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BIOLOGÍA MOLECULAR > VIb > Flashcards

VIb Flashcards

1
Q

Genómica funcional

A

determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación “descubrimiento de genes”

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Q

genómica estructural

A

identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones

Localización y construcción de mapas

Identificar y predecir la conformación tridimensional y funciones de las proteínas modificadas

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Q

Genómica comparativa

A

estudio comparativo estructural y funcional de los genomas para explicar evolutivas y funcionales

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Q

determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación “descubrimiento de genes”

A

genómica funcional

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Q

identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones

A

genómica estructural

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6
Q

Localización y construcción de mapas

A

genómica estructural

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7
Q

Identificar y predecir la conformación tridimensional y funciones de las proteínas modificadas

A

genómica estructural

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8
Q

estudio comparativo estructural y funcional de los genomas para explicar evolutivas y funcionales

A

genómica comparativa

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9
Q

Apareamiento complementario de las bases

A

centro de todos los procesos que conciernen a los ácidos nucleicos

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10
Q

Temperatura a la cual al DNA se desnaturaliza

A

Tm

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11
Q

De qué depende la Tm

A

de la longitud de la cadena y la proporción de GC

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12
Q

A mayor proporción de GC…

A

mayor Tm

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13
Q

Dos hebras separadas y complementarias reconstituyen una doble hélice

A

renaturalización

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14
Q

Entre dos secuencias complementarias que previamente fueron separadas por desnaturalización

A

renaturalización

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15
Q

disminución gradual de la temperatura

A

renaturalización

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16
Q

Inicialmente se aparean algunas bases de diferentes zonas entre las
cadenas complementarias y después se extienden estas zonas
mediante un mecanismo de cremallera.

A

renaturalización

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17
Q

Cuando los ácidos nucleicos implicados proceden de
fuentes diferentes

A

hibridación

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18
Q

No estaban previamente formando una doble cadena

A

hibridación

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19
Q

Tm

A

La temperatura que corresponde a la mitad del incremento de
la absorbancia

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20
Q

cinética de renaturalización

A

brinda información de la
complejidad del genoma.

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21
Q

Cuanto menor sea el tamaño del genoma

A

mayor es el número
de genomas en un peso particular de DNA y más probable la
colisión entre los fragmentos complementarios

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22
Q

Una solución con elevada [DNA] incubada por breve tiempo
tiene la misma Cot que

A

una de baja [DNA] incubada en un lapso
mayor de tiempo.

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23
Q

en una preparación de fragmentos de DNA eucariota, las diferentes secuencias de nucleótidos se encuentran presentes en concentraciones muy variables

A

verdadero

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24
Q

Fracciones de renaturalización

A

muy repetida
moderadamente repetida
no repetida

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25
Q

Fracción de renaturalización que representa hasta el 10% del DNA total

A

muy repetida

26
Q

Fracción de renaturalización muy repetida

A

centrómero, heterocromatina

se repiten una y otra vez sin interrupción (repetidos en tándem)

27
Q

Tipos de repetidos en tándem

A

satélite
minisatélite
microsatélite

28
Q

Repetidos en tándem satélite

A

secuencias cortas (5 a pocos cientos de pb de longitud) que forman segmentos muy largos

29
Q

Repetidos en tándem minisatélite

A

10 a 100 pb de longitud en segmentos de unas 3 000 repeticiones

el número de repetidos aumenta o disminuye de una generación a la siguiente como resultado de entrecruzamiento desigual durante la meiosis

30
Q

el número de repetidos aumenta o disminuye de una generación a la siguiente como resultado de entrecruzamiento desigual durante la meiosis

A

Repetidos en tándem minisatélite

31
Q

Repetidos en tándem microsatélite

A

Secuencias muy cortas (1-5 Pb de longitud) casi siempre en pequeños
segmentos de 10 a 40 Pb de longitud.

32
Q

Fracciones de renaturalización moderadamente repetidas

A

Con funciones codificantes (histonas)

Sin funciones codificantes (rRNAs, tRNAs)

33
Q

Fracciones de renaturalización no repetidas

A

— Representa solamente el 1.50% del genoma humano.
— Todas las proteínas diferentes a las histonas.

34
Q

SNP

A

Variaciones en un único nucleótido presentes en al menos un 1% de la población

35
Q

El tipo más común de variación genética en humanos

A

SNP

36
Q

La mayoría existen como dos alelos alternos

A

SNP

37
Q

Pueden estar o no en la región codificante del gen

A

SNP

38
Q

Pueden no estar involucrados en la enfermedad, pero si están asociados a los genes relacionados a ella se pueden usar como marcadores moleculares

A

SNP

39
Q

Halotipos

A

Conjunto de variaciones del ADN, o polimorfismos, que tienden a ser
heredados juntos porque están muy cerca en el mismo cromosoma

40
Q

En los halotipos se forman quiasmas de recombinación

A

no

41
Q

Combinación de alelos o
conjunto de SNPs

A

halotipos

42
Q

Cada variante de halotipo se caracteriza por…

A

un grupo específico de alelos o SNPs que se encuentran juntos en una combinación específica en cada cromosoma

43
Q

Mapa genético

A

baja resolución

44
Q

Mapas físicos

A

alta resolución

45
Q

Qué son los mapas físicos

A

Distancia real entre marcadores basada en pares de bases (secuenciación)

46
Q

Mapas genéticos (ligamiento)

A

Diagrama que muestra la posición relativa de una secuencia o gen específico a lo largo del cromosoma

47
Q

es la máxima frecuencia de recombinación de dos loci que posteriormente quedarán sobre cromosomas separados

A

0.5 (50%)

48
Q

es la unidad de los mapas genéticos de ligamiento realizados por recombinación en eucariotas diploides

A

centimorgan

49
Q

centimorgan

A

unidad indivisible

50
Q

A cuánto equivale un centimorgan

A

a un 1% de frecuencia de recombinación, o lo que es lo mismo, a 1 unidad de mapa

51
Q

Tipo de digestión en la que la misma enzima de restricción corta en sitios distintos

A

digestión parcial

52
Q

Tipo de restricción en la que se usan diferentes enzimas de restricción y cortane n vaios lugares

A

digestión completa

53
Q

Cómo se puede incrementar el tamaño promedio de los fragmentos producidos por la digestión de la enzima de restricción

A

terminando la reacción antes de que se complete el corte de todos los sitios de reconocimiento

54
Q

Se usan en la estrategia para ensamblar el genoma

A

mapeo scalfolds
scalfold
conting

55
Q

Conting

A

Es un grupo de segmentos traslapantes de DNA que juntos representan una región consenso de DNA

56
Q

Qué se utiliza en el contig

A

algoritmos computaciones para ensamblar contigs derivados de miles de
secuencias traslapantes

57
Q

Cuál es la redundancia obtenida en el contig

A

5-10%

58
Q

El alineamiento…

A

ensambla clones contiguos y aumenta la exactitud de la secuencia creando una consenso

59
Q

Determinación de la secuencia de los Gaps: Gap filling project

A

diseño de primers
PCR
secuenciación

60
Q

Determinación de la secuencia de los Gaps: genome annotation project

A

BLAST nueva secuencia vs NCBI Database
identificación de genes ortólogos
identificación de codones de inicio y paro

61
Q

Determinación de la secuencia de los Gaps: genome finishing project

A

evaluación de la calidad de la secuencia
resecuenciación

62
Q

Anotación del genoma

A

Proceso de añadir capas de análisis e interpretación necesarias para extraer el significado biológico de las secuencias genómicas y ponerlas en el contexto de los procesos biológicos

BIOLOGÍA MOLECULAR (24 decks)

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