Aula 12 - Recombinacao E Transposição Flashcards
Mecanismo de reparação na dupla cadeia
Junção não homóloga: junção dos bordos da região lesada
Recombinacao homóloga: usa como molde cadeia integra de DNA
Recombinacao homóloga na reparação
Entre 2 cromatideos do msm cromossoma após replicacacao
Recombinacao homóloga na meios
Troca induzida de sequências
Crossing over
Entre cromossomas homólogos de 2n
Enzimas da Recombinacao homóloga
SPO11
MRE11
SPO11
Recombinacao homologa
Endonuclease
Corta ligação fosfodiester
MRE11
Recombinacao homologa
Exonuclease
Remove nucleotideos de modo a formar regiões de cadeia simples (q invadem cadeia dupla de cromossoma homólogo até encontrar zona de homologia)
Proteínas RAD51 e RAD52
ajuda na internação de cromosssomas homólogos
Regiões de Heteroduplex
Ligação de 2 DNA distintas:
Recombinacao sem crossing over ou com crossing over
Junção de Holliday
Intervém na lig de 2 DNA por complementaridade de bases
Se resolução for no eixo não há crossing over
Se for num eixo diferente da junção de Holliday ha crossing over
Conversão genética
Devido à recombinacao genética
Mismatch nas Heteroduplex
Mismatch repair corrige o erro de acordo com uma das cadeias, logo mais características de um dos progenitores
Pontual, só quando são poucos nucleotideos mal
Recombinacao nao homóloga conservative
Recombinarão de elementos do DNA q são transportados para outro local do genoma
Jumping genes: elementos móveis do DNA
Ex: infeção
Recombinase
Favorece integração/saída de um DNA estranho
Importante para formação de anticorpos no desenvolvimento embrionário
Anticorpo/imunoglobina
Proteínas grandes
4 cadeias polipeptidicas: 2 pesadas e 2 leves
Cadeias leves- recombinacao VJ
VJ (variability and joining)
Região V (de 250) liga a 4 de J
Transcrito primário (pre-mRNA)
Splicing
mRNA com V J C
Cadeias pesadas - recombinacao VDJ
VDJ ( variability diversity and joining)
Região V (de 500) liga a 12 de D que liga a 4 de J
Transcrito primário
Splicing
mRNA com V D J C
Recombinases Rag1 e Rag2
Catalisam recombinacao VDJ
Corta V e J
Na cadeia pesada liga V D e D J
(Então liga D)
Mutações: immunodeficiencias
Hairpin
Região de lig entre 2 cadeias de DNA q é quebrada
Simétrica: transferase de desoxirribonucleotideos terminal adiciona nucleotideos
Assimétrica: quebra assimetricamente pontes de hidrogénio
Formam ambas cadeia simples
DNA ligase IV
Liga as duas extremidades
Transposoes de DNA only (3% do DNA)
Tem target site direct repeat no local de inserção
Reconhecido por seq de repetição invertidas
Enzima Transposase
Cut and paste
Se ocorrer durante replicacao pode acontecer formação de novo transposao
Retrotransposicoes do tipo retroviral
Partilham mecanismos de infeção com retrovirus a exceção das proteínas do invólucro:
LTR
Target site direct repeat
Enzimas: transcriptase reversa e integrase
Transcrição do retrotransposao: produção do mRNA através de DNA retroviral
Transcrição reversa do mRNA (another flashcard)
Integração pela integrase do DNA
Transcrição reversa do mRNA do retrotransposao
Lig de tRNA a mRNA
Numa extremidade forma cDNA usando como primer tRNA
Degradação de mRNA dessa região híbrida
Jumping: emparelhares-te das regiões R do LTR
Síntese do resto do cDNA
Digestão da maioria do mRNA exceto um pouco que vai servir como primer para formar o resto do cDNA
Remoção do todo o mRNA
Retrotransposoes não-retroviricos (34%)
LINE
SINE
LINE (long interspersed nuclear element)
Tem L1 L2 e L3 mas só L1 é móvel
ORF1: codifica uma RNA binding protein
ORF2: codifica uma enzima que é transcriptase reversa e endonuclease
Regiões ricas em A e T
Síntese de mRNA Formação a partir desse mRNA da transcriptase reversa e da endonuclease Golpe no DNA alvo pela endonuclease Produção de cDNA pela transcriptase Afastamento das extremidades do DNA alvo Integração do cDNA
SINE (short intercepted nuclear element)
Não codificam enzimas para a sua retrotransposicao, recorrem às enzimas das LINE
Mais comuns: sequências Alu
Pseudogenes processados
Não entendi bem
Regiões de DNA complementares a mRNA sem introes e com cadeias poliA integradas e flanqueadas pelo short direct repeats
Consequências da transposição
Morte celular
Transformação tumoral
Duplicação de exoes
Duplicação dos genes
Partilha de exoes entre moléculas de DNA
Interação de 2 transposoes com uma região codificante no meio
Inserção de gene transcrito (pseudogene) juntamente com elemento móvel
Amplificação genética
Multiplicação da replicacao de um determinado gene várias vezes como que em paralelo
Altera características
Em células que estão em rápido crescimento tipo ovocitos e células tumorais
