HC. 3 - Gevolgen van fouten bij DNA replicatie: Lynch Syndroom Flashcards
Vanuit welke richting verloopt DNA-Polymerase?
5’ - 3’
Wanneer start replicatie van DNA?
In de S-fase van de celcyclus
Welke 3 mechanismes zorgen voor nauwkeurige DNA replicatie?
- Base selectie
- Proofreading
- Mismatch reparatie
Hoe vind base selectie plaats?
Het binden van nucleotide bij hun complementaire, dus A op een T. 1 op de 1000 nucleotide gaat verkeerd tho
Proofreading?
Als DNA-polymerase herkent dat er een foute nucleotide is gekoppeld, dan kan hij deze zelf wegknippen. (exonuclease activiteit)
Nauwkeurigheid 1/1000
Mismatch reparatie?
Wanneer er een mismatch van baseparen is, roept een eiwitten complex die deze mismatch kunnen identificeren een enzym “EXO1” om de mutant strand te verwijderen, om een DNA-polymerase het te laten fixen.
Hoe kun je een defecte mismatch reparatie systeem aantonen? (MMR)
Dit kan door middel van de Microsatellite Instability Assay.
Hoe noemen we een defect in mismatch reparatie?
RER fenotype
Wat is een RER fenotype?
Een Replication ERror Fenotype
Hoe werkt de assay die gebaseerd is op DNA-replicatie en wat wordt geobserveerd in geval van een defect in het reparatiesysteem?
Deze assay is gebaseerd op het feit dat replicatiefouten optreden als er een defect is in het reparatiesysteem. Het wordt duidelijk gemaakt door genoomgebieden met herhalingen (bijv. GTGTGTGTGTGT) te nemen. Bij problemen met mismatch-reparatie kan het kopiëren van deze herhalingen tijdens DNA-synthese moeilijk zijn.
Dit kan leiden tot situaties waarin de twee strengen tijdelijk uit elkaar gaan (reannealing en deannealing). Tijdens reannealing kunnen twee situaties optreden: 1) een insertie waarbij per ongeluk een base-repeat wordt overgeslagen, en 2) een deletie waarbij de templatestreng niet correct opnieuw annealed.
Wat is defect bij Lynch Syndroom?
De mismatch reparatie (MMR)
Waar hangt de gemiddelde levensverwachting van af bij iemand met uitgezaaide darmkanker?
Kankerkarakteristieken en microsatelliet instabiliteit
Wat zijn de erfelijkheid criteria van coloncarcinoom?
- Als er een eerstegraads familielid darmkanker heeft gehad voor het 50e levensjaar
- Dan wel drie of meer (eerste- of tweedegraads) familieleden Colorectaalcarcinoom (of een met Lynchsyndroom geassocieerd maligniteit*) <70 jaar.
- Als er een kiembaanmutatie in een van de mismatch repair genen al in de familie aanwezig is.
Hoeveel % van patienten is familiaire belast bij darmkanker?
18%
Wanneer lynch/erfelijke CRC?
- CRC voor je 50ste levensjaar
- 2maal CRC of icm andere lynch eassocieerde tumor bij 1 pt
- CRC met MSI <60jaar
- CRC met 1/2de graads fam met lynch geassocieerd (teminste 1maal <50j)
- CRC met 2 of meer 1e/2e graad fam met lynch geasso. tumoren