B-celler Flashcards
På vilka kromosomer finns tung och lätt kedja?
Kromosom 14 - tunga kedjan (alla ig)
Kromosom 2 - kappa lätt kedja
Kromosom 22 - lambda lätt kedja
Vilka segment bygger upp de lätta kedjorna, som finns i genen för både lambda och kappa?
VJCL
V, J och C
- V och J är de varibala segmenten som bildar den ag-bindande delen av en antikropp i den lätta kedjan
- C är konstant region
L-segment = signal peptide. Behövs för att peptiden ska gå via golgi och ER.
Vilka segment bygger upp den tunga kedjan i genen?
V D och J = variabla segment
C- kontstant region i AK. (olika C beroende på antikroppsklass och subklass) t.ex. C-region för IgG.
L - signal peptid
Beskriv kort hur lätt och tung kedja rearrangeras. Med vilka enzymer?
+
Vad som bildar en omogen BCR och en mogen BCR
- Tung kedja rekombineras först –> omogen BCR
- Lätt kedja rekombineras sedan och ersätter surrogat-lätt kedja i membranbundet omogen BCR.
- En komplett mogen BCR har också ko-receptorerna Cd19, cd21 och cd81, samt ITAM (ig-alfa, ig-beta)
Lätt kedja rearrangemang
- 1 V + 1 J läggs ihop. C kommer till.
- L-segment läggs till också.
Tung kedja rearrangemang
- DJ-läggs ihop. Sedan läggs V till.
- C-segment
- L-segment.
Enzymer
- RAG1 och RAG2 är viktiga i rekombinering
Vad innebär junctional diversity?
- beskriv processen kort med ord
- vilka enzymer är aktuella för detta?
JD är en mekanism för att skapa mer variation efter rekombinering av den lätta och tunga kedjan i de variabla regionerna när
Detta sker genom att nukleotider läggs till eller tas bort i gränsen i DNA mellan segmenten (V-J eller V-D-J).
Enzym som lägger till nukleotider
- NHEJ repair enzyme - P-nukleotider
- TdT - N-nukleotider
Enzym som tar bort nukleotider
- exonukleaser
Hur väljer en naiv B-cell mellan membranbundet IgM eller IgD, när mRNA har bildats av en ofärdig antikropp som både har IgM och IgD konstant region i tunga kedjan?
- mRNA finns för lätt och tung kedja. Tung kedja innehåller både IgM och IgD domän i sitt mRNA.
- I cytoplasman sker en RNA-splicing av mRNA i en specifik poly -A site.
- Bakom My respektive Delta-segmentet finns M1 och M2-regioner. Dessa kodar för membrandomänen av en BCR. Beroende på om klyvning av primärt mRNA och polyadenlering sker bakom (M1M2)-regionen för delta eller my, kommer en BCR-G eller BCR-D bildas.
S-domänen i bild
- kodar för sekretoriskt AK. Sker RNA-splicing även för att skapa en sekretorisk IgD eller IgM.
Vilken signal i benmärgen stimulerar en CLP att bli pre-pro-BC?
Vilken signal i benmärgen stimulerar en pre-pro-BC att bli en pro-BC?
CLP –> pre-pro-BC
- CXCL12 som uttrycks av stromaceller
pre-pro-BC –> pro-BC
- IL-7 som uttrycks av stromaceller
CLP -> prepro -> pro -> pre -> omogen BC
Varför är PAX5 en intressant transkrptionsfaktor?
PAX5 uttrycks när en pre-pro-BC stöter på IL-7 i benmärgen.
JAK-STAT signalering –> PAX5. När PAX5 uttrycks är cellen determinerad att bli en B-cell.
Beskriv i vilka utmognadsstadier av en B-cell
- rekombinering sker av lätt och tung kedja
- pro och pre- BC aktuella.
Pro-BC
- DJ segment och V-DJ segment börjar rekombineras
Pre-BC
- tung kedja är klar.
- uttrycks som en omogen BCR på cellytan
- rekombinering av lätt kedja börjar (VJ)
omogen BCR (pre-BC).
Vad sker när vi har en omogen BCR på cellytan, intracellulärt i pre-BC för att stimulera överlevnad mm?
Här sker också Checkpoint nr 1 - Vad händer om inte den tunga kedjan lyckats rearrangerats korrekt?
Flera omogna BCR går ihop på cellytan. De stimulerar ITAM-motiven intracellulärt till överlevnad. Detta nedreglerar också RAG-enzymerna så att rekombinering av tung kedja upphör.
Vpre-proteinet kommer också samtidigt binda in till variabel region på omogen BCR för att förhindra antigenbindning.
Checkpoint - Apoptos
- om inte tung kedja är funktionell = kan binda en annan omogen BCR eller associera med en surrogat = Fås inga överlevnadssignaler –> apoptos.
När checkpoint 1 har passerats för en pre-BC med en omogen BCR, vad händer då i pre-BC?
- vilka enzymer är viktiga nu för detta?
- här sker också checkpoint 2 - vad är det?
En funktionell omogen BCR finns. Nu börjar lätt kedja rearrangeras i cellen. Antingen kappa eller lambda.
RAG-enzymerna slås på igen så detta kan ske. IgM uttrycks sedan på cellytan när en mogen BCR har fåtts –> omogen BC har fötts :) Färdigt membran IgM signalerar sedan att stoppa rearrangemang.
Checkpoint 2
- om inte rearrangemang av lätt kedja går bra —> apoptos av pre-BC
Vad innebär allelisk exlusion?
När en färdig BCR har rearrangerats klart kommer alla andra alleler i cellen att inaktiveras med epigenetiska effekter t.ex. deacetylering –> heterokromatin. Då kan inte RAG-enzymerna komma åt dessa gener.
Slutrestultaten blir att endast 1 allel för lätt, och 1 allel för tung kedja uttrycks.
Hur många chanser har en BC att rearrangera en tung respektive lätt kedja?
Tung kedja rearrangeras först. Finns 2 alleler.
- därmed 2 chanser.
Lätt kedja - finns kappa och lambda x2 alleler ?
- totalt 4 chanser finns för BC att rearrangera en funktionell lätt kedja.
Varför finns det inte så mycket TdT-enzym i en pre-BC jämfört med pro-BC?
Eftersom den lätta kedjan inte får lika mycket junctional diversity. Lätt kedja rearrangeras ju i pre-BC, när tung kedja är klar i pro-BC (omogen BCR)
Innan en omogen BC lämnar benmärgen måste den klara central tolerans. Hur sker detta och vad innebär light chain editing?
Om membran BCR binder kroppseget antigen i benmärgen kommer detta leda till att omogen BC går i apoptos, då dessa BC uttrycker mycket lite anti-apoptotiska faktorer.
–> eliminering av en autoreaktiv omogen BC
Light chain editing
- en omogen BC kan ta sig tillbaka ett steg i differentiering och försöka rearrangera en ny lätt kedja, som en sista utväg att försöka hitta en BCR som inte är autoreaktiv + ska va funktionell