Va. Extracción, cuantificación y purificación de AN Flashcards

1
Q

Primer paso en la tecnología del DNA recombinante

A

aislamiento del DNA

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2
Q

extracción de DNA genómico

A
    • muestra de células
      añadir buffer de lisis para mantener pH, romper membranas, desnaturalizar y degradar proteínas
  • precipitación de proteínas
  • precipitación del DNA con alcohol frío y sal
  • lavados
  • resuspensión en agua libre de nucleasas
    -cuantificación y determinación de la pureza
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3
Q

Qué contiene el buffer de lisis

A

50 mM tris-HCl
pH 8

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4
Q

Buffer para mantener el pH en el cual el DNA se mnntiene estable y con carga negativa

A

50 mM tris-HCl

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5
Q

1% SDS

A

detergente aniónico para romper las membranas promoviendo la liberación del DNA

desnaturaliza proteínas

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6
Q

Qué pasa cuando el SDS entra en contacto con la célula

A

captura los lípidos y las proteínas

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7
Q

Qué es la proteinasa K

A

una seriana proteasa

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8
Q

Cuando está activa la proteinasa K

A

bajo condiciones desnaturalizantes

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9
Q

En dónde se encuentra activa la proteinasa K

A

sobre proteínas nativas y desnaturalizante

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10
Q

Qué inactiva la proteinasa K

A

RNAsas
DNAsas

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11
Q

Qué incrementa la proteinasa K

A

la pureza del DNA
la calidad / cantidad de DNA no degradado

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12
Q

Con qué se pueden precipitar las proteínas

A

con acetona

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13
Q

En la precipitación de proteínas, dónde se encuentra el pellet

A

en el precipitado

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14
Q

En la precipitación de proteínas, dónde se encuentra el ácido nucleico

A

sobrenadante

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15
Q

Qué se necesita para la precipitación del DNA

A

alta concentración de sales
alcohol frío

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16
Q

Neutralizan las cargas negativas de los grupos fosfatos

A

los iones Na+

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17
Q

En la precipitación del DNA, las moléculas de DNA se juntan o se separan

A

se juntan

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18
Q

El DNA NO es soluble en …

A

etanol

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19
Q

Polaridad RNA >

A

DNA
RNA no precipita

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20
Q

Lavados

A

etanol al 75% remueve sales e impurezas
NO DISUELVE DNA

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21
Q

Resuspensión del DNA

A

se solubiliza en agua libre de nucleasas

22
Q

Coeficiente para la determinación de la pureza

A

260/280

23
Q

Pureza DNA óptima

A

1.8-2

24
Q

pureza - contaminación con RNA

A

> 2.1

25
Q

Método para a extracciín de RNA

A

método de Fenol-cloroformo

26
Q

método de Fenol-cloroformo

A

rompe membranas, desnaturaliza proteínas y libera AN

27
Q

El RNA permanece disuelto en la fase

A

acuosa

28
Q

El DNA menos polar que el RNA se queda entre las fases…

A

acuosa y fenólica

29
Q

Pureza RNA óptima

A

2-2.2

30
Q

Geles de poliacrilamida

A

muestras de proteínas

31
Q

Geles de agarosa

A

análisis de AN

32
Q

Cómo está formada la agarosa

A

b-(1-4)-(3-6)-anhidro-L-galactosa
a-(1-3)-D-galactosa

33
Q

La agarosa es soluble a una Tem

A

superior a 65°

34
Q

Concentración de la agarosa

A

0.5 a 4%

35
Q

La movilidad disminuye al…

A

aumentar el % de agarosa

36
Q

A menor voltaje…

A

mayor difusión lateral

37
Q

A mayor tiempo de corrida…

A

mayor resolución

38
Q

Al imcrementar la temperatura…

A

la movilidad incrementa

39
Q

Bromuro de etidio

A

se intercala entre las bases
detecta hasta 1ng de dsDNA
en la agarosa o post-corrida

40
Q

SYBR

A

no intercalante

41
Q

Marcadores de peso molecular

A

mezcla de moléculas de diferente peso molecular que sirve como referencia para el análisis cuallitativo

42
Q

En un análisis cualitativo..

A

NO se puede conocer el # exacto de pb en las bandas

43
Q

Análisis de retraso en gel permite…

A

detectar interacciones entre la secuencia esécífica de AN

44
Q

Mayor resolución empleando un voltaje menor…

A

mayor tiempo de corrida y % mayor de agarosa

45
Q

A las cadenas más cortas …

A

les toma menos tiempo reorientarse y exhiben mayor movilidad

46
Q

El ángulo de reorientación entre E1 y E2 es…

A

mayor de 100°

47
Q

Campos eléctricos no homogéneos

A

va incrementando
PFGE: 110°-150°
OFAGE: 120°-150°
TAFE: 115°-165°

48
Q

Campos eléctricos homogénemos

A

permanece constante
FIGE: 180°
CHEF: 120°
RGE: 120°

49
Q

Electroforesis capilar

A

permite resultados en corto tiempo
mínimo consumo de muestra
muy alta resolución
empleada en la secuenciación automatizada

50
Q

Los grupos silanol en el interior…

A

se ionizan

51
Q

El DNA del gen discontinuo…

A

posee intrones

52
Q

El cDNA se corresponde…

A

al mRNA, el cual carece de intrones