Bakterier, allmänt Flashcards
vilka komponenter består bakterier av?
- fimbrier -> består av protein, kan vara en virulensfaktor(flytta sig från något man inte tycker om till något man tycker om)
- pili -> ofta långa, behövs för konjugation, an fungera som virusreceptor
- flageller -> proteinstruktur för rörelse
- glykokalyx -> omfattar både kapsel och slemlager, extracellulärt polysackarid material
- inklusionskroppar -> lagring av energi eller byggstenar, ofta som kolhydrater
vad är flageller?
det är en virulensfaktor så att bakterier ska kunna röra sig och består av proteiner flagellin. Bakterier kan då röra sig mot eller från en signalmolekyl, antingen via en kemisk gradient(kemotaxis) eller via uv - ljus(fototaxis)
vad menas med polära och peritricka flageller?
polära –> flagellen sitter på den ena änden av bakterien
peritricka –> flagellen sitter runtomkring bakterien.
vilken struktur har en flagell hos en gramneg bakterie?
- flagellin skapar ett filament som sitter förankrad i L - ring i yttermembranet(LPS).
- P ring i peptidoglucan som i sig finns i periplasman och ä tunn.
- MS- ring ovanför cytoplasmiska membranet
- dessa ringar är proteiner och det är en energikrävande process när flagellen ska röra sig.
- själva flagellen kan vara längre en bakterien.
- proteinerna gör att flagellen blir styv
hur rör sig en flagell?
- den kan röra sig medsols eller motsols (rotation).
- den rör sig, stannar upp och sen är det slumpen som avgör vilken riktning den rör sig i .
- dock tar detta lite längre tid.. men det är ändå fiffigt för en bakterie.
hur lagras energi? KOLLA UPP
i form av poly - beta - hydroxybutyrat
Vilka tillväxtfaser har bakterier?
- Lag fas –> anpassning till det nya mediet
- exponentiall fas –> max tillväxt
- stationär fas –> antal celldelningar är lika stor som antalet som dör
- deklinationsfas –> fler som dör än delar sig
hur kan vi betsämma den bakteriella bakterietillväxten?
- total räkning i mikroskop
- “viable count”
- turbiitetsmätningar
- men det kan vara svårt då det är svårt att slå sönder bakterieaggregat, bakterier rör även på sig. man kan färga in dem men då kan strukturen förändras.
hur mäter man mikrobiella tillväxt? hur går det till praktiskt?
- man sprider ut en viss volym över agar
- inkubationstid
- kan räkna hur många kolonier som uppkommit
- man kan även använda en spädningsfaktor
- inkubationstid
- yt och “sub - surface” kolonier
vad är svårigheterna för bakterier med att växa i en naturlig miljö?
- det är ofta begränsad näringstillgång
- konkurrens med såväl andra mikroorganismer som andra organismer(näring, eller äter upp varandra, eller så finns antimikrobiella svampar som tar kol på andra bakterier)
- snabba och oregelbundna förändringar i miljön(ex fukt och temperatur) skapar behov av stor flexibilitet(genotypiskt och fentotypiskt).
hur är genomet ordnat hos bakterier?
- dna är associerat med proteiner, kovalent sluten cirkulär molekyl
- haploid, en kopia av genomet i en vilande cell
- nukleoid, aggregat av packat DNA en prokaryot cell
- extragenomiskt DNA , bli plasmider
varför behövs plasmider?
det finns många olika plasmider - extragenomsikt dna.
- Virulensfaktor, viktiga för den genetiska plasticiteten -> anpassa sig till ett nytt medium och till en ny miljö.
- Behövs för Antibiotika resistens
- Oberoende replikation
- Själviskt DNA
- Viktigt för dna - vid överföring
vilka överföringsmekaniser finns av DNA?
- transformation –> överföring av fritt (naket) DNA till en cell
- transduktion –> virusmedierad (bakteriofagmedierad) DNA- överföring
- konjugation –> överföring medierad konjugativa plasmider (fertilitetsplasmider), kräver cell till cellkontakt
det finns mobila genetiska element hos bakterier. vilka då?
mobila element innebär att segment av DNA flyttas inom själva DNA - molekylen.
Både IS(insertion sequenses) - element och Transposoner kodar för enzymet transposas och de har upprepade sekvenserna vid deras ändar som också behövs vid förflyttning.
- IS - element
- den enklaste formen av ett mobilt element
- korta segment
- En gen - tnp - ett enzym som behövs för kopiering av förflyttning av is - elementet.
- Homolog rekombination -> kan baspara med varandra men genomet emellan kommer att klippas ut. Plasmiden kan även integreras…
- Förekommer hos både bakterier och archea, och vissa har identiska is - element och olika antal av dem.. - Transposon
- är större än IS - element
- transposas känner igen de upprepade sekvenserna och flyttar segmentet. Det Dna som ligger emellan de upprepade sekvenserna flyttas då också och blir en del av transposomen. Generna i transposomen kan variera stort.
- a. Konservativa formen, transposomen klipps bort och integreras på ett annat ställe
b. Replikativ transposering, en ny kopia induceras och integreras på ett nytt ställe, antingen i plasmiden eller i genomet.- > Finns alltid en målsekvens som man får en duplicering av när det ska integreras en transposom.
- > Patogenicitetsöar -> en stor transposon….
- > Vikig för att sprida virulsensfaktorer..
hur sker mutationer hos bakterier?
- mutant = organism som har fått en basparsförändring i sitt genom
- spontant (naturligt orsakade)
- inducerade (framkallande) - punktmutationer
- barsparsutbyten
- läsramsmutationer - större mutationer (deletion, insertion, translokation, inversion)
