Bakteriegenetik Och Mobila Element Flashcards
Hur sker Replikation av DNA?
DNA replikeras semikonservativt
Arvsmassan består av dubbelsträngat
DNA, två antiparallella strängar
Prokaryot transkription har flera
fundamentala skillnader jämfört eukaryot vilka?
Ingen processning av mRNA, inga intron • Polycistroniska mRNA • Kopplad transkription‐ translation
16S genen kan nyttjas för att typa bakterier, hur?
16S genen innehåller både regioner som är väl konserverade mellan olika arter
samt regioner där stor variation mellan arter ses
Vad angriper många antibiotikor ?
translationsprocessen
Hur fungerar Bakteriella genom?
• Bakterier har vanligen en cirkulär kromosom, men både högre antal kromosomer samt linjära kromosomer förekommer • Storleken på kromosomerna i bakterier varierar från ca 0,5 Mbp till ca 14 Mbp. • Hög gendensitet; inga intron, kodande gener sitter tätt ihop. • Pangenomet i E. coli, dvs alla gener som hittats i olika E.coli‐varianter, består av ca 13000 gener, medan de gemensamma generna är ca 2200 (core‐genomet).
Vad är Plasmider?
Kodar för olika funktioner som inte är livsnödvändiga
för bakterien.
• Replikeras oberoende av kromosomen.
– Olika kopietal, från 1 kopia/bakteriecell till hundratals.
• Mindre än kromosomen.
– Plasmidstorlek, från 1000 bp till 100 000-tals bp.
• Ex. resistensplasmider, virulensplasmider.
• Alla bakterier har inte plasmider men vissa kan ha
många olika typer av plasmider.
Bakterier har en mycket god förmåga
att anpassa sig till nya förhållanden, hur kommer detta sig?
• Tack vare kort generationstid kan en fördelaktig
förändring i arvsmassan snabbt få fäste i en
bakteriepopulation
2 huvudsakliga mekanismer
• Förändringar i befintligt DNA
• Förvärvande av DNA från andra
bakterier i omgivningen
(horisontell genöverföring)
Horisontell genöverföring – tre
huvudsakliga mekanismer, vilka?
- konjugation
- transduktion
- transformation
Bakterier har också försvar mot
främmande DNA?
• Bakterier kan bryta ner främmande DNA med specifika
restriktionsenzymer.
– Restriktionsenzymer känner igen och klyver en specifik DNA sekvens.
– Eget DNA skyddas genom modifiering av sekvensen, t ex genom metylering av
• CRISPR‐ känner igen och bryter ned DNA som tidigare har
invaderat cellen (immunologiskt minne hos bakterier).
Hur fungerad Konjugation?
-Överföring av DNA mellan två bakterier via en etablerad kanal (mating pair formation, MPF). • Kräver tät kontakt mellan bakterier, t ex i tarmen.
Alla plasmider är inte konjugativa?
Plasmider kan vara:
•Konjugativa
•Mobiliserbara
•Ej överförbara
Vad är Transformation?
• Upptag av DNA från omgivningen.
• Naturligt kompetenta bakterier kan ta upp DNA. Alla bakterier
är inte det.
– Exempel på kompetenta bakterier är pneumokocker och gonokocker.
• Transformerade bakterier har fått nya gener som nedärvs.
– Det nya DNA:t måste bli en del av kromosom eller plasmid för att
replikeras.
Vad ör Transduktion?
-> Bakteriofager - Virus som infekterar bakterier
Kan ha DNA eller RNA som genom
-> Generell transduktion
Vilken gen som helst kan överföras när bakterie‐DNA packas i
fagen vid lytisk cykel
-> Specialiserad transduktion
Bara de gener som sitter i närheten av profagen kan överföras
i övergång från lysogen till lytisk cykel