Cours 1 anti micro et parasitaires Flashcards
Cibles des ATB
- Inhibition de la paroi cellulaire (pénicillines céphalosporines, bacitracine et vancomycine)
- Inhibition de la synthèse des protéines (érythromycine,tétracyclines et streptomycine)
- Inhibition de la réplication et de la transcription de l’acide nucléique (quinolone et rifampicine)
- Détermination de la membrane plasmique (polymixine B)
- Inhibition de la synthèse de métabolites essentiels (sulfanilamide triméthoprime)
Bactéries Gram-négatif
(paroi cell)
-membrane cytoplasmique interne et externe
-espace périplasmique entre les 2 membranes
-vancomycine n’est pas active
-peptidoglycan entre les 2 membranes mais moins en qte que Gram +
Bactéries Gram +
(paroi cell)
-membrane cytoplasmique interne seulement
- paroi cellulaire grande (peptidogycan) + que Gram -
-pas d’espace périplasmique
-Vancomycine active
Peptidoglycan Gram +
(paroi cell)
Structure intercalée de NAG et NAM
Ces structures (brins) sont rattachés par des peptides:
- a-a du tétrapeptide latéral
- a-a du pont interpeptidique
présence d’acide techoique et d’acide lipoteichoique
Peptidoglycan Gram -
(paroi cell)
La structure est seulement Structure intercalée de NAG et NAM
Structure du peptidoglycane
- Rôle de la transpeptidation
(paroi cell)
Les liens peptidiques sont seulement sur NAM
- Dans E.Coli, le D-Ala se lie au NH2 d’un DAP. Une perte de D.Ala est considérée
- Dans S.aureus, L-Lys est attachée avec (Gly)5 et une H et va se lier à D-Ala résultant une perte d’un D-Ala.
Les pénicillines-binding proteins empoche cette transpeptidation ce qui affaiblie la paroi cellulaire des bactéries menant vers leur mort
Quel activité a la daptomycin (antibiotique) et ce qu’elle vise (cell membrane vs paroi cell)
Elle vise la membrane cellulaire et non la paroi cellulaire. En effet, c’est au niveau de la dépolarisation de la membrane
Vrai ou faux: Quand on vise les ribosomes, les sous-unités 30S et 50S sont touchées
Vrai
Quand on vise ARNt charging, on utilise quel antibio et ce qu’il fait
(tRNA charging)
On utilise la mupirocin qui inhibe la synthèse protéique et se lie de façon spécifique
Réplication de l’ADN
(nucleic acid)
- Gyrase et hélices déroule double hélice parentale
2.Protéines fixatrices stabilisent les 2 brins séparés - Brin directeur synthétisé de façon continu par l’ADN poly
- ADN du brin discontinu est synthétisé en fragments. On utilise amorce d’ARN fait par la primase qui sera prolongée par polymérase
- La polymérase digère ARN et la remplace par de l’ADN
6.La ligase réunit les fragments séparés du brin discontinu
surenroulement de l’ADN
(nucleic acid)
L’ADN gyrase introduit du
surenroulement (-) et élimine le surenroulement (+)
L’ADN Topo IV défait les
concatémères générés lors de la réplication
Que font les quinonolones
(nucleic acid)
Inhibe la réplication de l’ADN en inhibant la grasse par exemple pour induire mort cell. Il est bactéricide
Que fait la rifampicine
(nucleic acid)
Bloque l’initiation de la transcription
Bactéries aérobies
(nucleic acid)
l’oxygène est utilisé!
Le métronidazol, nitroimidazole, est inactif
Bactéries anaérobies
(nucleic acid)
Pas d’oxygène est utilisé
le metronidazole fait des modifications qui crée des dérivées toxiques
Donc effectif seulement contre anaérobique
Dommages à l’ADN causés par des groupements radicaux toxiques (Nitroimidazoles
(ex: métronidazole)
(nucleic acid)
Formation de radicaux
(aérobes et anaérobes), ça ron enlève des électrons de la ferrédoxine
Dommages à l’ADN
(anaérobes) par réduction
Détoxification des radicaux
(aérobes)
Superoxide dismutase,
catalase, peroxidase
*les radicaux toxiques sont crées autant chez anaérobique et aérobique, mais aéro bique ont enzyme pour détoxifier.
Dommages à la membrane cytoplasmique
(et membrane externe chez les Gram-) (cell membrane)
Polymyxine B
Daptomycine
Colistine
mec: crée une ouverture dans la membrane et on défait sa structure. Les ions et l’ATP sortent ce qui mène vers la mort cellulaire
Interférence (indirecte) avec la synthèse des acides nucléiques (folate synthesis)
Ptéridine+PABA+Acide glutamique—-»(Dihydroptéroate synthèse)—–»Dihydroptéroate—–»Dihydrofolate—–»(Dihydrofolate réductase)—-»Tétrhydrofolate—»Purines—»ADN
Sulfronamide attaque la DIhydroptéroate synthase
Diaminopyrimidines attaquent la Dihydrofolate reductase
Pk? La recherche dans le secteur des antibiotiques est en chute libre…
Tellement de phases à regarder pour devenir un antbio
La recherche de nouveaux ATB
- Modification de molécules existantes
La plupart des antibiotiques actuels sont dérivés de
quelques molécules « mères » ou « classes »
Amélioration des générations antérieures
La recherche de nouveaux ATB
- Stratégie de type Target-based
- Stratégie de type Target-based
- On teste des collections de molécules sur une cible bactérienne
spécifique (Ex: ARN polymérase, ribosomes, etc.) - Criblage virtuel
- Bio-essai impliquant le produit du gène cible
La recherche de nouveaux ATB
- Criblage virtuel et in vitro (target-based discovery)
On teste des collections de molécules sur une cible bactérienne
spécifique (Ex: ARN polymérase, ribosomes, etc.)
identify target, validate target, identify lead molecule et Lead optimization et Preclinical development
Évaluation de l’activité d’un ATB
Stratégie par bio-essai (cell-based assay)
Quels tests doit-on faire ?
- CMI
- Spectre d’activité (espèces et souches sensibles)
- Bactéricide vs bactériostatique (courbe mortalité)
Évaluation de l’activité d’un ATB
Stratégie par bio-essai (cell-based assay)
- Antimicrobial Activity Screening
2.Cytotoxicity Screening
3.Mécanisme d’action identification et characterisation - Lead optimization et Preclinical development
Comment détermine t-on la CMI?
- Kriby-Bauer: glose milieu riche avec disque d’antibio. Calculer le rayon autour du disque pour voir
- E-test: zone d’inhibition avec bandelette avec une gradient de concentration
Bactériostatique vs bactéricide
Comment détermine t-on la CMI?
Test avec témoins positif et négatif pour trouver CMI
ATB bactériostatique vs bactéricide
Comment détermine t-on cette différence en laboratoire?
- Courbe de mortalité (kill curve)
Controle solvant: peu de changement et le nb de bactéries a augmenté
Bactériostatique: change mécanisme de la bactérie pour ralentir son fonctionnement et rendre statique sa croissance
Bactéricide: Perte de croissance bactérienne. Elle sont morte il n’y en a plus
Évaluation de la toxicité d’un ATB
On fait (CC50)
Permet de voir si un antbio toxique détruit les cellules humaines donc il faut faire:
Évaluation de la perméabilité membranaire. Pour savoir si une molécule sera absorbée et pourra entrer dans les
cellules humaines, les tissus et prendre la voie systémique
Évaluation du potentiel carcinogène avec quel test
– Test AMES –
1. Prépare 2 culture de même bactérie. Une avec substance mutagène et l’autre non.
2. On les met dans un milieu dépourvu d’acide aminé histidine
3. Seulement les bactérie maintenant capable de faire de l’histamine peuvent pousser et on compare le nombre de colonies
Évaluation préclinique chez l’animal
(exemple d’un modèle d’infection à C. difficile)
IMP: 105 spores
by gavage et Analyses PK/PD à la fin
Évaluation préclinique – tests ex vivo
Suspension fécale de souris
Inoculation avec un nombre
précis de bactéries
Ajout de l’ATB
(diverses concentrations)
Détermination de la viabilité
(dénombrement bactérien)
Phase 0
- 10-15 individus
- Très petite dose
- Tolérance au composé
Phase 1
- 15-30 individus
- Meilleure voie d’administration
*Dosage et fréquence
*Dose maximale sécuritaire - Répertorier les effets secondaires
- ADME
Phase 2
- <100 – quelques milliers d’individus
- Tester l’efficacité du traitement
*Optimisation du dosage - Répertorier les effets secondaires
- ADME
Phase 3
- 100 – quelques milliers d’individus
- Comparer l’efficacité du traitement vs
meilleur traitement disponible et vs placebo - Plusieurs centres hospitaliers impliqués
Phase 4 juste après approbation
- Plusieurs milliers d’individus à
travers le monde - Suivi post mise en marché
- Suivi des effets secondaires à long
terme
