RNA Flashcards
trascrizione
processo di sintesi mRNA
RNA e dna qual’è la correlazione
RNA è complementare al dna perchè funge da stampo quest’ultimo
enzima che copia
rna polimerasi
copia in direzione 5–> 3
come inizia la trascrizione?
1 promotore di un gene che l’enzima riconosce l’inizio del gene
2 determina quale dei due filamenti di rna verrà trascritto
3 promotore non viene trascritto
enzima rna polimerasi
inizia a replicare dal promotore e
termina con la sequenza terminatore che segnala la fine del gene
enhancer e silencer
intensificatori o reprimono la trascrizione del rna
rna messaggero appena trascritto viene
tradotto in proteina
sintesi rna dove avviene?
nel nucleo e la sintesi proteine nel citoplasma
prima di lasciare il nucleo che succede al mRNA?
gli viene aggiunto il cappuccio e una coda
rimozione degli introni con lo SPLICING
chi effettua lo splicing?
lo spliceosoma
nei ribosomi
sintesi delle proteine
sub unità maggiore
sub unità minore
ogni subunità dei ribosomi è formata da
rna ribosomiale
proteine ribosomiali
tRNA cosa fa
abbina un amminoacido a un codone ovvero tripletta
sintesi rna e sintesi proteine dove avvengono?
rna nel nucleo
proteine nel citoplasma
maturazione del rna cosa significa?
prima di uscire dal nucleo subisce modificazioni
cappuccio e coda
rimozione introni con lo splicing
splicing chi lo fa?
spliceosoma ovvero piccoli frammenti di rna nucleari e proteine
ogni trna è specifico?
specifico per ogni amminoacido
anticodone complementare al codone
amminoacil- trna- sintetasi enzima, funzione?
permette di riconoscere il suo amminoacido
legame covalente con il gruppo COOH dell’amminoacido al tRNA
fasi traduzione
1 inizio
2 allungamento
3 termine
1 inizio della traduzione
trna si attacca con il suo anticodone del primo amminoacido al codone rna d’inizio AUG
porta il primo amminoacido ovvero metionina
al complesso d’inizio si lega cosa
subunità maggiore del ribosoma
subunità maggiore composizione
2 siti
sito P sito del peptide
sito A sito dell’amminoacido
come prosegue traduzione
primo trna che lega la metionina si posiziona sul sito P
riconoscimento anticodone da parte del trna
gli amminoacidi vengono aggiunti alla catena polipeptidica
legame codone anticodone permette?
allineamento degli amminoacidi nella catena polipeptidica
al riconoscimento del codone sul mrna cosa succede
formazione del legame peptidico
rotto il legame metionina e trna
si forma legame tra met e gruppo amminico della proteina
catalizzatore della formazione legame peptidico è
il ribozima
il trna una volta completato allungamento
si stacca dal sito P del ribosoma
trna cui è legato metionina-proteina va incontro al processo di traslocazione dal sito A al sito P
nel sito A si trova il terzo codone del mrna
può ricominciare il ciclo
il primo amminoacido di una proteina presenta quale gruppo?
NH2 non impiegato nel legame peptidico
codice genetico
insieme di regole che collega la sequenza di basi nel DNA alla successione di amminoacidi nelle proteine
caratteristiche codice genetico
triplette universale ridondante lineare senza segni di interpunzione
triplette
ogni amminoacido codificato da tre nucleotidi
sono totale 64
61 codoni senso codificano un amminoacido
3 codoni di stop non codificano per amminoacidi e sono codoni di sotp
universale
una tripletta uguale significato in quasi tutti gli organismi
degenerato detto anche ridondante
più codoni codificano per uno stesso amminoacido
lineare
letto in gruppi successivi di tre nucleotidi senza sovrapposizioni
senza segni di interpunizione
non ci sono segnali che indicano dove inizia e dove finisce un nucleotide
procarioti i geni sono raggruppati in
operoni
operoni come funzionano
proteine regolatrici in risposta a condizioni ambientali codificate da geni regolatori
tipi di operoni
inducibile come quello del lattosio
reprimibile come quello del triptofano
ogni operone è controllato da
promotore posto a monte dell’operone stesso
operoni composizione
- contiene operatore che è una corta sequenza di basi consente o impedisce trascrizione
- geni strutturali sono coordinati e codificano le proteine implicate nel funzionamento via metabolica
repressore cos’è?
proteina regolatrice prodtta da gene regolatore
blocca la trascrizione dell’operone stesso
induttore cosa fa
permette di bloccare il repressore e di attivare la trascrizione
come il lattosio toglie il repressone e attiva l’operone
operone reprimibile
triptofano è normalmente acceso
un metabolita che è il prodotto finale di una via metabolica può fungere da corepressore
- si lega la repressore e lo attiva
- in assenza di triptofano l’operone è attivo
microRNA composizone
rna a singolo filamento con sequenza nucleotidica complementare a tratto di mrna
microRNA funzione
silenziamento dell’espressione del mRNA citoplasmatici
causano blocco traduzione mRNA
mutazioni tipi
silente
missense
nonsenso
silente
codice genetico ridondante
questa mutazione fa passare da un codone ad un altro che codifica sempre lo stesso amminoacido
missense
da origine a un codone che codifica amminoacido diverso
sostituzione amminoacido con un altro nella proteina compromette la funzione
non senso
da origine a codone di stop
sintesi della proteina termina
proteina non funzionante
frameshift
mutazione che prevede delezione o inserzione di basi in un gene
proteina non funzionante
corea di huntington
ripetizione numero eccessivo di volte di una stessa tripletta
mutazioni genomiche
anomalie numero di cromosomi
carattere monofattoriale
carattere ereditario controllato da un solo gene
il gene può essere sul autosoma o sul cromosoma del sesso
caratteri autosomici dominanti
caratteri autosomici ovvero si manifestano con la stessa frequenza al di la del sesso
- dominanti
carattere che si manifesta in tutte le generazioni
individuo che ha generalmente il genitore affetto
genitore affetto eterozigote ha possibilità 50% di trasmettere carattere mutato
caratteri autosomici recessivi
non si manifesta in tutte le generazioni
un individuo generalmente ha genitori sani
i genitori sono eterozigoti, trasmissione probabilità 25%
galattosemia
anemia falciforme
fenilchetonuria
caratteri recessivi autosomici
gruppi sanguigni
differiscono per presenza antigeni e anticorpi nel sangue
antigeni dove si trovano
A e B hanno antigeni differenti
0 non ha antigeni
anticorpi nei gruppi sanguigni
gruppo sanguigno A anticorpi contro B
gruppo sanguigno B anticorpi contro A
AB non hanno anticorpi
0 sono presenti entrambi gli anticorpi
alleli multipli sono presenti nel gruppo sanguigno
AB
alleli codominanti
allele a
allele b
sono alleli che determinano antigeni
allele i è l’allele
recessivo
incapace di sintetizzare antigeni
sistema rh
a seconda delle membrane dei globuli rossi che presentano o meno antigene Rh
Rh positivo
Rh negativo
Rh è determinato da
alleli dello stesso gene e possono essere
DD Dd è dominante ovvero positivo
dd è recessivo ovvero negativo
pleiotropia
singolo gene che può causare effetti fenotipici multipli
clonaggio di un gene
1 enzimi di restrizione si legano al sito di restrizione che è palindromo ovvero sequenza nucleotidica a simmetria binaria
2 vettori sono costituiti da plasmidi / dna di batteriofagi
3 si lega porzione di dna al plasmide con dna ligasi
4 si inserisce nella cellula ospite
esistono librerie genomiche e librerie di cDNA
differenza
genomiche contengono copia genoma dell’organismo
cDNA contengono copia DNA fatta dal mRNA tramite trascrittasi inversa che permette di ricavare il DNA dal rna
trascrittasi inversa
enzima che permette di ricavare DNA dal RNA
questo fa si che il DNA non abbia alcuna sequenza non codificante come introni o regioni del gene non trascritte
cDNA è tessuto specifico
ovvero è specifico per ogni tessuto infatti quello del fegato sarà diverso da quello del rene
pcr cos’è
amplifica in modo selettivo una regione del genoma
cicli di amplificazione pcr
1 denaturazione temperatura elevata
2 legame degli inneschi, fungono da primer per sintesi
3 sintesi dna con dna polimerasi termostabile resistente al calore data l’elevata temperatura
in 30 cicli si ottengono
2 elevato 30 della sequenza di DNA originaria
la prodecura della pcr avviene dove
in un termociclatore , un apparecchio che autonomamente compie i cicli di PCR
traduzione fasi
1 si attacca il tRNA con anticodone che trasporta la metionina al codone di inizio AUG
2 si attacca il ribosoma e il tRNA si troverà nel sito P del ribosoma
3 nel sito A si attaccherà un altro tRNA con un altro amminoacido
4 nel frattempo il tRNA è reso inutilizzabile poichè ha terminato il suo lavoro
5 il ribosoma si stacca e si sposta più avanti cosicché il tRNA della metionina si troverà nel sito E ( EXIT), nel mentre il nuovo tRNA si troverà nel sito P perchè il ribosoma si è spostato
6 il tRNA lascerà mRNA e l’amminoacido metionina si legherà insieme all’altro amminoacido del secondo tRNA che si è attaccato
7 si formano catene polipeptidiche, ovvero + amminoacidi inseguito a modificazioni
perchè il ribosoma si sposta nella traduzione?
perchè il tRNA una volta attaccato non può staccarsi e quindi per passare nel sito E deve per forza staccarsi il ribosoma
codone di stop
codone a cui non corrisponde alcun anticodone e quindi si ferma la sintesi delle proteine
in un mRNA quanti ribosomi?
tanti ribosomi su un mRNA
gruppo di ribosomi chiamato polirobosoma
modificazioni post-traduzionali
modificazioni che comprendono fosforilazione o defosforilazione aggiunta zuccheri quindi glicoproteine aggiunta lipidi quindi lipoproteine rimozione sequenze amminoacidiche
rimozione sequenze amminoacidiche
esempio ne è l’insulina, sintetizzata in forma inattiva
viene rimosso un segmento centrale si formano due catene polipeptidiche più brevi che si legano con legami disolfuro generando la forma attiva dell’insulina
folding
polipeptidi che assumono conformazioni tridimensionali grazie ai chaperonine proteine in grado di legarsi a proteine neosintetizzate che le aiutano a assumere una conformazione corretta
degradazione proteine quali proteine?
comprende proteine che hanno conformazioni sbagliate o proteine che hanno esaurito la loro funzione
degradazione proteine ad opera di
proteasomi
formate da + proteine che permettono la degradazione attaverso il riconoscimento
enzima ubiquitina deputata al riconoscimento di queste proteine, quindi vengono marcate e riconosciute poi dal proteosoma
proteosoma e ubiquitina vengono riciclate?
si
