Grundläggande genetik Flashcards
Medfödda sjukdomar
- Av alla födslar kommer ca 3 % vara drabbade av medfödd sjukdom.
De allra flesta har ingen förklaring och endast 2-10 % har en?
-
Monogen förklaring vilket motsvarar 0,3 % av alla födslar.
- Det är främst dessa samt de kromosomala rearrangemangen som vi på klinisk genetik ser.
Analys
Ur ett blodprov kan man utvinna vårt arbetsmaterial: arvsmassan, numer även känt som genomet. I mikroskopet på labb kan man se kromosomerna när de befinner sig i vilken fas?
- Metafas (och på så viss organisera upp dem i respektive par)
Kromosomer
- En normal karyotyp består av 22 par autosoma kromosomer och 1 par könskromosomer.
Pedagogik
Hur kan vi förklara för patienten vad som gått fel vid en mutation?
I nästan alla våra celler finns en cellkärna som innehåller kromosomer som innehåller DNA som består av baspar, vissa delar av dessa utgör gener som ett recept till ett protein. En förändring i receptet kan ge fel protein/felveckat protein.
Idag kallas en mutation egentligen för?
Genetisk variant
Kromosomarearrangemang
- Kromosomrearrangemang kan också ge upphov till brott i viktiga onkogener och även metyleringsförändringar (sk epigenetik) kan påverka onkogener.
Ex på rearrangmang?
-
Punktmutation (numret i mutationen anger var i genen det skett)
- Kanske inte ett arrangemang men mkt vanligt
- Deletion
- Insertion
- Duplikation
- Inversion
- Translokation
Förklara nedärvningsmönstret autosomalt dominant
- Mutationer vanliga onkogenetiska syndrom nedärvs vanligen autosomalt dominant, dvs det krävs bara en genetisk förändring för att man ska ha en kraftigt ökad risk att insjukna. Då ena föräldern har en sådan mutation finns 50 % risk att föra den vidare till nästa generation, oavsett kön och utfall i tidigare graviditeter
Förklara nedärvningsmönstret autosomalt recessiv
- Det finns även vissa mutationer som nedärvs autosomalt recessivt, dvs det krävs att båda föräldrar är anlagsbärare av mutationen, men själva är friska för att de ska kunna få ett barn att utveckla sjukdomen. Denna risk är då 25 % i varje graviditet och 75 % chans att få ett friskt barn, dock kommer 50 % av barnen att vara friska anlagsbärare. Dessa sjukdomar är vanligare bland par med släktgifte
Förklara nedärvningsmönstret X-bunden
- Om modern är det ärver 50 % av hennes söner anlaget och blir därmed sjuka, medan de andra sönerna inte ärver anlaget. 50 % av hennes döttrar ärver anlaget och de blir friska anlagsbärare medan de andra döttrarna inte ärver anlaget (bild)
- När fadern har den är han sjuk. Hans X-kromosom med anlaget går till alla hans döttrar, som blir friska anlagsbärare och eftersom han ger sin Y-kromosom till sina söner går inte anlaget vidare till någon av sönerna. X-bundna sjukdomar ärvs alltid ärvs alltid från en anlagsbärande kvinna till sina söner, medan flickorna förblir friska, antingen som anlagsbärare eller icke-bärare
Förklara nedärvningsmönstret mitokondriell
- Mitokondrier är cellens energiproducent och finns i flera upplagor utanför cellkärnan. De har en egen arvsmassa formad i ringkromosomer och dessa ärvs alltid från mor- till barn eftersom de ligger i cytoplasman av äggcellen och spermierna inte tillför mitokondrier vid befruktningen. Alla barn till en kvinna som bär förändringar i mitokondrie-DNA har risk att insjukna och döttrarna kan i sin tur föra det vidare till sina barn. Sönerna kan inte föra anlaget vidare. Ofta har dessa sjukdomar väldigt varierande uttryck, beroende på hur många av mitokondriekromosomerna som bär mutationen (heteroplasmi)
Förklara mosaicism
- Att vara mosaiker innebär att vissa celler i kroppen bär en specifik genetisk förändring. Beroende på var i embryots utveckling förändringen uppstod så har alla efterföljande celler till den mutationen samma förändring. Detta ger oftare en mildare fenotyp
Förklara de-novo varianter av mutationer
- Förändring som uppstått för första gången i en individ
- Om en sådan genetisk förändring sker tidigt i embryots utveckling kommer alla eller nästan alla celler att bära förändringen och kunna föra den vidare trots att ingen annan bakåt i släkten har förändringen.
- Sker i ägg eller spermier eller vid befruktning så alla har genetisk förändring
Ärftlig cancer – gendefekter (2-10 %)
Endast ca 2-10 % av alla cancrar har en ärftlig bakgrund. Utveckling av cancer för någon som är anlagsbärare kräver, ja vad för att utvecklas?
- Mutationer i flera centrala cellreglerande gener, ex onkogener och tumörsuppressorer som BRCA, P54, RB, MYH. När en individ föds med mutation i en av dessa gener från början uppstår snabbare en ansamling mutationer i övriga gener, särskilt om genen är sådan som reglerar DNA-reparation som BRCA. När flera gener har mutationer leder det till ohämmad celldelning och tumören har uppstått
Medfödda vs förvärvade varianter gällande arv?
- Endast de medfödda mutationerna kan föras vidare till nästa generation och räknas då som ärftliga cancer-syndrom. Om det är somatiska mutationer som uppstått i celler (förutom könscellerna) så kommer dessa mutationer inte att gå i arv och de finns bara i enskilda celler!
Förklara begreppet penetrans vid cancer och varför detta kan skilja sig åt mellan individer?
- Variation i andel individer med patogen variant som insjuknar
- Reducerad penetrans upplevs i de flesta cancersyndrom och beror på flera samspelande faktorer, ex
- Miljöfaktorer
- Träning, mat, hur tidigt man fått barn
- Modifierande gener
- Hormonella faktorer
- Skyddande anlag
- Uppväxtmiljö
- Miljöfaktorer
Förklara begreppet genotyp-fenotyp-korrelation
- Det finns ett samband mellan var någonstans i genen varianten sitter med de symtom som uppstår. Exempelvis APC-genen som ger upphov till tarmcancer. Varianter i de vita regionerna ger mild (attenuerad) FAP, varianter i de grå segmenten av genen ger upphov till vanlig FAP och i den svarta regionen till mycket allvarlig FAP
Släkträd med genetiska sjukdomar
- Proband – individen som har pilen på sig och släkträdet utgår ifrån
- Kom ihåg att även män kan föra anlaget vidare varför gentestning på dem kan vara viktigt
Förklara alla tecken
