Cours 1 Part 2 Recherche antibiotiques

Question 1

Découverte de nouveaux antibiotiques : comment c’est?

Answer 1

• Recherche en antibiotique est en chute libre
  o Très peu se rendent en phase IV

Question 2

Quels sont les stratégies de recherche?

Answer 2

• Recherche de nouvelles molécules naturelles
• «Chemical repurposing»
• Modification de molécules existantes
  o Antibiotiques actuels sont dérivés de quelques molécules mère
  o Chaque molécule possède quand même un spectre différent

Question 3

Si tu veux évaluer L’ACTIVITÉ D’UN ATB, quels 2 stratégies?

Answer 3

• Stratégie de type Target-base
• Stratégie par bio-essai (cell-based assay)

Question 4

Évaluation de l’activité d’un antibiotique-Explique Stratégie de type Target-base

Answer 4

o Test de collections de molécules sur une cible bactérienne spécifique
 Méthodes (principe de clé-serrure):
* Criblage virtuel
* Bio-essai impliquant le produit du gène cible

Question 5

Évaluation de l’activité d’un antibiotique-Étapes de target based

Answer 5

1. Identification de la cible (grâce à séquençage de génome d’organisme non-présent dans l’hôte)
   2.Validation de la cible (Pérvoir les probabilités de trouver molécule qui puisse cibler la cible)
2. Identifications des molécules possibles (Clonage, surexpression et incorporation de séquence cible et criblage)
3. Optimisation et développement pré clinique (Amélioration toxicologie, pharmacocinétique, pharmacodynamie, spectre, activité etc.)

Question 6

Évaluation de l’activité d’un antibiotique-Explique stratégie cell-based assay

Answer 6

C’est pour:
o CMI
o Spectre d’activité (espèces et souches sensibles)
o Bactéricide vs bactériostatique

Question 7

Évaluation de l’activité d’un antibiotique- Stratégie cell-based away étapes

Answer 7

1. Évaluation de l’activité des molécules antimicrobiales (par dépistage à grande échelle)
2. Évaluation de la toxicité
   3.Identification et caractérisation du mécanisme d’action (par approche génomique, biochimie ou bio mol)
3. Optimisation et développement pré clinique (Amélioration toxicologie, pharmacocinétique, pharmacodynamie, spectre, activité etc.)

Question 8

Évaluation de l’activité d’un antibiotique quand tu as CMI

Answer 8

 Kirby Bauer :
* Disque contenant un concentration d’antibiotique prédéterminé
* Ensemencement de gélose + disque + incubation
* Selon des standards, on voit comparer le diamètre

 E test :
* Bandelette contenant une concentration croissante d’antibiotiques

 Microdilution ou dilution en bouillon :
* Utilisation de bouillon avec des concentrations croissantes d’antibiotique
* Dernière concentration qui inhibe = CMI

Question 9

Évaluation de l’activité d’un antibiotique quand tu as courbe de mortalité

Answer 9

Détermination bactéricide ou bactériostatique avec graphique

 Bactériostatique : Inhibe la croissance
 Bactéricide : tue les bactérie

Question 10

o Évaluation de la toxicité d’un antibiotique avec quel paramètre?

Answer 10

 Détermination du CC50  concentration cytotoxique (concentration induisant 50% de cytotoxicité des cellules)

Question 11

o Évaluation de la perméabilité membranaire (but)

Answer 11

 But : déterminer si la molécule sera absorbée par les cellules humaines

Question 12

o Évaluation du potentiel carcinogène (quel test et explique)

Answer 12

AMES
1. Préparation 2 cultures bactériennes qui ont perdu capacité de synthétiser l’histidine
2.Ajout substance mutagène à 1 culture et extrait de foie au 2
3.Ensemencement des 2 échantillons sur glose et incubation (SEULES LES BACT QUI ONT RETROUVÉ, PAR MUTATION RÉVÈRSE, LA CAPACITÉ DE SYNTHÉTISER L’HISTIDINE FORMERONT UNE COLONIE)
4. Boite témoin pourrait avoir colonie rétromutant et la boite expérimentale contient bcp de colonie à cause de l’agent mutagène et ainsi c’EST UN CARCINOGÈNE POTENTIEL

Question 13

Évaluation pré clinique

Answer 13

 Évaluation du nombre de bactérie dans les selles
1.Suspension fécale de souris
2.AJout nombre précis bactérie
3.Ajout ATB (Concentrations diverses)
4.DÉtermination viabilité (dénombrementO

Question 14

Évaluation clinique-Phase 0

Answer 14

Phase 0:
* 10-15 individus
* Très petite dose
* Tolérance au composé

Question 15

Évaluation clinique-Phase 1

Answer 15

Phase 1:
* 15-30 individus
* Meilleure voie d’administration
* Dosage et fréquence
* Dose maximale sécuritaire
* Répertorier les effets secondaires * ADME

Question 16

Évaluation clinique-Phase 2

Answer 16

Phase 2:
* <100 – quelques milliers d’individus * Tester l’efficacité du traitement
* Optimisation du dosage
* Répertorier les effets secondaires
* ADME

Question 17

Évaluation clinique-Phase 3

Answer 17

Phase 3:
* 100 – quelques milliers d’individus
* Comparer l’efficacité du traitement vs
meilleur traitement disponible et vs placebo * Plusieurs centres hospitaliers impliqués

Question 18

Évaluation clinique-Phase 4

Answer 18

Phase 4:
* Plusieurs milliers d’individus à travers le monde
* Suivi post mise en marché
* Suivi des effets secondaires à long terme