Transcripción Flashcards
En la transcripción la secuencia del ARN es complementaria a…
cadena molde idéntica a la cadena codificada
Lugar de síntesis de RNA que se mantiene dentro de la RNA polimerasa que desenrolla el DNA
burbuja de transcripción
Unidad de transcripción
fragmento de DNA que se expresa mediante la producción de una molécula de RNA
comprende desde el promotor hasta el terminador
Promotor
secuencia de DNA requerida por la RNA polimerasa para unirse al molde y completar la fase de iniciación
Sitio de iniciación
primer par de bases que se transcribe (>90
% purina)
Transcrito primario
-es el producto inmediato de la transcripción
-extremos 5´ y 3´ originales
-eucariotas: se modifica en los extremos y/o madura
-procariotas: se degrada rápidamente
Etapas de la transcripción
reconocimiento del molde
iniciación
elongación
terminación
Reconocimiento del molde
-unión de la RNA polimerasa al promotor
-separación del dúplex de DNA
-formación de la burbuja de transcripción
Iniciación
-síntesis de los primeros 9 nt del RNA
-se presentan intentos abortivos
-termina cuando la enzima abandona el promotor
Elongación
-la cadena de RNA crece
-La burbuja de transcripción se mueve
Terminación
-reconocimiento del terminador
-la burbuja de transcripción colapsa enseguida
Terminador
punto de adición de la última base al RNA
En eucariotas una solo enzima sintetiza…
mRNA, rRNA y tRNA
Se requiere de la holoenzima completa para reconocer al promotor
verdadero
Core o núcleo. a2BB´
se une al DNA débilmente
Cuando se libera sigma
al término de la iniciación
sigma libre…
no reconoce al DNA evitando bloquear los promotores
Fuerza del promotor
frecuencia de iniciación determinada por la afinidad de la holoenzima hacia dicha secuencia.
Secuencia consenso del promotor
secuencia ideal constituida por las bases que aparecen con más frecuencia en una posición determinada
Secuencia consenso 10 en procariotas
proporciona la señal para el reconocimiento de la RNA pol
Secuencia consenso 10 en eucariotas
necesaria para que factores de transcripción recluten a la RNA polimerasa, se una y complete la fase de iniciación
Secuencia consenso 35
permite la conversión de la forma cerrada a abierta del complejo
Influye en la fuerza total del promotor
región +1 a +30
determinando la velocidad a la que la ARN polimerasa abandona el promotor
Cada sigma obliga a…
la RNA polimerasa a iniciar la trascripción en diferentes series de promotores
Para el más común de los genes
gen rpoD
factor sigma 70
uso general
Terminadores intrínsecos
-no requieren factor externo
-requieren formación de un tallo burbuja en el RNA transcrito
Si el número de bases entre la región C-G y poli U es mayor a 9…
la RNA polimerasa hace una pausa pero no termina la transcripción
Tiene un apareamiento más débil
rU-dA
Rho se considera un…
factor auxiliar de la RNA polimerasa
Muy abundantes en genomas de los fagos
Rho
Secuencia que requiere Rho
de 50 a 90 bases corriente arriba del terminador, ricas en C y pobres en G
La terminación ocurre en 1 a 3 bases
C 41%
A 25%
U 20%
G 14%
Actividades de Rho
-actividad ATPasa RNA dependiente
-actividad helicasa que separa RNA-DNA
Con quién interacciona Rho
con la subunidad B de la RNA polimerasa
Terminadores dependientes de Rho
modelo del objetivo caliente
Impiden la unión de Rho y/o su movimiento
los ribosomas
Cuándo se traduce el mRNA
antes de terminar su transcripción
En qué dirección se degrada el mRNA
5´3´
Tiempo de vida media de un mRNA en vertebrados es de…
3hrs
3 tipos de RNA polimerasas
I: transcribe rRNAs. nucleolo
II: transcribe mRNA, miRNA, snRNA. nucleosoma
III: transcribe tRNA, rRNA 5S, snRNA. nucleoplasma
Cuántos genes suelen contener los RNAs eucariotas
solo un único gen
Factores de transcripción
toda proteína que se necesita para el reconocimiento del molde y la iniciación de la transcripción, pero que no es en sí parte de la RNA polimerasa
Elementos respuesta
reguladores en cis
promotor
reconocido por los factores generales quienes se unen a la RNA polimerasa constituyendo el aparado basal de la transcripción
Enhacer
elementos distales
las proteínas que lo reconocen interactúan también con elemtnos del promotor
RNA pol. I
secuencia bipartita
hacia el 5´ del sitio de iniciación
core y UCE
RNA pol. III
tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación
RNA pol. III
tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación