprotéines
1. Fragiles aux conditions adverses de l’environnement
2. Facilement détruits par l’acidité gastrique (survis pas dans le GI)
3. Transmission surtout par contact direct ou par gouttelettes (transfusion de sang, sécrétions et transplantation d’organes
4. Libérés de la cellule hôte soit par bourgeonnement ou lors de la lyse cellulaire.
5. Doivent rester dans milieux aqueux
6. Ne doit pas tuer la cellule pour la transmission
7. Besoin d’immunité humorale et cellulaire pour les tuer
8. Produisent des réactions d’hypersensibilité et inflammation
Où on cultive les virus?
sur des cellules vivantes
vrai ou faux. y’a des virus qui sont transmis par des arthropodes.
vrai
Classification des virus basée sur une manifestation clinique
▪ Jaunisse (ictère)
Virus des hépatites A, B, C, D, E
Virus de la fièvre jaune
▪ Encéphalite (inflammation du cerveau)
▪ Diarrhée
▪ Virus exanthémateux (éruption cutanée)
* Vésicules (cloches d’eau)
* Érythème ou macule (rougeurs sur la peau)
* Érythémato-papulaire ou maculo-papulaire (rougeurs et surélévation des lésions)
Classification des virus basée sur une manifestation clinique
▪ Jaunisse (ictère)
Virus des hépatites A, B, C, D, E
Virus de la fièvre jaune
▪ Encéphalite (inflammation du cerveau)
▪ Diarrhée
▪ Virus exanthémateux (éruption cutanée)
* Vésicules (cloches d’eau)
* Érythème ou macule (rougeurs sur la peau)
* Érythémato-papulaire ou maculo-papulaire (rougeurs et surélévation des lésions)
CLASSIFICATION BASÉE SUR UNE MANIFESTATION CLINIQUE
virus qui cause rougeur vs. vésicule
Recherche d’Ag1 pour le diagnostic d’infections virale
Tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN)
DESCRIPTION:
◆ Technique de + en + utilisée
◆ Applicable à beaucoup de virus (mais pas tous)
◆ $$$
◆ Rapide (< 24 heures)
◆ Personnel spécialisé (technicien, biologiste moléculaire)
◆ Ne sont pas disponibles dans tous les laboratoires hospitaliers
Ac IgM + = infection récente
VIRUS POUR LESQUELS UNE SÉROLOGIE IGM EST DISPONIBLE DANS LES LABORATOIRES HOSPITALIERS
