8. Genomer

Question 1

Pattedyrsgenomet består ca af:

Answer 1

Proteinkodende sekvens (”exomet”) – ca. 2 %
Introns 98%

Question 2

Imellem generne ligger overvejende: (2)

Answer 2

Mellem gener: overvejende repeats
1. Transposable elementer (ca. halvdelen!)
2. Simple repetitive sekvenser (CGCGCGCG…)

Question 3

Nævn hvilke typer RNA der skal forblive RNA: herunder deres funktion

Answer 3

RNA-gener der skal forblive RNA:
”RNA-gener”: ca. 8000 (rRNA, tRNA, snRNA, miRNA mfl)

mRNA: overførsel af genetisk infomration fra DNA streng til ribosom så proteiner kan udtrykkes
- tRNA: tRNA er et ribosommolekyle der danner karakteristisk T-form. Består af et antikodon der koder for en specifik aminosyre - har også et antikodon i toppen af
tRNA som er komplementær til aminosyren. Antikodon er komplementær til codon på
mRNA. Fra mRNA->Aminosyre
- rRNA: Ribosomalt rRNA har stor betydnign for ribosomers funktion go struktur -
bruges til at holde proteinkomplekset sammen
- miRNA: Regulering af proteiner i transkriptionen og inden transkription
- Transkriptionshæmining
- mRNA degradering
- Beskyttelse af fremmede mRNA molekyler

Question 4

tRNA

Answer 4

• tRNA: tRNA er et ribosommolekyle der danner karakteristisk T-form. Består af et antikodon der koder for en specifik aminosyre - har også et antikodon i toppen af
  tRNA som er komplementær til aminosyren. Antikodon er komplementær til codon på
  mRNA. Fra mRNA->Aminosyre

Question 5

miRNA

Answer 5

• miRNA: Regulering af proteiner i transkriptionen og inden transkription

Question 6

ET kromosoms principielle opbygning

Answer 6

Et kromosoms principielle opbygnign:
Telomerer (tandem repeat)-Gener-Centromer (tandem repeat)-GENER-Telomer (tandem repeat)

Question 7

Evolutionære ændringer - exon shuffling

Answer 7

-exon shuffling
Nye gener opstår ved exonshuffling. Exoner kan flyttes til nye gener el. slettes. Nye genproteiner dannes udfra nye kombinationer af domæner (=funktionelle enheder).

Question 8

Evolutionære ændringer - udvikling af paraloge genfamilier

Answer 8

Udviklign af paraloge genfamiler (besløftede gener fra oprindeligt gen) sker ved at et stamden er duplikeret og begge gener divergeret/muteret flere gange = to forskellige familer fra samme gen. ALFA OG BETA HÆMOGLOBIN

Nogle kopier ødelægges af mutationerne = PSEUDOGENER.

Question 9

Evolutionære ændringer - Kromosomale rearrangementer:

Answer 9

Pga mutationer opstår synteniblokke:
Blokke af gener der ligger i samme rækkefølge. Blokkenes position varierer efter dyreart pga kromosmale rearrangementer

Question 10

Tre typer evolutionære ændringer i genom der giver nye arter:

Answer 10

Exon shuffling
Udvikling af paraloge genfamilier
Kromosomale rearrangementer

Question 11

Orthologe gener

Answer 11

Orthologe gener (samme gen hos to forskellie arter): gener i forskellige arter, der stammer fra det samme gen i en fælles forfader. Fx tyrosinasegenet hos hund og kat.

Question 12

Paraloge gener

Answer 12

Paraloge gener (Genfamilier. Gener der ligner hinanden og stammer fra samme gen mener blevet til en gruppe gener der er sekvensmæssigt næsten identiske): gener hos den samme art opstået ved duplikation (samme familie). Fx hæmoglobin α og hæmoglobin β hos menneske

Question 13

Homologe gener

Answer 13

Homologe gener (Alle gener af fælles oprindelse som alle olfaktoriske gener): gener, der har en fælles oprindelse i den evolutionære historie

Question 14

Orthologe, paraloge og homologe forskel

Question 15

OPGAVE: Du har lavet cDNA fra en muskelprøve og vil nu sekventere den kodende sekvens fra et gen, som
udtrykkes i muskel.Efter PCR kører du en gel, som viser 2 bånd af næsten samme størrelse.Hvad kan forklaringen være på dette resultat? (flere muligheder):

Answer 15

flere gener koder for samme proteiner og ligner hinanden
Heterozygot med to alleler, der er lidt forskellige (mutation insertion/deletion)
Alternativ splejsning af exons = flere forskellige cDNA længder

Question 16

Alternativ splicing

Answer 16

Alternativ splejsning er et fænomen der opstår når snRNPerne kan klippe forskellige steder på et mRNA og derved danne forskellige codons af samme RNAsekvens. Således vil der i translationen af disse også kunne dannes flerer forskellige proteiner ud fra samme sekvens.

Question 17

Splicing:

Answer 17

Splejsning er den sidste post transkriptionelle process, der behandler det primære RNA til mRNA før det transporteres ud af nucleus til cytoplasmaet. Under speljsning klkipper specifikke klipperenzymer, snRNP’er ikke-kodende RNA-sekvenser, introns, ud af RNA strengen og limer de resterende kodende sekvenser, exons, sammen.