VIb Flashcards

1
Q

Genómica funcional

A

determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación “descubrimiento de genes”

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

genómica estructural

A

identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones

Localización y construcción de mapas

Identificar y predecir la conformación tridimensional y funciones de las proteínas modificadas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Genómica comparativa

A

estudio comparativo estructural y funcional de los genomas para explicar evolutivas y funcionales

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

determinación de la función biológica e interacciones de los genes y su regulación “descubrimiento de genes”

A

genómica funcional

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

identificación y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos, mutaciones, repeticiones, inserciones

A

genómica estructural

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Localización y construcción de mapas

A

genómica estructural

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Identificar y predecir la conformación tridimensional y funciones de las proteínas modificadas

A

genómica estructural

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

estudio comparativo estructural y funcional de los genomas para explicar evolutivas y funcionales

A

genómica comparativa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Apareamiento complementario de las bases

A

centro de todos los procesos que conciernen a los ácidos nucleicos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Temperatura a la cual al DNA se desnaturaliza

A

Tm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

De qué depende la Tm

A

de la longitud de la cadena y la proporción de GC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

A mayor proporción de GC…

A

mayor Tm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Dos hebras separadas y complementarias reconstituyen una doble hélice

A

renaturalización

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Entre dos secuencias complementarias que previamente fueron separadas por desnaturalización

A

renaturalización

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

disminución gradual de la temperatura

A

renaturalización

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Inicialmente se aparean algunas bases de diferentes zonas entre las
cadenas complementarias y después se extienden estas zonas
mediante un mecanismo de cremallera.

A

renaturalización

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Cuando los ácidos nucleicos implicados proceden de
fuentes diferentes

A

hibridación

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

No estaban previamente formando una doble cadena

A

hibridación

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Tm

A

La temperatura que corresponde a la mitad del incremento de
la absorbancia

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

cinética de renaturalización

A

brinda información de la
complejidad del genoma.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Cuanto menor sea el tamaño del genoma

A

mayor es el número
de genomas en un peso particular de DNA y más probable la
colisión entre los fragmentos complementarios

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Una solución con elevada [DNA] incubada por breve tiempo
tiene la misma Cot que

A

una de baja [DNA] incubada en un lapso
mayor de tiempo.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

en una preparación de fragmentos de DNA eucariota, las diferentes secuencias de nucleótidos se encuentran presentes en concentraciones muy variables

A

verdadero

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Fracciones de renaturalización

A

muy repetida
moderadamente repetida
no repetida

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Fracción de renaturalización que representa hasta el 10% del DNA total
muy repetida
26
Fracción de renaturalización muy repetida
centrómero, heterocromatina se repiten una y otra vez sin interrupción (repetidos en tándem)
27
Tipos de repetidos en tándem
satélite minisatélite microsatélite
28
Repetidos en tándem satélite
secuencias cortas (5 a pocos cientos de pb de longitud) que forman segmentos muy largos
29
Repetidos en tándem minisatélite
10 a 100 pb de longitud en segmentos de unas 3 000 repeticiones el número de repetidos aumenta o disminuye de una generación a la siguiente como resultado de entrecruzamiento desigual durante la meiosis
30
el número de repetidos aumenta o disminuye de una generación a la siguiente como resultado de entrecruzamiento desigual durante la meiosis
Repetidos en tándem minisatélite
31
Repetidos en tándem microsatélite
Secuencias muy cortas (1-5 Pb de longitud) casi siempre en pequeños segmentos de 10 a 40 Pb de longitud.
32
Fracciones de renaturalización moderadamente repetidas
Con funciones codificantes (histonas) Sin funciones codificantes (rRNAs, tRNAs)
33
Fracciones de renaturalización no repetidas
— Representa solamente el 1.50% del genoma humano. — Todas las proteínas diferentes a las histonas.
34
SNP
Variaciones en un único nucleótido presentes en al menos un 1% de la población
35
El tipo más común de variación genética en humanos
SNP
36
La mayoría existen como dos alelos alternos
SNP
37
Pueden estar o no en la región codificante del gen
SNP
38
Pueden no estar involucrados en la enfermedad, pero si están asociados a los genes relacionados a ella se pueden usar como marcadores moleculares
SNP
39
Halotipos
Conjunto de variaciones del ADN, o polimorfismos, que tienden a ser heredados juntos porque están muy cerca en el mismo cromosoma
40
En los halotipos se forman quiasmas de recombinación
no
41
Combinación de alelos o conjunto de SNPs
halotipos
42
Cada variante de halotipo se caracteriza por...
un grupo específico de alelos o SNPs que se encuentran juntos en una combinación específica en cada cromosoma
43
Mapa genético
baja resolución
44
Mapas físicos
alta resolución
45
Qué son los mapas físicos
Distancia real entre marcadores basada en pares de bases (secuenciación)
46
Mapas genéticos (ligamiento)
Diagrama que muestra la posición relativa de una secuencia o gen específico a lo largo del cromosoma
47
es la máxima frecuencia de recombinación de dos loci que posteriormente quedarán sobre cromosomas separados
0.5 (50%)
48
es la unidad de los mapas genéticos de ligamiento realizados por recombinación en eucariotas diploides
centimorgan
49
centimorgan
unidad indivisible
50
A cuánto equivale un centimorgan
a un 1% de frecuencia de recombinación, o lo que es lo mismo, a 1 unidad de mapa
51
Tipo de digestión en la que la misma enzima de restricción corta en sitios distintos
digestión parcial
52
Tipo de restricción en la que se usan diferentes enzimas de restricción y cortane n vaios lugares
digestión completa
53
Cómo se puede incrementar el tamaño promedio de los fragmentos producidos por la digestión de la enzima de restricción
terminando la reacción antes de que se complete el corte de todos los sitios de reconocimiento
54
Se usan en la estrategia para ensamblar el genoma
mapeo scalfolds scalfold conting
55
Conting
Es un grupo de segmentos traslapantes de DNA que juntos representan una región consenso de DNA
56
Qué se utiliza en el contig
algoritmos computaciones para ensamblar contigs derivados de miles de secuencias traslapantes
57
Cuál es la redundancia obtenida en el contig
5-10%
58
El alineamiento...
ensambla clones contiguos y aumenta la exactitud de la secuencia creando una consenso
59
Determinación de la secuencia de los Gaps: Gap filling project
diseño de primers PCR secuenciación
60
Determinación de la secuencia de los Gaps: genome annotation project
BLAST nueva secuencia vs NCBI Database identificación de genes ortólogos identificación de codones de inicio y paro
61
Determinación de la secuencia de los Gaps: genome finishing project
evaluación de la calidad de la secuencia resecuenciación
62
Anotación del genoma
Proceso de añadir capas de análisis e interpretación necesarias para extraer el significado biológico de las secuencias genómicas y ponerlas en el contexto de los procesos biológicos