Transcripción Flashcards

1
Q

En la transcripción la secuencia del ARN es complementaria a…

A

cadena molde idéntica a la cadena codificada

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Q

Lugar de síntesis de RNA que se mantiene dentro de la RNA polimerasa que desenrolla el DNA

A

burbuja de transcripción

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Q

Unidad de transcripción

A

fragmento de DNA que se expresa mediante la producción de una molécula de RNA

comprende desde el promotor hasta el terminador

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4
Q

Promotor

A

secuencia de DNA requerida por la RNA polimerasa para unirse al molde y completar la fase de iniciación

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Q

Sitio de iniciación

A

primer par de bases que se transcribe (>90
% purina)

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6
Q

Transcrito primario

A

-es el producto inmediato de la transcripción
-extremos 5´ y 3´ originales
-eucariotas: se modifica en los extremos y/o madura
-procariotas: se degrada rápidamente

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7
Q

Etapas de la transcripción

A

reconocimiento del molde
iniciación
elongación
terminación

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8
Q

Reconocimiento del molde

A

-unión de la RNA polimerasa al promotor
-separación del dúplex de DNA
-formación de la burbuja de transcripción

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9
Q

Iniciación

A

-síntesis de los primeros 9 nt del RNA
-se presentan intentos abortivos
-termina cuando la enzima abandona el promotor

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10
Q

Elongación

A

-la cadena de RNA crece
-La burbuja de transcripción se mueve

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11
Q

Terminación

A

-reconocimiento del terminador
-la burbuja de transcripción colapsa enseguida

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12
Q

Terminador

A

punto de adición de la última base al RNA

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13
Q

En eucariotas una solo enzima sintetiza…

A

mRNA, rRNA y tRNA

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14
Q

Se requiere de la holoenzima completa para reconocer al promotor

A

verdadero

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15
Q

Core o núcleo. a2BB´

A

se une al DNA débilmente

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16
Q

Cuando se libera sigma

A

al término de la iniciación

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17
Q

sigma libre…

A

no reconoce al DNA evitando bloquear los promotores

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18
Q

Fuerza del promotor

A

frecuencia de iniciación determinada por la afinidad de la holoenzima hacia dicha secuencia.

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19
Q

Secuencia consenso del promotor

A

secuencia ideal constituida por las bases que aparecen con más frecuencia en una posición determinada

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20
Q

Secuencia consenso 10 en procariotas

A

proporciona la señal para el reconocimiento de la RNA pol

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21
Q

Secuencia consenso 10 en eucariotas

A

necesaria para que factores de transcripción recluten a la RNA polimerasa, se una y complete la fase de iniciación

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22
Q

Secuencia consenso 35

A

permite la conversión de la forma cerrada a abierta del complejo

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23
Q

Influye en la fuerza total del promotor

A

región +1 a +30

determinando la velocidad a la que la ARN polimerasa abandona el promotor

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24
Q

Cada sigma obliga a…

A

la RNA polimerasa a iniciar la trascripción en diferentes series de promotores

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25
Q

Para el más común de los genes

A

gen rpoD
factor sigma 70
uso general

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26
Q

Terminadores intrínsecos

A

-no requieren factor externo
-requieren formación de un tallo burbuja en el RNA transcrito

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27
Q

Si el número de bases entre la región C-G y poli U es mayor a 9…

A

la RNA polimerasa hace una pausa pero no termina la transcripción

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28
Q

Tiene un apareamiento más débil

A

rU-dA

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29
Q

Rho se considera un…

A

factor auxiliar de la RNA polimerasa

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30
Q

Muy abundantes en genomas de los fagos

A

Rho

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31
Q

Secuencia que requiere Rho

A

de 50 a 90 bases corriente arriba del terminador, ricas en C y pobres en G

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32
Q

La terminación ocurre en 1 a 3 bases

A

C 41%
A 25%
U 20%
G 14%

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33
Q

Actividades de Rho

A

-actividad ATPasa RNA dependiente
-actividad helicasa que separa RNA-DNA

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34
Q

Con quién interacciona Rho

A

con la subunidad B de la RNA polimerasa

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35
Q

Terminadores dependientes de Rho

A

modelo del objetivo caliente

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36
Q

Impiden la unión de Rho y/o su movimiento

A

los ribosomas

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37
Q

Cuándo se traduce el mRNA

A

antes de terminar su transcripción

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38
Q

En qué dirección se degrada el mRNA

A

5´3´

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39
Q

Tiempo de vida media de un mRNA en vertebrados es de…

A

3hrs

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40
Q

3 tipos de RNA polimerasas

A

I: transcribe rRNAs. nucleolo
II: transcribe mRNA, miRNA, snRNA. nucleosoma
III: transcribe tRNA, rRNA 5S, snRNA. nucleoplasma

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41
Q

Cuántos genes suelen contener los RNAs eucariotas

A

solo un único gen

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42
Q

Factores de transcripción

A

toda proteína que se necesita para el reconocimiento del molde y la iniciación de la transcripción, pero que no es en sí parte de la RNA polimerasa

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43
Q

Elementos respuesta

A

reguladores en cis

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44
Q

promotor

A

reconocido por los factores generales quienes se unen a la RNA polimerasa constituyendo el aparado basal de la transcripción

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45
Q

Enhacer

A

elementos distales

las proteínas que lo reconocen interactúan también con elemtnos del promotor

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46
Q

RNA pol. I

A

secuencia bipartita
hacia el 5´ del sitio de iniciación

core y UCE

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47
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

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47
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

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47
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

47
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

47
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

48
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

48
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

49
Q

RNA pol. III

A

tipo I y II: hacia el 3´ del sitio de iniciación
tipo III: hacia el 5´ del sitio de iniciación

50
Q

Factores de transcripción de la RNA pol. III

A

TFIIIA
TFIIIB
TFIIIC

51
Q

Factores generales (basales) FTII

A

-análogos en función a sigma
-se requieren en todas las células para la transcripción de todos los genes clase II

52
Q

Promotor del aparato basal de la RNA pol. II

A

contiene TATA box

53
Q

TFIID

A

lleva a cabo el reconocimiento inicial del promotor

53
Q

TFIID

A

lleva a cabo el reconocimiento inicial del promotor

54
Q

Contiene a TBP y TAFs

A

TFIID

55
Q

TAFs

A

son equivalentes a los polipéptidos que siempre acompañan a TFIIIB y SL1

56
Q

Algunos TAFs son homólogos distantes de…

A

histonas H3 y H4

57
Q

Se une al DNA en el surco menor

A

TBP

58
Q

Único TFII que contacta una secuencia específica del DNA

A

TBP

59
Q

El TBP curva unos _________ en la TATA ampliando el surco menor

A

80°

60
Q

Impide la interacción DNA-TBP (inicio de la transcripción)

A

el nucleosoma

61
Q

Subunidades del TFIIF

A

-RAP74: helicasa ATP dependiente
-RAP38: une a la RNA polimerasa II

62
Q

Permiten el movimiento alejándose del promotor

A

TFIIE y (TFIIJ y TFIIH)

63
Q

CTD

A

dominio carboxilo terminal de la subunidad más grande de la RNA polimerasa II (10 subunidades)

64
Q

Cuántas repeticiones tiene el CTD

A

26 a 50 de 7 AA que son esenciales para su funcionamiento

65
Q

En el CTD la guanilil transferasa…

A

para el 5´-CAP se une a él

66
Q

TFIIH

A

ATPasa
helicasa
cinasa que fosforila el CTD de la RNA polimerasa II

67
Q

Organización del transcrito primario (pre-mRNA)

A

misma organización que el gen

68
Q

hnRNA heteronuclear

A

ribonucleoproteína
comprende el pre-mRNA y todo el material transcrito por la RNA pol II

69
Q

Genes consecutivos

A

codifican sistemas enzimáticos del metabolismo básico celular

70
Q

Los genes consecutivos se expresan…

A

a un nivel constante en todas las células y condiciones de un mismo organismo en todo momento

71
Q

Son el resultado de la interacción entre la RNA polimerasa y el promotor

A

genes consecutivod

72
Q

Genes adaptativos

A

codifican sistemas enzimáticos necesarios para expresan diferencialmente cuando la célula se adapta en una situación ambiental.

73
Q

Proceso que elimina los intrones

A

splicing

74
Q

Grupo I de eliminación de intrones

A

autocatalítico
bacterias, eucariotas inferiores

75
Q

Grupo II de eliminción de intrones

A

autocatalítico
bacterias mitocondria

76
Q

Grupo nucleares de eliminación de intrones

A

spliceosoma
GT-AG principalmente
AT-AC

77
Q

Grupos de eliminación de los intrones

A

grupo I
grupo II
nucleares

78
Q

No requieren dek complejo aparato de empalmes (spliceosomas)

A

autocatalíticos

79
Q

Spliceosoma

A

complejo de ARNs y proteínas que realiza la maduración del ARNm

80
Q

Todos los intrones, a excepción de ________________________ , se escinden por reacciones de transesterificación, aunque los componentes catalíticos sean distintos.

A

los pre-tRNAs nucleares

81
Q

Los puntos de empalme

A

-no hay homología entre los dos extremos del intrón
-pero sí GT… …AG están 100% conservadas

82
Q

Puntos de ramificación del splicing

A

-región consenso dentro del intrón necesaria para identificar el punto de empalme 3´
-18-40 nt corriente arriba del punto del empalme 3´

83
Q

El empalme se realiza a través de…

A

un lazo (lariat)

84
Q

Fases (transesterificaciones) del empalme - lazo

A
  1. corte en el 5´ del intrón
  2. corte en el 3´ del intrón
85
Q
  1. corte en el 5´ del intrón
A

el exón en 5´ se separa

intrón - exón a la derecha forma un lazo en el que el 5´ se une a 2´ a una base dentro del intrón en el sitio de ramificación

86
Q
  1. corte en el 3´ del intrón
A

linera el intrón libre en forma de lazo

el exón derecho queda empalmado al izquierdo

87
Q

Qué es el spliceosoma

A

cuerpo de gran tamaño equivalente a una subunidad ribosómica

88
Q

Qué unen los componentes del spliceosoma

A

unen secuencias consenso antes de que se produzca ninguna reacción

89
Q

Cómo está compuesta las ribonucleoproteínas

A

1 snRNA de 100-300 bases y <20 proteínas

90
Q

En conjunto en todas las snRNPs participan ….

A

40 proteínas

91
Q

Spliceosoma completo
Complejo pre empalme A

A

Complejo B1
Se une el trímero U5, U4, U6
U5 se une al exón del punto 5´
U6 se une a U2

92
Q

ASF

A

factor de splicing alternativo

93
Q

SF2

A

factor de splicing 2

94
Q

U2AF

A

factor auxiliar

95
Q

snRNA U1

A

tiene apareamiento de bases con el sitio de empalme 5´

96
Q

Splicing alternativo

A

comprende el uso diferencial de uniones de empalme

97
Q

Maduración de los tRNAs

A

1.- eliminación de nucleótidos 5´ y 3´ por la RNasa P y la RNasa D
2.- eliminación de intrones
3.-adición del 3´ CCA por la tRNA nucleotidil transfersasa
4.- modificación de algunas bases

98
Q

Eliminación de intrones del tRNA comprense actividades…

A

nucleasa (fosfodiesterasa) y ligasa (adenilato sintetasa)

no hay reacciones de transesterificación

99
Q

Terminación de la transcripción - RNA pol I

A

único precursor 45S que contiene las secuencias de los rRNAs (28S, 5.8S, 18S)

más de 1000 pb corriente abajo del extremo 3´

100
Q

Terminación de la transcripción - RNA pol II

A

extremo 3´ se genera por ruptura seguida de poliadenilación

101
Q

Terminación de la transcripción - RNA pol III

A

similar a la terminación intrínseca de bacterias

102
Q

Secuencia AAUAAA localizada _______________ del punto de la adición del poli A en 3´

A

11 a 30 nt cottiente arriba

103
Q

Cuán residuos une aprox, la poli A polimerasa

A

200

104
Q

PABP

A

proteína de unión al Poli A

se une cada 10 - 20 bases

105
Q

Necesario para la iniciación de traducción

A

PABP

106
Q

mRNAs de histonas no están poliadenilados y su terminación depende del…

A

snRNA U7 por apareamiento de bases

107
Q

El genoma miotocondrial es mayor en…

A

plantas que en animales

108
Q

Genoma mitocondrial en animales

A

2 rRNAs (12S y 16S)
22 tRNAs
13 proteínas

109
Q

En el genoma mitocondrial hay ausencia notable de…

A

secuencias reguladoras

110
Q

Transcritos mitocondriales

A

se transcriben ambas cadenas a partir de una sola región promotora en cada hebra

111
Q

RNAs gigantes - mitocondria

A

hebra H: 2rRNAs, 14 tRNAs y 10 mRNAs
hebra L: 8 tRNAs, 3 mRNAs. El 90% restante es degradado

112
Q

Ninguna proteína es exportada desde las mitocondrias al citosol

A

verdadero

113
Q

Mitorribosomas animales

A

son 55S
rRNAs 12S y 16S

114
Q

La replicación del DNA mitocondrial no es solamente durante la fase S del ciclo celular

A

verdadero

115
Q

Genomas mitocondriales codifican principalmente para…

A

proteínas de membrana interna