Aula 11 - DNA Reparação Flashcards
Causas de danos no DNA
Reações espontâneas
Fatores externos
Interação com moléculas resultantes do metabolismo celular
Modificações espontâneas no DNA
Reações de hidrólise
Reações oxidativas
Reações de metilacao
Reações de hidrólises
Podem resultar em:
Perda de bases puricas (mais instáveis)
Perda de bases pirimidicas (menos frequente)
Desaminações (metilcitosina transformada em timina)
Reações oxidativas
Causadas por radicais livres migram para núcleo e causam danos no DNA
Reações de metilacao
Raras nos eucariotas
Comuns em bactérias
Fatores externos
Radiações UV
Ligação dos grupos químicos volumosos prejudiciais as bases de DNA
Radiações UV
formação de diâmetros de bases pirimidicas
Diversos de timina/Citosina: anel ciclovia o entre duas bases seguidas
Ligação de grupos químicos volumosos prejudiciais as bases de DNA
Benzopirenos: ligam-se a bases de DNA e causam mutações
Interação com moléculas resultantes do metabolismo celular
Aflatoxina: 🥜 causam cancro do estômago
Reparação direta de mutações
Dimeros de timina: bactérias
Enzimas reconhecem metilacoes e desaminacoes e corrigem
O6- metilguanina: forma-se por metilo+guanina
96- metilguanina transferase: reverte mutação, corta entre oxigénio e grupo metilo
Base excision repair (BER)
Ocorre antes de replicacao de DNA
DNA glicosidase: reconhece e cliva ligação entre base e desoxirribose
Formação de AP site
AP endonuclease: cliva lig fosfodiester no AP site
Desoxirribosefosfodiesterase: endonuclease, quebra a outra ligação
DNA polimerase
DNA ligase
Dimeros de timina
Não pode ser por BER é preciso remover tudo
Nucleotide excision repair (NER)
Mutação num oligonucleotideo tendo de ser todo removido
Proteínas XP: reconhecem dano Ligam a região lesada Função de helicase Função de endonuclease XPA e XPG
DNA polimerase
DNA ligase
Xeroderma pigmentos
Mutação nas proteínas XP
Indivíduos não possuem proteínas que assistem na reparação dos dimeros de timina
Transcription-coupled repair (reparação de DNA associada a transcrição)
RNA polimerase: para ao encontrar mutação no DNA
Proteínas CSA e CSB: reconhecem a RNA polimerase parada
Proteínas XP
DNA polimerase
DNA ligase
Síndrome de cockayne
Mutação nas proteínas CSA e CSB
Acumula regiões de DNA em processo de transcrição
Mismatch repair
Mau emparelhamo-nos escapa ao proofreading de DNA polimerase após replicacao
Procariontes: proteínas MutS MutL MutH
Eucariontes: MSH2 e MSH6
Clivagem
Função de helicase e exonuclease das Mut’s
DNA polimerase
DNA ligase
Proteínas MutS MutL e MutH
procariontes
Apos replicacao
Cadeia ainda não tem metilacoes
Proteínas MSH2 e MSH6
Eucariontes
Durante a replicacao
HNPCC (Cancro colo-retal nao pólipos hereditário)
Mutação nas proteínas MSH2 e MSH6
Reparação translecao/ Error prone
Durante a replicacao por DNA polimerase
DNA polimerase V: assume
Mecanismo NER- remoção e reparação de região mutada
Grande probabilidade de erro
Reparação de dano na dupla cadeia de DNA
Causa: radiação ionizante (raio X, radioativa)
Homóloga
Não homóloga
Reparação não homóloga por junção dos extremos (end joining)
Junção das duas extremidades
Proteínas Ku: reconhecem dano e ligam extremidades
Kind of a damage control if you ask me, grosseira e com mutações associadas
Recombinacao homóloga
Durante ou imediatamente após replicacao
Quebra de forquilha de replicacao Exonuclease Scanning Strand invasion Formação do Heteroduplex Clivagem Recomeço de replicacao
ReA (bactérias)/Rad51 (eucariontes)
Formação de ligação entre cadeia simples e dupla
Permite invasão da cadeia dupla
Rad52- favorece ligação a Rad51
Heteroduplex estendidos por branch migration
Se não houver interação de proteínas é indiferenciada a direção
Se houver é migração unidirecional (ex:helicase)
Proteínas BRCA-1 e BRCA-2
Ajudam a reconhecer regiões de corte na dupla hélice
Mutação: cancro hereditário de mama e ovários