Taxonomi

Question 1

Varför taxonomi ?

Answer 1

Ett sätt att organisera kunskap
• Lättare att kommunicera
• Särskilja patogener mot icke-patogener
• En hjälp i att förutse och forma hypoteser för forskning
på liknande organismer

Question 2

Hur kan man dela in natur?

Answer 2

Livet -> domän-> rike -> stam-> klass-> ordning-> familj-> genis-> art

Question 3

Vad innebära de när man delar in naturen i ”arten” ?

Answer 3

Basenhet för den systematiska klassificeringen

Question 4

Att ge organismer vetenskapliga namn, hur går det till?

Answer 4

- För arter gäller en binär (tvådelad) 
nomenklatur införd av Linné- 
- Namnet består av två latinska ord
(skrivs kursiverade):
Primula veris (Gullviva)
Staphylococcus aureus (Den gula kocken)

Question 5

Vad innebär Klassifikationssystem för bakterier?

Answer 5

-> det finns inget allmänt accepterad klassificeringssystem.

Question 6

Vad finns det för principer vid gramfärgning?

Answer 6

1. Fixering
2. Primärinfärgning: Kristallviolett
3. Fixering av färgen: Jod
4. Avfärgning: Alkohol/Aceton
5. Motfärgning: Safranin

Question 7

Exempel på viktiga bakteriegrupper- som är gram positiva kocker?

Answer 7

• Staphylococcus aureus - kocker
• Streptococcus pyogenes - kocker i kedjor
• Streptococcus pneumoniae - diplokocker

Question 8

Exempel på viktiga bakteriegrupper, gram positiva stavar?

Answer 8

• Bacillus anthracis - alternering mellan två stadier, ett fortplantningsstadie och ett sporstadie. Mjältbrand
• Corynebacterium diphteriae - oregelbundna stavar/utan sporer. Difteri.

Question 9

Exempel på viktig bakteriegrupper- Mykoplasmor (bakterier utan cellvägg) ?

Answer 9

Mycoplasmataceae – mångformiga

Mycoplasma pneumoniae. Lunginflammation

Question 10

Exempel på viktiga bakteriegrupper

Gramnegativa kocker?

Answer 10

• Neisseria gonorrhae – gonorré

- Moraxella catarrhalis – infektioner i luftvägarna

Question 11

Exempel på viktiga bakteriegrupper

Gramnegativa stavar?

Answer 11

• Escherichia coli - urinvägsinfektion

- Vibrio cholerae. Kolera, tarmsjukdom

Question 12

Exempel på viktiga bakteriegrupper

Mykobakterier (syrafasta stavar)?

Answer 12

• Mycobacteriaceae

- Mycobacterium tuberculosis

Question 13

Exempel på viktiga bakteriegrupper

Spiroketer. Gramnegativa, spiralbakterier?

Answer 13

• Spirochetaceae - Tunna spiraler/rörliga
• Treponema pallidum – Syfilis
• Borrelia burgdorferi - Borrelia

Question 14

Exempel på viktiga bakteriegrupper

Rikettsier, Chlamydier?

Answer 14

• Rickettia prowazekii – fläcktyfus, den farligaste
  varianten av tyfus.
• Chlamydia trachomatis - klamydia

Question 15

Kemiska och genetiska egenskaper

studera proteinsammansättning, nämn en metod?

Answer 15

MALDI-TOF

Question 16

Vad är de som arbetsbestämmer hos bakterien?

Answer 16

16S rRNA genen

för artbestämning av bakterier

Question 17

Vad gör ribosomen?

Answer 17

En proteinfabrik som översätter mRNA till aminosyror och finns i alla levande celler

Question 18

Vad innebär Sekvensering av 16S rRNA genen?

Answer 18

Kodar för rRNA
• Finns i alla bakterier
• Variabla och konserverade regioner
• Ingen horizontell överföring

Question 19

Hur fungerar DNA-DNA hybridisering?

Answer 19

Mäter graden av genetisk likhet mellan olika enkelsträngade DNA-sekvenser.
Tekniken används oftast för att avgöra graden av genetisk distans mellan två taxa

Question 20

Vad innebär Bakteriegenom?

Answer 20

= Den fullständiga genetiska uppsättningen
(kromosom och eventuella plasmider) för en bakterie

=Den fullständiga genomsekvensen finns tillgänglig för många
bakterier

Question 21

Hur definierar man en ny art?

Answer 21

• fenptypiskt
  Metaboliskt, MALDI-TOF, serotyping
• genotypiskt
  DNA-DNA HYBRIDISERING

Question 22

Hur kan man
klassificera
bakterier?

Answer 22

• Makroskopiskt
• Mikroskopiskt
• Fysiologiskt
• 16S rRNA gensekvensering
• Helgenomsekvensering