Características y tipos de RNA Flashcards
Base de RNA
adenosin
guanosin
citidin
uridil
Bases de DNA
desoxitimidin
desoxiguanosin
desoxicitidin
desoxiadenosin
Segunda forma principal de ácido nucleico en la célula
RNA
Francois Jacob y Jacques Monod
mRNA es la porción total de la RNA de la célula que lleva la información genética del DNA a los ribosomas
Trnscripción
síntesis de RNA sobre un molde de DNA
Cómo son más fuertes las bases en el RNA monocatenario
entre dos purinas
En el RNA doble cadena también se presentan …
hibridaciones por complementariedad de bases inter o intracatenaria
El 2OH de la ribosa puede formar …
puentes de hidrógeno con otros grupos
Hélice dextrógira de cadenas antiparalelas con secuencias perfectamente complementarias. Hibridación DNA-RNA
Forma A
No ha sido observada
Forma B
Hecha en el laboratorio bajo condiciones muy altas de sales o altas temperaturas
Forma Z
Estructura primaria del RNA
secuencia de nucleótidos
Estructura secundaria del RNA
elementos helicoidales regulares sin anudar resultado de apareamiento intramoleculares en un patrón plano
Estructura terciaria del RNA
interacciones moleculares de orden superior
resultado de las interacciones en el espacio tridimensional
RNAs que participan en la síntesis proteíca
m
t
r
Pm del ARNm
25,000 - 1,000,000
Pm del ARNt
23,000 - 30,000
Pm del ARNr
35,000 - 1,100,000
Nucleótidos del RNAt
75-90
Nucleótidos del RNAm
75 - 3,000
Nucleótidos del RNAr
100 - 3,100
% de ARN celular en ARNt
16
% de ARN celular en ARNm
2
% de ARN celular en ARNr
82
Función del ARNt
transporte de AA en la síntesis de proteínas
Función del ARNm
transmisión de información del tipo y orden de AA en la síntesis de proteínas
Función del ARNr
formación y funcionamiento de los ribosomas
Características del ARNt
bases poco frecuentes alteradas en la síntesis
puede llevar un AA en 3´
Características del ARNm
tamaño muy variable
poca vida celular
cola poli A en 3´
sin estrutura completa
Características del ARNr
65% en peso del ribosoma
resto de proteínas básicas
estructura tridimensional complicada
probable catalizador
Vida media del RNAt
intermedia
Vida media del RNAm
corta
Vida media del RNAr
larga
200 pb dsDNA tienen un peso molecular aperox. de
130 KDa
RNAi. de intransferencia
suprimen la expresión de genes específicos
miRNA. endógenos
se transcriben a partir de información codificada a lo largo del genoma
siRNA
pueden ser de origen endógeno o exógeno (mecanismo de defensa, ruptura de RNA virales)
piRNA
origen endógeno, derivan de un número limitado de “puntos calientes” en el genoma
Activos contra transposones e importantes en línea germinal
piRNA
Ribozimas
RNA con actividad catalítica
splicing de intrones (autocatalíticos), maduración del tRNA (ribonucleasa P y D)
RNA pequeño nucleolar (snoRNA)
modificación química de otros RNAs (metilación, pseudouridificación)
RNA pequeño nuclear (sn RNA)
procesamiento del mRNA. Corte y empalme (splicing)
RNA mitocondrial
4% del RNA total celular
DNA +
sentido, codificante, no molde, no transcrita
DNA -
antisentido, no codificante, molde, transcrita
RNA +
sentido
RNA -
antisentido
mRNA monocistrónico
tiene un solo sitio de inicio de la traducción y codifica para un único polipéptido
UTR 5´3´
regiones no traducidas, antes y después de inicio y paro
mRNA policistrónico
codifica para dos o mas diferentes polipéptidos
bacterias y archaeas son
mono y policistrónicos
La mayoría con monocistrónicos
eucariotes
En el mRNA procariota, la distancia intercistrónica varía entre…
-1 y +40 bases
En la transcripción, el primer nucleótido…
retiene su grupo 5´trifosfato
La guanilil-transferasa inmediatamente…
adiciona una G en el 5´
Paso I en 5´cap del mRNA eucariota
presente en todas las “lapas”
única modificación en eucariotas unicelulares
Paso II en 5´cap del mRNA eucariota
presente en el cap
2-O-metil-transferasa
la gran mayoría de mRNAs (85%-90%) de eucariotas (excepto unicelulares)
Paso III en 5´cap del mRNA eucariota
puede metilarse en el cap 1
en pocos casos de aucariotas superiores
Paso IV en 5´cap del mRNA eucariota
presente en el cap 2
10 al 15% de mRNAs de eucariotas
3´ poliadenilado del mRNA eucariota
-confiere estabilidad al mRNA
-aproximadamente 200 residuos de A al 3´ OH
-catalizado por la poli(A)-polimerasa
PABP
proteína de unión al Poli A se une cada 10-20 bases
Eliminación del Poli(A) o PABP…
inhibe la iniciación de la traducción
Propiedades cruciales del tRNA
-representan un único AA
-contiene el anticodón
tRNA
74-95 nucleótidos de longitud
forma de hoja de trébol
brazo: tallo y asa
Brazos principales del tRNA
aceptor
D
TYC
anticodón
Dos clases en base al brazo extra:
I: pequeño de 3-5 bases (75%)
II: 13-21 bases - 5pb en el tallo
Algunas de las _____________ en la estructura secundaria estabilizan la estructura terciaria
bases no apareadas
Carga el AA específico en el tRNA correspondiente
aminoacil-tRNA sintetasa
