Control transcripcional Flashcards
Región entre la caperuza y el codón de inicio
5´ UTR
Región entre el codón de paro y la cola de poli A
3´ UTR
Tipos de regulación traduccional
- Splicing
- Desaminación
- Región 3´ UTR
- Búsqueda de escape
- Fosforilación de IF II
- Degradando el RNAm
¿Para qué sirve la región 3´ UTR?
Para llevar el RNAm a donde se requiera
¿Para que sirve la región 5´ UTR?
Regula si se traduce o no el RNAm
Transcrito primario o RNA HN (hetero nuclear)
RNA con intrones, exones y sin caperuza y cola de poli A
Otra forma de llamar al splicing
Corte y empalme
Proceso mediante el cual se eliminan los intrones
Splicing
Empalme alternativo
Se tienen diferentes proteínas del mismo gen
¿Por qué se da el empalme alternativo?
Por las secuencias ambiguas de los intrones
Conformación de la maquinaria de splicing
- Spliceosoma mayor
- Spliceosoma menor
Spliceosoma mayor y menor
Tienen snRNA + proteínas
snRNA del sipliceosoma mayor
U1, U2, U3, U4, U5, U6
snRNA del sipliceosoma menor
U11, U12, U4atac, U5, U6atac
Intrón
GU - AG
AU - AC
¿Quién identifica a GU - AG?
Spliceosoma mayor
¿Quién identifica a AU - AC?
Spliceosoma menor
Proteínas que identifican al intrón
HN RNP
¿Qué pasa si el internó no tiene proteínas?
No es reconocido y no se corta
Identifican al exon
SRP
¿Qué hace U1?
Identifica GU y el extremo 5´
¿Qué hace U2?
Identifica la adenina con la capacidad de hacer un ataque nucleofílico
U2 AF
Identifica el extremo 3´
U2 AF
Factor asociado a U2
¿Qué hace U5?
Agarra a los exones para juntarlos
¿Qué hace U6?
Ayuda a la adenina a hacer el ataque nucleofílico
¿Qué hace U4?
Mantiene contenida a U6 hasta que U5 agarra a los exones
¿Dónde ese pone U6 para ayudar a hacer el ataque nucelofílico?
Donde estaba U1 (lo reemplaza)
¿Qué pasa si se desaminan los nucleótidos?
Se obtiene una proteína diferente
¿Qué debe de tener el RNA para que pueda salir del núcleo?
Una cap, una cola de poli A y no debe de tener intrones
Proteínas que exportan el RNA fuera del núcleo
Exportinas
Búsqueda de escape
El primer AUG se salta
¿Qué pasa cuando el RE se estresa?
Fosforila IF II, inhibiendo la traducción
¿Qué determina la vida de un RNAm?
La cola de poli A
Una cola de poli A corta
Hace que dure muy poco el RNAm
Una cola de poli A larga
Dura más el RNA m
Vida promedio del RNAm en el citoplasma
30 minutos a 10 hrs
Formas de degradar el RNAm
- Con deadenilasas, descapsulasas y exonucleasas
- Con deadenilasas y exonucleasas
¿Quién quita la cola de poli A?
Deadenilasas
¿Quién quita la caperuza?
La enzima de descapsulación
¿Quiénes terminan de degradar el RNAm cuando ya no tiene caperuza ni cola de poli A?
Exonucleasas
¿Qué pasa cuando hay más adeninas después de la cola de poli A (en 3´ UTR)?
La deadenilasa sigue cortando y después la exonucleasa termina de degradar
