VIc Flashcards
Identificación de secuencias «conservadas» millones de años
genómica comparativa
Localización de regiones reguladoras y genes esenciales para la vida
genómica comparativa
Qué es la homología de secuencia
Secuencias de proteínas o ácidos nucleicos similares entre sí debido a que
presentan un mismo origen evolutivo
Dos secuencias son homólogas en base a…
su alta similitud
de donde poviene la similitud
de la observación
qué es la homología
es la interpretación de que la alta similitud se debe a que poseen un origen común
Qué permite la comparación de secuencias
predecir la función o la estructura
en base a datos conocidos de una secuencia homóloga
Se usa en la homología de secuencia
BLAST
Gen ortólogo
Aquellos que se han separado por un evento de especiación
Copias de un mismo gen en especies diferentes
Genes que se encuentran en diferentes especies y que son altamente similares debido a que se han originado en un
ancestro común
gen ortólogo
Este tipo de genes usualmente, pero no siempre, tienen la misma función
gen ortólogo
gen parálogo
Poseen un alto grado de identidad
Ambos se encuentran dentro del genoma de una especie
En este tipo de genes uno de ellos ha aparecido por duplicación del otro
gen parálogo
disminuye la presión evolutiva sobre una de las copias, permitiéndole acumular mutaciones sin que el individuo pierda la función de dicho gen
que uno de los genes aparece por duplicación de otro
permite generar proteínas nuevas con una función similar, creando la
posibilidad de la especialización
gen parálogo
Criterio de naturaliad que ofreció la evolución
la ascendencia común
Cómo se explica el grado de similitud morfológica entre especies
por el árbol filogenético
Permite reconstruir la historia evolutiva independiente de cada especie
taxonomía
Se pueden deducir comparando secuencias de DNA
relaciones evolutivas entre los organismos
relaciones evolutivas entre los organismos
sitios sin variación (sin marca)
sitios neutrales filogenéticamente (puntos)
sitios filogenéticos informativos (flechas)
Las relaciones filogenéticamente se deducen…
indirectamente de la comparación de secuencias nucleotídicas
Cambian a ritmos distintos
secuencias de DNA
En sistemas artificiales vs naturales se asume:
- que el genoma es un registro explícito de los ancestros de dicho organismo
- los cambios nucleotídicos son aleatorios y se acumulan en la secuencia proporcionalmente al tipo transcurrido
la mutación actual puede borrar la información evolutiva, lo que hace que…
las diferencias de secuencia subestimen las distancias reales
Se emplean secuencias con diferentes grados de variabilidad dependiendo el nivel de comparación del análisis
relaciones evolutivas entre los organismos
Relaciones evolutivas en el conjunto entero de los seres vivos
se emplean secuencias nucleotídicas ALTAMENTE CONSERVADAS
Ejemplo de las Relaciones evolutivas en el conjunto entero de los seres vivos
rRNAs de la subunidad ribosómica pequeña
Relaciones evolutivas entre especies íntimamente relacionadas
se emplean secuencias nucleotídicas VARIABLES
Ejemplo de Relaciones evolutivas entre especies íntimamente relacionadas
secuencias que codifican para enzimas que catalizan rxn metabólicas esenciales
rbcL
subunidad grande de la ribulosa 1-5 bifosfato Carboxilasa-oxigenasa
ndhF
subunidad F de NADP deshidrogenasa
rpoA
subunidad alfa de la ARN polimerasa II
Relaciones evolutivas entre individuos de la misma especie
se emplean secuencias ALTAMENTE VARIABLES, las cuales pueden servir para identificación de individuos
Qué es una especie
conjunto de organismos que adquiere su propio set de cambios evolutivos ()<pueden hibridar entre sí y dar descendencia fértil
Variabilidad individual dentro de las especies
serotipo
cepa
variabilidad fenotípica
serotipo
microorganismo infeccioso clasificado según las regiones antigénicas que presenta
Qué permite el serotipo
diferenciar organismos a nivel de subespecie
Es importante en epidemiología
serotipo
Cómo se distinguen los serotipos
por medio de pruebas serológicas
Cepa
población celular de una especie que desciende de una única célula, usualmente propagada clonalmente
Conserva cualidades definitorias
cepa
Dos cepas de la misma especie
mínimo 70% de hibridación entre genomas completos
mínimo 97% de homología 16s rRNA
Organismos del mismo género
mínimo 25% de hibridación entre genomas completos
mínimo 90-95% de homología 16s rRNA
El % de hibridación representa…
% de homología
1x1 100%
misma cepa
1x2 25%
1 y 2 son probablemente diferentes géneros
100-75%
misma especie
75-25%
mismogénero, pero diferente especie
25-0%
diferente género
