Molekylär mikrobiologi Flashcards
vad är det mikrobiologer måste isolera och varför?
mikrobiologer måste få fram nukleinsyra, extraherad den. Sedan kommer PCR instrument amplifiera nukleinsyra till påvisbara mängder
realtids PCR, vanligaste metoden. Vad är det för metod?
semi kvantitativ. Används för att
- påvisa,
- kvantifiera och även
- karakterisera (man kan påvisa punktmutationer)
man kör en amplifiering i många cykler, vid varje cykel fördubblas antalet målDNA. Ju fler cyklar måste köras, desto mindre målDNA finns i provet/mindre bakterie i provet.
chlamydia testet är positivt, fast personen fått behandling. Varför kan det vara så?
chlamydia kan persistera, den kan gå i ide och sitta i kroppen även under en lång tid vilket ger upprepade positiva resultat på PCR
det kan även vara så att provet kontaminerats på labb
kan ge en GI infektion utan inflammation –> kvarstående infektion
har mycoplasma en cellvägg?
NEJ, bara membran
vilka mycoplasma bakterier är de två viktigaste och vilka sjukdomar kan de ge upphov till?
M. genitalium: urethritis, cervicit, salpingit
M. pneumoniae: atypisk pneumoni, respiratory tract infektions
vilka enterococker kan bli vancomycin resistenta?
enterococcus faecalis
Man 71 år: Traumatisk hjärnskada, afatisk, rullstolsbunden. Återkommande aspirationspneumonier, man tar ett pharynxprov
- växt gruppB-streptokocker, Pseudomonas aeruginosa, hudflora. Ingen resistensbestämning
- några månader senare hittas inget signifikant heller
- nån månad senare finner man ren kultur av pseudomonas aeruginosa
- varje gång tänkte man att det var hudflora bakterier och inget särskillt
- känslig för meropenem, eftazidim, ciprofloxacin, tazocin, gentamicin mfl. Han får bredspektrumantikbiotika meronem
vad skedde här?
man satte in karbapenemer på honom och då utvecklade han en resistens
viktigt att kunna, finns hos alla bakterier
16S RNA- genen
finns hos alla bakterier
vad behandlas bakteriell meningit med?
Penicillin G
Symptom av legionella
penumoni, pontiac fever (mild luftvägsinfektione) <– ovanligare
unginflammation med oftast hög feber, huvudvärk och muskelvärk. Diarré förekommer ofta. Oftast drabbas immunsuprimerade
påvisas snabbt i urinantigen
sprids gärna via aerosoler
multiplex detection, när används det?
används när vi har flera agens och vill veta vad som har smittat patienten
När använder vi oss av kvantitativ PCR?
om en person stack sig i fingret t.ex och vill veta om de fått HIV samt hur mycket HIV som finns i personen
- för att avgöra om det smittar/hur mkt det smittar
- för att kunna välja behandling och följa den
problemet är att …
pre- emptive therapy
man följer patient redan innan de blir sjuk och sen när man ser att det börjar bli dåligt sätter man in behandling
MALDI-TOF, vad är det och vad används det för? (SKA VI KÄNNA TILL)
Användbar metod för artidentifiering av bakterier, den är väldigt bra men har också sina begränsningar. Tex pneumokocker är svåra att identifiera då det finns så många närbesläktade arter
tekniken bygger på massa och laddning
