HC. 6 - Het Humane Genoom - Analyse van Genexpressie

Question 1

Welke 2 soorten typen DNA heb je in humane genoom?

Answer 1

• Kern DNA
• Mitochondriale DNA

Question 2

Lengte mitochondriale DNA?

Answer 2

16.5 kb

Question 3

Hoeveel maximale kopieen per cel Mt DNA?

Answer 3

max 1000

Question 4

Hoeveel % van DNA is Mt DNA?

Answer 4

1%

Question 5

Hoe ziet MtDNA eruit?

Answer 5

Circulair

Question 6

Lengte van Kern DNA?

Answer 6

haploide: 3 miljard baseparen

Question 7

Lengte van Kern DNA per chromosoom?

Answer 7

50 -250 Mb per chromosoom (1,7-8.5 cm lang)

Question 8

Hoe wordt sequentie van menselijk genoom bepaald? (stappen)

Answer 8

1. Isoleren van DNA
2. Kloneren van DNA
3. Delen van DNA ordenen op plek van chromosoom
4. Specifiek deel van DNA in kleine stukjes knippen
5. Sequencen van kleine stukjes DNA, zodat deze dan weer op volgorde kunnen

Question 9

Algemene kenmerken humane genoom

Answer 9

Pls check slimstuderen, H3.6 Deel 1. Heb geen zin..

Question 10

Hoe werkt analyse van microarray?

Answer 10

1. Geen oplichting, genen geen expressie
2. Gele uitslag, genen even hard tot expressie in beide weefsel
3. Rode of groene uitslag, in ene weefsel meer tot expressie dan andere

Question 11

Hoe wordt een microarray uiteindelijk geanalyseerd?

Answer 11

Door middel van bioinformatica

Question 12

Hoe wordt de microarray uiteidelijk gevalideerd?

Answer 12

Via een western blot of PCR

Question 13

Hoe kan onderscheid gemaakt worden tussen vormen van DLBCL? (Diffuse large B cell Lymphoma)

Answer 13

Door cDNA microarrays, in de vormen GC B-Like DLBCL en Activated B-like DLBCL

Question 14

Wat kun je met info uit NGS?

Answer 14

• Gebruik maken van alternatieve promotoren
• Alternatieve splicing
• Allel specifieke genexpressie
• Mutatie detecteren
• Ontdekken van nieuwe exons